MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruegeria sp. TM1040 chromosome

Total Repeats: 58485

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_008044	GGT	2	6	306314	306319	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080141
5502	NC_008044	GC	3	6	306390	306395	0 %	0 %	50 %	50 %	99080141
5503	NC_008044	A	6	6	306456	306461	100 %	0 %	0 %	0 %	99080141
5504	NC_008044	TCA	2	6	306496	306501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080141
5505	NC_008044	CAG	2	6	306507	306512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080141
5506	NC_008044	GC	3	6	306532	306537	0 %	0 %	50 %	50 %	99080141
5507	NC_008044	CGG	2	6	306640	306645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080141
5508	NC_008044	TGT	2	6	306671	306676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99080141
5509	NC_008044	GGCACA	2	12	306760	306771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080141
5510	NC_008044	GGAG	2	8	306811	306818	25 %	0 %	75 %	0 %	99080141
5511	NC_008044	ATC	2	6	307017	307022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080142
5512	NC_008044	CGTC	2	8	307074	307081	0 %	25 %	25 %	50 %	99080142
5513	NC_008044	GC	3	6	307095	307100	0 %	0 %	50 %	50 %	99080142
5514	NC_008044	CGC	2	6	307105	307110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080142
5515	NC_008044	CGG	2	6	307114	307119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080142
5516	NC_008044	CGGTCT	2	12	307126	307137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080142
5517	NC_008044	ACC	2	6	307148	307153	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99080142
5518	NC_008044	CGG	2	6	307168	307173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080142
5519	NC_008044	TCC	2	6	307179	307184	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99080142
5520	NC_008044	CGG	2	6	307189	307194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080142
5521	NC_008044	TTC	2	6	307227	307232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99080142
5522	NC_008044	CAG	2	6	307250	307255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080142
5523	NC_008044	GCG	2	6	307278	307283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080142
5524	NC_008044	GCG	2	6	307296	307301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080142
5525	NC_008044	GCCG	2	8	307328	307335	0 %	0 %	50 %	50 %	99080142
5526	NC_008044	TTC	2	6	307386	307391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99080142
5527	NC_008044	TGA	2	6	307459	307464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080142
5528	NC_008044	GCC	2	6	307499	307504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080142
5529	NC_008044	TTG	2	6	307533	307538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99080142
5530	NC_008044	CCA	2	6	307561	307566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99080142
5531	NC_008044	TGG	2	6	307573	307578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080142
5532	NC_008044	AGC	2	6	307635	307640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080142
5533	NC_008044	ATC	2	6	307647	307652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080142
5534	NC_008044	CGC	2	6	307657	307662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080142
5535	NC_008044	CAC	2	6	307703	307708	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99080142
5536	NC_008044	TCG	2	6	307734	307739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080142
5537	NC_008044	CCG	2	6	307755	307760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080142
5538	NC_008044	TGA	2	6	307765	307770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080142
5539	NC_008044	CGT	2	6	307780	307785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080142
5540	NC_008044	AGGGC	2	10	307801	307810	20 %	0 %	60 %	20 %	99080142
5541	NC_008044	TCTG	2	8	307867	307874	0 %	50 %	25 %	25 %	99080142
5542	NC_008044	AGCC	2	8	308118	308125	25 %	0 %	25 %	50 %	99080143
5543	NC_008044	GCG	3	9	308222	308230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080143
5544	NC_008044	GGA	2	6	308307	308312	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99080143
5545	NC_008044	CAA	2	6	308334	308339	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99080143
5546	NC_008044	GGT	2	6	308442	308447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080143
5547	NC_008044	GC	3	6	308452	308457	0 %	0 %	50 %	50 %	99080143
5548	NC_008044	GGC	2	6	308544	308549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080143
5549	NC_008044	GGC	2	6	308565	308570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080143
5550	NC_008044	GGC	2	6	308574	308579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080143
5551	NC_008044	CG	3	6	308585	308590	0 %	0 %	50 %	50 %	99080143
5552	NC_008044	AGC	2	6	308767	308772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080143
5553	NC_008044	GC	3	6	308804	308809	0 %	0 %	50 %	50 %	99080143
5554	NC_008044	CCA	2	6	308947	308952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99080144
5555	NC_008044	GCACC	2	10	308986	308995	20 %	0 %	20 %	60 %	99080144
5556	NC_008044	CGG	2	6	309023	309028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080144
5557	NC_008044	GCG	2	6	309056	309061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080144
5558	NC_008044	ATC	2	6	309099	309104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080144
5559	NC_008044	AAT	2	6	309199	309204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	99080144
5560	NC_008044	CG	3	6	309331	309336	0 %	0 %	50 %	50 %	99080144
5561	NC_008044	GC	4	8	309370	309377	0 %	0 %	50 %	50 %	99080144
5562	NC_008044	CGG	2	6	309436	309441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080144
5563	NC_008044	CAT	2	6	309487	309492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080144
5564	NC_008044	TGC	2	6	309496	309501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080144
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5566	NC_008044	CGC	2	6	309699	309704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080144
5567	NC_008044	GC	4	8	309703	309710	0 %	0 %	50 %	50 %	99080144
5568	NC_008044	GCA	2	6	309718	309723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080144
5569	NC_008044	CG	3	6	309742	309747	0 %	0 %	50 %	50 %	99080144
5570	NC_008044	CCA	2	6	309749	309754	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99080144
5571	NC_008044	TC	3	6	309823	309828	0 %	50 %	0 %	50 %	99080144
5572	NC_008044	ACC	2	6	309868	309873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99080144
5573	NC_008044	GC	3	6	309876	309881	0 %	0 %	50 %	50 %	99080144
5574	NC_008044	GGC	2	6	310022	310027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080144
5575	NC_008044	TGA	2	6	310117	310122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080144
5576	NC_008044	CAT	3	9	310124	310132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080144
5577	NC_008044	GGC	2	6	310202	310207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080144
5578	NC_008044	GCG	2	6	310236	310241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080144
5579	NC_008044	GGT	2	6	310259	310264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080144
5580	NC_008044	GA	3	6	310352	310357	50 %	0 %	50 %	0 %	99080145
5581	NC_008044	GCGG	2	8	310358	310365	0 %	0 %	75 %	25 %	99080145
5582	NC_008044	GC	5	10	310416	310425	0 %	0 %	50 %	50 %	99080145
5583	NC_008044	CAGGGG	2	12	310450	310461	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	99080145
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5585	NC_008044	TCG	2	6	310535	310540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080145
5586	NC_008044	GC	3	6	310554	310559	0 %	0 %	50 %	50 %	99080145
5587	NC_008044	CAG	2	6	310606	310611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080145
5588	NC_008044	CCG	2	6	310647	310652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080145
5589	NC_008044	GAG	2	6	310770	310775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99080146
5590	NC_008044	GGC	2	6	310796	310801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080146
5591	NC_008044	TCA	2	6	310879	310884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080146
5592	NC_008044	AAG	2	6	310913	310918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99080146
5593	NC_008044	TCG	2	6	310932	310937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080146
5594	NC_008044	GGCGC	2	10	310976	310985	0 %	0 %	60 %	40 %	99080146
5595	NC_008044	GGC	2	6	310993	310998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080146
5596	NC_008044	GA	3	6	311001	311006	50 %	0 %	50 %	0 %	99080146
5597	NC_008044	CCA	2	6	311035	311040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99080146
5598	NC_008044	GCG	2	6	311047	311052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080146
5599	NC_008044	CATAGC	2	12	311059	311070	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	99080146
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5601	NC_008044	TGCG	2	8	311124	311131	0 %	25 %	50 %	25 %	99080146
5602	NC_008044	GC	4	8	311148	311155	0 %	0 %	50 %	50 %	99080146
5603	NC_008044	TGA	2	6	311182	311187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080146
5604	NC_008044	GGC	2	6	311244	311249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080146
5605	NC_008044	CG	4	8	311481	311488	0 %	0 %	50 %	50 %	99080147
5606	NC_008044	CCA	2	6	311535	311540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99080147
5607	NC_008044	GC	3	6	311548	311553	0 %	0 %	50 %	50 %	99080147
5608	NC_008044	TTC	2	6	311590	311595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99080147
5609	NC_008044	GAGG	2	8	311680	311687	25 %	0 %	75 %	0 %	99080147
5610	NC_008044	ATCCGC	2	12	311716	311727	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	99080147
5611	NC_008044	GCC	2	6	311731	311736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080147
5612	NC_008044	TGA	2	6	311748	311753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080147
5613	NC_008044	CGG	2	6	311775	311780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080147
5614	NC_008044	CGG	2	6	311889	311894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080147
5615	NC_008044	AGC	2	6	311919	311924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080147
5616	NC_008044	CG	3	6	311925	311930	0 %	0 %	50 %	50 %	99080147
5617	NC_008044	GCC	2	6	312072	312077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080147
5618	NC_008044	TCT	2	6	312104	312109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99080148
5619	NC_008044	CTT	2	6	312129	312134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99080148
5620	NC_008044	CTG	2	6	312198	312203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080148
5621	NC_008044	GTT	2	6	312219	312224	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99080148
5622	NC_008044	GCC	2	6	312258	312263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080148
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5624	NC_008044	CTG	2	6	312342	312347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080148
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5748	NC_008044	GGT	2	6	319544	319549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080155
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5750	NC_008044	TCT	2	6	319606	319611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99080155
5751	NC_008044	ATT	2	6	319629	319634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	99080155
5752	NC_008044	CTG	2	6	319713	319718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080155
5753	NC_008044	ATC	2	6	319731	319736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080155
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5755	NC_008044	GGC	2	6	319763	319768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080155
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5994	NC_008044	CGC	2	6	333935	333940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080169
5995	NC_008044	CG	3	6	334062	334067	0 %	0 %	50 %	50 %	99080170
5996	NC_008044	GAC	2	6	334115	334120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080170
5997	NC_008044	GGGC	2	8	334159	334166	0 %	0 %	75 %	25 %	99080170
5998	NC_008044	TCA	2	6	334199	334204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080170
5999	NC_008044	CGC	2	6	334307	334312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080170
6000	NC_008044	CGC	2	6	334339	334344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080170

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