MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruegeria sp. TM1040 mega plasmid

Total Repeats: 14281

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_008043	CTG	2	6	53167	53172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078063
1002	NC_008043	TCCCC	2	10	53259	53268	0 %	20 %	0 %	80 %	99078063
1003	NC_008043	TGC	2	6	53289	53294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078063
1004	NC_008043	TGC	2	6	53331	53336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078063
1005	NC_008043	TGT	2	6	53341	53346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99078063
1006	NC_008043	CTGC	2	8	53350	53357	0 %	25 %	25 %	50 %	99078063
1007	NC_008043	TGGGC	2	10	53370	53379	0 %	20 %	60 %	20 %	99078063
1008	NC_008043	GAT	2	6	53380	53385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078063
1009	NC_008043	TC	3	6	53424	53429	0 %	50 %	0 %	50 %	99078063
1010	NC_008043	CAA	2	6	53431	53436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99078063
1011	NC_008043	TTCT	2	8	53444	53451	0 %	75 %	0 %	25 %	99078063
1012	NC_008043	CGG	2	6	53475	53480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078063
1013	NC_008043	TTAT	2	8	53484	53491	25 %	75 %	0 %	0 %	99078063
1014	NC_008043	TCTG	2	8	53514	53521	0 %	50 %	25 %	25 %	99078063
1015	NC_008043	TC	4	8	53551	53558	0 %	50 %	0 %	50 %	99078063
1016	NC_008043	GTC	2	6	53612	53617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078064
1017	NC_008043	CG	4	8	53876	53883	0 %	0 %	50 %	50 %	99078064
1018	NC_008043	CGC	2	6	53918	53923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078064
1019	NC_008043	CATG	2	8	53924	53931	25 %	25 %	25 %	25 %	99078064
1020	NC_008043	CGG	2	6	53993	53998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078064
1021	NC_008043	GGT	2	6	54002	54007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99078064
1022	NC_008043	ACCA	2	8	54012	54019	50 %	0 %	0 %	50 %	99078064
1023	NC_008043	CGC	2	6	54062	54067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078064
1024	NC_008043	CCT	2	6	54130	54135	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99078064
1025	NC_008043	GCC	2	6	54161	54166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078064
1026	NC_008043	GAT	2	6	54173	54178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078064
1027	NC_008043	CG	3	6	54619	54624	0 %	0 %	50 %	50 %	99078065
1028	NC_008043	ACC	2	6	54672	54677	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99078065
1029	NC_008043	CTG	2	6	54712	54717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078065
1030	NC_008043	CTCGC	2	10	54789	54798	0 %	20 %	20 %	60 %	99078065
1031	NC_008043	GATC	2	8	54803	54810	25 %	25 %	25 %	25 %	99078065
1032	NC_008043	CTCCA	2	10	54872	54881	20 %	20 %	0 %	60 %	99078065
1033	NC_008043	AAG	2	6	54889	54894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99078065
1034	NC_008043	GGC	2	6	54933	54938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078065
1035	NC_008043	CGG	2	6	55037	55042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078065
1036	NC_008043	TCTGG	2	10	55058	55067	0 %	40 %	40 %	20 %	99078065
1037	NC_008043	GACG	2	8	55118	55125	25 %	0 %	50 %	25 %	99078065
1038	NC_008043	TGAT	2	8	55159	55166	25 %	50 %	25 %	0 %	99078065
1039	NC_008043	GGGC	2	8	55186	55193	0 %	0 %	75 %	25 %	99078065
1040	NC_008043	GGTGA	2	10	55266	55275	20 %	20 %	60 %	0 %	99078065
1041	NC_008043	GTG	2	6	55353	55358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99078065
1042	NC_008043	C	6	6	55416	55421	0 %	0 %	0 %	100 %	99078065
1043	NC_008043	TGA	2	6	55498	55503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078065
1044	NC_008043	GCA	2	6	55543	55548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078065
1045	NC_008043	CG	3	6	55556	55561	0 %	0 %	50 %	50 %	99078065
1046	NC_008043	CCA	2	6	55604	55609	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99078065
1047	NC_008043	TCA	2	6	55693	55698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078065
1048	NC_008043	CGTG	2	8	55793	55800	0 %	25 %	50 %	25 %	99078065
1049	NC_008043	ACC	2	6	55825	55830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99078065
1050	NC_008043	CCGAG	2	10	55868	55877	20 %	0 %	40 %	40 %	99078065
1051	NC_008043	CTG	2	6	55915	55920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078065
1052	NC_008043	CG	3	6	55939	55944	0 %	0 %	50 %	50 %	99078065
1053	NC_008043	GCT	2	6	55952	55957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078065
1054	NC_008043	GCA	2	6	56514	56519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078066
1055	NC_008043	GGTCT	2	10	56543	56552	0 %	40 %	40 %	20 %	99078066
1056	NC_008043	GC	3	6	56584	56589	0 %	0 %	50 %	50 %	99078066
1057	NC_008043	AGA	2	6	56614	56619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99078066
1058	NC_008043	GCT	2	6	56629	56634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078066
1059	NC_008043	CCG	2	6	56642	56647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078066
1060	NC_008043	CGGACC	2	12	56688	56699	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	99078066
1061	NC_008043	TACC	2	8	56737	56744	25 %	25 %	0 %	50 %	99078066
1062	NC_008043	CGCC	2	8	56928	56935	0 %	0 %	25 %	75 %	99078066
1063	NC_008043	ACC	2	6	57077	57082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99078066
1064	NC_008043	TCG	2	6	57087	57092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078066
1065	NC_008043	GGATGT	2	12	57118	57129	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	99078066
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1068	NC_008043	TCG	2	6	57658	57663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078067
1069	NC_008043	T	7	7	57672	57678	0 %	100 %	0 %	0 %	99078067
1070	NC_008043	CGC	2	6	57690	57695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078067
1071	NC_008043	GC	3	6	57755	57760	0 %	0 %	50 %	50 %	99078067
1072	NC_008043	ATA	2	6	57790	57795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	99078067
1073	NC_008043	ATG	2	6	57989	57994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078067
1074	NC_008043	GGC	2	6	57995	58000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078067
1075	NC_008043	GC	3	6	58045	58050	0 %	0 %	50 %	50 %	99078067
1076	NC_008043	GC	3	6	58079	58084	0 %	0 %	50 %	50 %	99078067
1077	NC_008043	GGC	2	6	58092	58097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078067
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1083	NC_008043	TGG	2	6	58526	58531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99078067
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1085	NC_008043	GCC	2	6	58628	58633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078067
1086	NC_008043	GAAT	2	8	58647	58654	50 %	25 %	25 %	0 %	99078067
1087	NC_008043	GCG	2	6	58668	58673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078067
1088	NC_008043	AGA	2	6	58686	58691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99078067
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1098	NC_008043	GCA	2	6	59230	59235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078067
1099	NC_008043	TGGA	2	8	59281	59288	25 %	25 %	50 %	0 %	99078067
1100	NC_008043	GAT	2	6	59293	59298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078067
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1102	NC_008043	CTG	2	6	59377	59382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078067
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1108	NC_008043	TCA	2	6	59543	59548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078067
1109	NC_008043	CTG	2	6	59554	59559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078067
1110	NC_008043	TGG	2	6	59736	59741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99078067
1111	NC_008043	CCA	2	6	59790	59795	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99078067
1112	NC_008043	ATCT	2	8	59803	59810	25 %	50 %	0 %	25 %	99078067
1113	NC_008043	GC	3	6	59831	59836	0 %	0 %	50 %	50 %	99078067
1114	NC_008043	CGG	2	6	59896	59901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078068
1115	NC_008043	GCA	2	6	59932	59937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078068
1116	NC_008043	CAT	3	9	59948	59956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078068
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1118	NC_008043	CGG	2	6	60015	60020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078068
1119	NC_008043	TC	3	6	60021	60026	0 %	50 %	0 %	50 %	99078068
1120	NC_008043	GC	4	8	60049	60056	0 %	0 %	50 %	50 %	99078068
1121	NC_008043	ACA	2	6	60142	60147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99078068
1122	NC_008043	CGC	2	6	60150	60155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078068
1123	NC_008043	G	6	6	60191	60196	0 %	0 %	100 %	0 %	99078068
1124	NC_008043	TCAT	2	8	60204	60211	25 %	50 %	0 %	25 %	99078068
1125	NC_008043	CAA	2	6	60241	60246	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99078068
1126	NC_008043	CG	3	6	60251	60256	0 %	0 %	50 %	50 %	99078068
1127	NC_008043	GAA	2	6	60344	60349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99078068
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1129	NC_008043	G	6	6	60369	60374	0 %	0 %	100 %	0 %	99078068
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