MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Ruegeria sp. TM1040 mega plasmid

Total Repeats: 511

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008043	CGGAT	2	10	7466	7475	20 %	20 %	40 %	20 %	99078018
2	NC_008043	GACGC	2	10	8508	8517	20 %	0 %	40 %	40 %	99078019
3	NC_008043	GGCCC	2	10	10975	10984	0 %	0 %	40 %	60 %	99078019
4	NC_008043	CGCGC	2	10	11176	11185	0 %	0 %	40 %	60 %	99078019
5	NC_008043	GCCAG	2	10	11578	11587	20 %	0 %	40 %	40 %	99078020
6	NC_008043	CTTGC	2	10	12889	12898	0 %	40 %	20 %	40 %	99078021
7	NC_008043	TTCTG	2	10	13524	13533	0 %	60 %	20 %	20 %	99078022
8	NC_008043	TGGAG	2	10	13693	13702	20 %	20 %	60 %	0 %	99078022
9	NC_008043	CTGGG	2	10	14390	14399	0 %	20 %	60 %	20 %	99078022
10	NC_008043	ACGGT	2	10	14817	14826	20 %	20 %	40 %	20 %	99078023
11	NC_008043	TTGCC	2	10	15806	15815	0 %	40 %	20 %	40 %	99078024
12	NC_008043	GCTCT	2	10	16039	16048	0 %	40 %	20 %	40 %	99078025
13	NC_008043	CTGCA	2	10	16409	16418	20 %	20 %	20 %	40 %	99078025
14	NC_008043	ATTGC	2	10	18035	18044	20 %	40 %	20 %	20 %	99078027
15	NC_008043	CCCCG	2	10	22507	22516	0 %	0 %	20 %	80 %	99078030
16	NC_008043	GATCA	2	10	23252	23261	40 %	20 %	20 %	20 %	99078031
17	NC_008043	CCCAT	2	10	25039	25048	20 %	20 %	0 %	60 %	99078034
18	NC_008043	TCGCC	2	10	26736	26745	0 %	20 %	20 %	60 %	99078036
19	NC_008043	GCGCC	2	10	27263	27272	0 %	0 %	40 %	60 %	99078037
20	NC_008043	GGCCC	2	10	29002	29011	0 %	0 %	40 %	60 %	99078038
21	NC_008043	GCGCC	2	10	29651	29660	0 %	0 %	40 %	60 %	99078038
22	NC_008043	GGGCC	2	10	30122	30131	0 %	0 %	60 %	40 %	99078039
23	NC_008043	CGCCC	2	10	32550	32559	0 %	0 %	20 %	80 %	99078043
24	NC_008043	GTGGG	2	10	32936	32945	0 %	20 %	80 %	0 %	99078043
25	NC_008043	GCACC	2	10	34005	34014	20 %	0 %	20 %	60 %	99078044
26	NC_008043	AGCGC	2	10	37923	37932	20 %	0 %	40 %	40 %	99078046
27	NC_008043	CGGGC	2	10	39411	39420	0 %	0 %	60 %	40 %	99078047
28	NC_008043	CATGG	2	10	40954	40963	20 %	20 %	40 %	20 %	99078049
29	NC_008043	GATCA	2	10	42074	42083	40 %	20 %	20 %	20 %	99078050
30	NC_008043	TGGGC	2	10	42765	42774	0 %	20 %	60 %	20 %	99078051
31	NC_008043	ATCGG	2	10	42787	42796	20 %	20 %	40 %	20 %	99078051
32	NC_008043	CGTCG	2	10	47227	47236	0 %	20 %	40 %	40 %	99078056
33	NC_008043	GATCC	2	10	47330	47339	20 %	20 %	20 %	40 %	99078056
34	NC_008043	TGCCC	2	10	48141	48150	0 %	20 %	20 %	60 %	99078057
35	NC_008043	GCGCG	2	10	48451	48460	0 %	0 %	60 %	40 %	99078058
36	NC_008043	ACGGC	2	10	48881	48890	20 %	0 %	40 %	40 %	99078058
37	NC_008043	CGCCC	2	10	49546	49555	0 %	0 %	20 %	80 %	99078059
38	NC_008043	GCAGT	2	10	52958	52967	20 %	20 %	40 %	20 %	99078063
39	NC_008043	TCCCC	2	10	53259	53268	0 %	20 %	0 %	80 %	99078063
40	NC_008043	TGGGC	2	10	53370	53379	0 %	20 %	60 %	20 %	99078063
41	NC_008043	CTCGC	2	10	54789	54798	0 %	20 %	20 %	60 %	99078065
42	NC_008043	CTCCA	2	10	54872	54881	20 %	20 %	0 %	60 %	99078065
43	NC_008043	TCTGG	2	10	55058	55067	0 %	40 %	40 %	20 %	99078065
44	NC_008043	GGTGA	2	10	55266	55275	20 %	20 %	60 %	0 %	99078065
45	NC_008043	CCGAG	2	10	55868	55877	20 %	0 %	40 %	40 %	99078065
46	NC_008043	GGTCT	2	10	56543	56552	0 %	40 %	40 %	20 %	99078066
47	NC_008043	AAGCA	2	10	58889	58898	60 %	0 %	20 %	20 %	99078067
48	NC_008043	CAAAG	2	10	63608	63617	60 %	0 %	20 %	20 %	99078072
49	NC_008043	CAAGG	2	10	65235	65244	40 %	0 %	40 %	20 %	99078073
50	NC_008043	TTCCC	2	10	65710	65719	0 %	40 %	0 %	60 %	99078074
51	NC_008043	CATTC	2	10	67007	67016	20 %	40 %	0 %	40 %	99078075
52	NC_008043	TGCCC	2	10	67408	67417	0 %	20 %	20 %	60 %	99078075
53	NC_008043	GGCAA	2	10	67454	67463	40 %	0 %	40 %	20 %	99078075
54	NC_008043	ATCCG	2	10	69011	69020	20 %	20 %	20 %	40 %	99078077
55	NC_008043	TGCGC	2	10	69659	69668	0 %	20 %	40 %	40 %	99078078
56	NC_008043	CCAGA	2	10	70859	70868	40 %	0 %	20 %	40 %	99078079
57	NC_008043	CGATG	2	10	72336	72345	20 %	20 %	40 %	20 %	99078080
58	NC_008043	GCTCT	2	10	72653	72662	0 %	40 %	20 %	40 %	99078081
59	NC_008043	GCCGC	2	10	75482	75491	0 %	0 %	40 %	60 %	99078083
60	NC_008043	GCGCC	2	10	75552	75561	0 %	0 %	40 %	60 %	99078083
61	NC_008043	GCGCC	2	10	75663	75672	0 %	0 %	40 %	60 %	99078083
62	NC_008043	TGAGC	2	10	84528	84537	20 %	20 %	40 %	20 %	99078090
63	NC_008043	TGCGC	2	10	85281	85290	0 %	20 %	40 %	40 %	99078091
64	NC_008043	CAGAT	2	10	86102	86111	40 %	20 %	20 %	20 %	99078092
65	NC_008043	TGATC	2	10	89749	89758	20 %	40 %	20 %	20 %	99078095
66	NC_008043	GATGC	2	10	89763	89772	20 %	20 %	40 %	20 %	99078095
67	NC_008043	CTTCC	2	10	90715	90724	0 %	40 %	0 %	60 %	99078095
68	NC_008043	GTCTG	2	10	91563	91572	0 %	40 %	40 %	20 %	99078096
69	NC_008043	GATTT	2	10	93293	93302	20 %	60 %	20 %	0 %	99078098
70	NC_008043	CCTTC	2	10	98662	98671	0 %	40 %	0 %	60 %	99078102
71	NC_008043	ACCAG	2	10	100071	100080	40 %	0 %	20 %	40 %	99078103
72	NC_008043	CCGTG	2	10	103679	103688	0 %	20 %	40 %	40 %	99078107
73	NC_008043	TCCGA	2	10	106454	106463	20 %	20 %	20 %	40 %	99078110
74	NC_008043	TGCCG	2	10	106898	106907	0 %	20 %	40 %	40 %	99078110
75	NC_008043	GTCGC	2	10	109518	109527	0 %	20 %	40 %	40 %	99078111
76	NC_008043	CCTGG	2	10	109735	109744	0 %	20 %	40 %	40 %	99078111
77	NC_008043	GGCGC	2	10	110124	110133	0 %	0 %	60 %	40 %	99078111
78	NC_008043	CCGTC	2	10	110842	110851	0 %	20 %	20 %	60 %	99078112
79	NC_008043	CGCCC	2	10	113062	113071	0 %	0 %	20 %	80 %	99078114
80	NC_008043	CGCGC	2	10	115655	115664	0 %	0 %	40 %	60 %	99078115
81	NC_008043	GATCC	2	10	115939	115948	20 %	20 %	20 %	40 %	99078115
82	NC_008043	TGCGG	2	10	116168	116177	0 %	20 %	60 %	20 %	99078115
83	NC_008043	ACGCG	2	10	118908	118917	20 %	0 %	40 %	40 %	99078118
84	NC_008043	GAAGA	2	10	119786	119795	60 %	0 %	40 %	0 %	99078119
85	NC_008043	GCATC	2	10	122061	122070	20 %	20 %	20 %	40 %	99078121
86	NC_008043	CAGGC	2	10	122662	122671	20 %	0 %	40 %	40 %	99078121
87	NC_008043	GCCGC	2	10	123070	123079	0 %	0 %	40 %	60 %	99078121
88	NC_008043	CCCAG	2	10	123676	123685	20 %	0 %	20 %	60 %	99078122
89	NC_008043	CCCGC	2	10	125399	125408	0 %	0 %	20 %	80 %	99078123
90	NC_008043	GCGCG	2	10	125592	125601	0 %	0 %	60 %	40 %	99078123
91	NC_008043	GGCAG	2	10	125648	125657	20 %	0 %	60 %	20 %	99078123
92	NC_008043	CCCAA	2	10	126196	126205	40 %	0 %	0 %	60 %	99078124
93	NC_008043	CGTTG	2	10	127166	127175	0 %	40 %	40 %	20 %	99078124
94	NC_008043	TCACC	2	10	128465	128474	20 %	20 %	0 %	60 %	99078125
95	NC_008043	CGGCG	2	10	128842	128851	0 %	0 %	60 %	40 %	99078126
96	NC_008043	GCCGC	2	10	129163	129172	0 %	0 %	40 %	60 %	99078126
97	NC_008043	ACGAT	2	10	130058	130067	40 %	20 %	20 %	20 %	99078127
98	NC_008043	ATCGG	2	10	130075	130084	20 %	20 %	40 %	20 %	99078127
99	NC_008043	GTGAC	2	10	130523	130532	20 %	20 %	40 %	20 %	99078127
100	NC_008043	CTCAG	2	10	130555	130564	20 %	20 %	20 %	40 %	99078127
101	NC_008043	CGCGA	2	10	131141	131150	20 %	0 %	40 %	40 %	99078128
102	NC_008043	GGCGC	2	10	133000	133009	0 %	0 %	60 %	40 %	99078130
103	NC_008043	TGATC	2	10	134064	134073	20 %	40 %	20 %	20 %	99078131
104	NC_008043	TGGCG	2	10	134893	134902	0 %	20 %	60 %	20 %	99078131
105	NC_008043	TCAGG	2	10	137108	137117	20 %	20 %	40 %	20 %	99078134
106	NC_008043	AGCAA	2	10	137448	137457	60 %	0 %	20 %	20 %	99078134
107	NC_008043	GCGCC	2	10	139205	139214	0 %	0 %	40 %	60 %	99078136
108	NC_008043	CCGGG	2	10	140224	140233	0 %	0 %	60 %	40 %	99078137
109	NC_008043	GCTGC	2	10	141820	141829	0 %	20 %	40 %	40 %	99078138
110	NC_008043	GCCTT	2	10	141906	141915	0 %	40 %	20 %	40 %	99078138
111	NC_008043	CCGTA	2	10	148726	148735	20 %	20 %	20 %	40 %	99078146
112	NC_008043	GGTCT	2	10	148979	148988	0 %	40 %	40 %	20 %	99078146
113	NC_008043	CCGAA	2	10	149650	149659	40 %	0 %	20 %	40 %	99078147
114	NC_008043	GCGCT	2	10	151526	151535	0 %	20 %	40 %	40 %	99078149
115	NC_008043	CGCGC	3	15	154651	154665	0 %	0 %	40 %	60 %	99078151
116	NC_008043	CGGCC	2	10	156103	156112	0 %	0 %	40 %	60 %	99078152
117	NC_008043	CGTGG	2	10	156689	156698	0 %	20 %	60 %	20 %	99078153
118	NC_008043	CGACC	2	10	158937	158946	20 %	0 %	20 %	60 %	99078155
119	NC_008043	GACCT	2	10	164453	164462	20 %	20 %	20 %	40 %	99078157
120	NC_008043	CAGAG	2	10	169561	169570	40 %	0 %	40 %	20 %	99078162
121	NC_008043	CTCCG	2	10	171876	171885	0 %	20 %	20 %	60 %	99078164
122	NC_008043	CCCCA	2	10	182042	182051	20 %	0 %	0 %	80 %	99078168
123	NC_008043	AAATC	2	10	187489	187498	60 %	20 %	0 %	20 %	99078172
124	NC_008043	AAGCA	2	10	187961	187970	60 %	0 %	20 %	20 %	99078172
125	NC_008043	GTGCT	2	10	188017	188026	0 %	40 %	40 %	20 %	99078172
126	NC_008043	CGTCT	2	10	188465	188474	0 %	40 %	20 %	40 %	99078172
127	NC_008043	GGTGG	2	10	189299	189308	0 %	20 %	80 %	0 %	99078172
128	NC_008043	CCGGC	2	10	192428	192437	0 %	0 %	40 %	60 %	99078175
129	NC_008043	GATCC	2	10	192838	192847	20 %	20 %	20 %	40 %	99078175
130	NC_008043	ACCGC	2	10	192901	192910	20 %	0 %	20 %	60 %	99078175
131	NC_008043	CCCGC	2	10	195525	195534	0 %	0 %	20 %	80 %	99078178
132	NC_008043	GGCAA	2	10	196945	196954	40 %	0 %	40 %	20 %	99078179
133	NC_008043	CGGCA	2	10	197313	197322	20 %	0 %	40 %	40 %	99078179
134	NC_008043	GCCGG	2	10	198780	198789	0 %	0 %	60 %	40 %	99078182
135	NC_008043	GTTGG	2	10	198865	198874	0 %	40 %	60 %	0 %	99078182
136	NC_008043	GCCAA	2	10	199479	199488	40 %	0 %	20 %	40 %	99078182
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