MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Ruegeria sp. TM1040 chromosome

Total Repeats: 39534

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008044	GCA	2	6	40	45	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99079842
2	NC_008044	GAC	2	6	51	56	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99079842
3	NC_008044	CTA	2	6	66	71	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99079842
4	NC_008044	AAC	2	6	102	107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99079842
5	NC_008044	CAC	2	6	110	115	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99079842
6	NC_008044	GGC	2	6	150	155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99079842
7	NC_008044	CAA	2	6	236	241	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99079842
8	NC_008044	AAG	2	6	379	384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99079842
9	NC_008044	CGC	2	6	403	408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99079842
10	NC_008044	AGA	2	6	410	415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99079842
11	NC_008044	GGC	2	6	552	557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99079842
12	NC_008044	CCG	2	6	643	648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99079842
13	NC_008044	GAT	2	6	692	697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99079842
14	NC_008044	TGG	2	6	736	741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99079842
15	NC_008044	TTC	2	6	786	791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99079842
16	NC_008044	TGG	2	6	808	813	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99079842
17	NC_008044	ATC	3	9	828	836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99079842
18	NC_008044	TGG	3	9	907	915	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99079842
19	NC_008044	GCA	2	6	968	973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99079842
20	NC_008044	GCT	2	6	1022	1027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99079842
21	NC_008044	TGC	2	6	1150	1155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99079842
22	NC_008044	ACA	2	6	1213	1218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99079842
23	NC_008044	ATC	2	6	1233	1238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99079842
24	NC_008044	TGG	2	6	1340	1345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99079842
25	NC_008044	ACC	2	6	1356	1361	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99079842
26	NC_008044	TGC	2	6	1432	1437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99079842
27	NC_008044	GGT	2	6	1795	1800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99079843
28	NC_008044	GTC	2	6	1895	1900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99079843
29	NC_008044	CCA	2	6	1935	1940	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99079843
30	NC_008044	CCA	2	6	1950	1955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99079843
31	NC_008044	AGA	2	6	2080	2085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99079843
32	NC_008044	GCC	2	6	2135	2140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99079843
33	NC_008044	GCG	2	6	2146	2151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99079843
34	NC_008044	CTC	2	6	2375	2380	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99079843
35	NC_008044	GAC	2	6	2387	2392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99079843
36	NC_008044	CCG	2	6	2518	2523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99079843
37	NC_008044	TGA	2	6	2614	2619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99079843
38	NC_008044	TGT	2	6	2631	2636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99079843
39	NC_008044	GAA	2	6	2666	2671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99079843
40	NC_008044	CGA	2	6	2692	2697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99079843
41	NC_008044	TCT	2	6	2728	2733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99079843
42	NC_008044	CGA	2	6	2818	2823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99079843
43	NC_008044	CAA	2	6	3018	3023	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99079844
44	NC_008044	GTT	2	6	3060	3065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99079844
45	NC_008044	TCC	2	6	3157	3162	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99079844
46	NC_008044	CCT	2	6	3185	3190	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99079844
47	NC_008044	ACA	2	6	3224	3229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99079844
48	NC_008044	GCG	2	6	3321	3326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99079844
49	NC_008044	GCT	2	6	3532	3537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99079844
50	NC_008044	CTG	3	9	3832	3840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99079844
51	NC_008044	GGC	2	6	3849	3854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99079844
52	NC_008044	GCG	2	6	3870	3875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99079844
53	NC_008044	TGG	2	6	4105	4110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99079845
54	NC_008044	TGG	2	6	4124	4129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99079845
55	NC_008044	CAA	2	6	4321	4326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99079845
56	NC_008044	ACG	2	6	4574	4579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99079845
57	NC_008044	GAG	2	6	4639	4644	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99079845
58	NC_008044	GGT	2	6	4679	4684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99079846
59	NC_008044	GAC	2	6	4855	4860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99079846
60	NC_008044	TTC	2	6	4861	4866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99079846
61	NC_008044	GTG	2	6	4880	4885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99079846
62	NC_008044	GAT	2	6	4912	4917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99079846
63	NC_008044	ATT	2	6	5150	5155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	99079846
64	NC_008044	CAG	2	6	5170	5175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99079846
65	NC_008044	TCT	2	6	5197	5202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99079846
66	NC_008044	GCG	2	6	5205	5210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99079846
67	NC_008044	TGC	2	6	5419	5424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99079847
68	NC_008044	GCC	2	6	5429	5434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99079847
69	NC_008044	TGG	2	6	5571	5576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99079847
70	NC_008044	TGG	2	6	5591	5596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99079847
71	NC_008044	GAT	2	6	5698	5703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99079847
72	NC_008044	AAG	2	6	5783	5788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99079847
73	NC_008044	GCG	2	6	5849	5854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99079847
74	NC_008044	CAG	2	6	6037	6042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99079848
75	NC_008044	CAC	2	6	6141	6146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99079848
76	NC_008044	GTC	2	6	6159	6164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99079848
77	NC_008044	CGA	2	6	6176	6181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99079848
78	NC_008044	GCA	2	6	6300	6305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99079848
79	NC_008044	TCA	2	6	6310	6315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99079848
80	NC_008044	CGG	2	6	6368	6373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99079848
81	NC_008044	GTG	2	6	6498	6503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99079848
82	NC_008044	GTG	2	6	6642	6647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99079848
83	NC_008044	GCG	2	6	6697	6702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99079848
84	NC_008044	GAC	2	6	6780	6785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99079848
85	NC_008044	TGG	2	6	6807	6812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99079848
86	NC_008044	TGC	2	6	6835	6840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99079848
87	NC_008044	CAA	2	6	6848	6853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99079848
88	NC_008044	TCC	2	6	6933	6938	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99079848
89	NC_008044	CGA	2	6	6974	6979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99079848
90	NC_008044	GGT	2	6	7148	7153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99079848
91	NC_008044	ATC	2	6	7161	7166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99079848
92	NC_008044	GCC	2	6	7188	7193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99079848
93	NC_008044	TCA	2	6	7519	7524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99079848
94	NC_008044	GCT	3	9	7562	7570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99079848
95	NC_008044	TTC	2	6	7575	7580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99079848
96	NC_008044	GCC	2	6	7631	7636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99079848
97	NC_008044	GAC	2	6	7695	7700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99079848
98	NC_008044	TGC	2	6	7732	7737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99079848
99	NC_008044	TGA	2	6	7787	7792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99079848
100	NC_008044	TGC	2	6	8059	8064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99079848
101	NC_008044	GGA	2	6	8198	8203	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99079848
102	NC_008044	ACG	2	6	8274	8279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99079848
103	NC_008044	CTG	2	6	8301	8306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99079848
104	NC_008044	GAT	2	6	8337	8342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99079848
105	NC_008044	GTG	2	6	8367	8372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99079848
106	NC_008044	GAT	2	6	8474	8479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99079849
107	NC_008044	GGT	2	6	8482	8487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99079849
108	NC_008044	GGC	2	6	8516	8521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99079849
109	NC_008044	GAT	2	6	8578	8583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99079849
110	NC_008044	TTC	2	6	8681	8686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99079849
111	NC_008044	CAG	2	6	8774	8779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99079849
112	NC_008044	AAG	2	6	8951	8956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99079849
113	NC_008044	GAT	2	6	9079	9084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99079849
114	NC_008044	ATG	2	6	9114	9119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99079849
115	NC_008044	GCA	2	6	9169	9174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99079849
116	NC_008044	TGC	2	6	9205	9210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99079849
117	NC_008044	GAG	2	6	9377	9382	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99079850
118	NC_008044	GCG	2	6	9456	9461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99079850
119	NC_008044	GGC	2	6	9558	9563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99079850
120	NC_008044	ACC	2	6	9601	9606	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99079850
121	NC_008044	TGG	2	6	9612	9617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99079850
122	NC_008044	GCC	2	6	9631	9636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99079850
123	NC_008044	GCC	2	6	9641	9646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99079850
124	NC_008044	GTT	2	6	9679	9684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99079850
125	NC_008044	CCA	2	6	9749	9754	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99079850
126	NC_008044	ATC	2	6	9887	9892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99079850
127	NC_008044	CTG	2	6	9943	9948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99079850
128	NC_008044	GTT	2	6	9986	9991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99079850
129	NC_008044	GCC	2	6	10000	10005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99079850
130	NC_008044	AGG	2	6	10026	10031	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99079850
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132	NC_008044	GTC	2	6	10189	10194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99079850
133	NC_008044	GGC	2	6	10282	10287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99079850
134	NC_008044	CTT	2	6	10353	10358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99079850
135	NC_008044	CTT	2	6	10417	10422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99079850
136	NC_008044	TCG	2	6	10442	10447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99079850
137	NC_008044	TTG	2	6	10584	10589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99079851
138	NC_008044	GTC	3	9	10622	10630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99079851
139	NC_008044	TCA	2	6	10653	10658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99079851
140	NC_008044	CTT	2	6	10684	10689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99079851
141	NC_008044	CGC	2	6	10727	10732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99079851
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154	NC_008044	ACC	2	6	11505	11510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99079851
155	NC_008044	GCG	3	9	11550	11558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99079851
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159	NC_008044	CTT	2	6	11731	11736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99079851
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163	NC_008044	CCA	2	6	11922	11927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99079851
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