MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rubrobacter xylanophilus DSM 9941 chromosome

Total Repeats: 88957

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_008148	CGG	2	6	157453	157458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803004
4502	NC_008148	GCC	2	6	157480	157485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803004
4503	NC_008148	C	6	6	157579	157584	0 %	0 %	0 %	100 %	108803004
4504	NC_008148	CAT	2	6	157594	157599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108803004
4505	NC_008148	GAG	2	6	157615	157620	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803004
4506	NC_008148	GGC	3	9	157660	157668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803004
4507	NC_008148	GCG	2	6	157744	157749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803004
4508	NC_008148	GAT	2	6	157780	157785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108803004
4509	NC_008148	CAC	2	6	157888	157893	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108803004
4510	NC_008148	CAGCGC	2	12	157897	157908	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	108803004
4511	NC_008148	GGGATG	2	12	157925	157936	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	108803004
4512	NC_008148	GGC	2	6	157975	157980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803004
4513	NC_008148	CTG	2	6	157987	157992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803004
4514	NC_008148	AGCGGC	2	12	158003	158014	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	108803004
4515	NC_008148	GC	3	6	158072	158077	0 %	0 %	50 %	50 %	108803004
4516	NC_008148	CTC	2	6	158086	158091	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803004
4517	NC_008148	GGCG	2	8	158092	158099	0 %	0 %	75 %	25 %	108803004
4518	NC_008148	GCT	2	6	158112	158117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803004
4519	NC_008148	TCT	2	6	158239	158244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108803005
4520	NC_008148	GCG	2	6	158256	158261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803005
4521	NC_008148	GGC	2	6	158271	158276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803005
4522	NC_008148	CCT	2	6	158291	158296	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803005
4523	NC_008148	GCG	2	6	158370	158375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803005
4524	NC_008148	GGT	2	6	158397	158402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108803005
4525	NC_008148	AGG	2	6	158419	158424	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803005
4526	NC_008148	AGC	2	6	158452	158457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803005
4527	NC_008148	GGC	2	6	158462	158467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803005
4528	NC_008148	CCA	2	6	158475	158480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108803005
4529	NC_008148	CGGAG	2	10	158504	158513	20 %	0 %	60 %	20 %	108803005
4530	NC_008148	GCCGG	2	10	158562	158571	0 %	0 %	60 %	40 %	108803005
4531	NC_008148	GTC	2	6	158598	158603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803005
4532	NC_008148	GAG	2	6	158682	158687	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803005
4533	NC_008148	TCG	2	6	158692	158697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803005
4534	NC_008148	GGC	2	6	158769	158774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803005
4535	NC_008148	C	6	6	158811	158816	0 %	0 %	0 %	100 %	108803005
4536	NC_008148	GGC	2	6	158817	158822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803005
4537	NC_008148	GGC	2	6	158856	158861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803005
4538	NC_008148	GTA	2	6	158913	158918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108803005
4539	NC_008148	GGT	2	6	158931	158936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108803005
4540	NC_008148	GGC	2	6	158940	158945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803005
4541	NC_008148	CGA	2	6	158960	158965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803005
4542	NC_008148	GCC	2	6	158973	158978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803005
4543	NC_008148	AGG	2	6	159002	159007	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803005
4544	NC_008148	CGC	2	6	159041	159046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803005
4545	NC_008148	GCG	2	6	159198	159203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803006
4546	NC_008148	GC	3	6	159216	159221	0 %	0 %	50 %	50 %	108803006
4547	NC_008148	TGC	2	6	159230	159235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803006
4548	NC_008148	G	6	6	159238	159243	0 %	0 %	100 %	0 %	108803006
4549	NC_008148	CTG	2	6	159247	159252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803006
4550	NC_008148	CTC	2	6	159253	159258	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803006
4551	NC_008148	GTG	2	6	159268	159273	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108803006
4552	NC_008148	GACC	2	8	159285	159292	25 %	0 %	25 %	50 %	108803006
4553	NC_008148	GTG	2	6	159295	159300	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108803006
4554	NC_008148	GCC	2	6	159322	159327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803006
4555	NC_008148	GTG	2	6	159352	159357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108803006
4556	NC_008148	G	6	6	159366	159371	0 %	0 %	100 %	0 %	108803006
4557	NC_008148	CG	3	6	159389	159394	0 %	0 %	50 %	50 %	108803006
4558	NC_008148	CGC	2	6	159438	159443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803006
4559	NC_008148	G	6	6	159454	159459	0 %	0 %	100 %	0 %	108803006
4560	NC_008148	TGG	3	9	159518	159526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108803006
4561	NC_008148	GGA	2	6	159540	159545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803006
4562	NC_008148	CGG	2	6	159561	159566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803006
4563	NC_008148	CGG	2	6	159695	159700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803006
4564	NC_008148	CAG	2	6	159721	159726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803006
4565	NC_008148	CGG	2	6	159746	159751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803006
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4569	NC_008148	GCG	2	6	159799	159804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803006
4570	NC_008148	GGC	2	6	159948	159953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803006
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4578	NC_008148	CTC	2	6	160186	160191	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803007
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4580	NC_008148	GC	3	6	160223	160228	0 %	0 %	50 %	50 %	108803007
4581	NC_008148	GC	3	6	160250	160255	0 %	0 %	50 %	50 %	108803007
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4584	NC_008148	CCGGG	2	10	160309	160318	0 %	0 %	60 %	40 %	108803007
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4587	NC_008148	CGG	2	6	160366	160371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803007
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4590	NC_008148	CTC	2	6	160417	160422	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803007
4591	NC_008148	TCG	2	6	160436	160441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803007
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4593	NC_008148	GC	3	6	160522	160527	0 %	0 %	50 %	50 %	108803007
4594	NC_008148	CG	3	6	160606	160611	0 %	0 %	50 %	50 %	108803007
4595	NC_008148	TC	3	6	160656	160661	0 %	50 %	0 %	50 %	108803007
4596	NC_008148	CGC	2	6	161120	161125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803008
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4603	NC_008148	GAG	2	6	161280	161285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803008
4604	NC_008148	AAC	2	6	161337	161342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108803008
4605	NC_008148	TGA	2	6	161395	161400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108803008
4606	NC_008148	CAG	2	6	161424	161429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803008
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4610	NC_008148	AGG	2	6	161551	161556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803008
4611	NC_008148	CGA	2	6	161576	161581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803008
4612	NC_008148	GGT	2	6	161585	161590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108803008
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4622	NC_008148	GGC	2	6	161958	161963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803008
4623	NC_008148	CGG	2	6	161972	161977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803008
4624	NC_008148	GGA	2	6	161999	162004	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803008
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4651	NC_008148	CG	3	6	162866	162871	0 %	0 %	50 %	50 %	108803009
4652	NC_008148	CGA	2	6	162875	162880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803009
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4741	NC_008148	CCT	2	6	166118	166123	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803012
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4743	NC_008148	CGC	2	6	166160	166165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803012
4744	NC_008148	GCT	2	6	166253	166258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803012
4745	NC_008148	TGC	2	6	166264	166269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803012
4746	NC_008148	GTC	2	6	166272	166277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803012
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4756	NC_008148	CTG	2	6	166443	166448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803012
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4865	NC_008148	TACACC	2	12	169862	169873	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	108803017
4866	NC_008148	CGAG	2	8	169875	169882	25 %	0 %	50 %	25 %	108803017
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4986	NC_008148	TCG	2	6	173803	173808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803022
4987	NC_008148	CCGA	2	8	173923	173930	25 %	0 %	25 %	50 %	108803023
4988	NC_008148	ACC	2	6	174019	174024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108803023
4989	NC_008148	CCT	3	9	174035	174043	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803023
4990	NC_008148	AGA	2	6	174068	174073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108803023
4991	NC_008148	GCT	2	6	174074	174079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803023
4992	NC_008148	CTT	2	6	174123	174128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108803023
4993	NC_008148	CTC	2	6	174129	174134	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803023
4994	NC_008148	GC	3	6	174162	174167	0 %	0 %	50 %	50 %	108803023
4995	NC_008148	AGC	2	6	174181	174186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803023
4996	NC_008148	GAG	2	6	174298	174303	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803023
4997	NC_008148	CAC	2	6	174321	174326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108803023
4998	NC_008148	GCC	2	6	174330	174335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803023
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5000	NC_008148	GC	3	6	174387	174392	0 %	0 %	50 %	50 %	108803023

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