MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 chromosome

Total Repeats: 185852

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_008268	GCC	2	6	76417	76422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017093
1502	NC_008268	CGA	2	6	76434	76439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017093
1503	NC_008268	TGG	2	6	76449	76454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017093
1504	NC_008268	TCC	2	6	76482	76487	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111017093
1505	NC_008268	TCT	2	6	76497	76502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111017093
1506	NC_008268	CGT	2	6	76528	76533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017093
1507	NC_008268	TCT	2	6	76545	76550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111017093
1508	NC_008268	ACACCG	2	12	76551	76562	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	111017093
1509	NC_008268	GCT	2	6	76600	76605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017093
1510	NC_008268	CCG	2	6	76633	76638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017093
1511	NC_008268	GCCGCG	2	12	76670	76681	0 %	0 %	50 %	50 %	111017093
1512	NC_008268	ACGG	2	8	76688	76695	25 %	0 %	50 %	25 %	111017093
1513	NC_008268	CGT	2	6	76699	76704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017093
1514	NC_008268	CGGG	2	8	76874	76881	0 %	0 %	75 %	25 %	111017094
1515	NC_008268	GCA	2	6	76901	76906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017094
1516	NC_008268	CAG	2	6	76923	76928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017094
1517	NC_008268	CTG	2	6	76995	77000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017094
1518	NC_008268	CCA	2	6	77069	77074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017094
1519	NC_008268	GGT	2	6	77108	77113	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017094
1520	NC_008268	CGA	2	6	77215	77220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017094
1521	NC_008268	CGA	2	6	77234	77239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017094
1522	NC_008268	CAC	2	6	77265	77270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017094
1523	NC_008268	GCG	2	6	77289	77294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017094
1524	NC_008268	ATG	2	6	77295	77300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111017094
1525	NC_008268	CCG	2	6	77314	77319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017094
1526	NC_008268	CGG	2	6	77389	77394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017094
1527	NC_008268	ACG	2	6	77395	77400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017094
1528	NC_008268	GCC	2	6	77468	77473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017094
1529	NC_008268	GAC	2	6	77491	77496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017094
1530	NC_008268	TGG	2	6	77524	77529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017094
1531	NC_008268	GCA	2	6	77548	77553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017094
1532	NC_008268	GGT	4	12	77600	77611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017094
1533	NC_008268	GGC	2	6	77612	77617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017094
1534	NC_008268	CGC	2	6	77621	77626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017094
1535	NC_008268	CGA	2	6	77651	77656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017094
1536	NC_008268	GGT	2	6	77712	77717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017094
1537	NC_008268	TCC	2	6	77731	77736	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111017094
1538	NC_008268	CGGCAC	2	12	77756	77767	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	111017094
1539	NC_008268	GCGG	2	8	77783	77790	0 %	0 %	75 %	25 %	111017094
1540	NC_008268	TCA	2	6	77819	77824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111017094
1541	NC_008268	CCG	2	6	77831	77836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017094
1542	NC_008268	CGGTC	2	10	77888	77897	0 %	20 %	40 %	40 %	111017094
1543	NC_008268	GAC	2	6	77963	77968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017094
1544	NC_008268	ACC	2	6	78008	78013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017094
1545	NC_008268	ACG	2	6	78058	78063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017094
1546	NC_008268	GCC	3	9	78120	78128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017094
1547	NC_008268	GGATC	2	10	78230	78239	20 %	20 %	40 %	20 %	111017094
1548	NC_008268	CGC	2	6	78242	78247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017094
1549	NC_008268	CGT	2	6	78251	78256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017094
1550	NC_008268	CCCG	2	8	78259	78266	0 %	0 %	25 %	75 %	111017094
1551	NC_008268	GTG	2	6	78297	78302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017094
1552	NC_008268	CGA	2	6	78317	78322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017094
1553	NC_008268	GCC	2	6	78324	78329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017094
1554	NC_008268	TGG	2	6	78379	78384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017094
1555	NC_008268	CGGCG	2	10	78443	78452	0 %	0 %	60 %	40 %	111017094
1556	NC_008268	ACCC	2	8	78471	78478	25 %	0 %	0 %	75 %	111017094
1557	NC_008268	ACCG	2	8	78480	78487	25 %	0 %	25 %	50 %	111017094
1558	NC_008268	GCG	2	6	78516	78521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017094
1559	NC_008268	GC	3	6	78543	78548	0 %	0 %	50 %	50 %	111017094
1560	NC_008268	CAC	2	6	78560	78565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017094
1561	NC_008268	GCTG	2	8	78571	78578	0 %	25 %	50 %	25 %	111017094
1562	NC_008268	CGA	2	6	78584	78589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017094
1563	NC_008268	GAC	2	6	78594	78599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017094
1564	NC_008268	CCG	2	6	78603	78608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017094
1565	NC_008268	CA	3	6	78701	78706	50 %	0 %	0 %	50 %	111017094
1566	NC_008268	TGC	2	6	78772	78777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017094
1567	NC_008268	CGG	2	6	78833	78838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017094
1568	NC_008268	CCGA	2	8	78858	78865	25 %	0 %	25 %	50 %	111017094
1569	NC_008268	CGG	2	6	78872	78877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017094
1570	NC_008268	CTG	2	6	78894	78899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017094
1571	NC_008268	CTG	2	6	78921	78926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017094
1572	NC_008268	GACTC	2	10	78964	78973	20 %	20 %	20 %	40 %	111017094
1573	NC_008268	TCG	2	6	78988	78993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017094
1574	NC_008268	ACC	2	6	79243	79248	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017094
1575	NC_008268	GAC	2	6	79249	79254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017094
1576	NC_008268	TCG	2	6	79276	79281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017094
1577	NC_008268	CGA	2	6	79376	79381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017094
1578	NC_008268	CCA	2	6	79462	79467	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017094
1579	NC_008268	CAT	2	6	79514	79519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111017094
1580	NC_008268	GCG	2	6	79523	79528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017094
1581	NC_008268	GATC	2	8	79600	79607	25 %	25 %	25 %	25 %	111017094
1582	NC_008268	CGA	2	6	79636	79641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017094
1583	NC_008268	GC	3	6	79657	79662	0 %	0 %	50 %	50 %	111017094
1584	NC_008268	ACG	2	6	79683	79688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017094
1585	NC_008268	ACG	2	6	79713	79718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017094
1586	NC_008268	CCG	2	6	79765	79770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017094
1587	NC_008268	CGG	2	6	79774	79779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017094
1588	NC_008268	TTC	2	6	79788	79793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111017094
1589	NC_008268	CGG	2	6	79799	79804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017094
1590	NC_008268	GGT	2	6	79826	79831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017094
1591	NC_008268	CGACG	2	10	79853	79862	20 %	0 %	40 %	40 %	111017094
1592	NC_008268	CGA	2	6	79919	79924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017094
1593	NC_008268	CGC	2	6	79967	79972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017094
1594	NC_008268	CCG	2	6	79975	79980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017094
1595	NC_008268	GCA	2	6	80009	80014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017094
1596	NC_008268	CCA	2	6	80032	80037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017094
1597	NC_008268	CGC	2	6	80041	80046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017094
1598	NC_008268	GC	3	6	80127	80132	0 %	0 %	50 %	50 %	111017094
1599	NC_008268	CGG	3	9	80164	80172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017094
1600	NC_008268	CTG	2	6	80187	80192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017094
1601	NC_008268	CGA	2	6	80198	80203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017094
1602	NC_008268	CCG	2	6	80230	80235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017094
1603	NC_008268	CGA	2	6	80240	80245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017094
1604	NC_008268	GC	3	6	80309	80314	0 %	0 %	50 %	50 %	111017094
1605	NC_008268	CG	4	8	80333	80340	0 %	0 %	50 %	50 %	111017094
1606	NC_008268	CCT	2	6	80345	80350	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111017094
1607	NC_008268	GT	3	6	80354	80359	0 %	50 %	50 %	0 %	111017094
1608	NC_008268	CCA	2	6	80363	80368	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017094
1609	NC_008268	CGGA	2	8	80377	80384	25 %	0 %	50 %	25 %	111017094
1610	NC_008268	CGCTGG	2	12	80389	80400	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	111017094
1611	NC_008268	GCC	2	6	80462	80467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017094
1612	NC_008268	GT	3	6	80491	80496	0 %	50 %	50 %	0 %	111017094
1613	NC_008268	GCGTC	2	10	80536	80545	0 %	20 %	40 %	40 %	111017094
1614	NC_008268	GCA	2	6	80546	80551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017094
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1616	NC_008268	CAC	2	6	80625	80630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017094
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1618	NC_008268	TCGC	2	8	80694	80701	0 %	25 %	25 %	50 %	111017094
1619	NC_008268	GAC	2	6	80829	80834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017094
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1622	NC_008268	TCG	2	6	80971	80976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017094
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1624	NC_008268	TTC	2	6	81015	81020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111017094
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1996	NC_008268	CCGTG	2	10	95655	95664	0 %	20 %	40 %	40 %	111017111
1997	NC_008268	CAA	2	6	95677	95682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111017111
1998	NC_008268	GGA	2	6	95746	95751	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111017111
1999	NC_008268	CTG	2	6	95759	95764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017111
2000	NC_008268	TTCCG	2	10	95808	95817	0 %	40 %	20 %	40 %	111017112

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