MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 chromosome

Total Repeats: 185852

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_008268	CCG	2	6	55771	55776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017071
1003	NC_008268	TGC	2	6	55780	55785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017071
1004	NC_008268	CGA	2	6	55796	55801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017071
1005	NC_008268	GTG	2	6	55887	55892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017071
1006	NC_008268	CGG	2	6	55900	55905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017071
1007	NC_008268	TCGGA	2	10	55914	55923	20 %	20 %	40 %	20 %	111017071
1008	NC_008268	GGCGCT	2	12	56048	56059	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	111017071
1009	NC_008268	CGA	2	6	56132	56137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017071
1010	NC_008268	GGC	2	6	56171	56176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017071
1011	NC_008268	ATCGC	2	10	56242	56251	20 %	20 %	20 %	40 %	111017071
1012	NC_008268	GC	3	6	56250	56255	0 %	0 %	50 %	50 %	111017071
1013	NC_008268	AGC	2	6	56344	56349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017071
1014	NC_008268	TCGA	2	8	56361	56368	25 %	25 %	25 %	25 %	111017071
1015	NC_008268	CGTG	2	8	56384	56391	0 %	25 %	50 %	25 %	111017071
1016	NC_008268	CGG	2	6	56420	56425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017071
1017	NC_008268	G	7	7	56429	56435	0 %	0 %	100 %	0 %	111017071
1018	NC_008268	CGG	3	9	56448	56456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017071
1019	NC_008268	TCG	2	6	56467	56472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017071
1020	NC_008268	ACC	2	6	56478	56483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017071
1021	NC_008268	CGC	2	6	56540	56545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017071
1022	NC_008268	ACGGTC	2	12	56616	56627	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	111017071
1023	NC_008268	GAC	2	6	56667	56672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017071
1024	NC_008268	CGT	2	6	56693	56698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017071
1025	NC_008268	CCGC	2	8	56940	56947	0 %	0 %	25 %	75 %	111017072
1026	NC_008268	AGG	2	6	57012	57017	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111017072
1027	NC_008268	CTT	2	6	57103	57108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111017072
1028	NC_008268	CGA	3	9	57109	57117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017072
1029	NC_008268	GGCT	2	8	57138	57145	0 %	25 %	50 %	25 %	111017072
1030	NC_008268	CGC	2	6	57160	57165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017072
1031	NC_008268	GCCG	2	8	57220	57227	0 %	0 %	50 %	50 %	111017072
1032	NC_008268	CTC	2	6	57233	57238	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111017072
1033	NC_008268	CCG	2	6	57252	57257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017072
1034	NC_008268	GTC	3	9	57263	57271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017072
1035	NC_008268	ATC	2	6	57290	57295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111017072
1036	NC_008268	CCAC	2	8	57333	57340	25 %	0 %	0 %	75 %	111017072
1037	NC_008268	ATC	2	6	57359	57364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111017072
1038	NC_008268	GTC	2	6	57407	57412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017072
1039	NC_008268	GGCC	2	8	57469	57476	0 %	0 %	50 %	50 %	111017072
1040	NC_008268	CTG	2	6	57590	57595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017072
1041	NC_008268	GCCG	2	8	57608	57615	0 %	0 %	50 %	50 %	111017072
1042	NC_008268	GTC	2	6	57653	57658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017072
1043	NC_008268	CCGG	2	8	57664	57671	0 %	0 %	50 %	50 %	111017072
1044	NC_008268	CGG	2	6	57733	57738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017072
1045	NC_008268	CGA	2	6	57762	57767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017072
1046	NC_008268	TCCG	2	8	57785	57792	0 %	25 %	25 %	50 %	111017072
1047	NC_008268	CTC	2	6	57800	57805	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111017072
1048	NC_008268	AGT	2	6	57865	57870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111017073
1049	NC_008268	TCC	2	6	57876	57881	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111017073
1050	NC_008268	A	7	7	57887	57893	100 %	0 %	0 %	0 %	111017073
1051	NC_008268	GCA	2	6	57895	57900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017073
1052	NC_008268	GTC	2	6	57932	57937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017073
1053	NC_008268	CGAT	2	8	58008	58015	25 %	25 %	25 %	25 %	111017073
1054	NC_008268	CCG	2	6	58051	58056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017073
1055	NC_008268	GC	3	6	58101	58106	0 %	0 %	50 %	50 %	111017073
1056	NC_008268	GT	3	6	58137	58142	0 %	50 %	50 %	0 %	111017073
1057	NC_008268	CCG	2	6	58153	58158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017073
1058	NC_008268	GTC	2	6	58232	58237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017073
1059	NC_008268	CAG	2	6	58262	58267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017073
1060	NC_008268	GGA	2	6	58295	58300	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111017073
1061	NC_008268	GCC	2	6	58304	58309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017073
1062	NC_008268	GC	3	6	58317	58322	0 %	0 %	50 %	50 %	111017073
1063	NC_008268	GCA	2	6	58360	58365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017073
1064	NC_008268	CGC	2	6	58397	58402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017073
1065	NC_008268	CAG	2	6	58415	58420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017073
1066	NC_008268	CCG	2	6	58469	58474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017073
1067	NC_008268	GTC	2	6	58515	58520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017073
1068	NC_008268	CGG	2	6	58531	58536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017073
1069	NC_008268	CTC	2	6	58555	58560	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111017073
1070	NC_008268	GC	3	6	58561	58566	0 %	0 %	50 %	50 %	111017073
1071	NC_008268	CCGA	2	8	58578	58585	25 %	0 %	25 %	50 %	111017073
1072	NC_008268	CGC	2	6	58586	58591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017073
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1074	NC_008268	TCC	2	6	58650	58655	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111017073
1075	NC_008268	CTG	2	6	58660	58665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017073
1076	NC_008268	CGA	2	6	58711	58716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017073
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1078	NC_008268	GCC	2	6	58782	58787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017073
1079	NC_008268	CGA	2	6	58818	58823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017073
1080	NC_008268	GCA	2	6	58834	58839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017073
1081	NC_008268	GCC	3	9	58878	58886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017073
1082	NC_008268	ACG	2	6	58977	58982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017073
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1084	NC_008268	GC	3	6	59031	59036	0 %	0 %	50 %	50 %	111017074
1085	NC_008268	CCCTCG	2	12	59040	59051	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	111017074
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1087	NC_008268	TCG	2	6	59123	59128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017074
1088	NC_008268	GGC	2	6	59143	59148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017074
1089	NC_008268	GTC	2	6	59177	59182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017074
1090	NC_008268	TCCA	2	8	59198	59205	25 %	25 %	0 %	50 %	111017074
1091	NC_008268	CCG	2	6	59347	59352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017075
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1093	NC_008268	GAC	2	6	59386	59391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017075
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1095	NC_008268	TG	3	6	59452	59457	0 %	50 %	50 %	0 %	111017075
1096	NC_008268	GGTC	2	8	59486	59493	0 %	25 %	50 %	25 %	111017075
1097	NC_008268	GCG	2	6	59503	59508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017075
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1099	NC_008268	GC	3	6	59604	59609	0 %	0 %	50 %	50 %	111017075
1100	NC_008268	CCG	2	6	59696	59701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017075
1101	NC_008268	GTG	2	6	59768	59773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017075
1102	NC_008268	TCC	2	6	59794	59799	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111017075
1103	NC_008268	GAC	3	9	59852	59860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017075
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1105	NC_008268	CGC	2	6	60283	60288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017076
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1107	NC_008268	CGT	3	9	60305	60313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017076
1108	NC_008268	GAC	2	6	60339	60344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017076
1109	NC_008268	ACG	2	6	60376	60381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017076
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1111	NC_008268	CGG	2	6	60482	60487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017076
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1113	NC_008268	TGC	2	6	60607	60612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017076
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1116	NC_008268	CGG	2	6	60661	60666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017076
1117	NC_008268	ACCTCG	4	24	60754	60777	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	111017076
1118	NC_008268	CGGCG	2	10	60805	60814	0 %	0 %	60 %	40 %	111017076
1119	NC_008268	CGT	2	6	60821	60826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017076
1120	NC_008268	GA	3	6	60855	60860	50 %	0 %	50 %	0 %	111017077
1121	NC_008268	GCAG	2	8	60881	60888	25 %	0 %	50 %	25 %	111017077
1122	NC_008268	GTC	2	6	60933	60938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017077
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1124	NC_008268	GAA	2	6	60965	60970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111017077
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1369	NC_008268	CGGTT	2	10	71735	71744	0 %	40 %	40 %	20 %	111017088
1370	NC_008268	CGA	2	6	71783	71788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017088
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1498	NC_008268	CGC	2	6	76348	76353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017093
1499	NC_008268	CTC	2	6	76355	76360	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111017093
1500	NC_008268	CGC	2	6	76408	76413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017093

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