MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rubrobacter xylanophilus DSM 9941 chromosome

Total Repeats: 88957

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_008148	CCAC	2	8	174455	174462	25 %	0 %	0 %	75 %	108803023
5002	NC_008148	TGG	2	6	174467	174472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108803023
5003	NC_008148	TGG	2	6	174536	174541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108803023
5004	NC_008148	CCA	2	6	174578	174583	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108803023
5005	NC_008148	TGG	2	6	174602	174607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108803023
5006	NC_008148	TCG	2	6	174655	174660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803023
5007	NC_008148	GAT	2	6	174663	174668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108803023
5008	NC_008148	CGG	2	6	174747	174752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803023
5009	NC_008148	ACGA	2	8	174760	174767	50 %	0 %	25 %	25 %	108803023
5010	NC_008148	GCC	2	6	174768	174773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803023
5011	NC_008148	GCG	2	6	174796	174801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803023
5012	NC_008148	TTG	2	6	174805	174810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108803023
5013	NC_008148	TCG	2	6	174811	174816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803023
5014	NC_008148	GCC	2	6	174870	174875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803023
5015	NC_008148	GAC	2	6	174891	174896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803023
5016	NC_008148	CTC	2	6	174912	174917	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803023
5017	NC_008148	GAC	2	6	174933	174938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803023
5018	NC_008148	GC	3	6	174953	174958	0 %	0 %	50 %	50 %	108803023
5019	NC_008148	TCT	2	6	175013	175018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108803023
5020	NC_008148	GTA	3	9	175074	175082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108803023
5021	NC_008148	GTC	2	6	175086	175091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803023
5022	NC_008148	C	6	6	175115	175120	0 %	0 %	0 %	100 %	108803023
5023	NC_008148	CTT	2	6	175191	175196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108803023
5024	NC_008148	TCG	2	6	175225	175230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803023
5025	NC_008148	GAA	2	6	175251	175256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108803023
5026	NC_008148	CTC	2	6	175260	175265	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803023
5027	NC_008148	CTC	2	6	175290	175295	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803023
5028	NC_008148	GGCA	2	8	175323	175330	25 %	0 %	50 %	25 %	108803023
5029	NC_008148	CCCCG	2	10	175354	175363	0 %	0 %	20 %	80 %	108803024
5030	NC_008148	CTC	2	6	175402	175407	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803024
5031	NC_008148	GCC	2	6	175420	175425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803024
5032	NC_008148	GGA	2	6	175482	175487	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803024
5033	NC_008148	TGA	2	6	175503	175508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108803024
5034	NC_008148	CGA	2	6	175554	175559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803024
5035	NC_008148	AGC	2	6	175628	175633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803024
5036	NC_008148	CTT	2	6	175651	175656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108803024
5037	NC_008148	CGC	2	6	175659	175664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803024
5038	NC_008148	GTCCAT	2	12	175705	175716	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	108803024
5039	NC_008148	TCT	2	6	175725	175730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108803024
5040	NC_008148	CGG	2	6	175756	175761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803024
5041	NC_008148	CCT	2	6	175764	175769	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803024
5042	NC_008148	CCG	2	6	175788	175793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803024
5043	NC_008148	CTCG	2	8	175828	175835	0 %	25 %	25 %	50 %	108803024
5044	NC_008148	TCG	2	6	175874	175879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803024
5045	NC_008148	ATG	2	6	175997	176002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108803024
5046	NC_008148	GAG	2	6	176389	176394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803025
5047	NC_008148	CGG	2	6	176403	176408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803025
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5049	NC_008148	G	6	6	176455	176460	0 %	0 %	100 %	0 %	108803025
5050	NC_008148	GGA	2	6	176479	176484	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803025
5051	NC_008148	CGG	2	6	176502	176507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803025
5052	NC_008148	GAGG	2	8	176557	176564	25 %	0 %	75 %	0 %	108803025
5053	NC_008148	G	6	6	176579	176584	0 %	0 %	100 %	0 %	108803025
5054	NC_008148	AGG	2	6	176585	176590	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803025
5055	NC_008148	AGGGG	2	10	176616	176625	20 %	0 %	80 %	0 %	108803025
5056	NC_008148	GCG	2	6	176629	176634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803025
5057	NC_008148	GGGC	2	8	176635	176642	0 %	0 %	75 %	25 %	108803025
5058	NC_008148	GGCC	2	8	176649	176656	0 %	0 %	50 %	50 %	108803025
5059	NC_008148	GGC	2	6	176676	176681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803025
5060	NC_008148	GTGCT	2	10	176744	176753	0 %	40 %	40 %	20 %	108803025
5061	NC_008148	GC	3	6	176799	176804	0 %	0 %	50 %	50 %	108803025
5062	NC_008148	TGCCG	2	10	176805	176814	0 %	20 %	40 %	40 %	108803025
5063	NC_008148	CG	3	6	176839	176844	0 %	0 %	50 %	50 %	108803025
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5069	NC_008148	CGC	2	6	177021	177026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803025
5070	NC_008148	CTC	2	6	177055	177060	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803025
5071	NC_008148	CGG	2	6	177087	177092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803025
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5074	NC_008148	CGC	2	6	177235	177240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803026
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5080	NC_008148	GCGG	2	8	177343	177350	0 %	0 %	75 %	25 %	108803026
5081	NC_008148	CCA	2	6	177362	177367	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108803026
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5085	NC_008148	CAG	2	6	177468	177473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803026
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5089	NC_008148	CTC	3	9	177555	177563	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803026
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5092	NC_008148	CTC	2	6	177615	177620	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803026
5093	NC_008148	CGGCAC	2	12	177645	177656	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	108803026
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5105	NC_008148	CAG	2	6	177984	177989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803026
5106	NC_008148	GCG	3	9	178021	178029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803026
5107	NC_008148	GCGCC	2	10	178046	178055	0 %	0 %	40 %	60 %	108803026
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5120	NC_008148	GCCC	2	8	178572	178579	0 %	0 %	25 %	75 %	108803027
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5122	NC_008148	GGA	2	6	178623	178628	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803027
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5230	NC_008148	GGAGG	2	10	182553	182562	20 %	0 %	80 %	0 %	108803033
5231	NC_008148	ACG	2	6	182579	182584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803033
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5241	NC_008148	TCG	2	6	182906	182911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803033
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5243	NC_008148	CCGC	2	8	183017	183024	0 %	0 %	25 %	75 %	108803033
5244	NC_008148	GCG	2	6	183060	183065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803033
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5364	NC_008148	GCG	2	6	187117	187122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803038
5365	NC_008148	CTC	2	6	187128	187133	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803038
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5484	NC_008148	GCC	2	6	190883	190888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803041
5485	NC_008148	GC	3	6	190899	190904	0 %	0 %	50 %	50 %	108803041
5486	NC_008148	CTG	3	9	190928	190936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803041
5487	NC_008148	G	6	6	190940	190945	0 %	0 %	100 %	0 %	108803041
5488	NC_008148	G	6	6	190966	190971	0 %	0 %	100 %	0 %	108803041
5489	NC_008148	GAG	2	6	190973	190978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803041
5490	NC_008148	GTG	2	6	190994	190999	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108803041
5491	NC_008148	GCG	2	6	191000	191005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803041
5492	NC_008148	GCC	2	6	191031	191036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803041
5493	NC_008148	GC	3	6	191100	191105	0 %	0 %	50 %	50 %	108803041
5494	NC_008148	G	7	7	191164	191170	0 %	0 %	100 %	0 %	108803041
5495	NC_008148	GTG	2	6	191174	191179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108803041
5496	NC_008148	GGA	2	6	191194	191199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803041
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5498	NC_008148	CGG	2	6	191216	191221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803041
5499	NC_008148	CCCT	2	8	191342	191349	0 %	25 %	0 %	75 %	108803041
5500	NC_008148	CGG	2	6	191422	191427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803041

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