MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rubrobacter xylanophilus DSM 9941 chromosome

Total Repeats: 88957

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008148	CTC	2	6	18955	18960	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802875
502	NC_008148	GCG	2	6	18974	18979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802875
503	NC_008148	GCT	2	6	19003	19008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802875
504	NC_008148	AGG	3	9	19038	19046	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802875
505	NC_008148	GGA	2	6	19059	19064	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802875
506	NC_008148	GCTC	2	8	19077	19084	0 %	25 %	25 %	50 %	108802875
507	NC_008148	CGG	3	9	19094	19102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802875
508	NC_008148	CGCCC	2	10	19114	19123	0 %	0 %	20 %	80 %	108802875
509	NC_008148	GAT	2	6	19144	19149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108802875
510	NC_008148	GTC	2	6	19186	19191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802875
511	NC_008148	GAA	2	6	19219	19224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108802875
512	NC_008148	TGC	2	6	19244	19249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802875
513	NC_008148	GCT	2	6	19272	19277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802875
514	NC_008148	GGT	2	6	19297	19302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108802875
515	NC_008148	GAC	2	6	19303	19308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802875
516	NC_008148	C	6	6	19426	19431	0 %	0 %	0 %	100 %	108802875
517	NC_008148	GGT	2	6	19441	19446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108802875
518	NC_008148	TCT	2	6	19467	19472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108802875
519	NC_008148	ATG	2	6	19523	19528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108802875
520	NC_008148	GCCGG	2	10	19557	19566	0 %	0 %	60 %	40 %	108802875
521	NC_008148	G	6	6	19565	19570	0 %	0 %	100 %	0 %	108802875
522	NC_008148	TCC	2	6	19583	19588	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802875
523	NC_008148	GCT	2	6	19624	19629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802875
524	NC_008148	AGC	2	6	19634	19639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802875
525	NC_008148	GCC	2	6	19646	19651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802875
526	NC_008148	GCC	2	6	19690	19695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802875
527	NC_008148	CTT	2	6	19735	19740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108802875
528	NC_008148	GCC	2	6	19759	19764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802875
529	NC_008148	CGC	2	6	19773	19778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802875
530	NC_008148	CGC	2	6	19783	19788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802875
531	NC_008148	GGT	2	6	19854	19859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108802875
532	NC_008148	CAG	2	6	19867	19872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802875
533	NC_008148	CCCG	2	8	19962	19969	0 %	0 %	25 %	75 %	108802875
534	NC_008148	CCA	2	6	19989	19994	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108802875
535	NC_008148	AGG	2	6	20018	20023	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802875
536	NC_008148	GCT	2	6	20026	20031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802875
537	NC_008148	GCC	2	6	20032	20037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802875
538	NC_008148	CGGG	2	8	20077	20084	0 %	0 %	75 %	25 %	108802875
539	NC_008148	CGGA	2	8	20093	20100	25 %	0 %	50 %	25 %	108802875
540	NC_008148	GCCG	2	8	20120	20127	0 %	0 %	50 %	50 %	108802875
541	NC_008148	CGGC	2	8	20128	20135	0 %	0 %	50 %	50 %	108802875
542	NC_008148	G	6	6	20142	20147	0 %	0 %	100 %	0 %	108802875
543	NC_008148	CTC	2	6	20158	20163	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802875
544	NC_008148	CTC	3	9	20167	20175	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802875
545	NC_008148	GC	3	6	20176	20181	0 %	0 %	50 %	50 %	108802875
546	NC_008148	GCC	2	6	20196	20201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802875
547	NC_008148	CAG	2	6	20257	20262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802875
548	NC_008148	TTC	2	6	20315	20320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108802875
549	NC_008148	AGC	2	6	20333	20338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802875
550	NC_008148	CCA	2	6	20403	20408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108802875
551	NC_008148	CTC	2	6	20431	20436	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802875
552	NC_008148	CGG	2	6	20445	20450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802875
553	NC_008148	CGC	2	6	20465	20470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802875
554	NC_008148	CGC	2	6	20504	20509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802875
555	NC_008148	TCG	2	6	20528	20533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802875
556	NC_008148	CG	4	8	20557	20564	0 %	0 %	50 %	50 %	108802875
557	NC_008148	CTC	2	6	20569	20574	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802875
558	NC_008148	TCC	2	6	20600	20605	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802875
559	NC_008148	CGCT	2	8	20606	20613	0 %	25 %	25 %	50 %	108802875
560	NC_008148	CAG	2	6	20617	20622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802875
561	NC_008148	CCT	2	6	20628	20633	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802875
562	NC_008148	GGC	2	6	20659	20664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802875
563	NC_008148	CTT	2	6	20695	20700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108802875
564	NC_008148	CTC	2	6	20704	20709	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802875
565	NC_008148	TGG	2	6	20744	20749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108802875
566	NC_008148	CTT	2	6	20752	20757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108802875
567	NC_008148	CTC	2	6	20758	20763	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802875
568	NC_008148	CCG	2	6	20764	20769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802875
569	NC_008148	TCC	3	9	20774	20782	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802875
570	NC_008148	CT	3	6	20786	20791	0 %	50 %	0 %	50 %	108802875
571	NC_008148	GCC	2	6	20840	20845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802875
572	NC_008148	AGC	2	6	20846	20851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802875
573	NC_008148	GTG	2	6	20861	20866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108802875
574	NC_008148	TCG	2	6	20882	20887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802875
575	NC_008148	CGG	2	6	20929	20934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802875
576	NC_008148	CCA	2	6	20943	20948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108802875
577	NC_008148	CGC	2	6	20971	20976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802875
578	NC_008148	GCA	2	6	21009	21014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802875
579	NC_008148	CGG	2	6	21032	21037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802875
580	NC_008148	AGC	2	6	21068	21073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802875
581	NC_008148	CCT	2	6	21075	21080	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802875
582	NC_008148	GCC	3	9	21141	21149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802875
583	NC_008148	CTC	2	6	21157	21162	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802875
584	NC_008148	GCG	2	6	21186	21191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802875
585	NC_008148	CTT	2	6	21196	21201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108802875
586	NC_008148	TCCC	2	8	21322	21329	0 %	25 %	0 %	75 %	108802876
587	NC_008148	CG	3	6	21345	21350	0 %	0 %	50 %	50 %	108802876
588	NC_008148	CGC	2	6	21368	21373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802876
589	NC_008148	GAA	2	6	21383	21388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108802876
590	NC_008148	ATCCTG	2	12	21432	21443	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	108802876
591	NC_008148	GC	3	6	21464	21469	0 %	0 %	50 %	50 %	108802876
592	NC_008148	GCC	2	6	21547	21552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802876
593	NC_008148	AG	3	6	21579	21584	50 %	0 %	50 %	0 %	108802876
594	NC_008148	GCCG	2	8	21587	21594	0 %	0 %	50 %	50 %	108802876
595	NC_008148	GCT	2	6	21623	21628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802876
596	NC_008148	CGG	2	6	21635	21640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802876
597	NC_008148	TCC	2	6	21667	21672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802877
598	NC_008148	CGG	2	6	21678	21683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802877
599	NC_008148	TCG	2	6	21730	21735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802877
600	NC_008148	GCC	2	6	21756	21761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802877
601	NC_008148	CCCT	2	8	21762	21769	0 %	25 %	0 %	75 %	108802877
602	NC_008148	GCC	2	6	21774	21779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802877
603	NC_008148	CTC	2	6	21783	21788	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802877
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606	NC_008148	CGGG	2	8	21813	21820	0 %	0 %	75 %	25 %	108802877
607	NC_008148	CCGG	2	8	21824	21831	0 %	0 %	50 %	50 %	108802877
608	NC_008148	ACC	2	6	21844	21849	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108802877
609	NC_008148	CGG	2	6	21881	21886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802877
610	NC_008148	CGC	2	6	21920	21925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802877
611	NC_008148	CGC	2	6	21959	21964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802877
612	NC_008148	GCG	2	6	22022	22027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802877
613	NC_008148	CTC	2	6	22062	22067	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802877
614	NC_008148	CGG	3	9	22080	22088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802877
615	NC_008148	CGG	2	6	22190	22195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802877
616	NC_008148	CAC	3	9	22218	22226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108802877
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618	NC_008148	CTC	3	9	22323	22331	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802877
619	NC_008148	CTC	2	6	22341	22346	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802877
620	NC_008148	CCA	2	6	22406	22411	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108802877
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622	NC_008148	G	6	6	22482	22487	0 %	0 %	100 %	0 %	108802877
623	NC_008148	CGA	2	6	22544	22549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802877
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625	NC_008148	CCG	2	6	22569	22574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802877
626	NC_008148	CCT	2	6	22580	22585	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802877
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