MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 chromosome

Total Repeats: 185852

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_008268	CCG	2	6	264959	264964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017237
6002	NC_008268	TGGG	2	8	264980	264987	0 %	25 %	75 %	0 %	111017237
6003	NC_008268	CTG	2	6	264988	264993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017237
6004	NC_008268	GCA	2	6	265004	265009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017237
6005	NC_008268	CAC	2	6	265017	265022	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017237
6006	NC_008268	CGC	2	6	265065	265070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017237
6007	NC_008268	TCC	2	6	265129	265134	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111017237
6008	NC_008268	CGC	2	6	265203	265208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017237
6009	NC_008268	CGA	2	6	265221	265226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017237
6010	NC_008268	CCCG	2	8	265242	265249	0 %	0 %	25 %	75 %	111017237
6011	NC_008268	TCC	2	6	265330	265335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111017237
6012	NC_008268	GGGC	2	8	265349	265356	0 %	0 %	75 %	25 %	111017237
6013	NC_008268	GC	3	6	265373	265378	0 %	0 %	50 %	50 %	111017237
6014	NC_008268	GTT	2	6	265383	265388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111017237
6015	NC_008268	CGC	2	6	265413	265418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017237
6016	NC_008268	GTCAC	2	10	265456	265465	20 %	20 %	20 %	40 %	111017237
6017	NC_008268	TG	3	6	265484	265489	0 %	50 %	50 %	0 %	111017237
6018	NC_008268	CG	3	6	265492	265497	0 %	0 %	50 %	50 %	111017237
6019	NC_008268	TCC	2	6	265596	265601	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111017237
6020	NC_008268	CGG	2	6	265847	265852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017238
6021	NC_008268	CGCGGC	2	12	265887	265898	0 %	0 %	50 %	50 %	111017238
6022	NC_008268	CA	3	6	265932	265937	50 %	0 %	0 %	50 %	111017238
6023	NC_008268	TCC	2	6	266023	266028	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111017238
6024	NC_008268	GGC	2	6	266080	266085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017238
6025	NC_008268	GGTC	2	8	266102	266109	0 %	25 %	50 %	25 %	111017238
6026	NC_008268	GCCC	2	8	266176	266183	0 %	0 %	25 %	75 %	111017239
6027	NC_008268	TCTCG	2	10	266240	266249	0 %	40 %	20 %	40 %	111017239
6028	NC_008268	ATCCG	2	10	266250	266259	20 %	20 %	20 %	40 %	111017239
6029	NC_008268	GGC	2	6	266267	266272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017239
6030	NC_008268	CGC	2	6	266300	266305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017239
6031	NC_008268	CTC	2	6	266312	266317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111017239
6032	NC_008268	CCG	2	6	266382	266387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017239
6033	NC_008268	CGG	2	6	266431	266436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017239
6034	NC_008268	GTC	2	6	266543	266548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017239
6035	NC_008268	GCC	2	6	266678	266683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017239
6036	NC_008268	CCG	2	6	266704	266709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017239
6037	NC_008268	CGGC	2	8	266714	266721	0 %	0 %	50 %	50 %	111017239
6038	NC_008268	ACG	2	6	266752	266757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017239
6039	NC_008268	CCGTC	2	10	266768	266777	0 %	20 %	20 %	60 %	111017239
6040	NC_008268	GGC	2	6	267017	267022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017240
6041	NC_008268	TCG	2	6	267042	267047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017240
6042	NC_008268	GGC	2	6	267071	267076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017240
6043	NC_008268	GCC	3	9	267110	267118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017240
6044	NC_008268	CAC	2	6	267190	267195	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017240
6045	NC_008268	GACGC	2	10	267205	267214	20 %	0 %	40 %	40 %	111017240
6046	NC_008268	GCGTG	2	10	267238	267247	0 %	20 %	60 %	20 %	111017240
6047	NC_008268	AGC	2	6	267304	267309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017240
6048	NC_008268	TGC	2	6	267327	267332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017240
6049	NC_008268	ACG	2	6	267357	267362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017240
6050	NC_008268	CGGC	2	8	267465	267472	0 %	0 %	50 %	50 %	111017240
6051	NC_008268	TGC	2	6	267477	267482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017240
6052	NC_008268	CGT	2	6	267499	267504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017240
6053	NC_008268	GTT	2	6	267520	267525	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111017240
6054	NC_008268	AG	3	6	267535	267540	50 %	0 %	50 %	0 %	111017240
6055	NC_008268	TCG	2	6	267597	267602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017240
6056	NC_008268	TCG	2	6	267641	267646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017240
6057	NC_008268	ACC	2	6	267657	267662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017240
6058	NC_008268	GCG	2	6	267670	267675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017240
6059	NC_008268	CG	3	6	267680	267685	0 %	0 %	50 %	50 %	111017240
6060	NC_008268	GGACG	2	10	267712	267721	20 %	0 %	60 %	20 %	111017240
6061	NC_008268	GCAGGC	2	12	267727	267738	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	111017240
6062	NC_008268	CGA	2	6	267763	267768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017240
6063	NC_008268	ACGA	2	8	267786	267793	50 %	0 %	25 %	25 %	111017240
6064	NC_008268	TCC	2	6	267810	267815	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111017240
6065	NC_008268	ACT	2	6	267867	267872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111017240
6066	NC_008268	GCC	2	6	267887	267892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017240
6067	NC_008268	CCGGCA	2	12	267897	267908	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	111017240
6068	NC_008268	CA	3	6	267907	267912	50 %	0 %	0 %	50 %	111017240
6069	NC_008268	TGCC	2	8	267918	267925	0 %	25 %	25 %	50 %	111017240
6070	NC_008268	GCG	2	6	267959	267964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017240
6071	NC_008268	GCA	2	6	267984	267989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017240
6072	NC_008268	GTC	2	6	267992	267997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017240
6073	NC_008268	TTG	2	6	268123	268128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111017241
6074	NC_008268	TCG	2	6	268151	268156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017241
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6076	NC_008268	ACG	2	6	268174	268179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017241
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6078	NC_008268	TCG	2	6	268289	268294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017241
6079	NC_008268	TCG	2	6	268527	268532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017242
6080	NC_008268	GCG	2	6	268539	268544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017242
6081	NC_008268	GGCC	2	8	268593	268600	0 %	0 %	50 %	50 %	111017242
6082	NC_008268	ACG	2	6	268629	268634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017242
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6086	NC_008268	CG	4	8	269006	269013	0 %	0 %	50 %	50 %	111017243
6087	NC_008268	GCC	2	6	269077	269082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017243
6088	NC_008268	CGC	3	9	269085	269093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017243
6089	NC_008268	ACC	2	6	269122	269127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017243
6090	NC_008268	CGC	2	6	269163	269168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017243
6091	NC_008268	CCA	2	6	269171	269176	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017243
6092	NC_008268	GTG	2	6	269189	269194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017243
6093	NC_008268	CGAC	2	8	269217	269224	25 %	0 %	25 %	50 %	111017243
6094	NC_008268	CGA	2	6	269268	269273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017243
6095	NC_008268	CAG	2	6	269292	269297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017243
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6098	NC_008268	TCG	2	6	269399	269404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017244
6099	NC_008268	GCGA	2	8	269413	269420	25 %	0 %	50 %	25 %	111017244
6100	NC_008268	GCCA	2	8	269490	269497	25 %	0 %	25 %	50 %	111017244
6101	NC_008268	CG	3	6	269536	269541	0 %	0 %	50 %	50 %	111017244
6102	NC_008268	CCT	2	6	269605	269610	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111017244
6103	NC_008268	CG	3	6	269642	269647	0 %	0 %	50 %	50 %	111017244
6104	NC_008268	TCG	2	6	269664	269669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017244
6105	NC_008268	TGG	2	6	269692	269697	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017244
6106	NC_008268	CGATC	2	10	269722	269731	20 %	20 %	20 %	40 %	111017244
6107	NC_008268	AGT	2	6	269737	269742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111017244
6108	NC_008268	AGA	2	6	269743	269748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111017244
6109	NC_008268	CGA	2	6	269824	269829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017244
6110	NC_008268	GAT	2	6	269834	269839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111017244
6111	NC_008268	GTC	2	6	269840	269845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017244
6112	NC_008268	GCA	2	6	269983	269988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017245
6113	NC_008268	TGC	2	6	270015	270020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017245
6114	NC_008268	CTC	2	6	270179	270184	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111017245
6115	NC_008268	GAAC	2	8	270212	270219	50 %	0 %	25 %	25 %	111017245
6116	NC_008268	CGA	2	6	270271	270276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017245
6117	NC_008268	TGAGCG	2	12	270297	270308	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	111017245
6118	NC_008268	CGC	3	9	270313	270321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017245
6119	NC_008268	TCG	2	6	270369	270374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017245
6120	NC_008268	AC	3	6	270387	270392	50 %	0 %	0 %	50 %	111017245
6121	NC_008268	GC	3	6	270401	270406	0 %	0 %	50 %	50 %	111017245
6122	NC_008268	CGT	2	6	270439	270444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017245
6123	NC_008268	CA	3	6	270509	270514	50 %	0 %	0 %	50 %	111017245
6124	NC_008268	CGCT	2	8	270540	270547	0 %	25 %	25 %	50 %	111017245
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6239	NC_008268	GACC	2	8	275460	275467	25 %	0 %	25 %	50 %	111017250
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6363	NC_008268	GTG	2	6	281325	281330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017254
6364	NC_008268	CGC	2	6	281396	281401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017254
6365	NC_008268	TCG	2	6	281413	281418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017254
6366	NC_008268	CGGCG	2	10	281424	281433	0 %	0 %	60 %	40 %	111017254
6367	NC_008268	CCTCC	2	10	281448	281457	0 %	20 %	0 %	80 %	111017254
6368	NC_008268	CCCCG	2	10	281466	281475	0 %	0 %	20 %	80 %	111017254
6369	NC_008268	GTC	2	6	281562	281567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017254
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6382	NC_008268	GCG	2	6	282128	282133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017254
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6481	NC_008268	CGA	2	6	286763	286768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017254
6482	NC_008268	GTG	2	6	286782	286787	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017254
6483	NC_008268	CCCT	2	8	286797	286804	0 %	25 %	0 %	75 %	111017254
6484	NC_008268	ATC	2	6	286825	286830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111017254
6485	NC_008268	ACGG	2	8	286889	286896	25 %	0 %	50 %	25 %	111017254
6486	NC_008268	AGC	2	6	286899	286904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017254
6487	NC_008268	GGC	2	6	286952	286957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017254
6488	NC_008268	ACG	2	6	286975	286980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017254
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6490	NC_008268	CGT	2	6	287045	287050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017254
6491	NC_008268	CGT	2	6	287069	287074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017254
6492	NC_008268	CGG	2	6	287102	287107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017254
6493	NC_008268	TCG	2	6	287161	287166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017254
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6500	NC_008268	TCCG	2	8	287480	287487	0 %	25 %	25 %	50 %	111017254

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