MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rubrobacter xylanophilus DSM 9941 chromosome

Total Repeats: 88957

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_008148	GCT	2	6	122489	122494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802971
3502	NC_008148	GGC	2	6	122499	122504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802971
3503	NC_008148	GAC	2	6	122550	122555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802971
3504	NC_008148	CGC	2	6	122584	122589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802971
3505	NC_008148	CGG	2	6	122626	122631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802971
3506	NC_008148	CG	3	6	122698	122703	0 %	0 %	50 %	50 %	108802971
3507	NC_008148	CCG	2	6	122716	122721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802971
3508	NC_008148	GGT	3	9	122726	122734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108802971
3509	NC_008148	CGA	2	6	122744	122749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802971
3510	NC_008148	AGG	2	6	122833	122838	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802971
3511	NC_008148	GCC	2	6	122878	122883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802971
3512	NC_008148	GCC	2	6	122901	122906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802971
3513	NC_008148	GAGG	2	8	122912	122919	25 %	0 %	75 %	0 %	108802971
3514	NC_008148	GAG	3	9	122931	122939	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802971
3515	NC_008148	GAG	2	6	122991	122996	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802971
3516	NC_008148	CGG	2	6	122998	123003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802971
3517	NC_008148	G	6	6	123048	123053	0 %	0 %	100 %	0 %	108802971
3518	NC_008148	CGCC	2	8	123083	123090	0 %	0 %	25 %	75 %	108802971
3519	NC_008148	GCG	2	6	123104	123109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802971
3520	NC_008148	TGC	2	6	123129	123134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802972
3521	NC_008148	CGC	2	6	123136	123141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802972
3522	NC_008148	GGGGA	2	10	123143	123152	20 %	0 %	80 %	0 %	108802972
3523	NC_008148	GCT	2	6	123172	123177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802972
3524	NC_008148	GGC	2	6	123192	123197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802972
3525	NC_008148	TGG	2	6	123201	123206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108802972
3526	NC_008148	CTC	2	6	123215	123220	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802972
3527	NC_008148	GGT	2	6	123256	123261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108802972
3528	NC_008148	GGGGGA	2	12	123262	123273	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	108802972
3529	NC_008148	GTG	2	6	123317	123322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108802972
3530	NC_008148	GCG	2	6	123398	123403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802972
3531	NC_008148	GTC	2	6	123404	123409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802972
3532	NC_008148	GAG	2	6	123470	123475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802972
3533	NC_008148	GCG	2	6	123488	123493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802972
3534	NC_008148	GGA	3	9	123556	123564	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802972
3535	NC_008148	TGC	2	6	123594	123599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802972
3536	NC_008148	GGA	2	6	123670	123675	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802972
3537	NC_008148	GCG	2	6	123679	123684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802972
3538	NC_008148	GAG	2	6	123689	123694	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802972
3539	NC_008148	CG	3	6	123700	123705	0 %	0 %	50 %	50 %	108802972
3540	NC_008148	GA	3	6	123708	123713	50 %	0 %	50 %	0 %	108802972
3541	NC_008148	CCTGGA	2	12	123789	123800	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	108802973
3542	NC_008148	CTGC	2	8	123813	123820	0 %	25 %	25 %	50 %	108802973
3543	NC_008148	GCAG	2	8	123840	123847	25 %	0 %	50 %	25 %	108802973
3544	NC_008148	CCGC	2	8	123893	123900	0 %	0 %	25 %	75 %	108802973
3545	NC_008148	CGA	2	6	123930	123935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802973
3546	NC_008148	GGCG	2	8	123944	123951	0 %	0 %	75 %	25 %	108802973
3547	NC_008148	GAG	3	9	124024	124032	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802973
3548	NC_008148	GTG	3	9	124048	124056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108802973
3549	NC_008148	CGGA	2	8	124057	124064	25 %	0 %	50 %	25 %	108802973
3550	NC_008148	CAG	2	6	124108	124113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802973
3551	NC_008148	CCT	2	6	124145	124150	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802973
3552	NC_008148	TCT	2	6	124166	124171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108802973
3553	NC_008148	GAG	2	6	124228	124233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802974
3554	NC_008148	GGA	2	6	124257	124262	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802974
3555	NC_008148	CTGC	2	8	124272	124279	0 %	25 %	25 %	50 %	108802974
3556	NC_008148	GAG	2	6	124309	124314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802974
3557	NC_008148	CCGC	2	8	124352	124359	0 %	0 %	25 %	75 %	108802974
3558	NC_008148	CGA	2	6	124389	124394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802974
3559	NC_008148	GCGG	2	8	124424	124431	0 %	0 %	75 %	25 %	108802974
3560	NC_008148	GCGG	2	8	124481	124488	0 %	0 %	75 %	25 %	108802974
3561	NC_008148	GCA	2	6	124493	124498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802974
3562	NC_008148	CGGG	2	8	124533	124540	0 %	0 %	75 %	25 %	108802974
3563	NC_008148	CGGG	2	8	124551	124558	0 %	0 %	75 %	25 %	108802974
3564	NC_008148	CAG	2	6	124564	124569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802974
3565	NC_008148	CCA	2	6	124577	124582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108802974
3566	NC_008148	GGA	2	6	124635	124640	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802974
3567	NC_008148	GCC	3	9	124642	124650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802974
3568	NC_008148	AGG	3	9	124655	124663	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802974
3569	NC_008148	AGC	2	6	124664	124669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802974
3570	NC_008148	GGTGCG	2	12	124671	124682	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	108802974
3571	NC_008148	CAG	2	6	124690	124695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802974
3572	NC_008148	GAGCCG	2	12	124699	124710	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	108802974
3573	NC_008148	GCC	2	6	124762	124767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802974
3574	NC_008148	GCG	2	6	124786	124791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802974
3575	NC_008148	CTG	2	6	124792	124797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802974
3576	NC_008148	TCT	2	6	124805	124810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108802974
3577	NC_008148	CTC	2	6	124847	124852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802975
3578	NC_008148	GCT	3	9	124882	124890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802975
3579	NC_008148	GAT	2	6	124895	124900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108802975
3580	NC_008148	GGT	2	6	124975	124980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108802975
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3582	NC_008148	CAT	2	6	125054	125059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108802975
3583	NC_008148	CTC	2	6	125132	125137	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802975
3584	NC_008148	CCGC	2	8	125143	125150	0 %	0 %	25 %	75 %	108802975
3585	NC_008148	GCC	2	6	125176	125181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802975
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3587	NC_008148	CCG	2	6	125267	125272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802975
3588	NC_008148	AGT	2	6	125278	125283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108802975
3589	NC_008148	CCG	2	6	125287	125292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802975
3590	NC_008148	GCC	2	6	125300	125305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802975
3591	NC_008148	CGC	2	6	125320	125325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802975
3592	NC_008148	TTC	2	6	125342	125347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108802975
3593	NC_008148	CGC	2	6	125356	125361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802975
3594	NC_008148	CTC	2	6	125384	125389	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802975
3595	NC_008148	AGG	2	6	125418	125423	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802975
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3597	NC_008148	AGCG	2	8	125441	125448	25 %	0 %	50 %	25 %	108802975
3598	NC_008148	GC	3	6	125454	125459	0 %	0 %	50 %	50 %	108802975
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3601	NC_008148	GC	3	6	125956	125961	0 %	0 %	50 %	50 %	108802976
3602	NC_008148	CCA	2	6	125973	125978	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108802976
3603	NC_008148	CG	3	6	125998	126003	0 %	0 %	50 %	50 %	108802976
3604	NC_008148	ACG	2	6	126026	126031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802976
3605	NC_008148	GCC	2	6	126042	126047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802976
3606	NC_008148	GGT	2	6	126054	126059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108802976
3607	NC_008148	CT	3	6	126093	126098	0 %	50 %	0 %	50 %	108802976
3608	NC_008148	GAG	2	6	126119	126124	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802976
3609	NC_008148	AGC	2	6	126143	126148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802976
3610	NC_008148	GCA	2	6	126165	126170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802976
3611	NC_008148	GTC	2	6	126199	126204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802976
3612	NC_008148	TGC	2	6	126210	126215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802976
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3617	NC_008148	GC	3	6	126440	126445	0 %	0 %	50 %	50 %	108802976
3618	NC_008148	CACC	2	8	126451	126458	25 %	0 %	0 %	75 %	108802976
3619	NC_008148	GGC	2	6	126459	126464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802976
3620	NC_008148	AGG	2	6	126476	126481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802976
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3990	NC_008148	CGG	2	6	136441	136446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802987
3991	NC_008148	ACG	2	6	136503	136508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802987
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