MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris BisB5 chromosome

Total Repeats: 82737

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007958	CAG	2	6	760	765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91974483
2	NC_007958	ACT	2	6	821	826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91974483
3	NC_007958	CTG	2	6	843	848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974483
4	NC_007958	CGC	2	6	946	951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974483
5	NC_007958	CGG	3	9	965	973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91974483
6	NC_007958	GCC	2	6	991	996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974483
7	NC_007958	CGG	2	6	1023	1028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91974483
8	NC_007958	CGC	2	6	1031	1036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974483
9	NC_007958	TCG	3	9	1064	1072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974483
10	NC_007958	CGC	3	9	1095	1103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974483
11	NC_007958	GCC	2	6	1121	1126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974483
12	NC_007958	GCG	2	6	1127	1132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91974483
13	NC_007958	CTG	2	6	1192	1197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974483
14	NC_007958	CCG	2	6	1253	1258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974483
15	NC_007958	TCG	2	6	1277	1282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974483
16	NC_007958	CGA	2	6	1350	1355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91974483
17	NC_007958	ACC	2	6	1378	1383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	91974483
18	NC_007958	GTG	2	6	1438	1443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	91974483
19	NC_007958	CCG	2	6	1456	1461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974483
20	NC_007958	CGA	2	6	1479	1484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91974483
21	NC_007958	CGG	2	6	1506	1511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91974483
22	NC_007958	CAT	2	6	1591	1596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91974483
23	NC_007958	GCT	2	6	1686	1691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974483
24	NC_007958	CGT	2	6	1806	1811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974483
25	NC_007958	TGT	2	6	1844	1849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	91974483
26	NC_007958	GCC	2	6	1940	1945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974483
27	NC_007958	CGG	2	6	1950	1955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91974483
28	NC_007958	CAC	2	6	1965	1970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	91974483
29	NC_007958	TGC	2	6	1973	1978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974483
30	NC_007958	CGA	2	6	2028	2033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91974483
31	NC_007958	ACC	2	6	2527	2532	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	91974484
32	NC_007958	CGC	2	6	2688	2693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974484
33	NC_007958	GAG	2	6	2776	2781	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	91974484
34	NC_007958	TAT	2	6	2788	2793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	91974484
35	NC_007958	CCG	2	6	2897	2902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974484
36	NC_007958	ACG	2	6	2975	2980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91974484
37	NC_007958	CCG	2	6	3002	3007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974484
38	NC_007958	AAC	2	6	3097	3102	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	91974484
39	NC_007958	TGG	2	6	3113	3118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	91974484
40	NC_007958	AAG	2	6	3124	3129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	91974484
41	NC_007958	CGA	2	6	3158	3163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91974484
42	NC_007958	TCC	2	6	3166	3171	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	91974484
43	NC_007958	GCG	3	9	3676	3684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91974485
44	NC_007958	GTG	2	6	3706	3711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	91974485
45	NC_007958	TGG	2	6	3713	3718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	91974485
46	NC_007958	CGA	2	6	3801	3806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91974485
47	NC_007958	CGC	2	6	3912	3917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974485
48	NC_007958	ACG	2	6	3919	3924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91974485
49	NC_007958	ATC	2	6	3977	3982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91974485
50	NC_007958	GCG	2	6	4030	4035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91974485
51	NC_007958	CGG	3	9	4042	4050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91974485
52	NC_007958	GCT	2	6	4137	4142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974485
53	NC_007958	GGA	2	6	4143	4148	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	91974485
54	NC_007958	CCG	2	6	4193	4198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974485
55	NC_007958	CGC	2	6	4248	4253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974485
56	NC_007958	GCC	2	6	4388	4393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974485
57	NC_007958	CGC	3	9	4401	4409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974485
58	NC_007958	GCT	2	6	4509	4514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974485
59	NC_007958	CGC	2	6	4568	4573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974485
60	NC_007958	TGC	3	9	4574	4582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974485
61	NC_007958	CGA	2	6	4584	4589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91974485
62	NC_007958	GGT	2	6	4590	4595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	91974485
63	NC_007958	CGG	2	6	4682	4687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91974485
64	NC_007958	CGC	2	6	4745	4750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974485
65	NC_007958	CGA	2	6	5119	5124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91974486
66	NC_007958	CAC	2	6	5138	5143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	91974486
67	NC_007958	GTC	2	6	5156	5161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974486
68	NC_007958	GTG	2	6	5210	5215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	91974486
69	NC_007958	CGA	2	6	5245	5250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91974486
70	NC_007958	TCA	2	6	5307	5312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91974486
71	NC_007958	CGG	2	6	5329	5334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91974486
72	NC_007958	CGG	2	6	5365	5370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91974486
73	NC_007958	GGT	2	6	5392	5397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	91974486
74	NC_007958	CAT	2	6	5452	5457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91974486
75	NC_007958	GAG	2	6	5675	5680	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	91974486
76	NC_007958	GCG	2	6	5694	5699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91974486
77	NC_007958	CAA	2	6	5728	5733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	91974486
78	NC_007958	TGG	2	6	5804	5809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	91974486
79	NC_007958	CAA	2	6	5845	5850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	91974486
80	NC_007958	CGG	2	6	5866	5871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91974486
81	NC_007958	AAG	2	6	5939	5944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	91974486
82	NC_007958	CGA	2	6	5965	5970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91974486
83	NC_007958	TCG	2	6	6026	6031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974486
84	NC_007958	GGT	2	6	6070	6075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	91974486
85	NC_007958	GCA	2	6	6101	6106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91974486
86	NC_007958	GAG	2	6	6113	6118	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	91974486
87	NC_007958	TCG	2	6	6141	6146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974486
88	NC_007958	GCC	4	12	6161	6172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974486
89	NC_007958	TCG	2	6	6294	6299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974486
90	NC_007958	CCG	2	6	6309	6314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974486
91	NC_007958	TGC	2	6	6357	6362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974486
92	NC_007958	ATC	2	6	6506	6511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91974486
93	NC_007958	TGA	2	6	6513	6518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91974486
94	NC_007958	GCT	3	9	6553	6561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974486
95	NC_007958	TTC	3	9	6566	6574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	91974486
96	NC_007958	GGC	2	6	6599	6604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91974486
97	NC_007958	GCC	2	6	6622	6627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974486
98	NC_007958	CGA	2	6	6712	6717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91974486
99	NC_007958	GCG	2	6	6738	6743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91974486
100	NC_007958	CTG	2	6	6764	6769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974486
101	NC_007958	GGT	2	6	6838	6843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	91974486
102	NC_007958	GGC	2	6	6850	6855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91974486
103	NC_007958	GGC	3	9	6910	6918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91974486
104	NC_007958	CGA	2	6	6949	6954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91974486
105	NC_007958	GCG	2	6	7020	7025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91974486
106	NC_007958	ATC	2	6	7040	7045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91974486
107	NC_007958	GAC	2	6	7046	7051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91974486
108	NC_007958	GCT	2	6	7054	7059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974486
109	NC_007958	CGA	2	6	7084	7089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91974486
110	NC_007958	CGC	2	6	7093	7098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974486
111	NC_007958	TGC	2	6	7131	7136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974486
112	NC_007958	CGA	2	6	7324	7329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91974486
113	NC_007958	CGA	2	6	7333	7338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91974486
114	NC_007958	CGT	2	6	7363	7368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974486
115	NC_007958	CGC	2	6	7376	7381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974486
116	NC_007958	GGA	2	6	7696	7701	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	91974487
117	NC_007958	CAG	2	6	7766	7771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91974487
118	NC_007958	GCG	2	6	7856	7861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91974487
119	NC_007958	GCT	2	6	7924	7929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974487
120	NC_007958	CGA	2	6	7932	7937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91974487
121	NC_007958	CTC	2	6	7994	7999	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	91974487
122	NC_007958	TTC	2	6	8015	8020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	91974487
123	NC_007958	CGC	2	6	8054	8059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974487
124	NC_007958	CGT	2	6	8068	8073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974487
125	NC_007958	TTC	2	6	8099	8104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	91974487
126	NC_007958	ACG	2	6	8113	8118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91974487
127	NC_007958	TTC	2	6	8126	8131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	91974487
128	NC_007958	GGT	2	6	8217	8222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	91974487
129	NC_007958	CAG	2	6	8226	8231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91974487
130	NC_007958	TCC	2	6	8253	8258	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	91974487
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132	NC_007958	CGC	3	9	8396	8404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974487
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