MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruegeria sp. TM1040 chromosome

Total Repeats: 58485

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_008044	GC	3	6	279093	279098	0 %	0 %	50 %	50 %	99080111
5002	NC_008044	GGT	2	6	279190	279195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080111
5003	NC_008044	CCG	2	6	279392	279397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080112
5004	NC_008044	CCG	2	6	279404	279409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080112
5005	NC_008044	GGT	2	6	279480	279485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080112
5006	NC_008044	GCTTCG	2	12	279490	279501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080112
5007	NC_008044	TCG	3	9	279508	279516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080112
5008	NC_008044	CAAGC	2	10	279597	279606	40 %	0 %	20 %	40 %	99080112
5009	NC_008044	GAT	2	6	279611	279616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080112
5010	NC_008044	CAC	2	6	279648	279653	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99080112
5011	NC_008044	ATC	2	6	279717	279722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080112
5012	NC_008044	GGT	2	6	279726	279731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080112
5013	NC_008044	ACA	2	6	279805	279810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99080112
5014	NC_008044	CCA	2	6	279820	279825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99080112
5015	NC_008044	A	6	6	279837	279842	100 %	0 %	0 %	0 %	99080112
5016	NC_008044	CGT	2	6	279870	279875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080112
5017	NC_008044	TCG	2	6	279964	279969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080113
5018	NC_008044	CCG	2	6	280000	280005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080113
5019	NC_008044	GC	3	6	280010	280015	0 %	0 %	50 %	50 %	99080113
5020	NC_008044	CAA	2	6	280094	280099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99080113
5021	NC_008044	TGG	2	6	280111	280116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080113
5022	NC_008044	TCG	2	6	280120	280125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080113
5023	NC_008044	CCTC	2	8	280491	280498	0 %	25 %	0 %	75 %	99080114
5024	NC_008044	CAA	2	6	281330	281335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99080115
5025	NC_008044	GAA	2	6	281345	281350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99080115
5026	NC_008044	TGT	2	6	281357	281362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99080115
5027	NC_008044	CGTC	2	8	281450	281457	0 %	25 %	25 %	50 %	99080115
5028	NC_008044	AGGC	2	8	281560	281567	25 %	0 %	50 %	25 %	99080115
5029	NC_008044	CAG	3	9	281724	281732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080116
5030	NC_008044	GGC	2	6	281740	281745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080116
5031	NC_008044	CCG	2	6	281892	281897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080116
5032	NC_008044	GGC	2	6	281909	281914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080116
5033	NC_008044	CAT	2	6	281971	281976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080116
5034	NC_008044	AAGA	2	8	282044	282051	75 %	0 %	25 %	0 %	99080116
5035	NC_008044	AAG	2	6	282068	282073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99080116
5036	NC_008044	CTG	2	6	282104	282109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080116
5037	NC_008044	GCA	2	6	282134	282139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080116
5038	NC_008044	TGG	2	6	282207	282212	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080116
5039	NC_008044	ATC	2	6	282284	282289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080116
5040	NC_008044	TCG	2	6	282291	282296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080116
5041	NC_008044	CAT	2	6	282298	282303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080116
5042	NC_008044	CGC	2	6	282316	282321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080116
5043	NC_008044	TGG	2	6	282393	282398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080116
5044	NC_008044	TGCGC	2	10	282433	282442	0 %	20 %	40 %	40 %	99080116
5045	NC_008044	CGG	2	6	282493	282498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080116
5046	NC_008044	CCTG	2	8	282508	282515	0 %	25 %	25 %	50 %	99080116
5047	NC_008044	CGG	2	6	282528	282533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080116
5048	NC_008044	CCT	2	6	282555	282560	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99080116
5049	NC_008044	GCT	2	6	282562	282567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080116
5050	NC_008044	TGC	2	6	282570	282575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080116
5051	NC_008044	TGA	2	6	282621	282626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080116
5052	NC_008044	CTG	2	6	282668	282673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080116
5053	NC_008044	GAT	2	6	282685	282690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080116
5054	NC_008044	GAA	2	6	282757	282762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99080116
5055	NC_008044	AAG	2	6	282797	282802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99080116
5056	NC_008044	GTG	2	6	282824	282829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080116
5057	NC_008044	CGTCCT	2	12	282835	282846	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	99080116
5058	NC_008044	TGCT	2	8	282872	282879	0 %	50 %	25 %	25 %	99080116
5059	NC_008044	CAA	2	6	282895	282900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99080116
5060	NC_008044	GGC	2	6	282923	282928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080116
5061	NC_008044	CAG	2	6	282971	282976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080116
5062	NC_008044	TCT	2	6	282988	282993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99080116
5063	NC_008044	TCG	2	6	283072	283077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080116
5064	NC_008044	ATT	2	6	283087	283092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	99080117
5065	NC_008044	GCCC	2	8	283100	283107	0 %	0 %	25 %	75 %	99080117
5066	NC_008044	GCCA	2	8	283129	283136	25 %	0 %	25 %	50 %	99080117
5067	NC_008044	TGC	2	6	283181	283186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080117
5068	NC_008044	GC	3	6	283185	283190	0 %	0 %	50 %	50 %	99080117
5069	NC_008044	TCC	2	6	283198	283203	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99080117
5070	NC_008044	AAG	2	6	283219	283224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99080117
5071	NC_008044	AAG	2	6	283298	283303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99080117
5072	NC_008044	GGC	2	6	283312	283317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080117
5073	NC_008044	GCAG	2	8	283350	283357	25 %	0 %	50 %	25 %	99080117
5074	NC_008044	GC	4	8	283489	283496	0 %	0 %	50 %	50 %	99080117
5075	NC_008044	TAC	2	6	283537	283542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080117
5076	NC_008044	AAG	2	6	283543	283548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99080117
5077	NC_008044	CGC	2	6	283553	283558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080117
5078	NC_008044	CGA	2	6	283617	283622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080117
5079	NC_008044	CGT	2	6	284194	284199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080118
5080	NC_008044	GAAC	2	8	284202	284209	50 %	0 %	25 %	25 %	99080118
5081	NC_008044	CGT	2	6	284278	284283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080118
5082	NC_008044	GCT	2	6	284321	284326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080118
5083	NC_008044	AAG	3	9	284425	284433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99080118
5084	NC_008044	AGGG	2	8	284436	284443	25 %	0 %	75 %	0 %	99080118
5085	NC_008044	CTC	2	6	284524	284529	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99080119
5086	NC_008044	CAA	2	6	284533	284538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99080119
5087	NC_008044	TCC	2	6	284585	284590	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99080119
5088	NC_008044	AGA	2	6	284653	284658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99080119
5089	NC_008044	TCGAGG	2	12	284697	284708	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	99080119
5090	NC_008044	GC	4	8	284743	284750	0 %	0 %	50 %	50 %	99080119
5091	NC_008044	CA	3	6	284802	284807	50 %	0 %	0 %	50 %	99080119
5092	NC_008044	GCC	2	6	284814	284819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080119
5093	NC_008044	GCC	2	6	284829	284834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080119
5094	NC_008044	TGA	2	6	285104	285109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080120
5095	NC_008044	TGC	2	6	285155	285160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080120
5096	NC_008044	TCC	2	6	285169	285174	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99080120
5097	NC_008044	CAT	2	6	285204	285209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080120
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5099	NC_008044	CGA	2	6	285363	285368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080120
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5102	NC_008044	ACG	2	6	285506	285511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080120
5103	NC_008044	CGA	2	6	285654	285659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080120
5104	NC_008044	GTC	2	6	285674	285679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080120
5105	NC_008044	AGGACG	2	12	285680	285691	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	99080120
5106	NC_008044	ACA	2	6	285776	285781	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99080120
5107	NC_008044	GCC	2	6	285921	285926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080120
5108	NC_008044	ACA	2	6	285929	285934	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99080120
5109	NC_008044	CACG	2	8	286125	286132	25 %	0 %	25 %	50 %	99080121
5110	NC_008044	CGC	2	6	286140	286145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080121
5111	NC_008044	TGGC	2	8	286189	286196	0 %	25 %	50 %	25 %	99080121
5112	NC_008044	CGAACA	2	12	286205	286216	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	99080121
5113	NC_008044	GAC	2	6	286223	286228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080121
5114	NC_008044	ATC	2	6	286257	286262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080121
5115	NC_008044	GAT	2	6	286268	286273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080121
5116	NC_008044	GCG	2	6	286288	286293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080121
5117	NC_008044	AGA	2	6	286331	286336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99080121
5118	NC_008044	ATC	2	6	286452	286457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080121
5119	NC_008044	CGAAGA	2	12	286529	286540	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	99080121
5120	NC_008044	CTG	2	6	286729	286734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080122
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5122	NC_008044	CT	3	6	286773	286778	0 %	50 %	0 %	50 %	99080122
5123	NC_008044	TTGG	2	8	286790	286797	0 %	50 %	50 %	0 %	99080122
5124	NC_008044	GGCAA	3	15	286838	286852	40 %	0 %	40 %	20 %	99080122
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5247	NC_008044	CGT	2	6	293078	293083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080128
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5371	NC_008044	GCA	2	6	298843	298848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080133
5372	NC_008044	CGC	2	6	298853	298858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080133
5373	NC_008044	GC	3	6	298870	298875	0 %	0 %	50 %	50 %	99080133
5374	NC_008044	CAC	2	6	299008	299013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99080133
5375	NC_008044	GAT	2	6	299034	299039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080133
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5378	NC_008044	GC	3	6	299181	299186	0 %	0 %	50 %	50 %	99080133
5379	NC_008044	CTG	2	6	299224	299229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080133
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5383	NC_008044	CG	4	8	299445	299452	0 %	0 %	50 %	50 %	99080134
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5390	NC_008044	TGG	2	6	299823	299828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080134
5391	NC_008044	GC	3	6	299875	299880	0 %	0 %	50 %	50 %	99080134
5392	NC_008044	TGA	2	6	299911	299916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080134
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5395	NC_008044	GC	3	6	300357	300362	0 %	0 %	50 %	50 %	99080135
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5399	NC_008044	CGAACG	2	12	300477	300488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080135
5400	NC_008044	TGC	2	6	300529	300534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080135
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5402	NC_008044	TCG	2	6	300681	300686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080135
5403	NC_008044	ACT	2	6	300693	300698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080135
5404	NC_008044	ACG	2	6	300699	300704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080135
5405	NC_008044	TCC	2	6	300740	300745	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99080135
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5430	NC_008044	G	6	6	301977	301982	0 %	0 %	100 %	0 %	99080136
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5435	NC_008044	CAGA	2	8	302450	302457	50 %	0 %	25 %	25 %	99080136
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5443	NC_008044	TGC	2	6	302794	302799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080137
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5445	NC_008044	GC	3	6	302846	302851	0 %	0 %	50 %	50 %	99080137
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5479	NC_008044	GC	3	6	305200	305205	0 %	0 %	50 %	50 %	99080139
5480	NC_008044	GC	3	6	305225	305230	0 %	0 %	50 %	50 %	99080139
5481	NC_008044	GAA	2	6	305256	305261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99080139
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5484	NC_008044	TCGGCC	2	12	305375	305386	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	99080139
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5490	NC_008044	GCA	2	6	305913	305918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080140
5491	NC_008044	TGCGC	2	10	306009	306018	0 %	20 %	40 %	40 %	99080140
5492	NC_008044	GAG	3	9	306020	306028	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99080140
5493	NC_008044	GCT	2	6	306046	306051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080140
5494	NC_008044	GCG	2	6	306077	306082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080140
5495	NC_008044	GCG	2	6	306088	306093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080140
5496	NC_008044	CG	3	6	306096	306101	0 %	0 %	50 %	50 %	99080140
5497	NC_008044	GC	3	6	306112	306117	0 %	0 %	50 %	50 %	99080140
5498	NC_008044	TGG	2	6	306208	306213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080141
5499	NC_008044	GC	3	6	306264	306269	0 %	0 %	50 %	50 %	99080141
5500	NC_008044	GT	3	6	306305	306310	0 %	50 %	50 %	0 %	99080141

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