MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Rubrobacter xylanophilus DSM 9941 chromosome

Total Repeats: 66871

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008148	GGA	2	6	190	195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802857
2	NC_008148	AGG	2	6	219	224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802857
3	NC_008148	CAT	2	6	232	237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108802857
4	NC_008148	GAG	2	6	275	280	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802857
5	NC_008148	CGC	3	9	394	402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802857
6	NC_008148	CGT	2	6	427	432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802857
7	NC_008148	ACG	2	6	627	632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802857
8	NC_008148	TCC	2	6	633	638	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802857
9	NC_008148	GAC	2	6	644	649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802857
10	NC_008148	AGG	2	6	681	686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802857
11	NC_008148	CTT	2	6	688	693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108802857
12	NC_008148	GAG	2	6	716	721	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802857
13	NC_008148	TCC	2	6	855	860	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802857
14	NC_008148	ATG	2	6	872	877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108802857
15	NC_008148	GAC	2	6	893	898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802857
16	NC_008148	AGG	2	6	1020	1025	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802857
17	NC_008148	CGA	2	6	1198	1203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802857
18	NC_008148	CGG	2	6	1231	1236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802857
19	NC_008148	GGA	2	6	2035	2040	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802858
20	NC_008148	GAT	2	6	2104	2109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108802858
21	NC_008148	ACG	2	6	2121	2126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802858
22	NC_008148	GCC	2	6	2138	2143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802858
23	NC_008148	CGC	2	6	2185	2190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802858
24	NC_008148	GGA	2	6	2191	2196	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802858
25	NC_008148	GGA	2	6	2221	2226	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802858
26	NC_008148	TGG	2	6	2256	2261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108802858
27	NC_008148	CAC	2	6	2362	2367	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108802858
28	NC_008148	ACC	2	6	2408	2413	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108802858
29	NC_008148	AGG	2	6	2457	2462	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802858
30	NC_008148	TCT	2	6	2472	2477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108802858
31	NC_008148	CGA	2	6	2485	2490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802858
32	NC_008148	TGC	2	6	2547	2552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802858
33	NC_008148	CCG	2	6	2590	2595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802858
34	NC_008148	CGG	2	6	2604	2609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802858
35	NC_008148	CGA	2	6	2638	2643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802858
36	NC_008148	TCT	2	6	2715	2720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108802858
37	NC_008148	GGT	3	9	2737	2745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108802858
38	NC_008148	GCG	2	6	2751	2756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802858
39	NC_008148	CAG	2	6	2788	2793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802858
40	NC_008148	GAC	2	6	2798	2803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802858
41	NC_008148	CCT	2	6	2830	2835	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802858
42	NC_008148	GTC	2	6	2867	2872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802858
43	NC_008148	GAG	3	9	2921	2929	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802858
44	NC_008148	TGA	2	6	2978	2983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108802858
45	NC_008148	CGG	2	6	3042	3047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802859
46	NC_008148	CGC	2	6	3106	3111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802859
47	NC_008148	CGT	2	6	3135	3140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802859
48	NC_008148	CTC	2	6	3234	3239	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802860
49	NC_008148	TCG	2	6	3259	3264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802860
50	NC_008148	CCT	2	6	3290	3295	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802860
51	NC_008148	TCG	2	6	3310	3315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802860
52	NC_008148	CTC	2	6	3323	3328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802860
53	NC_008148	GTC	2	6	3354	3359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802860
54	NC_008148	GGT	2	6	3395	3400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108802860
55	NC_008148	GCA	2	6	3445	3450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802860
56	NC_008148	CTT	2	6	3533	3538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108802860
57	NC_008148	GAC	2	6	3543	3548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802860
58	NC_008148	CTC	2	6	3605	3610	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802860
59	NC_008148	GCG	2	6	3633	3638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802860
60	NC_008148	CAG	2	6	3660	3665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802860
61	NC_008148	GCT	2	6	3674	3679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802860
62	NC_008148	GCG	2	6	3680	3685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802860
63	NC_008148	CTC	2	6	3701	3706	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802860
64	NC_008148	TGC	2	6	3757	3762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802860
65	NC_008148	CGA	2	6	3794	3799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802860
66	NC_008148	GCC	2	6	3843	3848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802860
67	NC_008148	GAC	2	6	3954	3959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802860
68	NC_008148	CAC	2	6	3989	3994	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108802860
69	NC_008148	CAG	2	6	4011	4016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802860
70	NC_008148	CGC	2	6	4043	4048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802860
71	NC_008148	TGC	2	6	4087	4092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802860
72	NC_008148	CGA	2	6	4097	4102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802860
73	NC_008148	CGA	2	6	4118	4123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802860
74	NC_008148	CCA	3	9	4180	4188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108802860
75	NC_008148	GCG	2	6	4217	4222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802860
76	NC_008148	TGG	2	6	4244	4249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108802860
77	NC_008148	GTG	2	6	4273	4278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108802860
78	NC_008148	GCG	2	6	4544	4549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802861
79	NC_008148	CAC	2	6	4590	4595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108802861
80	NC_008148	CGA	2	6	4697	4702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802861
81	NC_008148	CCG	3	9	4747	4755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802861
82	NC_008148	TCA	2	6	4759	4764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108802861
83	NC_008148	CGG	2	6	4781	4786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802861
84	NC_008148	CGG	2	6	4817	4822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802861
85	NC_008148	GGT	2	6	4844	4849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108802861
86	NC_008148	GCC	2	6	5050	5055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802861
87	NC_008148	CAA	2	6	5078	5083	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108802861
88	NC_008148	CGA	2	6	5105	5110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802861
89	NC_008148	GAG	2	6	5115	5120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802861
90	NC_008148	GTC	2	6	5130	5135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802861
91	NC_008148	GAG	3	9	5226	5234	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802861
92	NC_008148	CAA	2	6	5300	5305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108802861
93	NC_008148	GCT	2	6	5393	5398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802861
94	NC_008148	CGA	2	6	5426	5431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802861
95	NC_008148	GCG	2	6	5448	5453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802861
96	NC_008148	TCG	2	6	5533	5538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802861
97	NC_008148	CCA	2	6	5545	5550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108802861
98	NC_008148	GGA	2	6	5573	5578	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802861
99	NC_008148	CTC	2	6	5717	5722	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802861
100	NC_008148	CGG	2	6	5767	5772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802861
101	NC_008148	GAG	2	6	5940	5945	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802861
102	NC_008148	TCA	2	6	5965	5970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108802861
103	NC_008148	GCG	2	6	6152	6157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802861
104	NC_008148	GCA	2	6	6218	6223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802861
105	NC_008148	ACC	2	6	6234	6239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108802861
106	NC_008148	GCT	2	6	6260	6265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802861
107	NC_008148	CCG	2	6	6292	6297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802861
108	NC_008148	GAA	2	6	6374	6379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108802861
109	NC_008148	CGG	2	6	6523	6528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802862
110	NC_008148	GTC	2	6	6592	6597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802862
111	NC_008148	ACC	2	6	6617	6622	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108802862
112	NC_008148	CGG	2	6	6635	6640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802862
113	NC_008148	TGG	2	6	6692	6697	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108802862
114	NC_008148	CGG	3	9	6734	6742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802862
115	NC_008148	TGC	2	6	6788	6793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802862
116	NC_008148	CGA	2	6	6834	6839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802862
117	NC_008148	TGC	2	6	6860	6865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802862
118	NC_008148	CGC	2	6	6935	6940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802862
119	NC_008148	CGA	3	9	6996	7004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802862
120	NC_008148	GTG	2	6	7054	7059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108802862
121	NC_008148	GTC	2	6	7162	7167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802862
122	NC_008148	AGA	2	6	7208	7213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108802862
123	NC_008148	CGG	2	6	7278	7283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802862
124	NC_008148	GGT	2	6	7326	7331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108802862
125	NC_008148	AAC	2	6	7336	7341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108802862
126	NC_008148	GCA	2	6	7362	7367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802862
127	NC_008148	TGG	2	6	7385	7390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108802862
128	NC_008148	TGG	2	6	7394	7399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108802862
129	NC_008148	AGG	2	6	7427	7432	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802862
130	NC_008148	CCA	2	6	7452	7457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108802862
131	NC_008148	GCT	2	6	7530	7535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802862
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133	NC_008148	GCG	2	6	7692	7697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802862
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253	NC_008148	CAT	3	9	13229	13237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108802867
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