MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Roseobacter denitrificans OCh 114 chromosome

Total Repeats: 75029

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008209	GC	3	6	26575	26580	0 %	0 %	50 %	50 %	110677444
502	NC_008209	GCAA	2	8	26699	26706	50 %	0 %	25 %	25 %	110677445
503	NC_008209	AGA	2	6	26710	26715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110677445
504	NC_008209	TGC	2	6	26755	26760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110677445
505	NC_008209	TGA	2	6	26800	26805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110677445
506	NC_008209	GT	3	6	26946	26951	0 %	50 %	50 %	0 %	110677445
507	NC_008209	AAC	2	6	27065	27070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110677446
508	NC_008209	GCA	2	6	27109	27114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677446
509	NC_008209	GAA	2	6	27169	27174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110677446
510	NC_008209	AAC	2	6	27211	27216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110677446
511	NC_008209	CCG	2	6	27235	27240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677446
512	NC_008209	ACC	2	6	27464	27469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110677446
513	NC_008209	TG	3	6	27816	27821	0 %	50 %	50 %	0 %	110677447
514	NC_008209	CACAT	2	10	27823	27832	40 %	20 %	0 %	40 %	110677447
515	NC_008209	GCTG	2	8	27835	27842	0 %	25 %	50 %	25 %	110677447
516	NC_008209	CAA	2	6	27866	27871	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110677447
517	NC_008209	GGC	2	6	27872	27877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677447
518	NC_008209	GATG	2	8	27883	27890	25 %	25 %	50 %	0 %	110677447
519	NC_008209	CTG	2	6	27911	27916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110677447
520	NC_008209	TGATCG	2	12	27973	27984	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	110677447
521	NC_008209	TGCG	2	8	27993	28000	0 %	25 %	50 %	25 %	110677447
522	NC_008209	CG	3	6	28016	28021	0 %	0 %	50 %	50 %	110677447
523	NC_008209	ACC	2	6	28064	28069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110677447
524	NC_008209	GCT	2	6	28165	28170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110677447
525	NC_008209	TGG	2	6	28404	28409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110677447
526	NC_008209	GCGG	2	8	28424	28431	0 %	0 %	75 %	25 %	110677447
527	NC_008209	CA	3	6	28436	28441	50 %	0 %	0 %	50 %	110677447
528	NC_008209	GAT	2	6	28445	28450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110677447
529	NC_008209	GACATC	2	12	28502	28513	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	110677447
530	NC_008209	C	6	6	28523	28528	0 %	0 %	0 %	100 %	110677447
531	NC_008209	GGC	2	6	28633	28638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677447
532	NC_008209	ATG	2	6	28650	28655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110677447
533	NC_008209	A	6	6	28727	28732	100 %	0 %	0 %	0 %	110677447
534	NC_008209	GAT	2	6	28741	28746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110677447
535	NC_008209	GCC	2	6	28772	28777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677447
536	NC_008209	GGC	2	6	28970	28975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677447
537	NC_008209	TGC	2	6	29007	29012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110677447
538	NC_008209	AACC	2	8	29089	29096	50 %	0 %	0 %	50 %	110677447
539	NC_008209	CG	3	6	29139	29144	0 %	0 %	50 %	50 %	110677447
540	NC_008209	CGG	2	6	29251	29256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677447
541	NC_008209	ATG	2	6	29270	29275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110677447
542	NC_008209	AAT	2	6	29439	29444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110677448
543	NC_008209	CAG	2	6	29503	29508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677448
544	NC_008209	ATA	2	6	29512	29517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110677448
545	NC_008209	GCT	2	6	29520	29525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110677448
546	NC_008209	TTC	2	6	29566	29571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110677448
547	NC_008209	GC	3	6	29660	29665	0 %	0 %	50 %	50 %	110677448
548	NC_008209	CA	3	6	29869	29874	50 %	0 %	0 %	50 %	110677449
549	NC_008209	CCTG	2	8	29898	29905	0 %	25 %	25 %	50 %	110677449
550	NC_008209	AGA	2	6	29941	29946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110677449
551	NC_008209	GCC	2	6	29966	29971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677449
552	NC_008209	CGT	2	6	29986	29991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110677449
553	NC_008209	CAT	2	6	30133	30138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110677449
554	NC_008209	CAT	2	6	30148	30153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110677449
555	NC_008209	TCG	2	6	30186	30191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110677449
556	NC_008209	GGT	2	6	30214	30219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110677449
557	NC_008209	TCA	2	6	30342	30347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110677449
558	NC_008209	G	7	7	30379	30385	0 %	0 %	100 %	0 %	110677449
559	NC_008209	GC	3	6	30391	30396	0 %	0 %	50 %	50 %	110677449
560	NC_008209	TGC	2	6	30607	30612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110677449
561	NC_008209	TGT	2	6	30636	30641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110677449
562	NC_008209	CCT	2	6	30757	30762	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110677450
563	NC_008209	G	7	7	30765	30771	0 %	0 %	100 %	0 %	110677450
564	NC_008209	GCA	2	6	30808	30813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677450
565	NC_008209	TGCG	2	8	30838	30845	0 %	25 %	50 %	25 %	110677450
566	NC_008209	CGC	2	6	30937	30942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677450
567	NC_008209	GC	3	6	31034	31039	0 %	0 %	50 %	50 %	110677450
568	NC_008209	GC	3	6	31056	31061	0 %	0 %	50 %	50 %	110677450
569	NC_008209	CAGC	2	8	31112	31119	25 %	0 %	25 %	50 %	110677450
570	NC_008209	ATG	2	6	31141	31146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110677450
571	NC_008209	CA	3	6	31179	31184	50 %	0 %	0 %	50 %	110677450
572	NC_008209	GC	4	8	31248	31255	0 %	0 %	50 %	50 %	110677450
573	NC_008209	AG	3	6	31341	31346	50 %	0 %	50 %	0 %	110677451
574	NC_008209	CAT	2	6	31408	31413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110677451
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576	NC_008209	TCG	2	6	31507	31512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110677451
577	NC_008209	GC	3	6	31526	31531	0 %	0 %	50 %	50 %	110677451
578	NC_008209	CAG	2	6	31577	31582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677451
579	NC_008209	GCG	2	6	31588	31593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677451
580	NC_008209	GGTT	2	8	31620	31627	0 %	50 %	50 %	0 %	110677451
581	NC_008209	CAC	2	6	31646	31651	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110677451
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583	NC_008209	CGGG	2	8	31684	31691	0 %	0 %	75 %	25 %	110677451
584	NC_008209	GCG	2	6	31718	31723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677451
585	NC_008209	CAT	3	9	31753	31761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110677451
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589	NC_008209	ACC	2	6	32162	32167	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110677452
590	NC_008209	CGCC	2	8	32376	32383	0 %	0 %	25 %	75 %	110677452
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592	NC_008209	GC	4	8	32564	32571	0 %	0 %	50 %	50 %	110677452
593	NC_008209	CCA	2	6	32616	32621	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110677452
594	NC_008209	TCA	2	6	32622	32627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110677452
595	NC_008209	TCA	2	6	32639	32644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110677452
596	NC_008209	TTC	2	6	32683	32688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110677452
597	NC_008209	TTC	2	6	32836	32841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110677452
598	NC_008209	ACC	2	6	32852	32857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110677452
599	NC_008209	GGTC	2	8	32886	32893	0 %	25 %	50 %	25 %	110677452
600	NC_008209	ACA	2	6	32894	32899	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110677452
601	NC_008209	CAG	2	6	32905	32910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677452
602	NC_008209	CGT	2	6	32922	32927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110677452
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604	NC_008209	ATC	2	6	32963	32968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110677452
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606	NC_008209	CGC	2	6	33099	33104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677452
607	NC_008209	GAC	2	6	33181	33186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677452
608	NC_008209	ACCG	2	8	33224	33231	25 %	0 %	25 %	50 %	110677452
609	NC_008209	CG	3	6	33251	33256	0 %	0 %	50 %	50 %	110677452
610	NC_008209	GCC	2	6	33263	33268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677452
611	NC_008209	CG	3	6	33275	33280	0 %	0 %	50 %	50 %	110677452
612	NC_008209	ATC	2	6	33283	33288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110677452
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614	NC_008209	CAA	2	6	33372	33377	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110677452
615	NC_008209	GC	3	6	33421	33426	0 %	0 %	50 %	50 %	110677452
616	NC_008209	CAG	2	6	33484	33489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677452
617	NC_008209	GCG	2	6	33495	33500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677452
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620	NC_008209	CGCGG	2	10	33606	33615	0 %	0 %	60 %	40 %	110677452
621	NC_008209	ATG	2	6	33669	33674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110677452
622	NC_008209	TCT	2	6	33680	33685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110677452
623	NC_008209	GC	3	6	33718	33723	0 %	0 %	50 %	50 %	110677452
624	NC_008209	CCG	2	6	33828	33833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677452
625	NC_008209	GC	3	6	33871	33876	0 %	0 %	50 %	50 %	110677452
626	NC_008209	CAT	2	6	34027	34032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110677452
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