MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 plasmid pRHL1

Total Repeats: 22173

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_008269	TCG	2	6	125349	125354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024912
2502	NC_008269	CTG	2	6	125366	125371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024912
2503	NC_008269	CAG	2	6	125410	125415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024912
2504	NC_008269	GGT	2	6	125425	125430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111024912
2505	NC_008269	TGG	2	6	125442	125447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111024912
2506	NC_008269	CTA	2	6	125470	125475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111024912
2507	NC_008269	CGT	2	6	125496	125501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024912
2508	NC_008269	AGC	2	6	125521	125526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024913
2509	NC_008269	GTCCC	2	10	125538	125547	0 %	20 %	20 %	60 %	111024913
2510	NC_008269	TCGATC	2	12	125550	125561	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	111024913
2511	NC_008269	C	6	6	125561	125566	0 %	0 %	0 %	100 %	111024913
2512	NC_008269	CCG	2	6	125627	125632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024913
2513	NC_008269	CCGA	2	8	125643	125650	25 %	0 %	25 %	50 %	111024913
2514	NC_008269	AC	3	6	125788	125793	50 %	0 %	0 %	50 %	111024913
2515	NC_008269	CGG	2	6	125799	125804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024913
2516	NC_008269	ACG	2	6	125836	125841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024913
2517	NC_008269	GCG	3	9	125981	125989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024914
2518	NC_008269	GCG	2	6	126008	126013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024914
2519	NC_008269	CGG	2	6	126023	126028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024914
2520	NC_008269	ACT	2	6	126060	126065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111024914
2521	NC_008269	ACC	2	6	126102	126107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024914
2522	NC_008269	GCCG	2	8	126175	126182	0 %	0 %	50 %	50 %	111024914
2523	NC_008269	CGC	2	6	126190	126195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024914
2524	NC_008269	CCA	2	6	126252	126257	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024914
2525	NC_008269	CGG	2	6	126384	126389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024914
2526	NC_008269	TAC	3	9	126392	126400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111024914
2527	NC_008269	CCG	2	6	126417	126422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024914
2528	NC_008269	CCGC	2	8	126531	126538	0 %	0 %	25 %	75 %	111024914
2529	NC_008269	GAATG	2	10	126599	126608	40 %	20 %	40 %	0 %	111024914
2530	NC_008269	CGG	2	6	126640	126645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024914
2531	NC_008269	CCG	2	6	126656	126661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024914
2532	NC_008269	CCG	2	6	126665	126670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024914
2533	NC_008269	GTG	2	6	126671	126676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111024914
2534	NC_008269	TCT	2	6	126747	126752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111024914
2535	NC_008269	GTGC	2	8	126815	126822	0 %	25 %	50 %	25 %	111024914
2536	NC_008269	CGGC	2	8	126832	126839	0 %	0 %	50 %	50 %	111024914
2537	NC_008269	TTC	2	6	126845	126850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111024914
2538	NC_008269	TTC	2	6	126863	126868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111024914
2539	NC_008269	GGGC	2	8	126919	126926	0 %	0 %	75 %	25 %	111024914
2540	NC_008269	GTC	2	6	126941	126946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024914
2541	NC_008269	CGG	2	6	126993	126998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024914
2542	NC_008269	ACG	2	6	127005	127010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024914
2543	NC_008269	CGG	2	6	127016	127021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024914
2544	NC_008269	GCG	2	6	127042	127047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024914
2545	NC_008269	CCA	2	6	127100	127105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024914
2546	NC_008269	CGA	2	6	127252	127257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024914
2547	NC_008269	C	6	6	127288	127293	0 %	0 %	0 %	100 %	111024914
2548	NC_008269	GCCCCC	2	12	127294	127305	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	111024914
2549	NC_008269	CGA	2	6	127333	127338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024914
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2551	NC_008269	GACC	2	8	127445	127452	25 %	0 %	25 %	50 %	111024915
2552	NC_008269	GA	3	6	127480	127485	50 %	0 %	50 %	0 %	111024915
2553	NC_008269	CGG	2	6	127526	127531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024915
2554	NC_008269	CGC	2	6	127604	127609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024915
2555	NC_008269	CAA	2	6	127649	127654	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111024915
2556	NC_008269	CGA	2	6	127772	127777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024915
2557	NC_008269	CGG	2	6	127799	127804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024915
2558	NC_008269	CGG	2	6	127835	127840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024915
2559	NC_008269	CCG	2	6	127844	127849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024915
2560	NC_008269	CGG	2	6	127868	127873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024915
2561	NC_008269	ACC	2	6	127896	127901	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024915
2562	NC_008269	GGC	2	6	127902	127907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024915
2563	NC_008269	TGC	2	6	127927	127932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024915
2564	NC_008269	GCT	2	6	127955	127960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024915
2565	NC_008269	CCAC	2	8	128019	128026	25 %	0 %	0 %	75 %	111024915
2566	NC_008269	AAC	2	6	128082	128087	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111024915
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2568	NC_008269	CGT	2	6	128135	128140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024915
2569	NC_008269	CCGG	2	8	128180	128187	0 %	0 %	50 %	50 %	111024915
2570	NC_008269	GGC	2	6	128208	128213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024915
2571	NC_008269	CGT	2	6	128219	128224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024915
2572	NC_008269	CGG	2	6	128237	128242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024915
2573	NC_008269	CAT	2	6	128279	128284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111024915
2574	NC_008269	GGTACA	2	12	128336	128347	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	111024915
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2577	NC_008269	GAC	2	6	128412	128417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024915
2578	NC_008269	ACG	2	6	128434	128439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024915
2579	NC_008269	AGG	2	6	128491	128496	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111024915
2580	NC_008269	GCC	2	6	128518	128523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024915
2581	NC_008269	CGG	2	6	128530	128535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024915
2582	NC_008269	AAC	2	6	128592	128597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111024915
2583	NC_008269	ACT	2	6	128600	128605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111024915
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2585	NC_008269	TCGACG	2	12	128632	128643	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	111024915
2586	NC_008269	GGGC	2	8	128752	128759	0 %	0 %	75 %	25 %	111024916
2587	NC_008269	ACC	2	6	128808	128813	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024916
2588	NC_008269	GGT	2	6	128816	128821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111024916
2589	NC_008269	CGC	2	6	128867	128872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024916
2590	NC_008269	CGTGC	2	10	128927	128936	0 %	20 %	40 %	40 %	111024916
2591	NC_008269	CGC	2	6	129005	129010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024916
2592	NC_008269	CTC	2	6	129027	129032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111024916
2593	NC_008269	CAG	2	6	129074	129079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024916
2594	NC_008269	CCG	2	6	129083	129088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024916
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2596	NC_008269	CAC	2	6	129275	129280	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024916
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2598	NC_008269	GCC	3	9	129321	129329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024916
2599	NC_008269	GCC	2	6	129440	129445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024916
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2601	NC_008269	GC	3	6	129574	129579	0 %	0 %	50 %	50 %	111024916
2602	NC_008269	CGG	2	6	129623	129628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024916
2603	NC_008269	GTG	2	6	129657	129662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111024916
2604	NC_008269	GCCG	2	8	129680	129687	0 %	0 %	50 %	50 %	111024916
2605	NC_008269	TCG	2	6	129691	129696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024916
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2607	NC_008269	CAC	2	6	129761	129766	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024916
2608	NC_008269	CGG	2	6	129793	129798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024916
2609	NC_008269	CAT	2	6	129866	129871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111024916
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2620	NC_008269	CCG	2	6	130426	130431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024917
2621	NC_008269	GAT	2	6	130450	130455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111024917
2622	NC_008269	CTG	2	6	130464	130469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024917
2623	NC_008269	G	6	6	130495	130500	0 %	0 %	100 %	0 %	111024917
2624	NC_008269	GCC	2	6	130524	130529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024917
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2652	NC_008269	CGCC	2	8	132267	132274	0 %	0 %	25 %	75 %	111024919
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2735	NC_008269	CG	3	6	135872	135877	0 %	0 %	50 %	50 %	111024923
2736	NC_008269	TCAT	2	8	135907	135914	25 %	50 %	0 %	25 %	111024923
2737	NC_008269	TAGCCA	2	12	135916	135927	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	111024923
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2861	NC_008269	CGC	2	6	142638	142643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024926
2862	NC_008269	ACC	2	6	142686	142691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024927
2863	NC_008269	ACC	2	6	142744	142749	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024927
2864	NC_008269	CGA	2	6	142775	142780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024927
2865	NC_008269	ACG	2	6	142813	142818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024927
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2867	NC_008269	CGA	2	6	142904	142909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024927
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2869	NC_008269	CG	3	6	143084	143089	0 %	0 %	50 %	50 %	111024927
2870	NC_008269	TGT	2	6	143092	143097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111024927
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2882	NC_008269	ACCG	2	8	144106	144113	25 %	0 %	25 %	50 %	111024928
2883	NC_008269	CGC	3	9	144117	144125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024928
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2885	NC_008269	CTG	2	6	144247	144252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024928
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2980	NC_008269	CGA	2	6	148698	148703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024934
2981	NC_008269	CGG	2	6	148713	148718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024934
2982	NC_008269	CGAACG	2	12	148752	148763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024934
2983	NC_008269	CGG	2	6	148788	148793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024934
2984	NC_008269	CCG	2	6	148813	148818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024934
2985	NC_008269	GAT	2	6	148864	148869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111024934
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