MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 chromosome

Total Repeats: 142412

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008268	GGT	2	6	1403	1408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017023
2	NC_008268	TGG	2	6	1420	1425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017023
3	NC_008268	GGC	2	6	1460	1465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017023
4	NC_008268	GGT	2	6	1553	1558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017023
5	NC_008268	CTG	2	6	1568	1573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017023
6	NC_008268	GAG	2	6	1604	1609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111017023
7	NC_008268	GAT	2	6	1616	1621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111017023
8	NC_008268	TCG	2	6	1626	1631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017023
9	NC_008268	TGC	2	6	1639	1644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017023
10	NC_008268	CGC	2	6	1727	1732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017023
11	NC_008268	CGA	2	6	1747	1752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017023
12	NC_008268	GGT	2	6	1786	1791	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017023
13	NC_008268	GCG	2	6	1799	1804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017023
14	NC_008268	GGC	4	12	1855	1866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017023
15	NC_008268	CAG	2	6	1997	2002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017023
16	NC_008268	CAG	2	6	2009	2014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017023
17	NC_008268	TCG	2	6	2016	2021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017023
18	NC_008268	GCC	2	6	2075	2080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017023
19	NC_008268	GTA	2	6	2126	2131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111017023
20	NC_008268	CGA	2	6	2321	2326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017023
21	NC_008268	GCA	2	6	2344	2349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017023
22	NC_008268	GCG	2	6	2362	2367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017023
23	NC_008268	CCT	2	6	2416	2421	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111017023
24	NC_008268	CAA	2	6	2434	2439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111017023
25	NC_008268	ATC	2	6	2469	2474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111017023
26	NC_008268	ATC	2	6	2481	2486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111017023
27	NC_008268	ACC	2	6	3606	3611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017024
28	NC_008268	GTC	2	6	3663	3668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017024
29	NC_008268	CGC	2	6	3671	3676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017024
30	NC_008268	CGG	2	6	3677	3682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017024
31	NC_008268	GCA	2	6	3712	3717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017024
32	NC_008268	CCG	2	6	3769	3774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017024
33	NC_008268	GCC	2	6	3777	3782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017024
34	NC_008268	GAC	2	6	3822	3827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017024
35	NC_008268	GAC	2	6	3830	3835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017024
36	NC_008268	GAC	2	6	3838	3843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017024
37	NC_008268	CGA	2	6	3885	3890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017024
38	NC_008268	GCT	2	6	3921	3926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017024
39	NC_008268	CCG	2	6	3930	3935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017024
40	NC_008268	CGC	2	6	3948	3953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017024
41	NC_008268	CAC	2	6	3978	3983	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017024
42	NC_008268	CGA	2	6	4041	4046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017024
43	NC_008268	CGC	2	6	4101	4106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017024
44	NC_008268	ACT	2	6	4152	4157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111017025
45	NC_008268	CGC	2	6	4230	4235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017025
46	NC_008268	TCG	2	6	4300	4305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017025
47	NC_008268	CGC	2	6	4330	4335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017025
48	NC_008268	GGC	2	6	4413	4418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017025
49	NC_008268	GTT	2	6	4460	4465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111017025
50	NC_008268	CAC	2	6	4480	4485	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017025
51	NC_008268	GCC	3	9	4598	4606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017025
52	NC_008268	TGG	2	6	4640	4645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017025
53	NC_008268	AGG	2	6	4658	4663	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111017025
54	NC_008268	CAT	3	9	4679	4687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111017025
55	NC_008268	GAC	2	6	4695	4700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017025
56	NC_008268	GAG	2	6	4717	4722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111017025
57	NC_008268	CGC	2	6	4785	4790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017025
58	NC_008268	CTG	2	6	4912	4917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017025
59	NC_008268	CGC	2	6	4968	4973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017025
60	NC_008268	TCG	2	6	4976	4981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017025
61	NC_008268	CGC	2	6	4986	4991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017025
62	NC_008268	CGA	2	6	5016	5021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017025
63	NC_008268	GAT	2	6	5040	5045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111017025
64	NC_008268	ACG	2	6	5075	5080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017025
65	NC_008268	CTC	2	6	5113	5118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111017025
66	NC_008268	CCG	2	6	5147	5152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017025
67	NC_008268	CAC	2	6	5161	5166	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017025
68	NC_008268	CCA	2	6	5179	5184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017025
69	NC_008268	CGA	2	6	5229	5234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017025
70	NC_008268	CGC	2	6	5235	5240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017025
71	NC_008268	CGA	2	6	5304	5309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017025
72	NC_008268	CTG	2	6	6253	6258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017026
73	NC_008268	GCG	2	6	6336	6341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017026
74	NC_008268	ACC	2	6	6420	6425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017026
75	NC_008268	CAG	2	6	6473	6478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017026
76	NC_008268	ACG	2	6	6481	6486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017026
77	NC_008268	GTG	2	6	6528	6533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017026
78	NC_008268	GCG	2	6	6579	6584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017026
79	NC_008268	CGG	2	6	6654	6659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017026
80	NC_008268	CGG	2	6	6759	6764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017026
81	NC_008268	CGC	2	6	6859	6864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017026
82	NC_008268	ACC	2	6	6986	6991	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017027
83	NC_008268	CAC	2	6	7027	7032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017027
84	NC_008268	TGG	2	6	7092	7097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017027
85	NC_008268	GGC	2	6	7110	7115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017027
86	NC_008268	CAG	2	6	7118	7123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017027
87	NC_008268	CGA	2	6	7219	7224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017027
88	NC_008268	ACC	2	6	7403	7408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017027
89	NC_008268	CGA	2	6	7441	7446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017027
90	NC_008268	GGC	2	6	7456	7461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017027
91	NC_008268	CTG	2	6	7595	7600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017027
92	NC_008268	GGC	3	9	7635	7643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017027
93	NC_008268	CGA	2	6	7648	7653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017027
94	NC_008268	CGA	2	6	7727	7732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017027
95	NC_008268	CGA	2	6	7798	7803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017027
96	NC_008268	GTG	2	6	7805	7810	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017027
97	NC_008268	CAC	2	6	7822	7827	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017027
98	NC_008268	TGC	2	6	7830	7835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017027
99	NC_008268	ACG	2	6	7871	7876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017027
100	NC_008268	GCC	2	6	7925	7930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017027
101	NC_008268	CGC	2	6	7988	7993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017027
102	NC_008268	CGG	2	6	8019	8024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017027
103	NC_008268	CGC	2	6	8041	8046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017027
104	NC_008268	ATC	2	6	8159	8164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111017027
105	NC_008268	CGC	2	6	8170	8175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017027
106	NC_008268	CCG	2	6	8235	8240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017027
107	NC_008268	CGG	2	6	8254	8259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017027
108	NC_008268	CGC	2	6	8269	8274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017027
109	NC_008268	CAT	2	6	8305	8310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111017027
110	NC_008268	CGT	2	6	11276	11281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017028
111	NC_008268	GAA	2	6	11322	11327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111017028
112	NC_008268	TCG	2	6	11329	11334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017028
113	NC_008268	ATC	2	6	11344	11349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111017028
114	NC_008268	TCT	2	6	11372	11377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111017028
115	NC_008268	CAT	2	6	11403	11408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111017028
116	NC_008268	AGC	2	6	12474	12479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017029
117	NC_008268	CCG	2	6	12493	12498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017029
118	NC_008268	CGG	2	6	12499	12504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017029
119	NC_008268	GGC	2	6	12561	12566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017029
120	NC_008268	CTG	2	6	12624	12629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017029
121	NC_008268	ACC	2	6	12631	12636	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017029
122	NC_008268	ACG	2	6	12654	12659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017029
123	NC_008268	CAT	2	6	15112	15117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111017030
124	NC_008268	CGG	2	6	15129	15134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017030
125	NC_008268	CAC	2	6	15148	15153	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017030
126	NC_008268	CGG	2	6	15157	15162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017030
127	NC_008268	CAT	2	6	15217	15222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111017030
128	NC_008268	ACC	2	6	15399	15404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017031
129	NC_008268	CAA	2	6	15416	15421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111017031
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499	NC_008268	GTG	2	6	41169	41174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017056
500	NC_008268	AGC	2	6	41271	41276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017056

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