MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruegeria sp. TM1040 mega plasmid

Total Repeats: 14281

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_008043	CCT	2	6	138840	138845	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99078135
2502	NC_008043	CGG	2	6	138876	138881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078135
2503	NC_008043	CCA	2	6	138912	138917	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99078135
2504	NC_008043	GCA	2	6	138939	138944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078135
2505	NC_008043	GCG	2	6	139013	139018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078135
2506	NC_008043	CG	3	6	139017	139022	0 %	0 %	50 %	50 %	99078135
2507	NC_008043	GCGCC	2	10	139205	139214	0 %	0 %	40 %	60 %	99078136
2508	NC_008043	CGA	2	6	139235	139240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078136
2509	NC_008043	TCGA	2	8	139257	139264	25 %	25 %	25 %	25 %	99078136
2510	NC_008043	CGCC	2	8	139283	139290	0 %	0 %	25 %	75 %	99078136
2511	NC_008043	AGC	2	6	139302	139307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078136
2512	NC_008043	ACT	2	6	139321	139326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078136
2513	NC_008043	GCA	2	6	139330	139335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078136
2514	NC_008043	GCC	2	6	139353	139358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078136
2515	NC_008043	CCG	2	6	139384	139389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078136
2516	NC_008043	GC	3	6	139394	139399	0 %	0 %	50 %	50 %	99078136
2517	NC_008043	CGGC	2	8	139427	139434	0 %	0 %	50 %	50 %	99078136
2518	NC_008043	ATC	2	6	139443	139448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078136
2519	NC_008043	GCC	2	6	139461	139466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078136
2520	NC_008043	TGA	2	6	139546	139551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078136
2521	NC_008043	GC	3	6	139595	139600	0 %	0 %	50 %	50 %	99078136
2522	NC_008043	GCC	2	6	139638	139643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078136
2523	NC_008043	GGT	2	6	139981	139986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99078137
2524	NC_008043	TCA	2	6	140032	140037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078137
2525	NC_008043	GAC	2	6	140043	140048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078137
2526	NC_008043	CGG	2	6	140096	140101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078137
2527	NC_008043	CCT	2	6	140104	140109	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99078137
2528	NC_008043	CTC	2	6	140167	140172	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99078137
2529	NC_008043	T	6	6	140189	140194	0 %	100 %	0 %	0 %	99078137
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2531	NC_008043	CCGGG	2	10	140224	140233	0 %	0 %	60 %	40 %	99078137
2532	NC_008043	CAC	2	6	140279	140284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99078137
2533	NC_008043	TGC	2	6	140368	140373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078137
2534	NC_008043	CAG	2	6	140449	140454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078137
2535	NC_008043	GC	3	6	140459	140464	0 %	0 %	50 %	50 %	99078137
2536	NC_008043	GCTC	2	8	140474	140481	0 %	25 %	25 %	50 %	99078137
2537	NC_008043	TCT	2	6	140531	140536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99078137
2538	NC_008043	GGC	2	6	140612	140617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078137
2539	NC_008043	ACA	2	6	140653	140658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99078137
2540	NC_008043	CA	3	6	140657	140662	50 %	0 %	0 %	50 %	99078137
2541	NC_008043	GC	3	6	140722	140727	0 %	0 %	50 %	50 %	99078137
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2543	NC_008043	TGCC	2	8	140770	140777	0 %	25 %	25 %	50 %	99078137
2544	NC_008043	GC	4	8	140781	140788	0 %	0 %	50 %	50 %	99078137
2545	NC_008043	TGG	2	6	140881	140886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99078137
2546	NC_008043	GCT	2	6	140912	140917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078137
2547	NC_008043	GGC	2	6	140999	141004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078138
2548	NC_008043	CACC	2	8	141106	141113	25 %	0 %	0 %	75 %	99078138
2549	NC_008043	GC	3	6	141142	141147	0 %	0 %	50 %	50 %	99078138
2550	NC_008043	GCC	2	6	141347	141352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078138
2551	NC_008043	GAT	2	6	141368	141373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078138
2552	NC_008043	GGT	2	6	141476	141481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99078138
2553	NC_008043	CCA	2	6	141484	141489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99078138
2554	NC_008043	GAC	2	6	141494	141499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078138
2555	NC_008043	CAC	3	9	141623	141631	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99078138
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2557	NC_008043	GCG	2	6	141703	141708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078138
2558	NC_008043	GCTGC	2	10	141820	141829	0 %	20 %	40 %	40 %	99078138
2559	NC_008043	GCG	2	6	141843	141848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078138
2560	NC_008043	CCA	2	6	141856	141861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99078138
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2562	NC_008043	GC	3	6	141881	141886	0 %	0 %	50 %	50 %	99078138
2563	NC_008043	GCCTT	2	10	141906	141915	0 %	40 %	20 %	40 %	99078138
2564	NC_008043	CCGG	2	8	142236	142243	0 %	0 %	50 %	50 %	99078139
2565	NC_008043	GGC	2	6	142274	142279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078139
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2580	NC_008043	CTG	2	6	143231	143236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078140
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2589	NC_008043	GAG	2	6	143682	143687	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99078140
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2593	NC_008043	TCA	2	6	143953	143958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078141
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2595	NC_008043	GC	3	6	144079	144084	0 %	0 %	50 %	50 %	99078141
2596	NC_008043	GTG	2	6	144090	144095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99078141
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2598	NC_008043	GC	3	6	144251	144256	0 %	0 %	50 %	50 %	99078141
2599	NC_008043	CAC	2	6	144883	144888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99078142
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2601	NC_008043	GA	3	6	144987	144992	50 %	0 %	50 %	0 %	99078142
2602	NC_008043	GCG	2	6	145014	145019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078142
2603	NC_008043	TGA	2	6	145026	145031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078142
2604	NC_008043	CGC	2	6	145051	145056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078142
2605	NC_008043	GCA	2	6	145170	145175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078142
2606	NC_008043	TGGCCT	2	12	145475	145486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078143
2607	NC_008043	CG	3	6	145508	145513	0 %	0 %	50 %	50 %	99078143
2608	NC_008043	GCA	2	6	145525	145530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078143
2609	NC_008043	CCA	2	6	145592	145597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99078143
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2993	NC_008043	CTG	2	6	164876	164881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078157
2994	NC_008043	GCG	2	6	164903	164908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078157
2995	NC_008043	CGGG	2	8	164909	164916	0 %	0 %	75 %	25 %	99078157
2996	NC_008043	TGG	2	6	164940	164945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99078157
2997	NC_008043	AGC	2	6	165017	165022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078157
2998	NC_008043	GAA	2	6	165221	165226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99078157
2999	NC_008043	CGC	2	6	165232	165237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078157
3000	NC_008043	TGC	2	6	165246	165251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078157

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