MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruegeria sp. TM1040 mega plasmid

Total Repeats: 14281

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_008043	GGT	2	6	79894	79899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99078087
1502	NC_008043	GCC	2	6	80045	80050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078087
1503	NC_008043	CG	3	6	80052	80057	0 %	0 %	50 %	50 %	99078087
1504	NC_008043	GC	3	6	80095	80100	0 %	0 %	50 %	50 %	99078087
1505	NC_008043	CG	3	6	80101	80106	0 %	0 %	50 %	50 %	99078087
1506	NC_008043	AGATCC	2	12	80111	80122	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	99078087
1507	NC_008043	GGC	2	6	80159	80164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078087
1508	NC_008043	GCG	2	6	80170	80175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078087
1509	NC_008043	TCTGCG	2	12	80180	80191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078087
1510	NC_008043	CAC	2	6	80353	80358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99078088
1511	NC_008043	GCG	2	6	80367	80372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078088
1512	NC_008043	GGT	3	9	80401	80409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99078088
1513	NC_008043	CAC	2	6	80431	80436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99078088
1514	NC_008043	GTT	2	6	80475	80480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99078088
1515	NC_008043	CA	3	6	80524	80529	50 %	0 %	0 %	50 %	99078088
1516	NC_008043	CGGT	2	8	80552	80559	0 %	25 %	50 %	25 %	99078088
1517	NC_008043	CGG	2	6	80679	80684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078088
1518	NC_008043	CCA	2	6	80703	80708	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99078088
1519	NC_008043	TCA	2	6	80769	80774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078088
1520	NC_008043	GCG	2	6	80793	80798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078088
1521	NC_008043	AGCC	2	8	80817	80824	25 %	0 %	25 %	50 %	99078088
1522	NC_008043	CGC	2	6	80866	80871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078088
1523	NC_008043	CGC	2	6	80875	80880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078088
1524	NC_008043	GC	3	6	81021	81026	0 %	0 %	50 %	50 %	99078088
1525	NC_008043	GAG	2	6	81059	81064	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99078088
1526	NC_008043	CTC	2	6	81127	81132	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99078088
1527	NC_008043	CCG	2	6	81141	81146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078088
1528	NC_008043	CGG	2	6	81186	81191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078088
1529	NC_008043	GC	3	6	81220	81225	0 %	0 %	50 %	50 %	99078088
1530	NC_008043	CGG	2	6	81237	81242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078088
1531	NC_008043	GGC	2	6	81271	81276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078088
1532	NC_008043	GC	3	6	81391	81396	0 %	0 %	50 %	50 %	99078088
1533	NC_008043	CGT	2	6	81480	81485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078088
1534	NC_008043	ACG	2	6	82041	82046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078089
1535	NC_008043	TGC	2	6	82226	82231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078089
1536	NC_008043	AAT	2	6	82234	82239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	99078089
1537	NC_008043	CCG	3	9	82259	82267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078089
1538	NC_008043	TCG	2	6	82290	82295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078089
1539	NC_008043	GTG	2	6	82320	82325	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99078089
1540	NC_008043	ATG	2	6	82329	82334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078089
1541	NC_008043	CAAA	2	8	82404	82411	75 %	0 %	0 %	25 %	99078089
1542	NC_008043	GATC	2	8	82477	82484	25 %	25 %	25 %	25 %	99078089
1543	NC_008043	AGC	2	6	82605	82610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078089
1544	NC_008043	TCAT	2	8	82623	82630	25 %	50 %	0 %	25 %	99078089
1545	NC_008043	TCGG	2	8	82746	82753	0 %	25 %	50 %	25 %	99078089
1546	NC_008043	GTCG	2	8	82763	82770	0 %	25 %	50 %	25 %	99078089
1547	NC_008043	AAC	2	6	82779	82784	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99078089
1548	NC_008043	TCA	2	6	82785	82790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078089
1549	NC_008043	CCG	2	6	82808	82813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078089
1550	NC_008043	TTCG	2	8	82873	82880	0 %	50 %	25 %	25 %	99078089
1551	NC_008043	A	6	6	82894	82899	100 %	0 %	0 %	0 %	99078089
1552	NC_008043	TTC	2	6	82932	82937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99078089
1553	NC_008043	TCAT	2	8	82960	82967	25 %	50 %	0 %	25 %	99078089
1554	NC_008043	TGC	2	6	83045	83050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078090
1555	NC_008043	TCC	2	6	83071	83076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99078090
1556	NC_008043	CAA	2	6	83127	83132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99078090
1557	NC_008043	CG	3	6	83168	83173	0 %	0 %	50 %	50 %	99078090
1558	NC_008043	GAT	2	6	83275	83280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078090
1559	NC_008043	TGGT	2	8	83415	83422	0 %	50 %	50 %	0 %	99078090
1560	NC_008043	TGA	2	6	83442	83447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078090
1561	NC_008043	AAC	2	6	83471	83476	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99078090
1562	NC_008043	TGC	2	6	83489	83494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078090
1563	NC_008043	AGGC	2	8	83525	83532	25 %	0 %	50 %	25 %	99078090
1564	NC_008043	TCG	2	6	83573	83578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078090
1565	NC_008043	ATG	2	6	83639	83644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078090
1566	NC_008043	TAC	2	6	83647	83652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078090
1567	NC_008043	GGC	2	6	83667	83672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078090
1568	NC_008043	CGG	2	6	83726	83731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078090
1569	NC_008043	G	6	6	83742	83747	0 %	0 %	100 %	0 %	99078090
1570	NC_008043	TGG	2	6	83807	83812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99078090
1571	NC_008043	CG	3	6	83834	83839	0 %	0 %	50 %	50 %	99078090
1572	NC_008043	CGC	2	6	83859	83864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078090
1573	NC_008043	CAA	2	6	83895	83900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99078090
1574	NC_008043	GAAA	2	8	83937	83944	75 %	0 %	25 %	0 %	99078090
1575	NC_008043	TCG	2	6	83957	83962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078090
1576	NC_008043	GTT	2	6	83977	83982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99078090
1577	NC_008043	GCTG	2	8	84066	84073	0 %	25 %	50 %	25 %	99078090
1578	NC_008043	CAT	2	6	84129	84134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078090
1579	NC_008043	ACT	2	6	84293	84298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078090
1580	NC_008043	GGTT	2	8	84346	84353	0 %	50 %	50 %	0 %	99078090
1581	NC_008043	GC	3	6	84387	84392	0 %	0 %	50 %	50 %	99078090
1582	NC_008043	AGA	2	6	84416	84421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99078090
1583	NC_008043	TGAGC	2	10	84528	84537	20 %	20 %	40 %	20 %	99078090
1584	NC_008043	AAG	2	6	84749	84754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99078091
1585	NC_008043	A	6	6	84865	84870	100 %	0 %	0 %	0 %	99078091
1586	NC_008043	CTG	2	6	84883	84888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078091
1587	NC_008043	GC	3	6	84926	84931	0 %	0 %	50 %	50 %	99078091
1588	NC_008043	TGGC	2	8	84990	84997	0 %	25 %	50 %	25 %	99078091
1589	NC_008043	CCG	2	6	85025	85030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078091
1590	NC_008043	CTGATC	2	12	85060	85071	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	99078091
1591	NC_008043	TGCGC	2	10	85281	85290	0 %	20 %	40 %	40 %	99078091
1592	NC_008043	TCA	2	6	85355	85360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078091
1593	NC_008043	TCT	3	9	85448	85456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99078091
1594	NC_008043	ACA	3	9	85544	85552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99078092
1595	NC_008043	CGA	2	6	85576	85581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078092
1596	NC_008043	ATC	2	6	85583	85588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078092
1597	NC_008043	GAT	2	6	85609	85614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078092
1598	NC_008043	TCTCAT	2	12	85665	85676	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	99078092
1599	NC_008043	GCC	2	6	85747	85752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078092
1600	NC_008043	AG	3	6	85762	85767	50 %	0 %	50 %	0 %	99078092
1601	NC_008043	GGGC	2	8	85924	85931	0 %	0 %	75 %	25 %	99078092
1602	NC_008043	CCT	2	6	85947	85952	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99078092
1603	NC_008043	CTG	2	6	85955	85960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078092
1604	NC_008043	TC	3	6	85982	85987	0 %	50 %	0 %	50 %	99078092
1605	NC_008043	TTG	2	6	86013	86018	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99078092
1606	NC_008043	GT	3	6	86052	86057	0 %	50 %	50 %	0 %	99078092
1607	NC_008043	TAC	2	6	86069	86074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078092
1608	NC_008043	TGG	2	6	86076	86081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99078092
1609	NC_008043	CAGAT	2	10	86102	86111	40 %	20 %	20 %	20 %	99078092
1610	NC_008043	CGG	2	6	86127	86132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078092
1611	NC_008043	GCA	2	6	86145	86150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078092
1612	NC_008043	ATC	2	6	86201	86206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078092
1613	NC_008043	CGT	2	6	86230	86235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078092
1614	NC_008043	CAT	2	6	86236	86241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078092
1615	NC_008043	CCT	2	6	86292	86297	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99078092
1616	NC_008043	TGA	2	6	86304	86309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078092
1617	NC_008043	ATG	2	6	86327	86332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078092
1618	NC_008043	TCG	2	6	86349	86354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078092
1619	NC_008043	TTG	2	6	86378	86383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99078092
1620	NC_008043	GCTG	2	8	86386	86393	0 %	25 %	50 %	25 %	99078092
1621	NC_008043	CTG	2	6	86399	86404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078092
1622	NC_008043	CCG	2	6	86534	86539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078093
1623	NC_008043	TTTC	2	8	86549	86556	0 %	75 %	0 %	25 %	99078093
1624	NC_008043	TCG	2	6	86585	86590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078093
1625	NC_008043	AAT	2	6	86628	86633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	99078093
1626	NC_008043	TGA	2	6	86682	86687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078093
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1628	NC_008043	GGC	2	6	86798	86803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078093
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