MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruegeria sp. TM1040 mega plasmid

Total Repeats: 14281

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_008043	GCC	2	6	516774	516779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078461
9002	NC_008043	CAC	2	6	516872	516877	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99078461
9003	NC_008043	ACT	2	6	516883	516888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078461
9004	NC_008043	TTG	2	6	517068	517073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99078461
9005	NC_008043	TTC	2	6	517074	517079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99078461
9006	NC_008043	TGTT	2	8	517081	517088	0 %	75 %	25 %	0 %	99078461
9007	NC_008043	GTTCC	2	10	517101	517110	0 %	40 %	20 %	40 %	99078461
9008	NC_008043	TCT	2	6	517300	517305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99078461
9009	NC_008043	TGC	2	6	517315	517320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078461
9010	NC_008043	TGA	2	6	517324	517329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078461
9011	NC_008043	GCG	2	6	517341	517346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078461
9012	NC_008043	GGT	2	6	517394	517399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99078461
9013	NC_008043	AGCC	2	8	517419	517426	25 %	0 %	25 %	50 %	99078461
9014	NC_008043	CGG	2	6	517432	517437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078461
9015	NC_008043	CG	3	6	517464	517469	0 %	0 %	50 %	50 %	99078461
9016	NC_008043	ACC	2	6	517474	517479	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99078461
9017	NC_008043	TGA	2	6	517480	517485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078461
9018	NC_008043	GGC	2	6	517502	517507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078461
9019	NC_008043	GCC	2	6	517511	517516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078461
9020	NC_008043	TTC	2	6	517527	517532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99078461
9021	NC_008043	GTC	2	6	517636	517641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078462
9022	NC_008043	GC	3	6	517659	517664	0 %	0 %	50 %	50 %	99078462
9023	NC_008043	GC	4	8	517712	517719	0 %	0 %	50 %	50 %	99078462
9024	NC_008043	GAT	2	6	517744	517749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078462
9025	NC_008043	GCC	2	6	517759	517764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078462
9026	NC_008043	GC	3	6	517875	517880	0 %	0 %	50 %	50 %	99078462
9027	NC_008043	CG	3	6	517898	517903	0 %	0 %	50 %	50 %	99078462
9028	NC_008043	GCGGG	2	10	517936	517945	0 %	0 %	80 %	20 %	99078462
9029	NC_008043	CAT	2	6	517984	517989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078462
9030	NC_008043	GC	3	6	518098	518103	0 %	0 %	50 %	50 %	99078462
9031	NC_008043	GGCG	2	8	518176	518183	0 %	0 %	75 %	25 %	99078462
9032	NC_008043	CGG	2	6	518230	518235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078462
9033	NC_008043	GCG	2	6	518269	518274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078462
9034	NC_008043	GC	3	6	518331	518336	0 %	0 %	50 %	50 %	99078462
9035	NC_008043	CTG	2	6	518458	518463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078462
9036	NC_008043	GC	3	6	518515	518520	0 %	0 %	50 %	50 %	99078462
9037	NC_008043	TGA	2	6	518551	518556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078462
9038	NC_008043	GAT	2	6	518576	518581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078462
9039	NC_008043	ACC	2	6	518585	518590	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99078462
9040	NC_008043	GCC	2	6	518775	518780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078462
9041	NC_008043	AGC	2	6	518781	518786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078462
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9043	NC_008043	CGG	3	9	518995	519003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078462
9044	NC_008043	ATG	2	6	519090	519095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078462
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9046	NC_008043	CGC	2	6	519196	519201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078462
9047	NC_008043	CG	3	6	519231	519236	0 %	0 %	50 %	50 %	99078462
9048	NC_008043	TGG	2	6	519281	519286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99078462
9049	NC_008043	AGC	2	6	519360	519365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078462
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9051	NC_008043	CAC	2	6	519509	519514	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99078462
9052	NC_008043	CG	3	6	519519	519524	0 %	0 %	50 %	50 %	99078462
9053	NC_008043	GCA	2	6	519577	519582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078462
9054	NC_008043	GCC	2	6	519752	519757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078463
9055	NC_008043	GCG	2	6	519839	519844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078463
9056	NC_008043	GAG	2	6	519952	519957	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99078463
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9058	NC_008043	GCG	2	6	520036	520041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078463
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9060	NC_008043	GC	3	6	520152	520157	0 %	0 %	50 %	50 %	99078463
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9062	NC_008043	CCTC	2	8	520253	520260	0 %	25 %	0 %	75 %	99078463
9063	NC_008043	CG	3	6	520314	520319	0 %	0 %	50 %	50 %	99078463
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9096	NC_008043	TGCC	2	8	521734	521741	0 %	25 %	25 %	50 %	99078464
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9122	NC_008043	GGC	2	6	522717	522722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078465
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9499	NC_008043	GCT	2	6	540536	540541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078480
9500	NC_008043	CGG	2	6	540597	540602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078480

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