MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruegeria sp. TM1040 chromosome

Total Repeats: 58485

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_008044	GCA	2	6	57629	57634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99079895
1003	NC_008044	GCAGA	2	10	57670	57679	40 %	0 %	40 %	20 %	99079895
1004	NC_008044	GCC	2	6	57697	57702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99079895
1005	NC_008044	TGC	2	6	57705	57710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99079895
1006	NC_008044	GAC	2	6	57739	57744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99079895
1007	NC_008044	CGG	2	6	57833	57838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99079895
1008	NC_008044	GCA	2	6	57865	57870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99079895
1009	NC_008044	TGCG	2	8	57926	57933	0 %	25 %	50 %	25 %	99079895
1010	NC_008044	CGG	2	6	57995	58000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99079895
1011	NC_008044	GGC	2	6	58011	58016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99079895
1012	NC_008044	CCG	2	6	58041	58046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99079895
1013	NC_008044	GCC	2	6	58136	58141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99079895
1014	NC_008044	CTG	2	6	58258	58263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99079896
1015	NC_008044	GGA	2	6	58317	58322	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99079896
1016	NC_008044	TGA	2	6	58581	58586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99079896
1017	NC_008044	GC	3	6	58636	58641	0 %	0 %	50 %	50 %	99079896
1018	NC_008044	GC	3	6	58661	58666	0 %	0 %	50 %	50 %	99079896
1019	NC_008044	TGA	2	6	58668	58673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99079896
1020	NC_008044	TGC	2	6	58709	58714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99079896
1021	NC_008044	CGG	2	6	58771	58776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99079896
1022	NC_008044	GGC	2	6	58813	58818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99079896
1023	NC_008044	AATG	2	8	58838	58845	50 %	25 %	25 %	0 %	99079896
1024	NC_008044	ATG	2	6	58918	58923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99079897
1025	NC_008044	CG	4	8	58945	58952	0 %	0 %	50 %	50 %	99079897
1026	NC_008044	GC	3	6	59007	59012	0 %	0 %	50 %	50 %	99079897
1027	NC_008044	GC	3	6	59165	59170	0 %	0 %	50 %	50 %	99079898
1028	NC_008044	AGGAT	2	10	59171	59180	40 %	20 %	40 %	0 %	99079898
1029	NC_008044	TTG	2	6	59198	59203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99079898
1030	NC_008044	GA	3	6	59224	59229	50 %	0 %	50 %	0 %	99079898
1031	NC_008044	GGT	2	6	59230	59235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99079898
1032	NC_008044	GC	3	6	59260	59265	0 %	0 %	50 %	50 %	99079898
1033	NC_008044	CCGCG	2	10	59294	59303	0 %	0 %	40 %	60 %	99079898
1034	NC_008044	CCA	2	6	59400	59405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99079898
1035	NC_008044	TCGC	2	8	59413	59420	0 %	25 %	25 %	50 %	99079898
1036	NC_008044	TC	3	6	59484	59489	0 %	50 %	0 %	50 %	99079898
1037	NC_008044	GCA	2	6	59514	59519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99079898
1038	NC_008044	GC	3	6	59554	59559	0 %	0 %	50 %	50 %	99079898
1039	NC_008044	CGG	2	6	59632	59637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99079898
1040	NC_008044	GC	4	8	59738	59745	0 %	0 %	50 %	50 %	99079898
1041	NC_008044	TG	3	6	59798	59803	0 %	50 %	50 %	0 %	99079898
1042	NC_008044	GCG	2	6	59914	59919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99079898
1043	NC_008044	TCG	2	6	59957	59962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99079898
1044	NC_008044	GCG	2	6	59991	59996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99079898
1045	NC_008044	GCG	2	6	60518	60523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99079899
1046	NC_008044	GA	3	6	60549	60554	50 %	0 %	50 %	0 %	99079899
1047	NC_008044	GC	3	6	60643	60648	0 %	0 %	50 %	50 %	99079899
1048	NC_008044	GC	3	6	60676	60681	0 %	0 %	50 %	50 %	99079899
1049	NC_008044	GAGC	2	8	60868	60875	25 %	0 %	50 %	25 %	99079899
1050	NC_008044	TG	3	6	60923	60928	0 %	50 %	50 %	0 %	99079899
1051	NC_008044	CGGG	2	8	60948	60955	0 %	0 %	75 %	25 %	99079899
1052	NC_008044	CGG	2	6	61021	61026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99079899
1053	NC_008044	ACC	2	6	61073	61078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99079899
1054	NC_008044	CGGG	2	8	61081	61088	0 %	0 %	75 %	25 %	99079899
1055	NC_008044	GC	3	6	61145	61150	0 %	0 %	50 %	50 %	99079899
1056	NC_008044	GAT	2	6	61268	61273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99079899
1057	NC_008044	GCC	2	6	61304	61309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99079899
1058	NC_008044	CT	3	6	61382	61387	0 %	50 %	0 %	50 %	99079899
1059	NC_008044	CAC	2	6	61399	61404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99079899
1060	NC_008044	CTGAT	2	10	61446	61455	20 %	40 %	20 %	20 %	99079899
1061	NC_008044	GCC	2	6	61609	61614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99079899
1062	NC_008044	TAC	2	6	61646	61651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99079899
1063	NC_008044	GCC	2	6	61963	61968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99079900
1064	NC_008044	TGCG	2	8	61986	61993	0 %	25 %	50 %	25 %	99079900
1065	NC_008044	CTT	2	6	61994	61999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99079900
1066	NC_008044	TGG	2	6	62014	62019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99079900
1067	NC_008044	CAA	2	6	62107	62112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99079900
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1069	NC_008044	GCG	2	6	62246	62251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99079900
1070	NC_008044	GGT	2	6	62290	62295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99079900
1071	NC_008044	GGC	2	6	62347	62352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99079900
1072	NC_008044	ACCGC	2	10	62430	62439	20 %	0 %	20 %	60 %	99079900
1073	NC_008044	GCA	2	6	62500	62505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99079900
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1077	NC_008044	GC	3	6	62751	62756	0 %	0 %	50 %	50 %	99079900
1078	NC_008044	GGC	3	9	62776	62784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99079900
1079	NC_008044	CG	3	6	62825	62830	0 %	0 %	50 %	50 %	99079900
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1081	NC_008044	AT	3	6	63034	63039	50 %	50 %	0 %	0 %	99079900
1082	NC_008044	CTA	2	6	63106	63111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99079900
1083	NC_008044	GGCAT	2	10	63229	63238	20 %	20 %	40 %	20 %	99079901
1084	NC_008044	GCA	2	6	63248	63253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99079901
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1086	NC_008044	GGC	2	6	63282	63287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99079901
1087	NC_008044	TGG	2	6	63344	63349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99079901
1088	NC_008044	ATC	2	6	63355	63360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99079901
1089	NC_008044	TGA	2	6	63375	63380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99079901
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1092	NC_008044	GGGA	2	8	63539	63546	25 %	0 %	75 %	0 %	99079901
1093	NC_008044	GAA	2	6	63625	63630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99079901
1094	NC_008044	GC	3	6	63633	63638	0 %	0 %	50 %	50 %	99079901
1095	NC_008044	GGC	2	6	63658	63663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99079901
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1097	NC_008044	GGCT	2	8	63713	63720	0 %	25 %	50 %	25 %	99079901
1098	NC_008044	CCG	2	6	63749	63754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99079901
1099	NC_008044	GAT	2	6	63759	63764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99079901
1100	NC_008044	TC	3	6	63791	63796	0 %	50 %	0 %	50 %	99079901
1101	NC_008044	TGA	2	6	63798	63803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99079901
1102	NC_008044	CG	3	6	63861	63866	0 %	0 %	50 %	50 %	99079901
1103	NC_008044	GTG	2	6	63878	63883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99079901
1104	NC_008044	G	6	6	63889	63894	0 %	0 %	100 %	0 %	99079901
1105	NC_008044	CG	3	6	63903	63908	0 %	0 %	50 %	50 %	99079901
1106	NC_008044	CGT	2	6	63922	63927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99079901
1107	NC_008044	GAT	2	6	63958	63963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99079901
1108	NC_008044	CG	3	6	64004	64009	0 %	0 %	50 %	50 %	99079901
1109	NC_008044	TGCGCC	2	12	64032	64043	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	99079901
1110	NC_008044	CGG	2	6	64089	64094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99079901
1111	NC_008044	CG	3	6	64105	64110	0 %	0 %	50 %	50 %	99079901
1112	NC_008044	TCG	2	6	64122	64127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99079901
1113	NC_008044	CGA	2	6	64203	64208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99079901
1114	NC_008044	AGA	2	6	64220	64225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99079901
1115	NC_008044	GC	3	6	64248	64253	0 %	0 %	50 %	50 %	99079901
1116	NC_008044	GCC	2	6	64263	64268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99079901
1117	NC_008044	GCC	2	6	64362	64367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99079901
1118	NC_008044	TC	3	6	64368	64373	0 %	50 %	0 %	50 %	99079901
1119	NC_008044	CAG	2	6	64384	64389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99079901
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1121	NC_008044	CCG	2	6	64529	64534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99079901
1122	NC_008044	CG	3	6	64633	64638	0 %	0 %	50 %	50 %	99079901
1123	NC_008044	GTG	2	6	64675	64680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99079901
1124	NC_008044	AGC	2	6	64682	64687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99079901
1125	NC_008044	AGA	2	6	64752	64757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99079901
1126	NC_008044	GCC	2	6	64776	64781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99079901
1127	NC_008044	CAT	2	6	64819	64824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99079901
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