MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 chromosome

Total Repeats: 185852

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008268	GTTCG	2	10	34448	34457	0 %	40 %	40 %	20 %	111017049
502	NC_008268	TCCG	2	8	34460	34467	0 %	25 %	25 %	50 %	111017049
503	NC_008268	CGA	2	6	34487	34492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017049
504	NC_008268	TCG	2	6	34526	34531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017049
505	NC_008268	GAA	2	6	34549	34554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111017049
506	NC_008268	CAC	2	6	34625	34630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017049
507	NC_008268	GCA	2	6	34670	34675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017049
508	NC_008268	TGT	2	6	34736	34741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111017049
509	NC_008268	GC	3	6	34751	34756	0 %	0 %	50 %	50 %	111017049
510	NC_008268	GTCG	2	8	34790	34797	0 %	25 %	50 %	25 %	111017049
511	NC_008268	CG	4	8	34812	34819	0 %	0 %	50 %	50 %	111017049
512	NC_008268	GCA	2	6	35100	35105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017050
513	NC_008268	TCG	2	6	35115	35120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017050
514	NC_008268	CGA	3	9	35163	35171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017050
515	NC_008268	CA	3	6	35185	35190	50 %	0 %	0 %	50 %	111017050
516	NC_008268	CGA	2	6	35226	35231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017050
517	NC_008268	TC	3	6	35232	35237	0 %	50 %	0 %	50 %	111017050
518	NC_008268	ATCG	2	8	35256	35263	25 %	25 %	25 %	25 %	111017050
519	NC_008268	GGGC	2	8	35306	35313	0 %	0 %	75 %	25 %	111017050
520	NC_008268	GGC	2	6	35345	35350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017050
521	NC_008268	CCA	2	6	35376	35381	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017050
522	NC_008268	GCG	2	6	35382	35387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017050
523	NC_008268	CGG	2	6	35409	35414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017050
524	NC_008268	CGA	2	6	35457	35462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017050
525	NC_008268	CG	3	6	35467	35472	0 %	0 %	50 %	50 %	111017050
526	NC_008268	CAC	2	6	35509	35514	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017050
527	NC_008268	GTGA	2	8	35526	35533	25 %	25 %	50 %	0 %	111017050
528	NC_008268	CAC	2	6	35599	35604	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017050
529	NC_008268	CCG	3	9	35640	35648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017050
530	NC_008268	GGTA	2	8	35656	35663	25 %	25 %	50 %	0 %	111017050
531	NC_008268	AGA	2	6	35784	35789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111017050
532	NC_008268	GCA	2	6	35802	35807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017050
533	NC_008268	CGG	2	6	35850	35855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017050
534	NC_008268	GC	3	6	35860	35865	0 %	0 %	50 %	50 %	111017050
535	NC_008268	CGA	3	9	35898	35906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017050
536	NC_008268	GA	3	6	35914	35919	50 %	0 %	50 %	0 %	111017050
537	NC_008268	CAC	2	6	35949	35954	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017051
538	NC_008268	CGA	2	6	35972	35977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017051
539	NC_008268	TGC	3	9	36021	36029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017051
540	NC_008268	ACC	2	6	36112	36117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017051
541	NC_008268	GGC	2	6	36195	36200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017051
542	NC_008268	TCCCC	2	10	36302	36311	0 %	20 %	0 %	80 %	111017051
543	NC_008268	CCG	2	6	36332	36337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017051
544	NC_008268	TCCG	2	8	36386	36393	0 %	25 %	25 %	50 %	111017051
545	NC_008268	AGC	2	6	36412	36417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017051
546	NC_008268	TCC	2	6	36436	36441	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111017051
547	NC_008268	CCG	3	9	36452	36460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017051
548	NC_008268	AGC	2	6	36487	36492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017051
549	NC_008268	CAG	2	6	36510	36515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017051
550	NC_008268	CAC	2	6	36645	36650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017051
551	NC_008268	CCA	2	6	36659	36664	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017051
552	NC_008268	CGA	2	6	36677	36682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017051
553	NC_008268	GCA	2	6	36737	36742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017051
554	NC_008268	CGA	2	6	36810	36815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017052
555	NC_008268	CGG	2	6	36833	36838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017052
556	NC_008268	CGG	2	6	36957	36962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017052
557	NC_008268	GCA	2	6	37029	37034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017052
558	NC_008268	CTG	2	6	37054	37059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017052
559	NC_008268	GAC	2	6	37079	37084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017052
560	NC_008268	CCG	2	6	37097	37102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017052
561	NC_008268	GAT	2	6	37120	37125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111017052
562	NC_008268	CCG	2	6	37160	37165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017052
563	NC_008268	TCG	2	6	37172	37177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017052
564	NC_008268	CAG	2	6	37183	37188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017052
565	NC_008268	GATCGA	4	24	37263	37286	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	111017052
566	NC_008268	GAA	2	6	37342	37347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111017052
567	NC_008268	TGC	2	6	37355	37360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017052
568	NC_008268	AG	3	6	37380	37385	50 %	0 %	50 %	0 %	111017052
569	NC_008268	CGA	2	6	37412	37417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017052
570	NC_008268	GCC	2	6	37430	37435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017052
571	NC_008268	GCA	2	6	37482	37487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017052
572	NC_008268	CGA	2	6	37560	37565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017052
573	NC_008268	ACCGA	2	10	37595	37604	40 %	0 %	20 %	40 %	111017052
574	NC_008268	GAG	2	6	37820	37825	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111017053
575	NC_008268	CGA	2	6	37849	37854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017053
576	NC_008268	CGT	2	6	37858	37863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017053
577	NC_008268	GTC	2	6	38009	38014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017053
578	NC_008268	GCG	2	6	38024	38029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017053
579	NC_008268	ATC	2	6	38034	38039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111017053
580	NC_008268	CGA	2	6	38118	38123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017053
581	NC_008268	ACG	2	6	38136	38141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017053
582	NC_008268	CGACTT	2	12	38158	38169	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	111017053
583	NC_008268	CGGTC	2	10	38212	38221	0 %	20 %	40 %	40 %	111017053
584	NC_008268	CGCGT	2	10	38262	38271	0 %	20 %	40 %	40 %	111017053
585	NC_008268	CTG	2	6	38288	38293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017053
586	NC_008268	TGG	2	6	38384	38389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017053
587	NC_008268	CGG	2	6	38421	38426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017053
588	NC_008268	GCCG	2	8	38483	38490	0 %	0 %	50 %	50 %	111017053
589	NC_008268	ACG	2	6	38496	38501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017053
590	NC_008268	CGG	2	6	38617	38622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017053
591	NC_008268	GAT	2	6	38674	38679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111017053
592	NC_008268	GAA	2	6	38740	38745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111017053
593	NC_008268	GCC	3	9	38799	38807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017053
594	NC_008268	CCG	2	6	38887	38892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017054
595	NC_008268	CCG	2	6	38896	38901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017054
596	NC_008268	CCG	3	9	38934	38942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017054
597	NC_008268	GAC	2	6	38972	38977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017054
598	NC_008268	ATG	2	6	39018	39023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111017054
599	NC_008268	GCCC	2	8	39056	39063	0 %	0 %	25 %	75 %	111017054
600	NC_008268	GAC	2	6	39125	39130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017054
601	NC_008268	CGGACA	2	12	39196	39207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017054
602	NC_008268	CG	3	6	39243	39248	0 %	0 %	50 %	50 %	111017054
603	NC_008268	CCG	2	6	39250	39255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017054
604	NC_008268	CGT	2	6	39265	39270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017054
605	NC_008268	CGG	2	6	39273	39278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017054
606	NC_008268	CAC	2	6	39299	39304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017054
607	NC_008268	CGG	2	6	39314	39319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017055
608	NC_008268	GTGG	2	8	39340	39347	0 %	25 %	75 %	0 %	111017055
609	NC_008268	GTTC	2	8	39380	39387	0 %	50 %	25 %	25 %	111017055
610	NC_008268	CGT	2	6	39394	39399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017055
611	NC_008268	TCG	3	9	39404	39412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017055
612	NC_008268	CG	3	6	39436	39441	0 %	0 %	50 %	50 %	111017055
613	NC_008268	GGC	2	6	39460	39465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017055
614	NC_008268	CGG	2	6	39481	39486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017055
615	NC_008268	TGG	2	6	39492	39497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017055
616	NC_008268	CGG	2	6	39513	39518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017055
617	NC_008268	CAG	2	6	39541	39546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017055
618	NC_008268	CGTA	2	8	39580	39587	25 %	25 %	25 %	25 %	111017055
619	NC_008268	CGG	2	6	39597	39602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017055
620	NC_008268	GAT	2	6	39634	39639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111017055
621	NC_008268	ACC	2	6	39665	39670	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017055
622	NC_008268	GAC	2	6	39682	39687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017055
623	NC_008268	TGC	2	6	39690	39695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017055
624	NC_008268	GC	3	6	39714	39719	0 %	0 %	50 %	50 %	111017055
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626	NC_008268	GGC	2	6	39745	39750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017055
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