MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 plasmid pRHL1

Total Repeats: 22173

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_008269	CGA	2	6	99417	99422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024888
2002	NC_008269	GTAC	2	8	99429	99436	25 %	25 %	25 %	25 %	111024888
2003	NC_008269	G	6	6	99457	99462	0 %	0 %	100 %	0 %	111024888
2004	NC_008269	CTG	2	6	99526	99531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024888
2005	NC_008269	CGC	2	6	99566	99571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024888
2006	NC_008269	CGA	2	6	99591	99596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024888
2007	NC_008269	CGA	2	6	99623	99628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024888
2008	NC_008269	GGCG	2	8	99666	99673	0 %	0 %	75 %	25 %	111024888
2009	NC_008269	AAG	2	6	99730	99735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111024888
2010	NC_008269	ACG	2	6	99749	99754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024888
2011	NC_008269	TCA	2	6	99976	99981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111024889
2012	NC_008269	CGG	2	6	100017	100022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024889
2013	NC_008269	GCG	2	6	100068	100073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024889
2014	NC_008269	CTT	2	6	100077	100082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111024889
2015	NC_008269	CGCC	2	8	100100	100107	0 %	0 %	25 %	75 %	111024889
2016	NC_008269	TCC	2	6	100155	100160	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111024889
2017	NC_008269	CGATC	2	10	100169	100178	20 %	20 %	20 %	40 %	111024889
2018	NC_008269	CGC	2	6	100197	100202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024889
2019	NC_008269	GAC	2	6	100219	100224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024889
2020	NC_008269	CTG	2	6	100409	100414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024890
2021	NC_008269	ACC	2	6	100445	100450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024890
2022	NC_008269	CGGC	2	8	100482	100489	0 %	0 %	50 %	50 %	111024890
2023	NC_008269	CGGC	2	8	100501	100508	0 %	0 %	50 %	50 %	111024890
2024	NC_008269	ACGC	2	8	100570	100577	25 %	0 %	25 %	50 %	111024890
2025	NC_008269	GC	3	6	100576	100581	0 %	0 %	50 %	50 %	111024890
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2031	NC_008269	CCAC	2	8	100869	100876	25 %	0 %	0 %	75 %	111024890
2032	NC_008269	CGG	2	6	100877	100882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024890
2033	NC_008269	CGGC	2	8	101019	101026	0 %	0 %	50 %	50 %	111024890
2034	NC_008269	TTG	2	6	101061	101066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111024890
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2036	NC_008269	TCT	2	6	101110	101115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111024890
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2039	NC_008269	CGC	3	9	101278	101286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024890
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2042	NC_008269	GC	3	6	101329	101334	0 %	0 %	50 %	50 %	111024890
2043	NC_008269	TGG	2	6	101342	101347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111024890
2044	NC_008269	CCG	4	12	101369	101380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024890
2045	NC_008269	GAC	2	6	101562	101567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024891
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2047	NC_008269	CGC	2	6	101631	101636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024891
2048	NC_008269	CTG	2	6	101668	101673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024891
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2050	NC_008269	CGT	2	6	101697	101702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024891
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2052	NC_008269	TAC	2	6	101758	101763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111024891
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2056	NC_008269	CGA	2	6	101898	101903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024891
2057	NC_008269	GTC	2	6	101911	101916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024891
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2063	NC_008269	GC	3	6	102172	102177	0 %	0 %	50 %	50 %	111024892
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2069	NC_008269	GTG	2	6	102384	102389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111024892
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2082	NC_008269	TCGT	2	8	102831	102838	0 %	50 %	25 %	25 %	111024892
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2122	NC_008269	TCG	2	6	104641	104646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024894
2123	NC_008269	AAC	2	6	104671	104676	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111024894
2124	NC_008269	CGGCG	2	10	104690	104699	0 %	0 %	60 %	40 %	111024894
2125	NC_008269	GTCGA	2	10	104747	104756	20 %	20 %	40 %	20 %	111024894
2126	NC_008269	TCGA	2	8	104793	104800	25 %	25 %	25 %	25 %	111024894
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2239	NC_008269	GCGAC	2	10	112889	112898	20 %	0 %	40 %	40 %	111024904
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2242	NC_008269	AAC	2	6	113062	113067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111024904
2243	NC_008269	GCCG	2	8	113097	113104	0 %	0 %	50 %	50 %	111024904
2244	NC_008269	CGG	2	6	113108	113113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024904
2245	NC_008269	CGA	2	6	113117	113122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024904
2246	NC_008269	CAA	2	6	113162	113167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111024904
2247	NC_008269	CGT	2	6	113204	113209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024904
2248	NC_008269	CGGCAT	7	42	113210	113251	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	111024904
2249	NC_008269	GAT	3	9	113256	113264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111024904
2250	NC_008269	CGG	2	6	113273	113278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024904
2251	NC_008269	GCC	2	6	113293	113298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024904
2252	NC_008269	GTGC	2	8	113362	113369	0 %	25 %	50 %	25 %	111024904
2253	NC_008269	CAC	2	6	113872	113877	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024905
2254	NC_008269	GGTC	2	8	113908	113915	0 %	25 %	50 %	25 %	111024905
2255	NC_008269	CGG	2	6	113923	113928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024905
2256	NC_008269	GGA	2	6	113941	113946	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111024905
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2258	NC_008269	CGG	2	6	114062	114067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024905
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2260	NC_008269	CCT	2	6	114168	114173	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111024905
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2262	NC_008269	CCA	2	6	114237	114242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024905
2263	NC_008269	CGG	2	6	114253	114258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024905
2264	NC_008269	CTG	2	6	114320	114325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024905
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2267	NC_008269	ATC	2	6	114437	114442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111024905
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2271	NC_008269	GAC	2	6	114626	114631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024905
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2274	NC_008269	CCCA	2	8	114682	114689	25 %	0 %	0 %	75 %	111024905
2275	NC_008269	CG	3	6	114699	114704	0 %	0 %	50 %	50 %	111024905
2276	NC_008269	CGA	2	6	114778	114783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024905
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2278	NC_008269	CGTAC	2	10	114823	114832	20 %	20 %	20 %	40 %	111024905
2279	NC_008269	CCG	2	6	114872	114877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024905
2280	NC_008269	GCA	2	6	114893	114898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024905
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2282	NC_008269	CCG	2	6	115047	115052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024905
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2284	NC_008269	CGA	2	6	115084	115089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024905
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2352	NC_008269	GAC	2	6	118387	118392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024907
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2354	NC_008269	GAC	2	6	118444	118449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024907
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2361	NC_008269	GGC	2	6	118716	118721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024907
2362	NC_008269	GCC	3	9	118726	118734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024907
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2364	NC_008269	CGA	2	6	118750	118755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024907
2365	NC_008269	GAC	2	6	118762	118767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024907
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2486	NC_008269	TG	3	6	124323	124328	0 %	50 %	50 %	0 %	111024910
2487	NC_008269	GAA	2	6	124345	124350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111024910
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2489	NC_008269	CAT	2	6	124934	124939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111024911
2490	NC_008269	GAC	2	6	124947	124952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024911
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