MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruegeria sp. TM1040 chromosome

Total Repeats: 58485

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_008044	GCC	2	6	197056	197061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080017
3502	NC_008044	CGC	2	6	197089	197094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080017
3503	NC_008044	GCG	2	6	197180	197185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080017
3504	NC_008044	G	6	6	197214	197219	0 %	0 %	100 %	0 %	99080017
3505	NC_008044	GC	4	8	197253	197260	0 %	0 %	50 %	50 %	99080017
3506	NC_008044	GAC	2	6	197423	197428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080018
3507	NC_008044	TAA	2	6	197483	197488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	99080018
3508	NC_008044	GAGTC	2	10	197504	197513	20 %	20 %	40 %	20 %	99080018
3509	NC_008044	CGG	2	6	197549	197554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080018
3510	NC_008044	TGC	2	6	197597	197602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080018
3511	NC_008044	CCTT	2	8	197641	197648	0 %	50 %	0 %	50 %	99080018
3512	NC_008044	GCC	2	6	197666	197671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080018
3513	NC_008044	CAC	2	6	197703	197708	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99080018
3514	NC_008044	AGCGC	2	10	197729	197738	20 %	0 %	40 %	40 %	99080018
3515	NC_008044	GGC	2	6	197748	197753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080018
3516	NC_008044	CTGG	2	8	197766	197773	0 %	25 %	50 %	25 %	99080018
3517	NC_008044	TGA	2	6	197804	197809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080018
3518	NC_008044	ATCC	2	8	197819	197826	25 %	25 %	0 %	50 %	99080018
3519	NC_008044	CGC	2	6	197876	197881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080018
3520	NC_008044	GC	3	6	197880	197885	0 %	0 %	50 %	50 %	99080018
3521	NC_008044	AAAGC	2	10	197899	197908	60 %	0 %	20 %	20 %	99080018
3522	NC_008044	CAA	2	6	197948	197953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99080018
3523	NC_008044	AGGGG	2	10	197960	197969	20 %	0 %	80 %	0 %	99080018
3524	NC_008044	G	6	6	197966	197971	0 %	0 %	100 %	0 %	99080018
3525	NC_008044	CGG	2	6	198070	198075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080019
3526	NC_008044	CCG	2	6	198163	198168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080019
3527	NC_008044	GCG	2	6	198180	198185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080019
3528	NC_008044	GGC	2	6	198232	198237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080019
3529	NC_008044	GAT	2	6	198380	198385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080019
3530	NC_008044	GCGTC	2	10	198403	198412	0 %	20 %	40 %	40 %	99080019
3531	NC_008044	ATC	2	6	198458	198463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080019
3532	NC_008044	CG	3	6	198467	198472	0 %	0 %	50 %	50 %	99080019
3533	NC_008044	CAC	2	6	198605	198610	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99080019
3534	NC_008044	TCG	2	6	198615	198620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080019
3535	NC_008044	GCG	2	6	198705	198710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080020
3536	NC_008044	GGC	2	6	198778	198783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080020
3537	NC_008044	TGA	2	6	198792	198797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080020
3538	NC_008044	T	7	7	198941	198947	0 %	100 %	0 %	0 %	99080020
3539	NC_008044	CGT	2	6	198961	198966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080020
3540	NC_008044	GGC	3	9	199036	199044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080020
3541	NC_008044	CGG	2	6	199047	199052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080020
3542	NC_008044	TCT	2	6	199070	199075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99080020
3543	NC_008044	GCA	2	6	199107	199112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080020
3544	NC_008044	GGC	2	6	199114	199119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080020
3545	NC_008044	GC	4	8	199157	199164	0 %	0 %	50 %	50 %	99080020
3546	NC_008044	GC	3	6	199170	199175	0 %	0 %	50 %	50 %	99080020
3547	NC_008044	GC	3	6	199228	199233	0 %	0 %	50 %	50 %	99080020
3548	NC_008044	TCT	2	6	199238	199243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99080020
3549	NC_008044	GCG	3	9	199244	199252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080020
3550	NC_008044	CGGG	2	8	199266	199273	0 %	0 %	75 %	25 %	99080020
3551	NC_008044	TTG	2	6	199448	199453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99080021
3552	NC_008044	GCC	2	6	199475	199480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080021
3553	NC_008044	GAT	2	6	199490	199495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080021
3554	NC_008044	CGG	2	6	199537	199542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080021
3555	NC_008044	GCC	2	6	199544	199549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080021
3556	NC_008044	GC	3	6	199613	199618	0 %	0 %	50 %	50 %	99080021
3557	NC_008044	ACC	2	6	199619	199624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99080021
3558	NC_008044	TCA	2	6	199798	199803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080021
3559	NC_008044	GCC	3	9	199808	199816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080021
3560	NC_008044	GGCGC	2	10	199838	199847	0 %	0 %	60 %	40 %	99080021
3561	NC_008044	TGA	2	6	199912	199917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080021
3562	NC_008044	CCGG	2	8	199919	199926	0 %	0 %	50 %	50 %	99080021
3563	NC_008044	AATC	2	8	199969	199976	50 %	25 %	0 %	25 %	99080021
3564	NC_008044	TCG	2	6	200025	200030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080021
3565	NC_008044	CCA	2	6	200044	200049	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99080021
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3567	NC_008044	CGTT	2	8	200175	200182	0 %	50 %	25 %	25 %	99080021
3568	NC_008044	TACT	2	8	200246	200253	25 %	50 %	0 %	25 %	99080022
3569	NC_008044	GCC	2	6	200275	200280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080022
3570	NC_008044	TG	3	6	200333	200338	0 %	50 %	50 %	0 %	99080022
3571	NC_008044	TGA	2	6	200394	200399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080022
3572	NC_008044	AGA	2	6	200424	200429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99080022
3573	NC_008044	GGC	2	6	200492	200497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080022
3574	NC_008044	GC	3	6	200521	200526	0 %	0 %	50 %	50 %	99080022
3575	NC_008044	CG	3	6	200629	200634	0 %	0 %	50 %	50 %	99080022
3576	NC_008044	CGC	2	6	200637	200642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080022
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3578	NC_008044	CAC	2	6	200752	200757	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99080022
3579	NC_008044	GCC	2	6	200761	200766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080022
3580	NC_008044	CG	3	6	200806	200811	0 %	0 %	50 %	50 %	99080022
3581	NC_008044	GGA	2	6	200842	200847	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99080022
3582	NC_008044	CCA	2	6	200900	200905	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99080022
3583	NC_008044	CAT	2	6	200932	200937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080022
3584	NC_008044	TCTGC	2	10	200940	200949	0 %	40 %	20 %	40 %	99080022
3585	NC_008044	TGCAG	2	10	200961	200970	20 %	20 %	40 %	20 %	99080022
3586	NC_008044	AGT	2	6	200997	201002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080022
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3588	NC_008044	GAC	2	6	201184	201189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080022
3589	NC_008044	GAG	2	6	201425	201430	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99080022
3590	NC_008044	GAC	3	9	201448	201456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080022
3591	NC_008044	GCG	2	6	201641	201646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080023
3592	NC_008044	GCCA	2	8	201766	201773	25 %	0 %	25 %	50 %	99080023
3593	NC_008044	CAT	2	6	201947	201952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080023
3594	NC_008044	CGG	2	6	201959	201964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080023
3595	NC_008044	TCT	2	6	202023	202028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99080023
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3597	NC_008044	GCTG	2	8	202362	202369	0 %	25 %	50 %	25 %	99080024
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3599	NC_008044	GAT	2	6	202435	202440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080024
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3601	NC_008044	GC	3	6	202479	202484	0 %	0 %	50 %	50 %	99080024
3602	NC_008044	ACC	2	6	202559	202564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99080024
3603	NC_008044	GT	3	6	202592	202597	0 %	50 %	50 %	0 %	99080024
3604	NC_008044	GAA	2	6	202612	202617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99080024
3605	NC_008044	GCC	2	6	202641	202646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080024
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3607	NC_008044	GGC	2	6	202990	202995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080025
3608	NC_008044	GGAA	2	8	202998	203005	50 %	0 %	50 %	0 %	99080025
3609	NC_008044	CTC	2	6	203155	203160	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99080025
3610	NC_008044	GCC	2	6	203163	203168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080025
3611	NC_008044	CCA	2	6	203177	203182	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99080025
3612	NC_008044	A	6	6	203182	203187	100 %	0 %	0 %	0 %	99080025
3613	NC_008044	GCG	2	6	203347	203352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080025
3614	NC_008044	AGA	2	6	203409	203414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99080025
3615	NC_008044	TGT	2	6	203424	203429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99080025
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3617	NC_008044	GGC	2	6	203458	203463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080025
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3619	NC_008044	GCT	2	6	203503	203508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080025
3620	NC_008044	GGT	2	6	203607	203612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080025
3621	NC_008044	GAA	2	6	203697	203702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99080025
3622	NC_008044	GC	3	6	203712	203717	0 %	0 %	50 %	50 %	99080025
3623	NC_008044	GGGC	2	8	203975	203982	0 %	0 %	75 %	25 %	99080026
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3749	NC_008044	TGC	2	6	211261	211266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080033
3750	NC_008044	CGTTTG	2	12	211269	211280	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	99080033
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3752	NC_008044	GC	3	6	211533	211538	0 %	0 %	50 %	50 %	99080034
3753	NC_008044	GCC	2	6	211542	211547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080034
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3777	NC_008044	TGC	2	6	212802	212807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080035
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3781	NC_008044	TCG	2	6	212942	212947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080035
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3788	NC_008044	CGA	2	6	213375	213380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080035
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3850	NC_008044	TGA	2	6	216955	216960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080040
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3855	NC_008044	CCTT	2	8	217059	217066	0 %	50 %	0 %	50 %	99080040
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3863	NC_008044	GAC	2	6	217514	217519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080040
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3869	NC_008044	CAT	2	6	218447	218452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080041
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3871	NC_008044	CGC	2	6	218607	218612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080041
3872	NC_008044	GAA	2	6	218613	218618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99080041
3873	NC_008044	GAC	2	6	218649	218654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080041
3874	NC_008044	CGG	2	6	218711	218716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080041
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3880	NC_008044	TGC	2	6	218989	218994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080041
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3885	NC_008044	AGC	2	6	219118	219123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080041
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3994	NC_008044	A	6	6	226334	226339	100 %	0 %	0 %	0 %	99080050
3995	NC_008044	AGC	2	6	226341	226346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080050
3996	NC_008044	CGA	2	6	226389	226394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080050
3997	NC_008044	GC	3	6	226414	226419	0 %	0 %	50 %	50 %	99080050
3998	NC_008044	TCT	2	6	226478	226483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99080050
3999	NC_008044	TTTC	2	8	226519	226526	0 %	75 %	0 %	25 %	99080050
4000	NC_008044	CGA	2	6	226594	226599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080050

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