MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 plasmid pRHL1

Total Repeats: 22173

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_008269	GAT	2	6	149910	149915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111024935
3002	NC_008269	TCG	2	6	149927	149932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024935
3003	NC_008269	GGTCG	2	10	149976	149985	0 %	20 %	60 %	20 %	111024935
3004	NC_008269	ACC	2	6	150073	150078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024935
3005	NC_008269	CGA	2	6	150108	150113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024935
3006	NC_008269	CCG	2	6	150146	150151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024935
3007	NC_008269	GAA	2	6	150159	150164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111024935
3008	NC_008269	TGG	2	6	150170	150175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111024935
3009	NC_008269	TGCG	2	8	150204	150211	0 %	25 %	50 %	25 %	111024935
3010	NC_008269	GGT	2	6	150297	150302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111024935
3011	NC_008269	CGG	2	6	150315	150320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024935
3012	NC_008269	GAA	2	6	150358	150363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111024935
3013	NC_008269	GCGCC	2	10	150369	150378	0 %	0 %	40 %	60 %	111024935
3014	NC_008269	GCCG	2	8	150397	150404	0 %	0 %	50 %	50 %	111024935
3015	NC_008269	GCC	2	6	150406	150411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024935
3016	NC_008269	CCA	2	6	150451	150456	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024935
3017	NC_008269	CG	3	6	150536	150541	0 %	0 %	50 %	50 %	111024936
3018	NC_008269	GCC	2	6	150581	150586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024936
3019	NC_008269	GGC	2	6	150625	150630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024936
3020	NC_008269	GCA	2	6	150636	150641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024936
3021	NC_008269	TCTCC	2	10	150694	150703	0 %	40 %	0 %	60 %	111024936
3022	NC_008269	GGA	2	6	150718	150723	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111024936
3023	NC_008269	GCA	2	6	150728	150733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024936
3024	NC_008269	GGGC	2	8	150771	150778	0 %	0 %	75 %	25 %	111024936
3025	NC_008269	TGG	2	6	150822	150827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111024936
3026	NC_008269	CCG	2	6	150849	150854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024936
3027	NC_008269	GTG	2	6	150862	150867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111024936
3028	NC_008269	CG	3	6	150879	150884	0 %	0 %	50 %	50 %	111024936
3029	NC_008269	CGA	2	6	150909	150914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024936
3030	NC_008269	GAA	2	6	151081	151086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111024936
3031	NC_008269	GTC	2	6	151118	151123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024936
3032	NC_008269	CCG	2	6	151143	151148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024936
3033	NC_008269	GTC	2	6	151154	151159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024936
3034	NC_008269	GCC	2	6	151262	151267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024936
3035	NC_008269	ACG	2	6	151277	151282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024936
3036	NC_008269	GCT	2	6	151375	151380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024936
3037	NC_008269	ACG	2	6	151383	151388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024936
3038	NC_008269	CGG	2	6	151416	151421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024936
3039	NC_008269	GCT	2	6	151447	151452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024936
3040	NC_008269	CGG	2	6	151501	151506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024936
3041	NC_008269	GAT	2	6	151540	151545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111024936
3042	NC_008269	CGT	2	6	151633	151638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024937
3043	NC_008269	CGAG	2	8	151756	151763	25 %	0 %	50 %	25 %	111024937
3044	NC_008269	CGC	2	6	151834	151839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024937
3045	NC_008269	CAA	2	6	151849	151854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111024937
3046	NC_008269	GCA	2	6	151857	151862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024937
3047	NC_008269	CTG	2	6	151881	151886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024937
3048	NC_008269	GCT	2	6	151909	151914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024937
3049	NC_008269	CGG	2	6	151953	151958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024937
3050	NC_008269	ACG	2	6	151980	151985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024937
3051	NC_008269	GGCC	2	8	152062	152069	0 %	0 %	50 %	50 %	111024937
3052	NC_008269	GCG	2	6	152112	152117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024937
3053	NC_008269	GCT	2	6	152296	152301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024937
3054	NC_008269	GAC	2	6	152356	152361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024937
3055	NC_008269	CTG	3	9	152369	152377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024937
3056	NC_008269	CGA	2	6	152434	152439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024937
3057	NC_008269	GTCC	2	8	152443	152450	0 %	25 %	25 %	50 %	111024937
3058	NC_008269	AGG	2	6	152490	152495	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111024937
3059	NC_008269	CG	3	6	152524	152529	0 %	0 %	50 %	50 %	111024937
3060	NC_008269	CAC	2	6	152536	152541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024937
3061	NC_008269	GCG	2	6	152546	152551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024937
3062	NC_008269	CTG	2	6	152573	152578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024937
3063	NC_008269	GCT	2	6	152587	152592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024937
3064	NC_008269	AGG	2	6	152601	152606	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111024937
3065	NC_008269	ATC	2	6	152613	152618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111024937
3066	NC_008269	TCG	2	6	152643	152648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024937
3067	NC_008269	GTCGAG	2	12	152651	152662	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	111024937
3068	NC_008269	GAC	2	6	152671	152676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024937
3069	NC_008269	GGTG	2	8	152743	152750	0 %	25 %	75 %	0 %	111024937
3070	NC_008269	CGA	2	6	152758	152763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024937
3071	NC_008269	GCA	2	6	152811	152816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024937
3072	NC_008269	ACC	2	6	152866	152871	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024938
3073	NC_008269	CGGG	2	8	152904	152911	0 %	0 %	75 %	25 %	111024938
3074	NC_008269	GTC	3	9	152959	152967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024938
3075	NC_008269	ACGC	2	8	152974	152981	25 %	0 %	25 %	50 %	111024938
3076	NC_008269	CGGT	2	8	153059	153066	0 %	25 %	50 %	25 %	111024938
3077	NC_008269	ACG	2	6	153094	153099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024938
3078	NC_008269	CG	3	6	153102	153107	0 %	0 %	50 %	50 %	111024938
3079	NC_008269	GAG	2	6	153112	153117	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111024938
3080	NC_008269	CTA	2	6	153171	153176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111024938
3081	NC_008269	CAG	2	6	153187	153192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024938
3082	NC_008269	TG	3	6	153203	153208	0 %	50 %	50 %	0 %	111024938
3083	NC_008269	ATCA	2	8	153229	153236	50 %	25 %	0 %	25 %	111024938
3084	NC_008269	GGGT	2	8	153264	153271	0 %	25 %	75 %	0 %	111024938
3085	NC_008269	CGA	2	6	153302	153307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024938
3086	NC_008269	GCA	2	6	153336	153341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024938
3087	NC_008269	GTC	2	6	153418	153423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024938
3088	NC_008269	GCG	2	6	153484	153489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024938
3089	NC_008269	ATC	2	6	153496	153501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111024938
3090	NC_008269	CGG	2	6	153504	153509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024938
3091	NC_008269	CG	3	6	153531	153536	0 %	0 %	50 %	50 %	111024938
3092	NC_008269	CGGC	2	8	153539	153546	0 %	0 %	50 %	50 %	111024938
3093	NC_008269	ACG	2	6	153619	153624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024938
3094	NC_008269	GGCG	2	8	153625	153632	0 %	0 %	75 %	25 %	111024938
3095	NC_008269	CGT	2	6	153642	153647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024938
3096	NC_008269	GCC	2	6	153655	153660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024938
3097	NC_008269	CGG	2	6	153671	153676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024938
3098	NC_008269	CGGCG	2	10	153700	153709	0 %	0 %	60 %	40 %	111024938
3099	NC_008269	TCG	3	9	153719	153727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024938
3100	NC_008269	CAC	2	6	153747	153752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024938
3101	NC_008269	GAA	2	6	153777	153782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111024938
3102	NC_008269	ACC	2	6	153824	153829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024938
3103	NC_008269	GCA	2	6	153859	153864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024938
3104	NC_008269	CCTCG	2	10	153873	153882	0 %	20 %	20 %	60 %	111024938
3105	NC_008269	GCTC	2	8	153944	153951	0 %	25 %	25 %	50 %	111024938
3106	NC_008269	CCG	2	6	154000	154005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024939
3107	NC_008269	ATCGA	2	10	154008	154017	40 %	20 %	20 %	20 %	111024939
3108	NC_008269	TCGAC	2	10	154030	154039	20 %	20 %	20 %	40 %	111024939
3109	NC_008269	AGCAG	2	10	154045	154054	40 %	0 %	40 %	20 %	111024939
3110	NC_008269	ACC	2	6	154098	154103	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024939
3111	NC_008269	CGA	2	6	154196	154201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024939
3112	NC_008269	GCG	2	6	154272	154277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024939
3113	NC_008269	ACC	2	6	154282	154287	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024939
3114	NC_008269	GCT	2	6	154340	154345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024939
3115	NC_008269	GGA	2	6	154394	154399	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111024939
3116	NC_008269	CTG	2	6	154458	154463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024939
3117	NC_008269	CGC	2	6	154505	154510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024939
3118	NC_008269	ACG	2	6	154633	154638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024939
3119	NC_008269	ACC	2	6	154641	154646	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024939
3120	NC_008269	TGG	2	6	154672	154677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111024939
3121	NC_008269	TCCT	2	8	154710	154717	0 %	50 %	0 %	50 %	111024939
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3230	NC_008269	CG	3	6	159430	159435	0 %	0 %	50 %	50 %	111024944
3231	NC_008269	CAA	2	6	159503	159508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111024944
3232	NC_008269	G	6	6	159514	159519	0 %	0 %	100 %	0 %	111024944
3233	NC_008269	GTC	2	6	159687	159692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024944
3234	NC_008269	TGA	2	6	159707	159712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111024944
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3237	NC_008269	GCGG	2	8	159932	159939	0 %	0 %	75 %	25 %	111024945
3238	NC_008269	GAC	4	12	159962	159973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024945
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3240	NC_008269	CGA	2	6	160055	160060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024945
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3242	NC_008269	TCT	2	6	160135	160140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111024945
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3358	NC_008269	CGA	2	6	165524	165529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024952
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3360	NC_008269	CGA	2	6	165568	165573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024952
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3362	NC_008269	GTG	2	6	165714	165719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111024952
3363	NC_008269	GAT	2	6	165728	165733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111024952
3364	NC_008269	CGG	2	6	165747	165752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024952
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3367	NC_008269	GTC	2	6	165813	165818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024952
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3465	NC_008269	GC	3	6	170958	170963	0 %	0 %	50 %	50 %	111024958
3466	NC_008269	CGCGG	2	10	170964	170973	0 %	0 %	60 %	40 %	111024958
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3481	NC_008269	TTC	2	6	171908	171913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111024959
3482	NC_008269	ATC	2	6	171953	171958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111024959
3483	NC_008269	CGA	2	6	171961	171966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024959
3484	NC_008269	GCG	2	6	171969	171974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024959
3485	NC_008269	CAC	2	6	171977	171982	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024959
3486	NC_008269	TCAGA	2	10	172031	172040	40 %	20 %	20 %	20 %	111024959
3487	NC_008269	AC	3	6	172062	172067	50 %	0 %	0 %	50 %	111024959
3488	NC_008269	ACG	2	6	172115	172120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024959
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3490	NC_008269	CGAA	2	8	172207	172214	50 %	0 %	25 %	25 %	111024959
3491	NC_008269	GAA	2	6	172244	172249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111024959
3492	NC_008269	AGC	2	6	172260	172265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024959
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3495	NC_008269	ACT	2	6	172541	172546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111024960
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