MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rubrobacter xylanophilus DSM 9941 chromosome

Total Repeats: 88957

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_008148	CCGA	2	8	105235	105242	25 %	0 %	25 %	50 %	108802955
3002	NC_008148	GCC	2	6	105274	105279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802955
3003	NC_008148	CTCC	2	8	105305	105312	0 %	25 %	0 %	75 %	108802955
3004	NC_008148	CCCGAG	2	12	105325	105336	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	108802955
3005	NC_008148	CGG	2	6	105344	105349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802955
3006	NC_008148	CGG	3	9	105371	105379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802955
3007	NC_008148	GAG	2	6	105391	105396	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802955
3008	NC_008148	GCGCCC	2	12	105403	105414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802955
3009	NC_008148	TCC	2	6	105436	105441	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802955
3010	NC_008148	GTG	2	6	105547	105552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108802955
3011	NC_008148	CGATCT	2	12	105575	105586	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	108802955
3012	NC_008148	ACT	2	6	105659	105664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108802955
3013	NC_008148	AGC	2	6	105709	105714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802955
3014	NC_008148	GCC	2	6	105724	105729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802955
3015	NC_008148	CGC	2	6	105855	105860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802955
3016	NC_008148	CGG	2	6	105864	105869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802955
3017	NC_008148	GCGA	2	8	105895	105902	25 %	0 %	50 %	25 %	108802956
3018	NC_008148	TGCCG	2	10	105920	105929	0 %	20 %	40 %	40 %	108802956
3019	NC_008148	GCAG	2	8	105953	105960	25 %	0 %	50 %	25 %	108802956
3020	NC_008148	AGC	2	6	105985	105990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802956
3021	NC_008148	CCG	2	6	106012	106017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802956
3022	NC_008148	AGGA	2	8	106051	106058	50 %	0 %	50 %	0 %	108802956
3023	NC_008148	GAA	2	6	106110	106115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108802956
3024	NC_008148	GGCC	2	8	106187	106194	0 %	0 %	50 %	50 %	108802956
3025	NC_008148	GCA	2	6	106244	106249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802956
3026	NC_008148	GAG	2	6	106264	106269	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802956
3027	NC_008148	GGC	2	6	106278	106283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802956
3028	NC_008148	ACG	2	6	106285	106290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802956
3029	NC_008148	GGT	2	6	106313	106318	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108802956
3030	NC_008148	CCT	2	6	106364	106369	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802956
3031	NC_008148	ACGC	2	8	106381	106388	25 %	0 %	25 %	50 %	108802956
3032	NC_008148	GCA	2	6	106403	106408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802956
3033	NC_008148	CCAC	2	8	106466	106473	25 %	0 %	0 %	75 %	108802956
3034	NC_008148	TCA	2	6	106505	106510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108802956
3035	NC_008148	AGC	2	6	106522	106527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802956
3036	NC_008148	CCA	2	6	106548	106553	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108802956
3037	NC_008148	CCGG	2	8	106605	106612	0 %	0 %	50 %	50 %	108802956
3038	NC_008148	GAG	2	6	106678	106683	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802956
3039	NC_008148	GCCG	2	8	106688	106695	0 %	0 %	50 %	50 %	108802956
3040	NC_008148	CGG	2	6	106742	106747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802956
3041	NC_008148	GAG	2	6	106761	106766	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802956
3042	NC_008148	AGC	2	6	106774	106779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802956
3043	NC_008148	AGC	2	6	106801	106806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802956
3044	NC_008148	CCTCC	2	10	106830	106839	0 %	20 %	0 %	80 %	108802956
3045	NC_008148	ACT	2	6	106855	106860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108802956
3046	NC_008148	AGC	2	6	107731	107736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802957
3047	NC_008148	TCT	2	6	107759	107764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108802957
3048	NC_008148	CGG	3	9	107768	107776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802957
3049	NC_008148	CTG	2	6	107791	107796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802957
3050	NC_008148	CTC	2	6	107812	107817	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802957
3051	NC_008148	AGG	2	6	107845	107850	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802957
3052	NC_008148	GC	3	6	107859	107864	0 %	0 %	50 %	50 %	108802957
3053	NC_008148	GCC	2	6	107866	107871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802957
3054	NC_008148	GGC	2	6	107880	107885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802957
3055	NC_008148	TGC	2	6	107894	107899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802957
3056	NC_008148	CGC	2	6	107931	107936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802957
3057	NC_008148	GCC	2	6	107941	107946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802957
3058	NC_008148	CTC	2	6	107995	108000	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802957
3059	NC_008148	CGG	2	6	108003	108008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802957
3060	NC_008148	GCC	2	6	108027	108032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802957
3061	NC_008148	CGG	2	6	108072	108077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802957
3062	NC_008148	GGC	3	9	108099	108107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802957
3063	NC_008148	CGG	2	6	108123	108128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802957
3064	NC_008148	GCG	3	9	108168	108176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802957
3065	NC_008148	GAG	3	9	108178	108186	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802957
3066	NC_008148	TCG	2	6	108221	108226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802957
3067	NC_008148	GCGAGC	2	12	108329	108340	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	108802957
3068	NC_008148	GCC	2	6	108448	108453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802957
3069	NC_008148	GTG	2	6	108463	108468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108802957
3070	NC_008148	CCT	2	6	108489	108494	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802957
3071	NC_008148	CGA	2	6	108498	108503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802957
3072	NC_008148	AGC	2	6	108551	108556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802957
3073	NC_008148	GGCG	2	8	108557	108564	0 %	0 %	75 %	25 %	108802957
3074	NC_008148	GAG	2	6	108586	108591	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802957
3075	NC_008148	CGCT	2	8	108598	108605	0 %	25 %	25 %	50 %	108802957
3076	NC_008148	CTG	2	6	108682	108687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802957
3077	NC_008148	CCT	2	6	108692	108697	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802957
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3080	NC_008148	CGG	2	6	108784	108789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802957
3081	NC_008148	AGG	2	6	108809	108814	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802957
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3083	NC_008148	GC	3	6	108930	108935	0 %	0 %	50 %	50 %	108802957
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3086	NC_008148	CG	3	6	109113	109118	0 %	0 %	50 %	50 %	108802957
3087	NC_008148	GC	3	6	109125	109130	0 %	0 %	50 %	50 %	108802957
3088	NC_008148	GAT	2	6	109149	109154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108802957
3089	NC_008148	CGA	2	6	109155	109160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802957
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3091	NC_008148	GAG	2	6	109243	109248	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802957
3092	NC_008148	CCG	2	6	109269	109274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802957
3093	NC_008148	TCG	2	6	109286	109291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802957
3094	NC_008148	CGGG	2	8	109292	109299	0 %	0 %	75 %	25 %	108802957
3095	NC_008148	CGC	2	6	109302	109307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802957
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3100	NC_008148	C	6	6	109382	109387	0 %	0 %	0 %	100 %	108802957
3101	NC_008148	GCG	2	6	109418	109423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802957
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3103	NC_008148	GAG	3	9	109516	109524	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802957
3104	NC_008148	CGC	2	6	109548	109553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802957
3105	NC_008148	CGG	2	6	109578	109583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802957
3106	NC_008148	AGGGG	2	10	109608	109617	20 %	0 %	80 %	0 %	108802957
3107	NC_008148	GGTG	2	8	109680	109687	0 %	25 %	75 %	0 %	108802958
3108	NC_008148	CGA	2	6	109694	109699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802958
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3110	NC_008148	GTG	2	6	109792	109797	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108802958
3111	NC_008148	TAC	3	9	109840	109848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108802958
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3118	NC_008148	GAG	2	6	109999	110004	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802958
3119	NC_008148	GCCGCG	2	12	110033	110044	0 %	0 %	50 %	50 %	108802958
3120	NC_008148	CCG	2	6	110052	110057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802958
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3122	NC_008148	GCGG	2	8	110260	110267	0 %	0 %	75 %	25 %	108802959
3123	NC_008148	GGT	2	6	110275	110280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108802959
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3246	NC_008148	GGA	2	6	113543	113548	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802961
3247	NC_008148	GCC	2	6	113603	113608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802962
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3249	NC_008148	CG	3	6	113676	113681	0 %	0 %	50 %	50 %	108802962
3250	NC_008148	CGC	2	6	113698	113703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802962
3251	NC_008148	GCC	2	6	113709	113714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802962
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3253	NC_008148	CGC	2	6	113767	113772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802962
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3271	NC_008148	GCT	2	6	114474	114479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802963
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3274	NC_008148	CGG	2	6	114566	114571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802963
3275	NC_008148	GGA	2	6	114582	114587	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802963
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3279	NC_008148	GCT	2	6	114729	114734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802963
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3352	NC_008148	GCT	2	6	117558	117563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802966
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3355	NC_008148	G	6	6	117659	117664	0 %	0 %	100 %	0 %	108802966
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3359	NC_008148	GAA	2	6	117753	117758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108802966
3360	NC_008148	CGA	2	6	117774	117779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802966
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3362	NC_008148	AGG	2	6	117889	117894	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802966
3363	NC_008148	GGC	3	9	117991	117999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802966
3364	NC_008148	GGC	2	6	118011	118016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802966
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3366	NC_008148	CGC	2	6	118067	118072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802966
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3487	NC_008148	GAG	2	6	122176	122181	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802970
3488	NC_008148	CTC	2	6	122215	122220	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802970
3489	NC_008148	CGA	2	6	122235	122240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802970
3490	NC_008148	GCG	2	6	122267	122272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802970
3491	NC_008148	TCG	2	6	122288	122293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802970
3492	NC_008148	GCT	2	6	122321	122326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802971
3493	NC_008148	GGC	2	6	122335	122340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802971
3494	NC_008148	GAGG	2	8	122351	122358	25 %	0 %	75 %	0 %	108802971
3495	NC_008148	CGGTCG	2	12	122362	122373	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	108802971
3496	NC_008148	GTG	2	6	122379	122384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108802971
3497	NC_008148	GCT	2	6	122408	122413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802971
3498	NC_008148	GGA	2	6	122423	122428	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802971
3499	NC_008148	CG	3	6	122463	122468	0 %	0 %	50 %	50 %	108802971
3500	NC_008148	GGC	2	6	122477	122482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802971

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