MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rubrobacter xylanophilus DSM 9941 chromosome

Total Repeats: 88957

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_008148	GAG	2	6	52180	52185	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802906
1502	NC_008148	AGG	2	6	52241	52246	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802906
1503	NC_008148	G	6	6	52291	52296	0 %	0 %	100 %	0 %	108802906
1504	NC_008148	AGG	2	6	52307	52312	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802906
1505	NC_008148	CCGGG	2	10	52313	52322	0 %	0 %	60 %	40 %	108802906
1506	NC_008148	CGG	2	6	52323	52328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802906
1507	NC_008148	GCG	2	6	52336	52341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802907
1508	NC_008148	CGA	2	6	52370	52375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802907
1509	NC_008148	GCG	2	6	52376	52381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802907
1510	NC_008148	CGCC	2	8	52389	52396	0 %	0 %	25 %	75 %	108802907
1511	NC_008148	GCCG	2	8	52400	52407	0 %	0 %	50 %	50 %	108802907
1512	NC_008148	GGC	3	9	52475	52483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802907
1513	NC_008148	GGT	2	6	52508	52513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108802907
1514	NC_008148	GCTC	2	8	52567	52574	0 %	25 %	25 %	50 %	108802907
1515	NC_008148	CG	3	6	52584	52589	0 %	0 %	50 %	50 %	108802907
1516	NC_008148	G	6	6	52589	52594	0 %	0 %	100 %	0 %	108802907
1517	NC_008148	GAG	2	6	52602	52607	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802907
1518	NC_008148	GCA	2	6	52627	52632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802907
1519	NC_008148	TCT	2	6	52633	52638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108802907
1520	NC_008148	CGG	2	6	52656	52661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802907
1521	NC_008148	CTC	2	6	52689	52694	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802907
1522	NC_008148	CGGG	2	8	52709	52716	0 %	0 %	75 %	25 %	108802907
1523	NC_008148	CGG	2	6	52721	52726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802907
1524	NC_008148	TCT	2	6	52735	52740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108802907
1525	NC_008148	CCT	2	6	52747	52752	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802907
1526	NC_008148	CCCT	2	8	52755	52762	0 %	25 %	0 %	75 %	108802907
1527	NC_008148	CGG	2	6	52875	52880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802907
1528	NC_008148	CTG	2	6	52893	52898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802907
1529	NC_008148	GGA	2	6	52910	52915	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802907
1530	NC_008148	G	6	6	53071	53076	0 %	0 %	100 %	0 %	108802907
1531	NC_008148	GAG	2	6	53085	53090	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802907
1532	NC_008148	ATG	2	6	53124	53129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108802907
1533	NC_008148	GCT	2	6	53132	53137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802907
1534	NC_008148	GCC	2	6	53156	53161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802907
1535	NC_008148	CGA	2	6	53189	53194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802907
1536	NC_008148	GAAGGT	2	12	53195	53206	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	108802907
1537	NC_008148	GGA	2	6	53231	53236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802907
1538	NC_008148	GGA	2	6	53243	53248	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802907
1539	NC_008148	GAG	2	6	53292	53297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802907
1540	NC_008148	GAG	3	9	53313	53321	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802907
1541	NC_008148	AAG	2	6	53433	53438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108802907
1542	NC_008148	CGC	2	6	53492	53497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802907
1543	NC_008148	GAG	2	6	53538	53543	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802907
1544	NC_008148	TACGG	2	10	53619	53628	20 %	20 %	40 %	20 %	108802907
1545	NC_008148	GGA	2	6	53636	53641	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802907
1546	NC_008148	CTG	3	9	53664	53672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802907
1547	NC_008148	GCGAC	2	10	53686	53695	20 %	0 %	40 %	40 %	108802907
1548	NC_008148	GAGGCG	2	12	53715	53726	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	108802907
1549	NC_008148	TGC	2	6	53749	53754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802907
1550	NC_008148	GC	3	6	53753	53758	0 %	0 %	50 %	50 %	108802907
1551	NC_008148	GGA	2	6	53771	53776	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802907
1552	NC_008148	CGG	2	6	53791	53796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802907
1553	NC_008148	CGA	2	6	53819	53824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802907
1554	NC_008148	GCGCC	2	10	53875	53884	0 %	0 %	40 %	60 %	108802908
1555	NC_008148	GAG	2	6	53909	53914	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802908
1556	NC_008148	GGC	2	6	53955	53960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802908
1557	NC_008148	GAG	2	6	54005	54010	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802908
1558	NC_008148	CG	3	6	54018	54023	0 %	0 %	50 %	50 %	108802908
1559	NC_008148	C	6	6	54135	54140	0 %	0 %	0 %	100 %	108802908
1560	NC_008148	GCG	3	9	54141	54149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802908
1561	NC_008148	CG	3	6	54199	54204	0 %	0 %	50 %	50 %	108802908
1562	NC_008148	T	7	7	54252	54258	0 %	100 %	0 %	0 %	108802908
1563	NC_008148	CCT	2	6	54282	54287	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802908
1564	NC_008148	CTC	3	9	54337	54345	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802908
1565	NC_008148	GCC	2	6	54406	54411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802908
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1573	NC_008148	GC	3	6	54623	54628	0 %	0 %	50 %	50 %	108802908
1574	NC_008148	C	7	7	54646	54652	0 %	0 %	0 %	100 %	108802908
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1583	NC_008148	GC	3	6	55015	55020	0 %	0 %	50 %	50 %	108802909
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1594	NC_008148	CG	3	6	55260	55265	0 %	0 %	50 %	50 %	108802909
1595	NC_008148	GAG	3	9	55273	55281	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802909
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1609	NC_008148	CCGGC	2	10	55590	55599	0 %	0 %	40 %	60 %	108802909
1610	NC_008148	TCG	2	6	55616	55621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802909
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1621	NC_008148	GCG	2	6	55955	55960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802910
1622	NC_008148	GCG	2	6	55973	55978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802910
1623	NC_008148	GACGG	2	10	55984	55993	20 %	0 %	60 %	20 %	108802910
1624	NC_008148	CGA	2	6	56025	56030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802910
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1872	NC_008148	CACCC	2	10	64735	64744	20 %	0 %	0 %	80 %	108802918
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