MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Ruegeria sp. TM1040 chromosome

Total Repeats: 2058

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008044	GTGAT	2	10	1857	1866	20 %	40 %	40 %	0 %	99079843
2	NC_008044	GCGCT	2	10	2252	2261	0 %	20 %	40 %	40 %	99079843
3	NC_008044	CGGGG	2	10	3071	3080	0 %	0 %	80 %	20 %	99079844
4	NC_008044	ATCGC	2	10	3338	3347	20 %	20 %	20 %	40 %	99079844
5	NC_008044	GTAGC	2	10	4891	4900	20 %	20 %	40 %	20 %	99079846
6	NC_008044	TTGAT	2	10	7939	7948	20 %	60 %	20 %	0 %	99079848
7	NC_008044	GCCGC	2	10	8375	8384	0 %	0 %	40 %	60 %	99079848
8	NC_008044	TGCGC	2	10	8830	8839	0 %	20 %	40 %	40 %	99079849
9	NC_008044	CGCAG	2	10	9521	9530	20 %	0 %	40 %	40 %	99079850
10	NC_008044	CCGCG	2	10	10119	10128	0 %	0 %	40 %	60 %	99079850
11	NC_008044	TCGCC	2	10	10708	10717	0 %	20 %	20 %	60 %	99079851
12	NC_008044	CTTCG	2	10	12191	12200	0 %	40 %	20 %	40 %	99079851
13	NC_008044	AAAGA	2	10	13154	13163	80 %	0 %	20 %	0 %	99079852
14	NC_008044	CTCGC	2	10	13215	13224	0 %	20 %	20 %	60 %	99079852
15	NC_008044	GTAGA	2	10	13929	13938	40 %	20 %	40 %	0 %	99079853
16	NC_008044	CGCAG	2	10	14835	14844	20 %	0 %	40 %	40 %	99079854
17	NC_008044	GGCGA	2	10	17254	17263	20 %	0 %	60 %	20 %	99079857
18	NC_008044	CTGGG	2	10	17914	17923	0 %	20 %	60 %	20 %	99079857
19	NC_008044	AGCGC	2	10	18178	18187	20 %	0 %	40 %	40 %	99079858
20	NC_008044	GCGCA	2	10	18222	18231	20 %	0 %	40 %	40 %	99079858
21	NC_008044	TCATT	2	10	22026	22035	20 %	60 %	0 %	20 %	99079861
22	NC_008044	ACTCA	2	10	24429	24438	40 %	20 %	0 %	40 %	99079863
23	NC_008044	CTGCA	2	10	24798	24807	20 %	20 %	20 %	40 %	99079864
24	NC_008044	TCTGC	2	10	25661	25670	0 %	40 %	20 %	40 %	99079866
25	NC_008044	CCGGG	2	10	26222	26231	0 %	0 %	60 %	40 %	99079867
26	NC_008044	CATGA	2	10	29077	29086	40 %	20 %	20 %	20 %	99079869
27	NC_008044	ATCCT	2	10	31537	31546	20 %	40 %	0 %	40 %	99079872
28	NC_008044	CGCGG	2	10	31970	31979	0 %	0 %	60 %	40 %	99079872
29	NC_008044	CGGGC	2	10	32261	32270	0 %	0 %	60 %	40 %	99079872
30	NC_008044	GCCCC	2	10	37815	37824	0 %	0 %	20 %	80 %	99079877
31	NC_008044	GCCTG	2	10	38361	38370	0 %	20 %	40 %	40 %	99079877
32	NC_008044	GGTCA	2	10	40294	40303	20 %	20 %	40 %	20 %	99079879
33	NC_008044	AGCAC	2	10	43340	43349	40 %	0 %	20 %	40 %	99079881
34	NC_008044	AAGCC	2	10	43777	43786	40 %	0 %	20 %	40 %	99079882
35	NC_008044	GACGG	2	10	43976	43985	20 %	0 %	60 %	20 %	99079882
36	NC_008044	GGCGA	2	10	44361	44370	20 %	0 %	60 %	20 %	99079882
37	NC_008044	GGGCA	2	10	44830	44839	20 %	0 %	60 %	20 %	99079882
38	NC_008044	GGACC	2	10	45841	45850	20 %	0 %	40 %	40 %	99079884
39	NC_008044	CGTCA	2	10	47489	47498	20 %	20 %	20 %	40 %	99079886
40	NC_008044	CTTCG	2	10	50508	50517	0 %	40 %	20 %	40 %	99079888
41	NC_008044	GGTAG	2	10	52295	52304	20 %	20 %	60 %	0 %	99079890
42	NC_008044	TGATG	2	10	52564	52573	20 %	40 %	40 %	0 %	99079890
43	NC_008044	CAGGC	2	10	53525	53534	20 %	0 %	40 %	40 %	99079891
44	NC_008044	GGGTT	2	10	55356	55365	0 %	40 %	60 %	0 %	99079893
45	NC_008044	CGCGC	2	10	56680	56689	0 %	0 %	40 %	60 %	99079894
46	NC_008044	GCAGA	2	10	57670	57679	40 %	0 %	40 %	20 %	99079895
47	NC_008044	AGGAT	2	10	59171	59180	40 %	20 %	40 %	0 %	99079898
48	NC_008044	CCGCG	2	10	59294	59303	0 %	0 %	40 %	60 %	99079898
49	NC_008044	CTGAT	2	10	61446	61455	20 %	40 %	20 %	20 %	99079899
50	NC_008044	TGCGC	2	10	62137	62146	0 %	20 %	40 %	40 %	99079900
51	NC_008044	ACCGC	2	10	62430	62439	20 %	0 %	20 %	60 %	99079900
52	NC_008044	GGCAT	2	10	63229	63238	20 %	20 %	40 %	20 %	99079901
53	NC_008044	GCCGG	2	10	65040	65049	0 %	0 %	60 %	40 %	99079901
54	NC_008044	GTCTC	2	10	66221	66230	0 %	40 %	20 %	40 %	99079901
55	NC_008044	GCTGG	2	10	66569	66578	0 %	20 %	60 %	20 %	99079902
56	NC_008044	CGCGT	2	10	70264	70273	0 %	20 %	40 %	40 %	99079906
57	NC_008044	CAGCG	2	10	71056	71065	20 %	0 %	40 %	40 %	99079908
58	NC_008044	CGGCA	2	10	71172	71181	20 %	0 %	40 %	40 %	99079908
59	NC_008044	GGTCA	2	10	71387	71396	20 %	20 %	40 %	20 %	99079908
60	NC_008044	GACTG	2	10	72377	72386	20 %	20 %	40 %	20 %	99079909
61	NC_008044	TTCTG	2	10	73617	73626	0 %	60 %	20 %	20 %	99079911
62	NC_008044	GAGGC	2	10	75726	75735	20 %	0 %	60 %	20 %	99079914
63	NC_008044	ACGCC	2	10	75842	75851	20 %	0 %	20 %	60 %	99079914
64	NC_008044	GATTG	2	10	78181	78190	20 %	40 %	40 %	0 %	99079916
65	NC_008044	CGGGT	2	10	85680	85689	0 %	20 %	60 %	20 %	99079923
66	NC_008044	TGATC	2	10	86270	86279	20 %	40 %	20 %	20 %	99079923
67	NC_008044	TCGCC	2	10	88185	88194	0 %	20 %	20 %	60 %	99079925
68	NC_008044	GGCGC	2	10	89333	89342	0 %	0 %	60 %	40 %	99079927
69	NC_008044	TGCGT	2	10	91229	91238	0 %	40 %	40 %	20 %	99079930
70	NC_008044	GCGAT	2	10	91456	91465	20 %	20 %	40 %	20 %	99079930
71	NC_008044	CGGCG	2	10	93393	93402	0 %	0 %	60 %	40 %	99079931
72	NC_008044	GCCGC	2	10	93620	93629	0 %	0 %	40 %	60 %	99079931
73	NC_008044	CGGGC	2	10	94086	94095	0 %	0 %	60 %	40 %	99079931
74	NC_008044	GCGCC	2	10	94832	94841	0 %	0 %	40 %	60 %	99079932
75	NC_008044	CGGCC	2	10	95041	95050	0 %	0 %	40 %	60 %	99079932
76	NC_008044	GCCAC	2	10	100460	100469	20 %	0 %	20 %	60 %	99079937
77	NC_008044	GCGCG	2	10	102120	102129	0 %	0 %	60 %	40 %	99079937
78	NC_008044	CGGGG	2	10	102313	102322	0 %	0 %	80 %	20 %	99079937
79	NC_008044	CGGCG	2	10	105493	105502	0 %	0 %	60 %	40 %	99079941
80	NC_008044	TTGCC	2	10	106773	106782	0 %	40 %	20 %	40 %	99079942
81	NC_008044	CGCAC	2	10	110855	110864	20 %	0 %	20 %	60 %	99079945
82	NC_008044	GGCCC	2	10	113837	113846	0 %	0 %	40 %	60 %	99079948
83	NC_008044	ATCCA	2	10	115653	115662	40 %	20 %	0 %	40 %	99079950
84	NC_008044	TGGCC	2	10	116123	116132	0 %	20 %	40 %	40 %	99079950
85	NC_008044	GGTGC	2	10	118494	118503	0 %	20 %	60 %	20 %	99079953
86	NC_008044	TGCGG	2	10	119811	119820	0 %	20 %	60 %	20 %	99079954
87	NC_008044	GCCGC	2	10	119977	119986	0 %	0 %	40 %	60 %	99079954
88	NC_008044	AGCTC	2	10	119995	120004	20 %	20 %	20 %	40 %	99079954
89	NC_008044	CTGGT	2	10	123065	123074	0 %	40 %	40 %	20 %	99079956
90	NC_008044	GCCGC	2	10	123664	123673	0 %	0 %	40 %	60 %	99079957
91	NC_008044	TGAGC	2	10	125986	125995	20 %	20 %	40 %	20 %	99079960
92	NC_008044	GAACA	2	10	127449	127458	60 %	0 %	20 %	20 %	99079961
93	NC_008044	GCGCT	2	10	127467	127476	0 %	20 %	40 %	40 %	99079961
94	NC_008044	CGCGG	2	10	129569	129578	0 %	0 %	60 %	40 %	99079963
95	NC_008044	CGGCT	2	10	130161	130170	0 %	20 %	40 %	40 %	99079963
96	NC_008044	AACCA	2	10	132595	132604	60 %	0 %	0 %	40 %	99079965
97	NC_008044	GTCAG	2	10	133742	133751	20 %	20 %	40 %	20 %	99079967
98	NC_008044	GCGCC	2	10	134841	134850	0 %	0 %	40 %	60 %	99079968
99	NC_008044	TTGCG	2	10	137872	137881	0 %	40 %	40 %	20 %	99079971
100	NC_008044	GTCGC	2	10	138395	138404	0 %	20 %	40 %	40 %	99079971
101	NC_008044	AGAGC	2	10	142123	142132	40 %	0 %	40 %	20 %	99079973
102	NC_008044	GGCGC	2	10	142172	142181	0 %	0 %	60 %	40 %	99079973
103	NC_008044	GGGTG	2	10	142183	142192	0 %	20 %	80 %	0 %	99079973
104	NC_008044	AGAGT	2	10	151005	151014	40 %	20 %	40 %	0 %	99079977
105	NC_008044	CCGGA	2	10	152065	152074	20 %	0 %	40 %	40 %	99079978
106	NC_008044	GCAGC	2	10	157125	157134	20 %	0 %	40 %	40 %	99079985
107	NC_008044	TCGGT	2	10	157360	157369	0 %	40 %	40 %	20 %	99079985
108	NC_008044	CGCGC	2	10	159905	159914	0 %	0 %	40 %	60 %	99079986
109	NC_008044	TCCAT	2	10	160415	160424	20 %	40 %	0 %	40 %	99079986
110	NC_008044	AATGA	2	10	160623	160632	60 %	20 %	20 %	0 %	99079987
111	NC_008044	CGTGC	2	10	164894	164903	0 %	20 %	40 %	40 %	99079990
112	NC_008044	CCTCG	2	10	166930	166939	0 %	20 %	20 %	60 %	99079992
113	NC_008044	CGATC	2	10	170478	170487	20 %	20 %	20 %	40 %	99079996
114	NC_008044	CGGCG	2	10	171832	171841	0 %	0 %	60 %	40 %	99079997
115	NC_008044	CGGGC	2	10	172444	172453	0 %	0 %	60 %	40 %	99079997
116	NC_008044	GTTCT	2	10	173774	173783	0 %	60 %	20 %	20 %	99079999
117	NC_008044	CGTGC	2	10	176221	176230	0 %	20 %	40 %	40 %	99080000
118	NC_008044	GGCGG	2	10	177434	177443	0 %	0 %	80 %	20 %	99080002
119	NC_008044	TGCTC	2	10	178167	178176	0 %	40 %	20 %	40 %	99080002
120	NC_008044	CGAGG	2	10	181114	181123	20 %	0 %	60 %	20 %	99080005
121	NC_008044	ATCGG	2	10	183022	183031	20 %	20 %	40 %	20 %	99080007
122	NC_008044	TGCGC	2	10	187088	187097	0 %	20 %	40 %	40 %	99080010
123	NC_008044	GCAGG	2	10	187305	187314	20 %	0 %	60 %	20 %	99080010
124	NC_008044	CGCGC	2	10	188026	188035	0 %	0 %	40 %	60 %	99080011
125	NC_008044	TCAAC	2	10	190435	190444	40 %	20 %	0 %	40 %	99080013
126	NC_008044	GAAGA	2	10	192082	192091	60 %	0 %	40 %	0 %	99080014
127	NC_008044	GTCAG	2	10	192262	192271	20 %	20 %	40 %	20 %	99080015
128	NC_008044	TGCCG	2	10	192933	192942	0 %	20 %	40 %	40 %	99080016
129	NC_008044	CGGCT	2	10	196742	196751	0 %	20 %	40 %	40 %	99080017
130	NC_008044	GAGTC	2	10	197504	197513	20 %	20 %	40 %	20 %	99080018
131	NC_008044	AGCGC	2	10	197729	197738	20 %	0 %	40 %	40 %	99080018
132	NC_008044	AAAGC	2	10	197899	197908	60 %	0 %	20 %	20 %	99080018
133	NC_008044	AGGGG	2	10	197960	197969	20 %	0 %	80 %	0 %	99080018
134	NC_008044	GCGTC	2	10	198403	198412	0 %	20 %	40 %	40 %	99080019
135	NC_008044	GGCGC	2	10	199838	199847	0 %	0 %	60 %	40 %	99080021
136	NC_008044	TCTGC	2	10	200940	200949	0 %	40 %	20 %	40 %	99080022
137	NC_008044	TGCAG	2	10	200961	200970	20 %	20 %	40 %	20 %	99080022
138	NC_008044	CGCGG	2	10	206078	206087	0 %	0 %	60 %	40 %	99080027
139	NC_008044	GGCTC	2	10	209803	209812	0 %	20 %	40 %	40 %	99080033
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266	NC_008044	ATCCG	2	10	437125	437134	20 %	20 %	20 %	40 %	99080265
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