MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruegeria sp. TM1040 chromosome

Total Repeats: 58485

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008044	TC	3	6	28983	28988	0 %	50 %	0 %	50 %	99079869
502	NC_008044	CG	3	6	29048	29053	0 %	0 %	50 %	50 %	99079869
503	NC_008044	CATGA	2	10	29077	29086	40 %	20 %	20 %	20 %	99079869
504	NC_008044	T	7	7	29094	29100	0 %	100 %	0 %	0 %	99079870
505	NC_008044	CGA	2	6	29172	29177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99079870
506	NC_008044	TG	3	6	29241	29246	0 %	50 %	50 %	0 %	99079870
507	NC_008044	TGG	2	6	29265	29270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99079870
508	NC_008044	CGC	2	6	29310	29315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99079870
509	NC_008044	GCT	2	6	29352	29357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99079870
510	NC_008044	CTA	2	6	29367	29372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99079870
511	NC_008044	AC	3	6	29423	29428	50 %	0 %	0 %	50 %	99079870
512	NC_008044	TCG	2	6	29444	29449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99079870
513	NC_008044	ACT	2	6	29450	29455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99079870
514	NC_008044	CTC	2	6	29488	29493	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99079870
515	NC_008044	CGG	2	6	29576	29581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99079870
516	NC_008044	CGA	2	6	29582	29587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99079870
517	NC_008044	CCAC	2	8	29606	29613	25 %	0 %	0 %	75 %	99079870
518	NC_008044	GCG	2	6	29621	29626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99079870
519	NC_008044	TGG	2	6	29723	29728	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99079870
520	NC_008044	ACG	2	6	29813	29818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99079870
521	NC_008044	TCGA	2	8	29959	29966	25 %	25 %	25 %	25 %	99079870
522	NC_008044	CAA	2	6	30015	30020	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99079870
523	NC_008044	CGG	2	6	30150	30155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99079870
524	NC_008044	GGC	2	6	30183	30188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99079870
525	NC_008044	ACCG	2	8	30229	30236	25 %	0 %	25 %	50 %	99079870
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530	NC_008044	GAAG	2	8	30444	30451	50 %	0 %	50 %	0 %	99079871
531	NC_008044	GGA	2	6	30525	30530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99079871
532	NC_008044	CAG	2	6	30563	30568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99079871
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534	NC_008044	GGCA	2	8	30649	30656	25 %	0 %	50 %	25 %	99079871
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538	NC_008044	ATT	2	6	30911	30916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	99079871
539	NC_008044	G	6	6	30927	30932	0 %	0 %	100 %	0 %	99079871
540	NC_008044	GTG	2	6	31108	31113	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99079871
541	NC_008044	TGA	2	6	31116	31121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99079871
542	NC_008044	AGC	2	6	31136	31141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99079871
543	NC_008044	CT	3	6	31149	31154	0 %	50 %	0 %	50 %	99079871
544	NC_008044	GC	3	6	31202	31207	0 %	0 %	50 %	50 %	99079871
545	NC_008044	GGA	2	6	31391	31396	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99079871
546	NC_008044	GCC	2	6	31456	31461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99079872
547	NC_008044	GCT	2	6	31523	31528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99079872
548	NC_008044	ATCCT	2	10	31537	31546	20 %	40 %	0 %	40 %	99079872
549	NC_008044	TCA	2	6	31580	31585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99079872
550	NC_008044	G	6	6	31631	31636	0 %	0 %	100 %	0 %	99079872
551	NC_008044	ACC	2	6	31771	31776	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99079872
552	NC_008044	ATC	2	6	31780	31785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99079872
553	NC_008044	TGA	2	6	31832	31837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99079872
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555	NC_008044	ATT	2	6	31894	31899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	99079872
556	NC_008044	CGGG	2	8	31948	31955	0 %	0 %	75 %	25 %	99079872
557	NC_008044	CGCGG	2	10	31970	31979	0 %	0 %	60 %	40 %	99079872
558	NC_008044	GC	3	6	32093	32098	0 %	0 %	50 %	50 %	99079872
559	NC_008044	GCG	2	6	32184	32189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99079872
560	NC_008044	GGT	2	6	32212	32217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99079872
561	NC_008044	CGGGC	2	10	32261	32270	0 %	0 %	60 %	40 %	99079872
562	NC_008044	GC	3	6	32277	32282	0 %	0 %	50 %	50 %	99079872
563	NC_008044	GGA	2	6	32333	32338	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99079872
564	NC_008044	CAT	2	6	32436	32441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99079872
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566	NC_008044	TAC	2	6	32488	32493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99079872
567	NC_008044	GC	3	6	32543	32548	0 %	0 %	50 %	50 %	99079872
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569	NC_008044	CTT	2	6	32618	32623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99079872
570	NC_008044	GCA	2	6	32757	32762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99079873
571	NC_008044	CTG	2	6	32785	32790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99079873
572	NC_008044	CTT	2	6	32811	32816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99079873
573	NC_008044	ATC	2	6	32858	32863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99079873
574	NC_008044	GC	3	6	33119	33124	0 %	0 %	50 %	50 %	99079873
575	NC_008044	CAG	2	6	33157	33162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99079873
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595	NC_008044	GAT	2	6	34090	34095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99079873
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600	NC_008044	GCCA	2	8	34845	34852	25 %	0 %	25 %	50 %	99079874
601	NC_008044	CGG	2	6	34939	34944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99079874
602	NC_008044	CCGA	2	8	35010	35017	25 %	0 %	25 %	50 %	99079874
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608	NC_008044	CATT	2	8	35423	35430	25 %	50 %	0 %	25 %	99079874
609	NC_008044	GCC	2	6	35475	35480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99079874
610	NC_008044	GGCT	2	8	35515	35522	0 %	25 %	50 %	25 %	99079874
611	NC_008044	TCC	2	6	35587	35592	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99079874
612	NC_008044	CG	3	6	35653	35658	0 %	0 %	50 %	50 %	99079874
613	NC_008044	TGA	2	6	35686	35691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99079874
614	NC_008044	GAG	3	9	35715	35723	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99079874
615	NC_008044	TCC	2	6	35761	35766	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99079874
616	NC_008044	CGC	2	6	35785	35790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99079874
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618	NC_008044	TG	3	6	35947	35952	0 %	50 %	50 %	0 %	99079875
619	NC_008044	GC	3	6	35974	35979	0 %	0 %	50 %	50 %	99079875
620	NC_008044	GTC	2	6	35982	35987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99079875
621	NC_008044	CAG	2	6	36171	36176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99079875
622	NC_008044	CG	3	6	36205	36210	0 %	0 %	50 %	50 %	99079875
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