MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruegeria sp. TM1040 mega plasmid

Total Repeats: 14281

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_008043	ACC	2	6	316852	316857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99078284
5502	NC_008043	GCC	2	6	316921	316926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078284
5503	NC_008043	GC	3	6	316977	316982	0 %	0 %	50 %	50 %	99078284
5504	NC_008043	GAT	2	6	317025	317030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078284
5505	NC_008043	GA	3	6	317066	317071	50 %	0 %	50 %	0 %	99078284
5506	NC_008043	CGA	2	6	317115	317120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078284
5507	NC_008043	GCC	2	6	317149	317154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078284
5508	NC_008043	GCAC	2	8	317181	317188	25 %	0 %	25 %	50 %	99078284
5509	NC_008043	TGC	2	6	317216	317221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078284
5510	NC_008043	GC	3	6	317253	317258	0 %	0 %	50 %	50 %	99078284
5511	NC_008043	GC	3	6	317316	317321	0 %	0 %	50 %	50 %	99078284
5512	NC_008043	CTG	2	6	317332	317337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078284
5513	NC_008043	CCG	2	6	317349	317354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078284
5514	NC_008043	AG	3	6	317376	317381	50 %	0 %	50 %	0 %	99078284
5515	NC_008043	CCG	3	9	317397	317405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078284
5516	NC_008043	GGC	2	6	317418	317423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078284
5517	NC_008043	TGA	2	6	317459	317464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078284
5518	NC_008043	GA	3	6	317471	317476	50 %	0 %	50 %	0 %	99078284
5519	NC_008043	ACGC	2	8	317508	317515	25 %	0 %	25 %	50 %	99078284
5520	NC_008043	ATC	2	6	317557	317562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078284
5521	NC_008043	GCC	2	6	317563	317568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078284
5522	NC_008043	GAA	2	6	317590	317595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99078284
5523	NC_008043	GAC	3	9	317638	317646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078284
5524	NC_008043	GTCG	2	8	317803	317810	0 %	25 %	50 %	25 %	99078284
5525	NC_008043	GCCCC	2	10	317819	317828	0 %	0 %	20 %	80 %	99078284
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5527	NC_008043	GGC	2	6	317940	317945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078285
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5529	NC_008043	GAG	2	6	318042	318047	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99078285
5530	NC_008043	CGC	2	6	318059	318064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078285
5531	NC_008043	TGC	2	6	318112	318117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078285
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5540	NC_008043	TGG	2	6	318790	318795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99078285
5541	NC_008043	GCC	2	6	319293	319298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078286
5542	NC_008043	CTT	2	6	319316	319321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99078286
5543	NC_008043	CTCG	2	8	319355	319362	0 %	25 %	25 %	50 %	99078286
5544	NC_008043	ATG	2	6	319370	319375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078286
5545	NC_008043	GA	3	6	319382	319387	50 %	0 %	50 %	0 %	99078286
5546	NC_008043	GGCC	2	8	319417	319424	0 %	0 %	50 %	50 %	99078286
5547	NC_008043	ACC	2	6	319440	319445	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99078286
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5553	NC_008043	GC	3	6	320498	320503	0 %	0 %	50 %	50 %	99078287
5554	NC_008043	GC	3	6	320553	320558	0 %	0 %	50 %	50 %	99078287
5555	NC_008043	GCC	2	6	320576	320581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078287
5556	NC_008043	CG	3	6	320590	320595	0 %	0 %	50 %	50 %	99078287
5557	NC_008043	GCC	2	6	320699	320704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078287
5558	NC_008043	CCCA	2	8	320716	320723	25 %	0 %	0 %	75 %	99078287
5559	NC_008043	ACC	2	6	320787	320792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99078287
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5562	NC_008043	ACC	2	6	320954	320959	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99078287
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5565	NC_008043	GAC	3	9	321095	321103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078287
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5574	NC_008043	GCCT	2	8	321626	321633	0 %	25 %	25 %	50 %	99078288
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5589	NC_008043	CGCT	2	8	322297	322304	0 %	25 %	25 %	50 %	99078289
5590	NC_008043	TCC	3	9	322338	322346	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99078289
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5597	NC_008043	GAA	2	6	322740	322745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99078289
5598	NC_008043	CG	3	6	322748	322753	0 %	0 %	50 %	50 %	99078289
5599	NC_008043	GC	3	6	322762	322767	0 %	0 %	50 %	50 %	99078289
5600	NC_008043	CGG	2	6	322825	322830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078289
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5607	NC_008043	ACT	2	6	323155	323160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078290
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5609	NC_008043	TC	3	6	323234	323239	0 %	50 %	0 %	50 %	99078290
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5612	NC_008043	CG	3	6	323427	323432	0 %	0 %	50 %	50 %	99078290
5613	NC_008043	GC	3	6	323486	323491	0 %	0 %	50 %	50 %	99078290
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5997	NC_008043	GCA	2	6	345160	345165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078310
5998	NC_008043	TACC	2	8	345187	345194	25 %	25 %	0 %	50 %	99078310
5999	NC_008043	GCT	2	6	345238	345243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078310
6000	NC_008043	CAT	2	6	345279	345284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078310

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