MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruegeria sp. TM1040 mega plasmid

Total Repeats: 14281

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_008043	CA	3	6	201487	201492	50 %	0 %	0 %	50 %	99078184
3502	NC_008043	GGTCAG	2	12	201545	201556	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	99078184
3503	NC_008043	GTC	2	6	201575	201580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078184
3504	NC_008043	AAC	2	6	201623	201628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99078184
3505	NC_008043	GA	3	6	201648	201653	50 %	0 %	50 %	0 %	99078184
3506	NC_008043	GAA	2	6	201665	201670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99078184
3507	NC_008043	T	6	6	201727	201732	0 %	100 %	0 %	0 %	99078184
3508	NC_008043	CCA	2	6	201768	201773	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99078184
3509	NC_008043	CTT	2	6	201802	201807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99078184
3510	NC_008043	TTC	2	6	201821	201826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99078184
3511	NC_008043	GCC	2	6	201869	201874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078184
3512	NC_008043	AG	3	6	201899	201904	50 %	0 %	50 %	0 %	99078184
3513	NC_008043	AGC	2	6	201924	201929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078184
3514	NC_008043	TTG	2	6	201957	201962	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99078184
3515	NC_008043	TG	3	6	201994	201999	0 %	50 %	50 %	0 %	99078184
3516	NC_008043	CAC	2	6	202036	202041	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99078184
3517	NC_008043	CCT	2	6	202098	202103	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99078184
3518	NC_008043	CTC	2	6	202151	202156	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99078184
3519	NC_008043	TCA	2	6	202237	202242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078185
3520	NC_008043	GC	3	6	202301	202306	0 %	0 %	50 %	50 %	99078185
3521	NC_008043	GTC	2	6	202312	202317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078185
3522	NC_008043	CGC	2	6	202352	202357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078185
3523	NC_008043	CTC	2	6	202362	202367	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99078185
3524	NC_008043	CGT	3	9	202430	202438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078185
3525	NC_008043	TGC	2	6	202503	202508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078185
3526	NC_008043	CAG	2	6	202509	202514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078185
3527	NC_008043	GTC	2	6	202533	202538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078185
3528	NC_008043	TGT	2	6	202674	202679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99078186
3529	NC_008043	GCAG	2	8	202699	202706	25 %	0 %	50 %	25 %	99078186
3530	NC_008043	TGC	2	6	202729	202734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078186
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3532	NC_008043	CT	3	6	203200	203205	0 %	50 %	0 %	50 %	99078187
3533	NC_008043	GCT	2	6	203253	203258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078187
3534	NC_008043	CAACG	2	10	203299	203308	40 %	0 %	20 %	40 %	99078187
3535	NC_008043	ATCG	2	8	203337	203344	25 %	25 %	25 %	25 %	99078187
3536	NC_008043	GC	3	6	203388	203393	0 %	0 %	50 %	50 %	99078187
3537	NC_008043	GCG	2	6	203452	203457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078187
3538	NC_008043	C	6	6	203523	203528	0 %	0 %	0 %	100 %	99078187
3539	NC_008043	ATG	2	6	203542	203547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078187
3540	NC_008043	CG	3	6	203551	203556	0 %	0 %	50 %	50 %	99078187
3541	NC_008043	ACA	2	6	203573	203578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99078187
3542	NC_008043	CCA	2	6	203580	203585	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99078187
3543	NC_008043	CCT	2	6	203600	203605	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99078187
3544	NC_008043	GCT	2	6	203613	203618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078187
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3546	NC_008043	GCA	2	6	203702	203707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078187
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3550	NC_008043	TGGT	2	8	203876	203883	0 %	50 %	50 %	0 %	99078187
3551	NC_008043	GAGT	2	8	203948	203955	25 %	25 %	50 %	0 %	99078187
3552	NC_008043	TGT	2	6	203967	203972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99078187
3553	NC_008043	CGA	2	6	204009	204014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078187
3554	NC_008043	GGA	2	6	204030	204035	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99078187
3555	NC_008043	TC	3	6	204044	204049	0 %	50 %	0 %	50 %	99078187
3556	NC_008043	GCGG	2	8	204057	204064	0 %	0 %	75 %	25 %	99078187
3557	NC_008043	CGT	2	6	204117	204122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078187
3558	NC_008043	GAA	2	6	204148	204153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99078187
3559	NC_008043	CGA	2	6	204186	204191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078187
3560	NC_008043	TGG	2	6	204274	204279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99078187
3561	NC_008043	GC	4	8	204317	204324	0 %	0 %	50 %	50 %	99078187
3562	NC_008043	TGAG	2	8	204326	204333	25 %	25 %	50 %	0 %	99078187
3563	NC_008043	GC	3	6	204435	204440	0 %	0 %	50 %	50 %	99078187
3564	NC_008043	GATGCC	2	12	204445	204456	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	99078187
3565	NC_008043	CAA	2	6	204478	204483	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99078187
3566	NC_008043	TCAGA	2	10	204584	204593	40 %	20 %	20 %	20 %	99078187
3567	NC_008043	CGG	2	6	204647	204652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078187
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3570	NC_008043	TGC	2	6	204747	204752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078187
3571	NC_008043	GC	3	6	204794	204799	0 %	0 %	50 %	50 %	99078187
3572	NC_008043	GC	3	6	204826	204831	0 %	0 %	50 %	50 %	99078187
3573	NC_008043	CGA	2	6	204849	204854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078187
3574	NC_008043	CGA	2	6	204933	204938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078187
3575	NC_008043	TTCC	2	8	204942	204949	0 %	50 %	0 %	50 %	99078187
3576	NC_008043	CTTG	2	8	204957	204964	0 %	50 %	25 %	25 %	99078187
3577	NC_008043	CGG	2	6	205139	205144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078187
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3581	NC_008043	GCC	2	6	205315	205320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078187
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3589	NC_008043	TGA	2	6	205745	205750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078188
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3593	NC_008043	ACGT	2	8	205859	205866	25 %	25 %	25 %	25 %	99078188
3594	NC_008043	CGC	2	6	205906	205911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078188
3595	NC_008043	CGC	2	6	205916	205921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078188
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3602	NC_008043	CA	3	6	206173	206178	50 %	0 %	0 %	50 %	99078188
3603	NC_008043	GGATC	2	10	206214	206223	20 %	20 %	40 %	20 %	99078188
3604	NC_008043	GGT	2	6	206235	206240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99078188
3605	NC_008043	GGC	2	6	206241	206246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078188
3606	NC_008043	GAC	2	6	206248	206253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078188
3607	NC_008043	CGC	2	6	206318	206323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078188
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3621	NC_008043	GGC	2	6	207054	207059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078189
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3623	NC_008043	GCA	2	6	207104	207109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078189
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3747	NC_008043	GCAGTC	2	12	213821	213832	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	99078195
3748	NC_008043	AGC	2	6	214099	214104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078196
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3993	NC_008043	ATC	2	6	228890	228895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078208
3994	NC_008043	AG	3	6	228901	228906	50 %	0 %	50 %	0 %	99078208
3995	NC_008043	ACG	2	6	228910	228915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078208
3996	NC_008043	GTC	2	6	228986	228991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078208
3997	NC_008043	ACGC	2	8	229000	229007	25 %	0 %	25 %	50 %	99078208
3998	NC_008043	GGC	2	6	229016	229021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078208
3999	NC_008043	GTG	2	6	229022	229027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99078208
4000	NC_008043	TGA	2	6	229036	229041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078208

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