MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rubrobacter xylanophilus DSM 9941 chromosome

Total Repeats: 88957

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_008148	CGC	2	6	191431	191436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803041
5502	NC_008148	G	7	7	191449	191455	0 %	0 %	100 %	0 %	108803041
5503	NC_008148	GCCC	2	8	191458	191465	0 %	0 %	25 %	75 %	108803041
5504	NC_008148	ACC	2	6	191498	191503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108803041
5505	NC_008148	CGG	2	6	191512	191517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803041
5506	NC_008148	GCGGG	2	10	191553	191562	0 %	0 %	80 %	20 %	108803042
5507	NC_008148	CAC	2	6	191619	191624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108803042
5508	NC_008148	CGCCC	2	10	191643	191652	0 %	0 %	20 %	80 %	108803042
5509	NC_008148	ATC	2	6	191686	191691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108803042
5510	NC_008148	CTG	2	6	191707	191712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803042
5511	NC_008148	GGC	2	6	191718	191723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803042
5512	NC_008148	G	6	6	191729	191734	0 %	0 %	100 %	0 %	108803042
5513	NC_008148	C	7	7	191755	191761	0 %	0 %	0 %	100 %	108803042
5514	NC_008148	GGC	2	6	191775	191780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803042
5515	NC_008148	TTC	2	6	191809	191814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108803042
5516	NC_008148	GC	3	6	191867	191872	0 %	0 %	50 %	50 %	108803042
5517	NC_008148	GCC	2	6	191878	191883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803042
5518	NC_008148	CTG	2	6	191968	191973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803042
5519	NC_008148	CGG	4	12	191976	191987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803042
5520	NC_008148	G	7	7	191986	191992	0 %	0 %	100 %	0 %	108803042
5521	NC_008148	GGCG	2	8	192003	192010	0 %	0 %	75 %	25 %	108803042
5522	NC_008148	CTG	2	6	192016	192021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803042
5523	NC_008148	CGA	2	6	192062	192067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803042
5524	NC_008148	GCT	2	6	192072	192077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803042
5525	NC_008148	CGG	2	6	192095	192100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803042
5526	NC_008148	GCT	3	9	192129	192137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803042
5527	NC_008148	TGC	2	6	192146	192151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803042
5528	NC_008148	CGC	2	6	192156	192161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803042
5529	NC_008148	GGCT	2	8	192166	192173	0 %	25 %	50 %	25 %	108803042
5530	NC_008148	GCG	2	6	192190	192195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803042
5531	NC_008148	CCG	3	9	192224	192232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803042
5532	NC_008148	CT	3	6	192256	192261	0 %	50 %	0 %	50 %	108803042
5533	NC_008148	CCG	2	6	192311	192316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803042
5534	NC_008148	GCT	2	6	192318	192323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803042
5535	NC_008148	CTCG	2	8	192360	192367	0 %	25 %	25 %	50 %	108803042
5536	NC_008148	CTG	2	6	192382	192387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803042
5537	NC_008148	G	7	7	192387	192393	0 %	0 %	100 %	0 %	108803042
5538	NC_008148	AGG	2	6	192419	192424	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803042
5539	NC_008148	TCG	4	12	192433	192444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803043
5540	NC_008148	CGT	2	6	192449	192454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803043
5541	NC_008148	CGT	2	6	192458	192463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803043
5542	NC_008148	GCG	2	6	192470	192475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803043
5543	NC_008148	GGGC	2	8	192476	192483	0 %	0 %	75 %	25 %	108803043
5544	NC_008148	CGGC	2	8	192491	192498	0 %	0 %	50 %	50 %	108803043
5545	NC_008148	GGGC	2	8	192500	192507	0 %	0 %	75 %	25 %	108803043
5546	NC_008148	TCCACC	2	12	192523	192534	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	108803043
5547	NC_008148	CG	3	6	192542	192547	0 %	0 %	50 %	50 %	108803043
5548	NC_008148	CGGA	2	8	192754	192761	25 %	0 %	50 %	25 %	108803043
5549	NC_008148	CGGG	2	8	192808	192815	0 %	0 %	75 %	25 %	108803043
5550	NC_008148	TCG	2	6	192827	192832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803043
5551	NC_008148	CGGG	2	8	192833	192840	0 %	0 %	75 %	25 %	108803043
5552	NC_008148	CGC	2	6	192862	192867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803043
5553	NC_008148	CGC	2	6	192872	192877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803043
5554	NC_008148	ACCC	2	8	192907	192914	25 %	0 %	0 %	75 %	108803043
5555	NC_008148	GAG	2	6	192930	192935	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803043
5556	NC_008148	GAG	2	6	192948	192953	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803043
5557	NC_008148	CG	3	6	192969	192974	0 %	0 %	50 %	50 %	108803043
5558	NC_008148	AGG	2	6	193201	193206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803044
5559	NC_008148	AGG	2	6	193231	193236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803044
5560	NC_008148	CAC	2	6	193283	193288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108803044
5561	NC_008148	GAA	2	6	193352	193357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108803044
5562	NC_008148	CCT	2	6	193364	193369	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803044
5563	NC_008148	TCC	2	6	193440	193445	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803044
5564	NC_008148	CGGCCC	2	12	193457	193468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803044
5565	NC_008148	ACCCGA	2	12	193490	193501	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	108803044
5566	NC_008148	GGA	2	6	193702	193707	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803045
5567	NC_008148	CGGG	3	12	193739	193750	0 %	0 %	75 %	25 %	108803045
5568	NC_008148	CGGG	2	8	193779	193786	0 %	0 %	75 %	25 %	108803045
5569	NC_008148	GCG	2	6	193787	193792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803045
5570	NC_008148	GGT	2	6	193802	193807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108803045
5571	NC_008148	AGC	2	6	193837	193842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803045
5572	NC_008148	GGAG	2	8	193849	193856	25 %	0 %	75 %	0 %	108803045
5573	NC_008148	CAC	2	6	193881	193886	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108803045
5574	NC_008148	GACC	2	8	193889	193896	25 %	0 %	25 %	50 %	108803045
5575	NC_008148	GCT	2	6	193925	193930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803045
5576	NC_008148	CTA	2	6	194033	194038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108803045
5577	NC_008148	GGA	2	6	194042	194047	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803045
5578	NC_008148	CGG	2	6	194074	194079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803045
5579	NC_008148	ACG	2	6	194119	194124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803045
5580	NC_008148	CGA	2	6	194138	194143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803045
5581	NC_008148	G	6	6	194161	194166	0 %	0 %	100 %	0 %	108803045
5582	NC_008148	CCG	2	6	194169	194174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803045
5583	NC_008148	GCG	2	6	194211	194216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803045
5584	NC_008148	GGT	2	6	194228	194233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108803045
5585	NC_008148	GAGGT	2	10	194250	194259	20 %	20 %	60 %	0 %	108803045
5586	NC_008148	CGG	2	6	194269	194274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803045
5587	NC_008148	CT	3	6	194343	194348	0 %	50 %	0 %	50 %	108803045
5588	NC_008148	GAG	2	6	194358	194363	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803045
5589	NC_008148	CCG	2	6	194440	194445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803045
5590	NC_008148	GGCT	2	8	194460	194467	0 %	25 %	50 %	25 %	108803045
5591	NC_008148	CTCCC	2	10	194473	194482	0 %	20 %	0 %	80 %	108803045
5592	NC_008148	GAG	2	6	194499	194504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803045
5593	NC_008148	ACC	2	6	194550	194555	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108803045
5594	NC_008148	G	6	6	194562	194567	0 %	0 %	100 %	0 %	108803045
5595	NC_008148	ACT	3	9	194593	194601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108803045
5596	NC_008148	GGA	2	6	194672	194677	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803045
5597	NC_008148	CGCAG	2	10	194692	194701	20 %	0 %	40 %	40 %	108803045
5598	NC_008148	GGGAGG	2	12	194719	194730	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	108803045
5599	NC_008148	GAGG	2	8	194762	194769	25 %	0 %	75 %	0 %	108803045
5600	NC_008148	CCTCC	2	10	194792	194801	0 %	20 %	0 %	80 %	108803045
5601	NC_008148	GCTACA	2	12	194875	194886	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	108803045
5602	NC_008148	GGT	2	6	194912	194917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108803045
5603	NC_008148	GGA	3	9	194918	194926	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803045
5604	NC_008148	TGT	2	6	194956	194961	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108803045
5605	NC_008148	GAG	2	6	194967	194972	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803045
5606	NC_008148	GGA	2	6	194996	195001	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803045
5607	NC_008148	GCCC	2	8	195035	195042	0 %	0 %	25 %	75 %	108803045
5608	NC_008148	CGGC	2	8	195147	195154	0 %	0 %	50 %	50 %	108803046
5609	NC_008148	GGGC	2	8	195177	195184	0 %	0 %	75 %	25 %	108803046
5610	NC_008148	GCT	3	9	195195	195203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803046
5611	NC_008148	GGC	2	6	195223	195228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803046
5612	NC_008148	GCG	2	6	195233	195238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803046
5613	NC_008148	AGGG	2	8	195242	195249	25 %	0 %	75 %	0 %	108803046
5614	NC_008148	G	6	6	195247	195252	0 %	0 %	100 %	0 %	108803046
5615	NC_008148	GCT	2	6	195276	195281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803046
5616	NC_008148	TCC	2	6	195341	195346	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803046
5617	NC_008148	CGG	2	6	195366	195371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803046
5618	NC_008148	GCGCTC	2	12	195496	195507	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	108803046
5619	NC_008148	ATC	2	6	195532	195537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108803046
5620	NC_008148	TCA	2	6	195539	195544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108803046
5621	NC_008148	CGC	2	6	195552	195557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803046
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5623	NC_008148	AGA	2	6	195581	195586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108803046
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5744	NC_008148	CGC	2	6	199935	199940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803051
5745	NC_008148	CG	3	6	199942	199947	0 %	0 %	50 %	50 %	108803051
5746	NC_008148	CAT	2	6	199962	199967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108803051
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5749	NC_008148	CCT	2	6	200042	200047	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803051
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5823	NC_008148	CTC	2	6	201766	201771	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803053
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5983	NC_008148	ACCG	2	8	207442	207449	25 %	0 %	25 %	50 %	108803059
5984	NC_008148	G	6	6	207475	207480	0 %	0 %	100 %	0 %	108803059
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5986	NC_008148	GCC	2	6	207528	207533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803059
5987	NC_008148	CGT	2	6	207582	207587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803059
5988	NC_008148	CGC	2	6	207633	207638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803059
5989	NC_008148	GAG	3	9	207670	207678	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803059
5990	NC_008148	GGA	2	6	207681	207686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803059
5991	NC_008148	GCC	2	6	207690	207695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803059
5992	NC_008148	CTC	2	6	207702	207707	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803059
5993	NC_008148	CCA	2	6	207728	207733	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108803059
5994	NC_008148	GC	4	8	207740	207747	0 %	0 %	50 %	50 %	108803059
5995	NC_008148	GCTC	2	8	207773	207780	0 %	25 %	25 %	50 %	108803059
5996	NC_008148	AAG	2	6	207790	207795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108803059
5997	NC_008148	CGT	2	6	207801	207806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803059
5998	NC_008148	CGC	2	6	207831	207836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803059
5999	NC_008148	GGT	2	6	207861	207866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108803059
6000	NC_008148	GCA	2	6	207869	207874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803059

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