MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruegeria sp. TM1040 plasmid unnamed

Total Repeats: 1979

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_008042	ATC	2	6	70395	70400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99077954
1002	NC_008042	TCA	2	6	70474	70479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99077954
1003	NC_008042	GCA	2	6	70496	70501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99077954
1004	NC_008042	TCA	2	6	70576	70581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99077954
1005	NC_008042	ATGG	2	8	70603	70610	25 %	25 %	50 %	0 %	99077955
1006	NC_008042	G	6	6	70624	70629	0 %	0 %	100 %	0 %	99077955
1007	NC_008042	TCA	3	9	70647	70655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99077955
1008	NC_008042	CGG	2	6	70680	70685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99077955
1009	NC_008042	ATG	2	6	70790	70795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99077955
1010	NC_008042	GGGC	2	8	70813	70820	0 %	0 %	75 %	25 %	99077955
1011	NC_008042	CGA	2	6	70873	70878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99077956
1012	NC_008042	TGG	2	6	70879	70884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99077956
1013	NC_008042	GGC	2	6	70886	70891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99077956
1014	NC_008042	GAT	2	6	70940	70945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99077956
1015	NC_008042	CAC	2	6	70994	70999	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99077956
1016	NC_008042	CGA	2	6	71023	71028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99077956
1017	NC_008042	GA	3	6	71055	71060	50 %	0 %	50 %	0 %	99077956
1018	NC_008042	CGA	2	6	71116	71121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99077956
1019	NC_008042	G	6	6	71212	71217	0 %	0 %	100 %	0 %	99077957
1020	NC_008042	TGC	2	6	71220	71225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99077957
1021	NC_008042	GTG	2	6	71230	71235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99077957
1022	NC_008042	GCA	2	6	71295	71300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99077957
1023	NC_008042	GCGG	2	8	71314	71321	0 %	0 %	75 %	25 %	99077957
1024	NC_008042	CG	3	6	71367	71372	0 %	0 %	50 %	50 %	99077957
1025	NC_008042	AG	3	6	71466	71471	50 %	0 %	50 %	0 %	99077957
1026	NC_008042	CG	3	6	71497	71502	0 %	0 %	50 %	50 %	99077957
1027	NC_008042	GGT	2	6	71536	71541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99077957
1028	NC_008042	TCA	2	6	71648	71653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99077957
1029	NC_008042	AG	3	6	71723	71728	50 %	0 %	50 %	0 %	99077957
1030	NC_008042	TGC	2	6	71803	71808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99077958
1031	NC_008042	GTCG	2	8	71816	71823	0 %	25 %	50 %	25 %	99077958
1032	NC_008042	CAGC	2	8	71824	71831	25 %	0 %	25 %	50 %	99077958
1033	NC_008042	TG	3	6	71833	71838	0 %	50 %	50 %	0 %	99077958
1034	NC_008042	CTT	2	6	71851	71856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99077958
1035	NC_008042	GCCAAT	2	12	71882	71893	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	99077958
1036	NC_008042	GC	3	6	72006	72011	0 %	0 %	50 %	50 %	99077958
1037	NC_008042	GTA	2	6	72026	72031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99077958
1038	NC_008042	CTT	2	6	72041	72046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99077958
1039	NC_008042	GTT	2	6	72336	72341	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99077959
1040	NC_008042	CAGGC	2	10	72392	72401	20 %	0 %	40 %	40 %	99077959
1041	NC_008042	GCAA	2	8	72447	72454	50 %	0 %	25 %	25 %	99077959
1042	NC_008042	CAT	2	6	72471	72476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99077959
1043	NC_008042	GCGTGC	2	12	72540	72551	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	99077959
1044	NC_008042	AGTC	2	8	72570	72577	25 %	25 %	25 %	25 %	99077959
1045	NC_008042	CGGT	2	8	72585	72592	0 %	25 %	50 %	25 %	99077959
1046	NC_008042	TGG	2	6	72602	72607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99077959
1047	NC_008042	CGT	2	6	72898	72903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99077960
1048	NC_008042	TCG	2	6	72960	72965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99077960
1049	NC_008042	GCC	2	6	72968	72973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99077960
1050	NC_008042	CA	3	6	72986	72991	50 %	0 %	0 %	50 %	99077960
1051	NC_008042	GAA	2	6	73001	73006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99077960
1052	NC_008042	GGT	2	6	73043	73048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99077960
1053	NC_008042	TGA	2	6	73098	73103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99077960
1054	NC_008042	TGT	2	6	73105	73110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99077960
1055	NC_008042	TGAA	2	8	73162	73169	50 %	25 %	25 %	0 %	99077960
1056	NC_008042	CATCGC	2	12	73184	73195	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	99077961
1057	NC_008042	GTA	2	6	73219	73224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99077961
1058	NC_008042	TTG	2	6	73225	73230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99077961
1059	NC_008042	GGC	2	6	73371	73376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99077961
1060	NC_008042	TCA	2	6	73527	73532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99077962
1061	NC_008042	GC	3	6	73607	73612	0 %	0 %	50 %	50 %	99077962
1062	NC_008042	ACC	2	6	73622	73627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99077962
1063	NC_008042	CGG	2	6	73706	73711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99077962
1064	NC_008042	CG	3	6	73745	73750	0 %	0 %	50 %	50 %	99077962
1065	NC_008042	CCA	2	6	73826	73831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99077963
1066	NC_008042	GA	3	6	73855	73860	50 %	0 %	50 %	0 %	99077963
1067	NC_008042	CAGG	2	8	73923	73930	25 %	0 %	50 %	25 %	99077963
1068	NC_008042	GTT	2	6	73954	73959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99077963
1069	NC_008042	TGA	2	6	74085	74090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99077963
1070	NC_008042	CGC	2	6	74097	74102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99077963
1071	NC_008042	CGGA	2	8	74137	74144	25 %	0 %	50 %	25 %	99077963
1072	NC_008042	TCA	2	6	74151	74156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99077963
1073	NC_008042	CAG	2	6	74226	74231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99077963
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1079	NC_008042	GCC	3	9	74623	74631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99077964
1080	NC_008042	TGA	2	6	74651	74656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99077964
1081	NC_008042	GCA	2	6	74684	74689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99077964
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1088	NC_008042	CGA	2	6	75400	75405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99077964
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1095	NC_008042	TCG	2	6	75962	75967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99077965
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1098	NC_008042	CCG	2	6	76120	76125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99077965
1099	NC_008042	CAGA	2	8	76176	76183	50 %	0 %	25 %	25 %	99077965
1100	NC_008042	GC	3	6	76218	76223	0 %	0 %	50 %	50 %	99077965
1101	NC_008042	GAG	2	6	76279	76284	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99077965
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1104	NC_008042	CATA	2	8	76335	76342	50 %	25 %	0 %	25 %	99077965
1105	NC_008042	TAT	2	6	77038	77043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	99077966
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1107	NC_008042	ACT	2	6	77136	77141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99077966
1108	NC_008042	GTT	2	6	77298	77303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99077966
1109	NC_008042	CATGA	2	10	77446	77455	40 %	20 %	20 %	20 %	99077966
1110	NC_008042	TCA	3	9	77472	77480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99077966
1111	NC_008042	GAA	2	6	77496	77501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99077966
1112	NC_008042	ACA	2	6	77513	77518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99077966
1113	NC_008042	C	6	6	77683	77688	0 %	0 %	0 %	100 %	99077966
1114	NC_008042	AT	3	6	77697	77702	50 %	50 %	0 %	0 %	99077966
1115	NC_008042	GT	3	6	77762	77767	0 %	50 %	50 %	0 %	99077966
1116	NC_008042	CT	3	6	77987	77992	0 %	50 %	0 %	50 %	99077966
1117	NC_008042	GAA	2	6	78034	78039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99077966
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1123	NC_008042	TAC	2	6	78424	78429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99077967
1124	NC_008042	ACA	2	6	78498	78503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99077967
1125	NC_008042	ATCCA	2	10	78666	78675	40 %	20 %	0 %	40 %	99077967
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1127	NC_008042	CTT	2	6	78698	78703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99077967
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