MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 chromosome

Total Repeats: 185852

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_008268	AT	3	6	201126	201131	50 %	50 %	0 %	0 %	111017166
4502	NC_008268	CGA	2	6	201148	201153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017166
4503	NC_008268	ACA	2	6	201160	201165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111017166
4504	NC_008268	CCGGCA	2	12	201187	201198	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	111017166
4505	NC_008268	GCTCCC	2	12	201221	201232	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	111017166
4506	NC_008268	GTC	2	6	201233	201238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017166
4507	NC_008268	CCA	2	6	201262	201267	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017166
4508	NC_008268	CCGC	2	8	201419	201426	0 %	0 %	25 %	75 %	111017166
4509	NC_008268	CCG	2	6	201457	201462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017166
4510	NC_008268	GCCCG	2	10	201466	201475	0 %	0 %	40 %	60 %	111017166
4511	NC_008268	CGC	2	6	201520	201525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017166
4512	NC_008268	CCGG	2	8	201531	201538	0 %	0 %	50 %	50 %	111017166
4513	NC_008268	GGT	2	6	201553	201558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017166
4514	NC_008268	GAC	2	6	201563	201568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017166
4515	NC_008268	CGGT	2	8	201583	201590	0 %	25 %	50 %	25 %	111017166
4516	NC_008268	GAC	2	6	201636	201641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017166
4517	NC_008268	CCGGC	2	10	201683	201692	0 %	0 %	40 %	60 %	111017166
4518	NC_008268	CCA	2	6	201703	201708	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017166
4519	NC_008268	CGG	2	6	201713	201718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017166
4520	NC_008268	CA	3	6	201720	201725	50 %	0 %	0 %	50 %	111017166
4521	NC_008268	CCA	2	6	201733	201738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017166
4522	NC_008268	GCC	2	6	201786	201791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017166
4523	NC_008268	GCT	2	6	201817	201822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017166
4524	NC_008268	CCA	3	9	201871	201879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017166
4525	NC_008268	CA	3	6	201892	201897	50 %	0 %	0 %	50 %	111017166
4526	NC_008268	GCA	2	6	201949	201954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017166
4527	NC_008268	CGA	2	6	201965	201970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017166
4528	NC_008268	CAC	2	6	201971	201976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017166
4529	NC_008268	CCG	2	6	201994	201999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017166
4530	NC_008268	CAC	2	6	202007	202012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017166
4531	NC_008268	CGAC	2	8	202087	202094	25 %	0 %	25 %	50 %	111017166
4532	NC_008268	CGC	3	9	202139	202147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017166
4533	NC_008268	TCG	3	9	202161	202169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017166
4534	NC_008268	GTGC	2	8	202184	202191	0 %	25 %	50 %	25 %	111017166
4535	NC_008268	CGG	2	6	202216	202221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017166
4536	NC_008268	CAC	2	6	202240	202245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017166
4537	NC_008268	TCC	2	6	202248	202253	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111017166
4538	NC_008268	GAAC	2	8	202297	202304	50 %	0 %	25 %	25 %	111017166
4539	NC_008268	CGCC	2	8	202309	202316	0 %	0 %	25 %	75 %	111017166
4540	NC_008268	CAACGC	2	12	202361	202372	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	111017166
4541	NC_008268	CG	3	6	202413	202418	0 %	0 %	50 %	50 %	111017166
4542	NC_008268	CGG	2	6	202462	202467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017166
4543	NC_008268	CGA	2	6	202489	202494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017166
4544	NC_008268	CGTCCC	2	12	202498	202509	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	111017166
4545	NC_008268	TGC	2	6	202513	202518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017166
4546	NC_008268	GAG	2	6	202532	202537	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111017166
4547	NC_008268	TCG	4	12	202599	202610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017166
4548	NC_008268	CAG	2	6	202814	202819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017166
4549	NC_008268	CGA	2	6	202831	202836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017166
4550	NC_008268	TGC	2	6	202837	202842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017166
4551	NC_008268	TCG	2	6	202854	202859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017166
4552	NC_008268	GGC	2	6	202910	202915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017166
4553	NC_008268	CCG	2	6	202919	202924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017166
4554	NC_008268	TGG	2	6	202947	202952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017166
4555	NC_008268	CCG	2	6	202981	202986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017166
4556	NC_008268	CCA	2	6	202987	202992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017166
4557	NC_008268	CGGA	2	8	203012	203019	25 %	0 %	50 %	25 %	111017166
4558	NC_008268	GCC	2	6	203054	203059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017166
4559	NC_008268	GCG	2	6	203063	203068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017166
4560	NC_008268	AGC	2	6	203070	203075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017166
4561	NC_008268	GGT	2	6	203078	203083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017166
4562	NC_008268	GCGG	2	8	203084	203091	0 %	0 %	75 %	25 %	111017166
4563	NC_008268	CGC	2	6	203153	203158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017166
4564	NC_008268	CGA	2	6	203177	203182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017166
4565	NC_008268	GGT	2	6	203209	203214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017166
4566	NC_008268	CGA	2	6	203215	203220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017166
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4568	NC_008268	CGA	2	6	203281	203286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017166
4569	NC_008268	TGG	2	6	203305	203310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017166
4570	NC_008268	GCG	2	6	203350	203355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017166
4571	NC_008268	GTC	3	9	203366	203374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017166
4572	NC_008268	GCG	2	6	203397	203402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017166
4573	NC_008268	GCG	2	6	203415	203420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017166
4574	NC_008268	GTG	2	6	203501	203506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017166
4575	NC_008268	CCG	2	6	203551	203556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017166
4576	NC_008268	GTG	2	6	203592	203597	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017166
4577	NC_008268	GCC	3	9	203622	203630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017166
4578	NC_008268	CGA	2	6	203656	203661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017166
4579	NC_008268	CGA	2	6	203719	203724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017166
4580	NC_008268	GGA	2	6	203728	203733	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111017166
4581	NC_008268	CGGC	2	8	203751	203758	0 %	0 %	50 %	50 %	111017166
4582	NC_008268	CCA	2	6	203800	203805	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017166
4583	NC_008268	GCT	2	6	203848	203853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017166
4584	NC_008268	CGG	2	6	203917	203922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017166
4585	NC_008268	CAC	2	6	203929	203934	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017166
4586	NC_008268	ACC	2	6	203949	203954	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017166
4587	NC_008268	CGG	2	6	203977	203982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017166
4588	NC_008268	CCAC	2	8	204002	204009	25 %	0 %	0 %	75 %	111017166
4589	NC_008268	GAG	2	6	204291	204296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111017167
4590	NC_008268	CGC	2	6	204314	204319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017167
4591	NC_008268	TC	3	6	204338	204343	0 %	50 %	0 %	50 %	111017167
4592	NC_008268	CCT	2	6	204383	204388	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111017167
4593	NC_008268	CGG	2	6	204472	204477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017167
4594	NC_008268	CCG	2	6	204490	204495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017167
4595	NC_008268	CGC	2	6	204545	204550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017167
4596	NC_008268	GAC	2	6	204582	204587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017167
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4599	NC_008268	CGGTG	2	10	204773	204782	0 %	20 %	60 %	20 %	111017167
4600	NC_008268	CGT	2	6	204803	204808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017167
4601	NC_008268	CGT	2	6	204857	204862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017167
4602	NC_008268	CGA	3	9	204863	204871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017167
4603	NC_008268	TCC	2	6	205016	205021	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111017168
4604	NC_008268	CGT	3	9	205079	205087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017168
4605	NC_008268	CAC	2	6	205090	205095	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017168
4606	NC_008268	AGA	2	6	205130	205135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111017168
4607	NC_008268	GCCGA	2	10	205150	205159	20 %	0 %	40 %	40 %	111017168
4608	NC_008268	GTA	2	6	205169	205174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111017168
4609	NC_008268	CCG	3	9	205230	205238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017168
4610	NC_008268	TGA	2	6	205254	205259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111017168
4611	NC_008268	CGA	3	9	205284	205292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017168
4612	NC_008268	GCT	2	6	205335	205340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017168
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4614	NC_008268	GAC	2	6	205486	205491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017168
4615	NC_008268	GCCC	2	8	205519	205526	0 %	0 %	25 %	75 %	111017168
4616	NC_008268	GAA	2	6	205552	205557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111017168
4617	NC_008268	GAT	2	6	205591	205596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111017168
4618	NC_008268	CTT	2	6	205597	205602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111017168
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4620	NC_008268	TGG	3	9	205653	205661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017168
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4740	NC_008268	ACG	2	6	210566	210571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017173
4741	NC_008268	CGT	2	6	210573	210578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017173
4742	NC_008268	GTG	2	6	210601	210606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017173
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4753	NC_008268	CCG	2	6	210977	210982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017174
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4842	NC_008268	GCC	2	6	214982	214987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017178
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4850	NC_008268	GA	3	6	215252	215257	50 %	0 %	50 %	0 %	111017178
4851	NC_008268	TCG	2	6	215271	215276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017178
4852	NC_008268	ACC	2	6	215306	215311	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017178
4853	NC_008268	CAGG	2	8	215397	215404	25 %	0 %	50 %	25 %	111017179
4854	NC_008268	ACCGG	2	10	215435	215444	20 %	0 %	40 %	40 %	111017179
4855	NC_008268	CA	3	6	215488	215493	50 %	0 %	0 %	50 %	111017179
4856	NC_008268	AGT	2	6	215498	215503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111017179
4857	NC_008268	AAC	2	6	215505	215510	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111017179
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4980	NC_008268	CGA	3	9	220076	220084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017182
4981	NC_008268	CGG	2	6	220103	220108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017182
4982	NC_008268	TGC	2	6	220109	220114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017182
4983	NC_008268	CGA	2	6	220127	220132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017182
4984	NC_008268	CAG	2	6	220158	220163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017182
4985	NC_008268	TGA	2	6	220202	220207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111017182
4986	NC_008268	GTGATC	2	12	220210	220221	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	111017182
4987	NC_008268	GCC	3	9	220243	220251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017182
4988	NC_008268	GGCA	2	8	220279	220286	25 %	0 %	50 %	25 %	111017182
4989	NC_008268	CAG	2	6	220287	220292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017182
4990	NC_008268	GAACAC	2	12	220341	220352	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	111017182
4991	NC_008268	CGC	2	6	220371	220376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017182
4992	NC_008268	CTT	2	6	220501	220506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111017183
4993	NC_008268	CCG	2	6	220511	220516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017183
4994	NC_008268	GCC	2	6	220522	220527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017183
4995	NC_008268	GGGT	2	8	220528	220535	0 %	25 %	75 %	0 %	111017183
4996	NC_008268	CGT	2	6	220542	220547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017183
4997	NC_008268	CGG	4	12	220548	220559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017183
4998	NC_008268	TCG	2	6	220586	220591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017183
4999	NC_008268	CGC	2	6	220604	220609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017183
5000	NC_008268	GGC	2	6	220611	220616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017183

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