MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 plasmid pRHL1

Total Repeats: 22173

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_008269	GCC	2	6	50092	50097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024837
1002	NC_008269	GCGT	2	8	50146	50153	0 %	25 %	50 %	25 %	111024837
1003	NC_008269	GGC	2	6	50171	50176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024837
1004	NC_008269	TGCC	2	8	50272	50279	0 %	25 %	25 %	50 %	111024837
1005	NC_008269	GCG	2	6	50285	50290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024837
1006	NC_008269	GCGA	2	8	50302	50309	25 %	0 %	50 %	25 %	111024837
1007	NC_008269	GCG	2	6	50324	50329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024837
1008	NC_008269	CAG	2	6	50333	50338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024837
1009	NC_008269	CCG	2	6	50359	50364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024837
1010	NC_008269	ACC	2	6	50371	50376	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024837
1011	NC_008269	TCG	2	6	50398	50403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024837
1012	NC_008269	CAG	2	6	50436	50441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024837
1013	NC_008269	CGA	2	6	50477	50482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024837
1014	NC_008269	GAG	2	6	50577	50582	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111024837
1015	NC_008269	ACCC	2	8	50584	50591	25 %	0 %	0 %	75 %	111024837
1016	NC_008269	GAG	2	6	50727	50732	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111024837
1017	NC_008269	CCG	2	6	50782	50787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024837
1018	NC_008269	AGCTGG	2	12	50842	50853	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	111024837
1019	NC_008269	TG	3	6	50948	50953	0 %	50 %	50 %	0 %	111024837
1020	NC_008269	TGGG	2	8	50959	50966	0 %	25 %	75 %	0 %	111024837
1021	NC_008269	CCG	2	6	51057	51062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024837
1022	NC_008269	GTC	2	6	51103	51108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024837
1023	NC_008269	GCA	2	6	51128	51133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024837
1024	NC_008269	TGT	2	6	51155	51160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111024837
1025	NC_008269	GCTC	2	8	51371	51378	0 %	25 %	25 %	50 %	111024838
1026	NC_008269	GAT	2	6	51387	51392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111024838
1027	NC_008269	TTC	2	6	51412	51417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111024838
1028	NC_008269	GCC	2	6	51503	51508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024838
1029	NC_008269	CGT	2	6	51552	51557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024838
1030	NC_008269	CCG	2	6	51795	51800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024839
1031	NC_008269	CCG	2	6	51831	51836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024839
1032	NC_008269	TGA	2	6	51844	51849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111024839
1033	NC_008269	CAG	2	6	51887	51892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024839
1034	NC_008269	GCA	2	6	51934	51939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024839
1035	NC_008269	TGG	2	6	51985	51990	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111024839
1036	NC_008269	GCC	4	12	52139	52150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024839
1037	NC_008269	GAT	2	6	52181	52186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111024839
1038	NC_008269	GGC	2	6	52199	52204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024839
1039	NC_008269	CTC	2	6	52208	52213	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111024839
1040	NC_008269	CCG	2	6	52216	52221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024839
1041	NC_008269	TCG	2	6	52266	52271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024839
1042	NC_008269	TCG	2	6	52312	52317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024839
1043	NC_008269	CGA	2	6	52342	52347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024839
1044	NC_008269	GAC	2	6	52385	52390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024839
1045	NC_008269	GC	3	6	52391	52396	0 %	0 %	50 %	50 %	111024839
1046	NC_008269	GTC	2	6	52400	52405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024839
1047	NC_008269	CCG	2	6	52477	52482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024839
1048	NC_008269	ACCC	2	8	52496	52503	25 %	0 %	0 %	75 %	111024839
1049	NC_008269	CCG	2	6	52557	52562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024839
1050	NC_008269	TCAA	2	8	52672	52679	50 %	25 %	0 %	25 %	111024840
1051	NC_008269	TGC	2	6	52697	52702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024840
1052	NC_008269	ACG	2	6	52765	52770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024840
1053	NC_008269	GGC	2	6	52868	52873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024840
1054	NC_008269	GTG	2	6	52959	52964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111024840
1055	NC_008269	TCT	2	6	52967	52972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111024840
1056	NC_008269	GTG	2	6	53004	53009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111024840
1057	NC_008269	TGCAG	2	10	53018	53027	20 %	20 %	40 %	20 %	111024840
1058	NC_008269	GAT	2	6	53070	53075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111024840
1059	NC_008269	GA	3	6	53080	53085	50 %	0 %	50 %	0 %	111024840
1060	NC_008269	GCA	2	6	53119	53124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024840
1061	NC_008269	CAGC	2	8	53138	53145	25 %	0 %	25 %	50 %	111024840
1062	NC_008269	TAG	2	6	53236	53241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111024840
1063	NC_008269	GCC	2	6	53302	53307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024840
1064	NC_008269	CGC	2	6	53312	53317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024840
1065	NC_008269	TGT	2	6	53322	53327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111024840
1066	NC_008269	CTT	2	6	53355	53360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111024840
1067	NC_008269	GCT	2	6	53484	53489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024840
1068	NC_008269	GC	3	6	53527	53532	0 %	0 %	50 %	50 %	111024840
1069	NC_008269	TGT	2	6	53669	53674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111024841
1070	NC_008269	CGT	2	6	53835	53840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024841
1071	NC_008269	GCTC	2	8	53915	53922	0 %	25 %	25 %	50 %	111024842
1072	NC_008269	CG	3	6	54027	54032	0 %	0 %	50 %	50 %	111024842
1073	NC_008269	GGGCC	2	10	54087	54096	0 %	0 %	60 %	40 %	111024842
1074	NC_008269	GTC	2	6	54097	54102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024842
1075	NC_008269	ATC	2	6	54149	54154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111024842
1076	NC_008269	CGG	2	6	54237	54242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024842
1077	NC_008269	CT	4	8	54247	54254	0 %	50 %	0 %	50 %	111024842
1078	NC_008269	CCG	2	6	54280	54285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024842
1079	NC_008269	CCCG	2	8	54286	54293	0 %	0 %	25 %	75 %	111024842
1080	NC_008269	GCG	2	6	54341	54346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024842
1081	NC_008269	GCC	2	6	54349	54354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024842
1082	NC_008269	GTG	2	6	54485	54490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111024842
1083	NC_008269	GC	3	6	54559	54564	0 %	0 %	50 %	50 %	111024842
1084	NC_008269	GCC	2	6	54574	54579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024842
1085	NC_008269	CGG	2	6	54584	54589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024842
1086	NC_008269	GCA	2	6	54603	54608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024842
1087	NC_008269	GGT	2	6	54658	54663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111024842
1088	NC_008269	ACG	3	9	54695	54703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024842
1089	NC_008269	CGT	2	6	54744	54749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024842
1090	NC_008269	AGG	2	6	54795	54800	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111024842
1091	NC_008269	CG	3	6	54804	54809	0 %	0 %	50 %	50 %	111024842
1092	NC_008269	GCC	2	6	54856	54861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024842
1093	NC_008269	TCG	2	6	54935	54940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024842
1094	NC_008269	CAG	2	6	54958	54963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024842
1095	NC_008269	GCGGT	2	10	55007	55016	0 %	20 %	60 %	20 %	111024842
1096	NC_008269	GTC	2	6	55141	55146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024843
1097	NC_008269	CGT	2	6	55172	55177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024843
1098	NC_008269	ACG	2	6	55282	55287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024843
1099	NC_008269	GAA	2	6	55350	55355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111024843
1100	NC_008269	CGAAG	2	10	55400	55409	40 %	0 %	40 %	20 %	111024843
1101	NC_008269	AGA	3	9	55471	55479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111024844
1102	NC_008269	GTT	2	6	55487	55492	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111024844
1103	NC_008269	GA	3	6	55494	55499	50 %	0 %	50 %	0 %	111024844
1104	NC_008269	TTCGC	2	10	55525	55534	0 %	40 %	20 %	40 %	111024844
1105	NC_008269	CGA	2	6	55675	55680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024844
1106	NC_008269	CAT	2	6	55769	55774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111024844
1107	NC_008269	TCT	2	6	55878	55883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111024844
1108	NC_008269	GCG	2	6	55910	55915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024844
1109	NC_008269	AGT	2	6	55939	55944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111024844
1110	NC_008269	TGC	2	6	55962	55967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024844
1111	NC_008269	CGGGT	2	10	56142	56151	0 %	20 %	60 %	20 %	111024845
1112	NC_008269	TCA	2	6	56181	56186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111024845
1113	NC_008269	CGC	2	6	56215	56220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024845
1114	NC_008269	TTC	2	6	56221	56226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111024845
1115	NC_008269	GCA	2	6	56331	56336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024845
1116	NC_008269	CTG	2	6	56338	56343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024845
1117	NC_008269	CGT	2	6	56364	56369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024845
1118	NC_008269	ACC	2	6	56383	56388	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024845
1119	NC_008269	CTG	2	6	56410	56415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024845
1120	NC_008269	CGA	2	6	56454	56459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024845
1121	NC_008269	GAAC	2	8	56533	56540	50 %	0 %	25 %	25 %	111024845
1122	NC_008269	TGC	2	6	56561	56566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024845
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1124	NC_008269	ATG	2	6	56663	56668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111024845
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1249	NC_008269	GCC	2	6	64020	64025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024852
1250	NC_008269	TTC	2	6	64086	64091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111024852
1251	NC_008269	CGA	2	6	64103	64108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024852
1252	NC_008269	CGA	2	6	64172	64177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024852
1253	NC_008269	CTC	2	6	64221	64226	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111024852
1254	NC_008269	CG	3	6	64238	64243	0 %	0 %	50 %	50 %	111024852
1255	NC_008269	CG	3	6	64265	64270	0 %	0 %	50 %	50 %	111024852
1256	NC_008269	CGT	2	6	64298	64303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024852
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1270	NC_008269	TGA	2	6	64921	64926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111024853
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1354	NC_008269	GTG	2	6	68951	68956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111024857
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1364	NC_008269	CAC	2	6	69437	69442	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024858
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1367	NC_008269	ATC	2	6	69526	69531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111024858
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1497	NC_008269	C	6	6	75196	75201	0 %	0 %	0 %	100 %	111024861
1498	NC_008269	GAACC	2	10	75288	75297	40 %	0 %	20 %	40 %	111024862
1499	NC_008269	CGC	2	6	75322	75327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024862
1500	NC_008269	CGA	2	6	75394	75399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024862

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