MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 chromosome

Total Repeats: 185852

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_008268	AGC	2	6	159858	159863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017163
3502	NC_008268	GCA	2	6	159889	159894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017163
3503	NC_008268	GAG	2	6	159926	159931	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111017163
3504	NC_008268	CGG	2	6	159961	159966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017163
3505	NC_008268	GCC	2	6	159971	159976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017163
3506	NC_008268	TCG	2	6	159987	159992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017163
3507	NC_008268	GCC	2	6	160159	160164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017163
3508	NC_008268	CGT	2	6	160201	160206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017163
3509	NC_008268	CGG	2	6	160261	160266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017163
3510	NC_008268	GCGG	2	8	160321	160328	0 %	0 %	75 %	25 %	111017163
3511	NC_008268	CGA	2	6	160333	160338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017163
3512	NC_008268	TCG	2	6	160401	160406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017163
3513	NC_008268	AC	3	6	160522	160527	50 %	0 %	0 %	50 %	111017163
3514	NC_008268	CGA	3	9	160531	160539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017163
3515	NC_008268	CGA	3	9	160549	160557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017163
3516	NC_008268	GGC	2	6	160561	160566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017163
3517	NC_008268	ACCAC	2	10	160588	160597	40 %	0 %	0 %	60 %	111017163
3518	NC_008268	GCG	2	6	160638	160643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017163
3519	NC_008268	CGC	2	6	160664	160669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017163
3520	NC_008268	CGG	2	6	160707	160712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017163
3521	NC_008268	CGG	2	6	160768	160773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017163
3522	NC_008268	GC	4	8	160786	160793	0 %	0 %	50 %	50 %	111017163
3523	NC_008268	CGG	2	6	160859	160864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017163
3524	NC_008268	CAG	2	6	160871	160876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017163
3525	NC_008268	CGC	2	6	160903	160908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017163
3526	NC_008268	AGC	2	6	160917	160922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017163
3527	NC_008268	GGT	2	6	160937	160942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017163
3528	NC_008268	TCG	2	6	160974	160979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017163
3529	NC_008268	GAC	3	9	160982	160990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017163
3530	NC_008268	CGG	2	6	160993	160998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017163
3531	NC_008268	CACC	2	8	160999	161006	25 %	0 %	0 %	75 %	111017163
3532	NC_008268	ACG	2	6	161008	161013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017163
3533	NC_008268	CAC	2	6	161069	161074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017163
3534	NC_008268	CGC	2	6	161078	161083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017163
3535	NC_008268	CG	3	6	161087	161092	0 %	0 %	50 %	50 %	111017163
3536	NC_008268	CCA	2	6	161095	161100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017163
3537	NC_008268	ATG	2	6	161112	161117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111017163
3538	NC_008268	CGC	2	6	161122	161127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017163
3539	NC_008268	GAA	2	6	161135	161140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111017163
3540	NC_008268	CCT	2	6	161200	161205	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111017163
3541	NC_008268	GC	3	6	161221	161226	0 %	0 %	50 %	50 %	111017163
3542	NC_008268	TCG	2	6	161307	161312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017163
3543	NC_008268	CCG	2	6	161355	161360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017163
3544	NC_008268	CGCC	2	8	161395	161402	0 %	0 %	25 %	75 %	111017163
3545	NC_008268	CGA	2	6	161419	161424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017163
3546	NC_008268	TGC	2	6	161440	161445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017163
3547	NC_008268	ACC	2	6	161460	161465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017163
3548	NC_008268	GC	3	6	161591	161596	0 %	0 %	50 %	50 %	111017163
3549	NC_008268	CCGGT	2	10	161604	161613	0 %	20 %	40 %	40 %	111017163
3550	NC_008268	CGA	2	6	161647	161652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017163
3551	NC_008268	CCG	2	6	161659	161664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017163
3552	NC_008268	CCCG	2	8	161670	161677	0 %	0 %	25 %	75 %	111017163
3553	NC_008268	CGG	2	6	161786	161791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017163
3554	NC_008268	ATC	2	6	161820	161825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111017163
3555	NC_008268	CCA	2	6	161908	161913	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017163
3556	NC_008268	CGG	2	6	161918	161923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017163
3557	NC_008268	CGC	2	6	161932	161937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017163
3558	NC_008268	GCC	2	6	161991	161996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017163
3559	NC_008268	TGA	2	6	162001	162006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111017163
3560	NC_008268	CGTG	2	8	162010	162017	0 %	25 %	50 %	25 %	111017163
3561	NC_008268	GCC	2	6	162053	162058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017163
3562	NC_008268	GACG	2	8	162062	162069	25 %	0 %	50 %	25 %	111017163
3563	NC_008268	AGC	2	6	162108	162113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017163
3564	NC_008268	CGA	2	6	162143	162148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017163
3565	NC_008268	TCG	2	6	162195	162200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017163
3566	NC_008268	GGTG	2	8	162223	162230	0 %	25 %	75 %	0 %	111017163
3567	NC_008268	ACG	2	6	162231	162236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017163
3568	NC_008268	GT	3	6	162305	162310	0 %	50 %	50 %	0 %	111017163
3569	NC_008268	GAC	2	6	162326	162331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017163
3570	NC_008268	CGG	2	6	162334	162339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017163
3571	NC_008268	GC	3	6	162343	162348	0 %	0 %	50 %	50 %	111017163
3572	NC_008268	TCG	3	9	162354	162362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017163
3573	NC_008268	ACG	2	6	162381	162386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017163
3574	NC_008268	GAGCGC	2	12	162431	162442	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	111017163
3575	NC_008268	CGGT	2	8	162474	162481	0 %	25 %	50 %	25 %	111017163
3576	NC_008268	GC	3	6	162560	162565	0 %	0 %	50 %	50 %	111017163
3577	NC_008268	CCA	2	6	162577	162582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017163
3578	NC_008268	TCG	2	6	162639	162644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017163
3579	NC_008268	GCC	2	6	162687	162692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017163
3580	NC_008268	GGCCGC	2	12	162707	162718	0 %	0 %	50 %	50 %	111017163
3581	NC_008268	GTCC	2	8	162754	162761	0 %	25 %	25 %	50 %	111017163
3582	NC_008268	CCA	2	6	162793	162798	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017163
3583	NC_008268	CCG	2	6	162934	162939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017163
3584	NC_008268	GGTGAG	2	12	162965	162976	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	111017163
3585	NC_008268	GTT	2	6	163058	163063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111017163
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3587	NC_008268	GCG	2	6	163090	163095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017163
3588	NC_008268	CG	3	6	163106	163111	0 %	0 %	50 %	50 %	111017163
3589	NC_008268	GTG	2	6	163157	163162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017163
3590	NC_008268	CAG	2	6	163196	163201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017163
3591	NC_008268	GCCG	2	8	163214	163221	0 %	0 %	50 %	50 %	111017163
3592	NC_008268	GCA	2	6	163237	163242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017163
3593	NC_008268	GTC	2	6	163271	163276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017163
3594	NC_008268	GCG	2	6	163281	163286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017163
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3596	NC_008268	CAG	2	6	163346	163351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017163
3597	NC_008268	AC	3	6	163381	163386	50 %	0 %	0 %	50 %	111017163
3598	NC_008268	CGC	2	6	163459	163464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017163
3599	NC_008268	CTG	2	6	163472	163477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017163
3600	NC_008268	GGT	2	6	163489	163494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017163
3601	NC_008268	GAG	2	6	163508	163513	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111017163
3602	NC_008268	AGT	2	6	163543	163548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111017163
3603	NC_008268	CAG	2	6	163562	163567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017163
3604	NC_008268	GTC	2	6	163577	163582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017163
3605	NC_008268	TGC	2	6	163602	163607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017163
3606	NC_008268	GCG	2	6	163639	163644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017163
3607	NC_008268	TCA	2	6	163687	163692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111017163
3608	NC_008268	TGG	2	6	163737	163742	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017163
3609	NC_008268	ACG	2	6	163743	163748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017163
3610	NC_008268	GCG	2	6	163788	163793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017163
3611	NC_008268	GCACCG	2	12	163795	163806	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	111017163
3612	NC_008268	CGT	2	6	163868	163873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017163
3613	NC_008268	CAC	2	6	163895	163900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017163
3614	NC_008268	TCGG	2	8	163905	163912	0 %	25 %	50 %	25 %	111017163
3615	NC_008268	CCA	2	6	163939	163944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017163
3616	NC_008268	TCG	2	6	164013	164018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017163
3617	NC_008268	ACCGC	2	10	164032	164041	20 %	0 %	20 %	60 %	111017163
3618	NC_008268	TGT	2	6	164050	164055	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111017163
3619	NC_008268	TGA	2	6	164083	164088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111017163
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3621	NC_008268	CCA	2	6	164143	164148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017163
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3982	NC_008268	GGC	2	6	178226	178231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017166
3983	NC_008268	GCCG	2	8	178255	178262	0 %	0 %	50 %	50 %	111017166
3984	NC_008268	GGCGA	2	10	178313	178322	20 %	0 %	60 %	20 %	111017166
3985	NC_008268	GTG	2	6	178345	178350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017166
3986	NC_008268	CGG	2	6	178396	178401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017166
3987	NC_008268	GTG	2	6	178419	178424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017166
3988	NC_008268	AGGCG	2	10	178459	178468	20 %	0 %	60 %	20 %	111017166
3989	NC_008268	GATC	2	8	178486	178493	25 %	25 %	25 %	25 %	111017166
3990	NC_008268	CGC	2	6	178504	178509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017166
3991	NC_008268	GCA	2	6	178516	178521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017166
3992	NC_008268	CAG	2	6	178538	178543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017166
3993	NC_008268	TCGA	2	8	178545	178552	25 %	25 %	25 %	25 %	111017166
3994	NC_008268	CAC	2	6	178571	178576	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017166
3995	NC_008268	CGAT	2	8	178596	178603	25 %	25 %	25 %	25 %	111017166
3996	NC_008268	CGG	2	6	178629	178634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017166
3997	NC_008268	GAA	2	6	178667	178672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111017166
3998	NC_008268	GC	3	6	178694	178699	0 %	0 %	50 %	50 %	111017166
3999	NC_008268	CGT	2	6	178727	178732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017166
4000	NC_008268	CGG	2	6	178733	178738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017166

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