MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 plasmid pRHL1

Total Repeats: 22173

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_008269	CGA	2	6	251847	251852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025044
5002	NC_008269	ACA	2	6	251876	251881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111025044
5003	NC_008269	TCG	2	6	251882	251887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025044
5004	NC_008269	GC	3	6	251988	251993	0 %	0 %	50 %	50 %	111025044
5005	NC_008269	GACAA	2	10	252026	252035	60 %	0 %	20 %	20 %	111025044
5006	NC_008269	CGTCG	2	10	252038	252047	0 %	20 %	40 %	40 %	111025044
5007	NC_008269	TCG	2	6	252365	252370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025045
5008	NC_008269	TCC	2	6	252397	252402	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111025045
5009	NC_008269	TGA	2	6	252408	252413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111025045
5010	NC_008269	ACCGA	2	10	252416	252425	40 %	0 %	20 %	40 %	111025045
5011	NC_008269	CCA	2	6	252426	252431	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025045
5012	NC_008269	CCG	2	6	252453	252458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025045
5013	NC_008269	TCG	2	6	252512	252517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025045
5014	NC_008269	CGC	2	6	252519	252524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025045
5015	NC_008269	CGA	2	6	252525	252530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025045
5016	NC_008269	CA	3	6	252552	252557	50 %	0 %	0 %	50 %	111025045
5017	NC_008269	GCT	2	6	252917	252922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025046
5018	NC_008269	CGA	2	6	252938	252943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025046
5019	NC_008269	ACCG	2	8	252990	252997	25 %	0 %	25 %	50 %	111025046
5020	NC_008269	CGG	2	6	253067	253072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025046
5021	NC_008269	CTT	2	6	253128	253133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111025046
5022	NC_008269	TGC	2	6	253176	253181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025046
5023	NC_008269	AGT	2	6	253223	253228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111025046
5024	NC_008269	ACCG	2	8	253234	253241	25 %	0 %	25 %	50 %	111025046
5025	NC_008269	CGA	2	6	253266	253271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025046
5026	NC_008269	CAC	2	6	253653	253658	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025047
5027	NC_008269	TCGCGG	2	12	253775	253786	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	111025047
5028	NC_008269	CGCC	2	8	253836	253843	0 %	0 %	25 %	75 %	111025047
5029	NC_008269	GGA	2	6	253860	253865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111025047
5030	NC_008269	CGG	2	6	253889	253894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025047
5031	NC_008269	GGT	2	6	253906	253911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025047
5032	NC_008269	CAC	2	6	253962	253967	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025047
5033	NC_008269	GC	3	6	254007	254012	0 %	0 %	50 %	50 %	111025048
5034	NC_008269	CAGAC	2	10	254029	254038	40 %	0 %	20 %	40 %	111025048
5035	NC_008269	GCC	2	6	254134	254139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025048
5036	NC_008269	CCT	2	6	254170	254175	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111025048
5037	NC_008269	CGCC	2	8	254215	254222	0 %	0 %	25 %	75 %	111025048
5038	NC_008269	GT	3	6	254255	254260	0 %	50 %	50 %	0 %	111025048
5039	NC_008269	TGG	2	6	254269	254274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025048
5040	NC_008269	GCG	2	6	254302	254307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025048
5041	NC_008269	TCGG	2	8	254377	254384	0 %	25 %	50 %	25 %	111025048
5042	NC_008269	CAA	2	6	254426	254431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111025048
5043	NC_008269	GCA	2	6	254459	254464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025048
5044	NC_008269	CGA	2	6	254471	254476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025048
5045	NC_008269	GTG	2	6	254541	254546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025048
5046	NC_008269	AC	3	6	254557	254562	50 %	0 %	0 %	50 %	111025048
5047	NC_008269	GAT	2	6	254618	254623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111025048
5048	NC_008269	CGG	2	6	254654	254659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025048
5049	NC_008269	GAGGCG	2	12	254664	254675	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	111025048
5050	NC_008269	CAC	2	6	254753	254758	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025048
5051	NC_008269	GTC	2	6	254808	254813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025048
5052	NC_008269	CGA	3	9	254927	254935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025048
5053	NC_008269	AGC	2	6	254971	254976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025048
5054	NC_008269	TCG	2	6	254986	254991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025048
5055	NC_008269	GCTG	2	8	255158	255165	0 %	25 %	50 %	25 %	111025048
5056	NC_008269	CGA	2	6	255200	255205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025048
5057	NC_008269	CGA	2	6	255212	255217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025048
5058	NC_008269	CGATC	2	10	255233	255242	20 %	20 %	20 %	40 %	111025048
5059	NC_008269	CGGA	2	8	255265	255272	25 %	0 %	50 %	25 %	111025048
5060	NC_008269	CGG	2	6	255274	255279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025048
5061	NC_008269	GGT	2	6	255329	255334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025048
5062	NC_008269	CGC	2	6	255380	255385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025048
5063	NC_008269	TGA	2	6	255421	255426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111025048
5064	NC_008269	CTG	2	6	255438	255443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025048
5065	NC_008269	GAA	2	6	255446	255451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111025048
5066	NC_008269	ACT	2	6	255526	255531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111025048
5067	NC_008269	CGGCT	2	10	255564	255573	0 %	20 %	40 %	40 %	111025048
5068	NC_008269	ACC	2	6	255597	255602	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025048
5069	NC_008269	CGC	2	6	255748	255753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025048
5070	NC_008269	TCA	2	6	255757	255762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111025048
5071	NC_008269	CGC	2	6	255798	255803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025048
5072	NC_008269	GAG	2	6	255867	255872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111025048
5073	NC_008269	CGA	2	6	255887	255892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025048
5074	NC_008269	CGA	2	6	255944	255949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025048
5075	NC_008269	GCG	2	6	256016	256021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025048
5076	NC_008269	ACC	2	6	256113	256118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025048
5077	NC_008269	CCG	2	6	256145	256150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025048
5078	NC_008269	CCGG	2	8	256158	256165	0 %	0 %	50 %	50 %	111025048
5079	NC_008269	TGA	2	6	256240	256245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111025048
5080	NC_008269	CTG	2	6	256281	256286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025048
5081	NC_008269	GCG	2	6	256303	256308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025048
5082	NC_008269	TGA	2	6	256336	256341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111025048
5083	NC_008269	CGC	2	6	256367	256372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025048
5084	NC_008269	ATC	2	6	256389	256394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111025048
5085	NC_008269	CG	3	6	256426	256431	0 %	0 %	50 %	50 %	111025048
5086	NC_008269	GGC	2	6	256436	256441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025048
5087	NC_008269	CTC	2	6	256455	256460	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111025048
5088	NC_008269	CGT	2	6	256483	256488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025048
5089	NC_008269	TGC	2	6	256528	256533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025048
5090	NC_008269	CCCG	2	8	256544	256551	0 %	0 %	25 %	75 %	111025048
5091	NC_008269	GGC	2	6	256614	256619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025048
5092	NC_008269	CG	4	8	256624	256631	0 %	0 %	50 %	50 %	111025048
5093	NC_008269	ACC	2	6	256663	256668	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025048
5094	NC_008269	CGG	2	6	256739	256744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025048
5095	NC_008269	TGC	2	6	256759	256764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025048
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5097	NC_008269	CG	3	6	257057	257062	0 %	0 %	50 %	50 %	111025049
5098	NC_008269	CG	3	6	257098	257103	0 %	0 %	50 %	50 %	111025049
5099	NC_008269	CGA	2	6	257336	257341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025050
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5101	NC_008269	GAA	2	6	257413	257418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111025050
5102	NC_008269	CGA	3	9	257430	257438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025050
5103	NC_008269	GGT	2	6	257482	257487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025050
5104	NC_008269	TGA	2	6	257553	257558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111025050
5105	NC_008269	ATCCG	2	10	257566	257575	20 %	20 %	20 %	40 %	111025050
5106	NC_008269	GC	3	6	257586	257591	0 %	0 %	50 %	50 %	111025050
5107	NC_008269	GCG	2	6	257596	257601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025050
5108	NC_008269	GGCA	2	8	257666	257673	25 %	0 %	50 %	25 %	111025050
5109	NC_008269	CGA	2	6	257778	257783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025050
5110	NC_008269	GTT	2	6	257797	257802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111025050
5111	NC_008269	GACA	2	8	257809	257816	50 %	0 %	25 %	25 %	111025050
5112	NC_008269	CGTGG	2	10	258023	258032	0 %	20 %	60 %	20 %	111025051
5113	NC_008269	CAC	2	6	258053	258058	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025051
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5115	NC_008269	C	6	6	258182	258187	0 %	0 %	0 %	100 %	111025051
5116	NC_008269	ACCGCC	2	12	258188	258199	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	111025051
5117	NC_008269	GATC	2	8	258252	258259	25 %	25 %	25 %	25 %	111025051
5118	NC_008269	AAG	2	6	258306	258311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111025051
5119	NC_008269	CTT	2	6	258323	258328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111025051
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5121	NC_008269	CCA	2	6	258431	258436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025051
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5241	NC_008269	GCG	2	6	264945	264950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025058
5242	NC_008269	CCCCG	2	10	264974	264983	0 %	0 %	20 %	80 %	111025058
5243	NC_008269	CCG	2	6	265000	265005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025058
5244	NC_008269	CGG	2	6	265092	265097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025058
5245	NC_008269	CGA	2	6	265100	265105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025058
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5254	NC_008269	CGGT	2	8	265317	265324	0 %	25 %	50 %	25 %	111025058
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5262	NC_008269	CGG	3	9	265732	265740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025059
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5272	NC_008269	GCC	2	6	266124	266129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025059
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5362	NC_008269	GGT	2	6	270160	270165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025064
5363	NC_008269	GT	3	6	270170	270175	0 %	50 %	50 %	0 %	111025064
5364	NC_008269	GGC	2	6	270184	270189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025064
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5375	NC_008269	GCCG	2	8	270420	270427	0 %	0 %	50 %	50 %	111025064
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5484	NC_008269	TTG	2	6	275411	275416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111025070
5485	NC_008269	GGC	2	6	275490	275495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025070
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5487	NC_008269	CGA	2	6	275871	275876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025071
5488	NC_008269	CAG	2	6	275944	275949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025071
5489	NC_008269	GCA	2	6	275955	275960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025071
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5493	NC_008269	CG	3	6	276131	276136	0 %	0 %	50 %	50 %	111025071
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