MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 plasmid pRHL1

Total Repeats: 22173

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008269	CAG	2	6	23619	23624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024811
502	NC_008269	CGGCCT	2	12	23645	23656	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	111024811
503	NC_008269	GCC	2	6	23657	23662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024811
504	NC_008269	CGT	2	6	23684	23689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024811
505	NC_008269	CTC	2	6	23823	23828	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111024811
506	NC_008269	CG	3	6	23838	23843	0 %	0 %	50 %	50 %	111024811
507	NC_008269	GCA	2	6	23855	23860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024811
508	NC_008269	CCA	2	6	23954	23959	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024811
509	NC_008269	CAC	2	6	24014	24019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024811
510	NC_008269	GGAA	2	8	24046	24053	50 %	0 %	50 %	0 %	111024811
511	NC_008269	CCA	2	6	24077	24082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024811
512	NC_008269	CCTT	2	8	24199	24206	0 %	50 %	0 %	50 %	111024811
513	NC_008269	TCG	2	6	24223	24228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024811
514	NC_008269	AGG	2	6	24229	24234	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111024811
515	NC_008269	CTC	2	6	24249	24254	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111024811
516	NC_008269	CCT	2	6	24257	24262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111024811
517	NC_008269	GC	3	6	24287	24292	0 %	0 %	50 %	50 %	111024811
518	NC_008269	GTT	2	6	24294	24299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111024811
519	NC_008269	GCG	2	6	24300	24305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024811
520	NC_008269	ACCC	2	8	24313	24320	25 %	0 %	0 %	75 %	111024811
521	NC_008269	CGT	2	6	24370	24375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024811
522	NC_008269	GCC	2	6	24391	24396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024811
523	NC_008269	TGC	2	6	24409	24414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024811
524	NC_008269	CGG	2	6	24452	24457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024811
525	NC_008269	TCT	2	6	25045	25050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111024812
526	NC_008269	GTT	2	6	25081	25086	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111024812
527	NC_008269	CACCCG	2	12	25159	25170	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	111024812
528	NC_008269	GC	3	6	25246	25251	0 %	0 %	50 %	50 %	111024812
529	NC_008269	ACCC	2	8	25303	25310	25 %	0 %	0 %	75 %	111024812
530	NC_008269	ACGCCG	2	12	25311	25322	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	111024812
531	NC_008269	GAAC	2	8	25417	25424	50 %	0 %	25 %	25 %	111024812
532	NC_008269	CG	4	8	25453	25460	0 %	0 %	50 %	50 %	111024812
533	NC_008269	CGC	2	6	25469	25474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024812
534	NC_008269	CGG	2	6	25486	25491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024812
535	NC_008269	CGG	2	6	25516	25521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024812
536	NC_008269	GCT	2	6	25528	25533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024812
537	NC_008269	CGC	2	6	25540	25545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024812
538	NC_008269	CTG	2	6	25550	25555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024812
539	NC_008269	ATC	2	6	25640	25645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111024812
540	NC_008269	TGC	2	6	25659	25664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024812
541	NC_008269	TCG	2	6	25665	25670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024812
542	NC_008269	CCA	2	6	25678	25683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024812
543	NC_008269	ACC	2	6	25694	25699	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024812
544	NC_008269	CAC	2	6	25711	25716	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024812
545	NC_008269	CGC	2	6	25717	25722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024812
546	NC_008269	GCC	2	6	25822	25827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024813
547	NC_008269	TCG	2	6	25843	25848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024813
548	NC_008269	GCC	2	6	25869	25874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024813
549	NC_008269	ACG	2	6	25883	25888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024813
550	NC_008269	CGG	2	6	25904	25909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024813
551	NC_008269	CGG	2	6	25931	25936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024813
552	NC_008269	TCC	2	6	25942	25947	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111024813
553	NC_008269	AGA	2	6	25948	25953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111024813
554	NC_008269	ACC	2	6	26118	26123	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024813
555	NC_008269	ACCGC	2	10	26128	26137	20 %	0 %	20 %	60 %	111024813
556	NC_008269	CGC	3	9	26135	26143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024813
557	NC_008269	CCT	2	6	26144	26149	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111024813
558	NC_008269	CGC	2	6	26150	26155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024813
559	NC_008269	CAC	2	6	26161	26166	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024813
560	NC_008269	AGG	2	6	26167	26172	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111024813
561	NC_008269	CAG	2	6	26528	26533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024814
562	NC_008269	GCT	2	6	26535	26540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024814
563	NC_008269	CGG	2	6	26626	26631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024814
564	NC_008269	GCA	2	6	26642	26647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024814
565	NC_008269	GCC	2	6	26706	26711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024814
566	NC_008269	GGCC	2	8	26988	26995	0 %	0 %	50 %	50 %	111024815
567	NC_008269	GAG	2	6	27008	27013	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111024815
568	NC_008269	CGG	2	6	27090	27095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024815
569	NC_008269	CG	3	6	27108	27113	0 %	0 %	50 %	50 %	111024815
570	NC_008269	TGG	2	6	27116	27121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111024815
571	NC_008269	GCC	2	6	27141	27146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024815
572	NC_008269	TCG	2	6	27155	27160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024815
573	NC_008269	GTGC	2	8	27172	27179	0 %	25 %	50 %	25 %	111024815
574	NC_008269	GTC	2	6	27209	27214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024815
575	NC_008269	CGC	2	6	27436	27441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024816
576	NC_008269	ATC	2	6	27451	27456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111024816
577	NC_008269	CGA	2	6	27507	27512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024816
578	NC_008269	TGC	2	6	27516	27521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024816
579	NC_008269	TAC	3	9	27550	27558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111024816
580	NC_008269	GCT	2	6	27576	27581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024816
581	NC_008269	CG	3	6	27598	27603	0 %	0 %	50 %	50 %	111024816
582	NC_008269	CGA	2	6	27627	27632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024816
583	NC_008269	CCA	2	6	27638	27643	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024816
584	NC_008269	CGA	2	6	27645	27650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024816
585	NC_008269	GGC	2	6	27666	27671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024816
586	NC_008269	TCG	2	6	27695	27700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024816
587	NC_008269	GAG	2	6	27703	27708	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111024816
588	NC_008269	TCT	2	6	27725	27730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111024816
589	NC_008269	CGA	3	9	27750	27758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024816
590	NC_008269	TCG	2	6	27806	27811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024816
591	NC_008269	GCG	2	6	27830	27835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024816
592	NC_008269	GC	3	6	27859	27864	0 %	0 %	50 %	50 %	111024816
593	NC_008269	GAT	2	6	27928	27933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111024816
594	NC_008269	TCG	2	6	27956	27961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024816
595	NC_008269	CAA	2	6	28157	28162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111024817
596	NC_008269	CGCAGG	2	12	28167	28178	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	111024817
597	NC_008269	CAG	3	9	28232	28240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024817
598	NC_008269	GGT	2	6	28247	28252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111024817
599	NC_008269	GCC	2	6	28290	28295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024817
600	NC_008269	CGC	2	6	28343	28348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024817
601	NC_008269	ATG	2	6	28359	28364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111024817
602	NC_008269	GCA	2	6	28459	28464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024817
603	NC_008269	CGC	2	6	28466	28471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024817
604	NC_008269	TGT	2	6	28518	28523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111024817
605	NC_008269	CGCC	2	8	28532	28539	0 %	0 %	25 %	75 %	111024817
606	NC_008269	CGG	2	6	28569	28574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024817
607	NC_008269	GAT	2	6	28885	28890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111024818
608	NC_008269	GTT	2	6	28906	28911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111024818
609	NC_008269	CGA	2	6	29041	29046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024818
610	NC_008269	CAG	2	6	29113	29118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024818
611	NC_008269	GCA	2	6	29129	29134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024818
612	NC_008269	GCT	2	6	29754	29759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024819
613	NC_008269	CAC	2	6	29776	29781	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024819
614	NC_008269	CCA	2	6	29792	29797	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024819
615	NC_008269	CTG	2	6	29815	29820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024819
616	NC_008269	GCA	2	6	29892	29897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024819
617	NC_008269	GGGT	2	8	29945	29952	0 %	25 %	75 %	0 %	111024819
618	NC_008269	CTT	2	6	30018	30023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111024819
619	NC_008269	GCT	2	6	30047	30052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024819
620	NC_008269	AAC	2	6	30151	30156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111024819
621	NC_008269	TCG	2	6	30167	30172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024819
622	NC_008269	TGG	2	6	30217	30222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111024819
623	NC_008269	CTCGGA	2	12	30249	30260	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	111024819
624	NC_008269	AGA	2	6	30296	30301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111024819
625	NC_008269	GCA	2	6	30318	30323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024819
626	NC_008269	CGC	2	6	30391	30396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024819
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629	NC_008269	CT	3	6	30542	30547	0 %	50 %	0 %	50 %	111024820
630	NC_008269	TCT	2	6	30589	30594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111024820
631	NC_008269	CGA	2	6	30614	30619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024820
632	NC_008269	CGA	2	6	30629	30634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024820
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642	NC_008269	GC	3	6	31174	31179	0 %	0 %	50 %	50 %	111024822
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659	NC_008269	TAC	2	6	31759	31764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111024822
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661	NC_008269	C	6	6	31840	31845	0 %	0 %	0 %	100 %	111024822
662	NC_008269	GGA	2	6	31854	31859	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111024822
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728	NC_008269	GA	3	6	36098	36103	50 %	0 %	50 %	0 %	111024827
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731	NC_008269	GCC	2	6	36236	36241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024827
732	NC_008269	ATC	2	6	36303	36308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111024827
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735	NC_008269	CGT	2	6	36532	36537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024827
736	NC_008269	CG	3	6	36544	36549	0 %	0 %	50 %	50 %	111024827
737	NC_008269	GTCA	2	8	36897	36904	25 %	25 %	25 %	25 %	111024828
738	NC_008269	CGG	2	6	36952	36957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024828
739	NC_008269	TCG	2	6	36991	36996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024828
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744	NC_008269	GGT	2	6	37142	37147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111024828
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751	NC_008269	GGT	2	6	37502	37507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111024828
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