MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rubrobacter xylanophilus DSM 9941 chromosome

Total Repeats: 88957

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_008148	CAC	2	6	136982	136987	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108802987
4003	NC_008148	ACC	2	6	137019	137024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108802987
4004	NC_008148	CCT	2	6	137044	137049	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802987
4005	NC_008148	TCC	2	6	137067	137072	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802987
4006	NC_008148	CCG	2	6	137073	137078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802987
4007	NC_008148	CAC	2	6	137081	137086	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108802987
4008	NC_008148	GCGG	2	8	137087	137094	0 %	0 %	75 %	25 %	108802987
4009	NC_008148	CTT	2	6	137117	137122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108802987
4010	NC_008148	CTCG	2	8	137129	137136	0 %	25 %	25 %	50 %	108802987
4011	NC_008148	TCC	2	6	137137	137142	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802987
4012	NC_008148	CCCGCG	2	12	137143	137154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802987
4013	NC_008148	AGC	2	6	137160	137165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802987
4014	NC_008148	AGG	2	6	137172	137177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802987
4015	NC_008148	ATG	2	6	137187	137192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108802987
4016	NC_008148	GCCC	2	8	137220	137227	0 %	0 %	25 %	75 %	108802987
4017	NC_008148	CGC	2	6	137252	137257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802987
4018	NC_008148	TGGCC	2	10	137311	137320	0 %	20 %	40 %	40 %	108802987
4019	NC_008148	C	6	6	137341	137346	0 %	0 %	0 %	100 %	108802987
4020	NC_008148	CCG	2	6	137354	137359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802987
4021	NC_008148	AGC	2	6	137394	137399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802987
4022	NC_008148	CGG	2	6	137426	137431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802987
4023	NC_008148	TCCC	2	8	137529	137536	0 %	25 %	0 %	75 %	108802987
4024	NC_008148	TCC	2	6	137547	137552	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802987
4025	NC_008148	CGC	2	6	137589	137594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802987
4026	NC_008148	CTC	2	6	137597	137602	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802987
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4028	NC_008148	CCCG	2	8	137680	137687	0 %	0 %	25 %	75 %	108802987
4029	NC_008148	CCG	2	6	138051	138056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802988
4030	NC_008148	CAT	2	6	138092	138097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108802988
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4032	NC_008148	GTT	2	6	138183	138188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108802988
4033	NC_008148	CTC	2	6	138216	138221	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802988
4034	NC_008148	GGA	2	6	138246	138251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802988
4035	NC_008148	CGTGG	2	10	138321	138330	0 %	20 %	60 %	20 %	108802988
4036	NC_008148	CCT	2	6	138335	138340	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802988
4037	NC_008148	GGT	2	6	138341	138346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108802988
4038	NC_008148	GCG	2	6	138379	138384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802988
4039	NC_008148	GGC	2	6	138422	138427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802988
4040	NC_008148	TGG	2	6	138454	138459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108802988
4041	NC_008148	GGC	2	6	138474	138479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802988
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4043	NC_008148	CGG	2	6	138529	138534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802988
4044	NC_008148	CTC	2	6	138651	138656	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802988
4045	NC_008148	GCG	2	6	138702	138707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802988
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4047	NC_008148	ACG	2	6	138775	138780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802988
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4050	NC_008148	CAGG	2	8	138983	138990	25 %	0 %	50 %	25 %	108802988
4051	NC_008148	AG	3	6	139028	139033	50 %	0 %	50 %	0 %	108802989
4052	NC_008148	CCCG	2	8	139096	139103	0 %	0 %	25 %	75 %	108802989
4053	NC_008148	CAC	2	6	139110	139115	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108802989
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4055	NC_008148	C	7	7	139184	139190	0 %	0 %	0 %	100 %	108802989
4056	NC_008148	CAG	2	6	139221	139226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802989
4057	NC_008148	CCA	2	6	139268	139273	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108802989
4058	NC_008148	CGC	2	6	139274	139279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802989
4059	NC_008148	CCA	2	6	139316	139321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108802989
4060	NC_008148	CTC	2	6	139332	139337	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802989
4061	NC_008148	CTC	2	6	139395	139400	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802989
4062	NC_008148	CGG	2	6	139423	139428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802989
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4065	NC_008148	GCTCCA	2	12	139562	139573	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	108802989
4066	NC_008148	CAG	2	6	139581	139586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802989
4067	NC_008148	CCT	2	6	139595	139600	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802989
4068	NC_008148	GTA	2	6	139605	139610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108802989
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4070	NC_008148	TCC	2	6	139718	139723	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802989
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4073	NC_008148	TGC	2	6	139808	139813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802989
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4082	NC_008148	GCCG	2	8	140147	140154	0 %	0 %	50 %	50 %	108802990
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4084	NC_008148	CGA	2	6	140177	140182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802990
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4092	NC_008148	GC	3	6	140667	140672	0 %	0 %	50 %	50 %	108802990
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4101	NC_008148	CGC	2	6	140829	140834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802990
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4105	NC_008148	GCC	2	6	140939	140944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802990
4106	NC_008148	GC	3	6	140992	140997	0 %	0 %	50 %	50 %	108802990
4107	NC_008148	GGT	2	6	141018	141023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108802990
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4112	NC_008148	GTC	2	6	141123	141128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802990
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4126	NC_008148	CGT	2	6	141902	141907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802991
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4229	NC_008148	CTT	2	6	145623	145628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108802994
4230	NC_008148	AGG	2	6	145654	145659	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802994
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4232	NC_008148	GCCG	2	8	145693	145700	0 %	0 %	50 %	50 %	108802994
4233	NC_008148	GAG	2	6	146097	146102	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802995
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4235	NC_008148	TCG	3	9	146131	146139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802995
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4237	NC_008148	GCTC	2	8	146173	146180	0 %	25 %	25 %	50 %	108802995
4238	NC_008148	AGG	2	6	146217	146222	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802995
4239	NC_008148	CTC	2	6	146223	146228	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802995
4240	NC_008148	GTC	2	6	146256	146261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802995
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4242	NC_008148	GCAC	2	8	146416	146423	25 %	0 %	25 %	50 %	108802995
4243	NC_008148	TCC	2	6	146434	146439	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802995
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4270	NC_008148	CTGCTC	2	12	147757	147768	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	108802997
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4345	NC_008148	CCGG	2	8	150928	150935	0 %	0 %	50 %	50 %	108803000
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4363	NC_008148	GGC	2	6	151601	151606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803000
4364	NC_008148	CCG	2	6	151624	151629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803000
4365	NC_008148	CCG	2	6	151710	151715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803000
4366	NC_008148	GTA	2	6	151853	151858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108803000
4367	NC_008148	TGG	2	6	151867	151872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108803000
4368	NC_008148	GTT	2	6	151883	151888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108803000
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4371	NC_008148	TGG	2	6	151969	151974	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108803000
4372	NC_008148	GC	3	6	152009	152014	0 %	0 %	50 %	50 %	108803000
4373	NC_008148	GTA	2	6	152066	152071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108803000
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4382	NC_008148	TCC	2	6	152425	152430	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803000
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4389	NC_008148	GAT	2	6	153092	153097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108803001
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4392	NC_008148	CTC	2	6	153314	153319	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803001
4393	NC_008148	CGC	3	9	153325	153333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803001
4394	NC_008148	CGT	2	6	153388	153393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803001
4395	NC_008148	TCG	2	6	153462	153467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803001
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4441	NC_008148	CCCG	2	8	155531	155538	0 %	0 %	25 %	75 %	108803003
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4452	NC_008148	GTC	2	6	155836	155841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803003
4453	NC_008148	AGC	2	6	155870	155875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803003
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4465	NC_008148	GCC	2	6	156268	156273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803003
4466	NC_008148	GGC	2	6	156278	156283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803003
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4468	NC_008148	GAG	2	6	156301	156306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803003
4469	NC_008148	AGG	2	6	156321	156326	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803003
4470	NC_008148	GTG	2	6	156364	156369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108803003
4471	NC_008148	G	6	6	156400	156405	0 %	0 %	100 %	0 %	108803003
4472	NC_008148	ACCTCG	2	12	156425	156436	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	108803003
4473	NC_008148	GCGGG	2	10	156437	156446	0 %	0 %	80 %	20 %	108803003
4474	NC_008148	CCAC	2	8	156453	156460	25 %	0 %	0 %	75 %	108803003
4475	NC_008148	CCA	2	6	156579	156584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108803004
4476	NC_008148	AGG	2	6	156605	156610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803004
4477	NC_008148	ATCAGG	2	12	156614	156625	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	108803004
4478	NC_008148	GAT	2	6	156628	156633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108803004
4479	NC_008148	CAT	2	6	156721	156726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108803004
4480	NC_008148	AGG	2	6	156735	156740	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803004
4481	NC_008148	CGG	2	6	156786	156791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803004
4482	NC_008148	ACG	2	6	156815	156820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803004
4483	NC_008148	TGG	2	6	156822	156827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108803004
4484	NC_008148	GGT	2	6	156844	156849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108803004
4485	NC_008148	GCA	2	6	157074	157079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803004
4486	NC_008148	AGC	2	6	157085	157090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803004
4487	NC_008148	GCG	3	9	157091	157099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803004
4488	NC_008148	TCG	2	6	157118	157123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803004
4489	NC_008148	CTC	2	6	157156	157161	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803004
4490	NC_008148	CGA	2	6	157176	157181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803004
4491	NC_008148	C	6	6	157239	157244	0 %	0 %	0 %	100 %	108803004
4492	NC_008148	GCT	2	6	157269	157274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803004
4493	NC_008148	CTC	2	6	157285	157290	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803004
4494	NC_008148	CAG	2	6	157360	157365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803004
4495	NC_008148	GGC	2	6	157378	157383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803004
4496	NC_008148	CAC	2	6	157384	157389	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108803004
4497	NC_008148	GAA	2	6	157396	157401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108803004
4498	NC_008148	TGG	2	6	157407	157412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108803004
4499	NC_008148	TCC	2	6	157421	157426	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803004
4500	NC_008148	GCCGAT	2	12	157435	157446	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	108803004

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