MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris BisB5 chromosome

Total Repeats: 114045

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_007958	AGC	2	6	217730	217735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91974674
5002	NC_007958	TCG	2	6	218019	218024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974675
5003	NC_007958	CGC	3	9	218027	218035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974675
5004	NC_007958	CCG	2	6	218038	218043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974675
5005	NC_007958	TGG	2	6	218076	218081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	91974675
5006	NC_007958	TCG	2	6	218085	218090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974675
5007	NC_007958	GTG	2	6	218093	218098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	91974675
5008	NC_007958	CGCC	2	8	218118	218125	0 %	0 %	25 %	75 %	91974675
5009	NC_007958	GGGC	2	8	218131	218138	0 %	0 %	75 %	25 %	91974675
5010	NC_007958	CG	3	6	218158	218163	0 %	0 %	50 %	50 %	91974675
5011	NC_007958	GCA	2	6	218187	218192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91974675
5012	NC_007958	CGC	2	6	218239	218244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974675
5013	NC_007958	CAC	2	6	218275	218280	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	91974675
5014	NC_007958	GAA	2	6	218291	218296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	91974675
5015	NC_007958	AAG	2	6	218327	218332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	91974675
5016	NC_007958	TGG	2	6	218337	218342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	91974675
5017	NC_007958	GGC	2	6	218359	218364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91974675
5018	NC_007958	GGC	2	6	218369	218374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91974675
5019	NC_007958	CAT	2	6	218401	218406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91974675
5020	NC_007958	CAG	2	6	218411	218416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91974675
5021	NC_007958	TGA	2	6	218472	218477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91974675
5022	NC_007958	TCG	2	6	218510	218515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974675
5023	NC_007958	GC	4	8	218561	218568	0 %	0 %	50 %	50 %	91974675
5024	NC_007958	GCA	2	6	218631	218636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91974675
5025	NC_007958	CGA	2	6	218713	218718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91974675
5026	NC_007958	CGA	2	6	218725	218730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91974675
5027	NC_007958	GTGGC	2	10	218741	218750	0 %	20 %	60 %	20 %	91974675
5028	NC_007958	GAA	2	6	218761	218766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	91974675
5029	NC_007958	GGC	2	6	218839	218844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91974675
5030	NC_007958	CG	3	6	218881	218886	0 %	0 %	50 %	50 %	91974675
5031	NC_007958	GTCG	2	8	218914	218921	0 %	25 %	50 %	25 %	91974675
5032	NC_007958	GGC	2	6	218963	218968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91974675
5033	NC_007958	GAT	2	6	219123	219128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91974676
5034	NC_007958	CGA	2	6	219213	219218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91974676
5035	NC_007958	CG	4	8	219294	219301	0 %	0 %	50 %	50 %	91974676
5036	NC_007958	GC	3	6	219323	219328	0 %	0 %	50 %	50 %	91974676
5037	NC_007958	GACGC	2	10	219428	219437	20 %	0 %	40 %	40 %	91974676
5038	NC_007958	GCGA	2	8	219454	219461	25 %	0 %	50 %	25 %	91974677
5039	NC_007958	GATT	2	8	219509	219516	25 %	50 %	25 %	0 %	91974677
5040	NC_007958	ATC	2	6	219622	219627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91974677
5041	NC_007958	CGG	2	6	219654	219659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91974677
5042	NC_007958	CG	3	6	219694	219699	0 %	0 %	50 %	50 %	91974677
5043	NC_007958	CGG	2	6	219703	219708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91974677
5044	NC_007958	GC	3	6	219753	219758	0 %	0 %	50 %	50 %	91974677
5045	NC_007958	CGT	2	6	219762	219767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974677
5046	NC_007958	CGGC	2	8	219818	219825	0 %	0 %	50 %	50 %	91974677
5047	NC_007958	GCG	2	6	219844	219849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91974677
5048	NC_007958	CGT	3	9	219916	219924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974678
5049	NC_007958	GCG	2	6	219962	219967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91974678
5050	NC_007958	CGC	2	6	220014	220019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974678
5051	NC_007958	CG	3	6	220070	220075	0 %	0 %	50 %	50 %	91974678
5052	NC_007958	TCG	2	6	220125	220130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974678
5053	NC_007958	ATTGCA	2	12	220150	220161	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	91974678
5054	NC_007958	CG	3	6	220187	220192	0 %	0 %	50 %	50 %	91974678
5055	NC_007958	TGA	2	6	220218	220223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91974678
5056	NC_007958	TGC	2	6	220260	220265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974678
5057	NC_007958	CCG	2	6	220281	220286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974678
5058	NC_007958	CG	3	6	220303	220308	0 %	0 %	50 %	50 %	91974678
5059	NC_007958	CCG	2	6	220310	220315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974678
5060	NC_007958	CCCG	2	8	220326	220333	0 %	0 %	25 %	75 %	91974678
5061	NC_007958	GGC	2	6	220334	220339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91974678
5062	NC_007958	GCT	2	6	220363	220368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974678
5063	NC_007958	CGG	2	6	220405	220410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91974678
5064	NC_007958	CGG	2	6	220456	220461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91974678
5065	NC_007958	GTC	2	6	220471	220476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974678
5066	NC_007958	CCGCG	2	10	220531	220540	0 %	0 %	40 %	60 %	91974678
5067	NC_007958	CG	4	8	220537	220544	0 %	0 %	50 %	50 %	91974678
5068	NC_007958	TGA	2	6	220557	220562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91974678
5069	NC_007958	CGA	2	6	220607	220612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91974679
5070	NC_007958	CGG	2	6	220634	220639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91974679
5071	NC_007958	TCG	2	6	220645	220650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974679
5072	NC_007958	CGGC	2	8	220757	220764	0 %	0 %	50 %	50 %	91974679
5073	NC_007958	CGC	2	6	220768	220773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974679
5074	NC_007958	CGG	2	6	220805	220810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91974679
5075	NC_007958	AAC	2	6	220866	220871	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	91974679
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5077	NC_007958	ATC	2	6	220917	220922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91974679
5078	NC_007958	CGCCAC	2	12	220952	220963	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	91974679
5079	NC_007958	GCA	2	6	221024	221029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91974679
5080	NC_007958	TGC	2	6	221038	221043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974679
5081	NC_007958	GAT	2	6	221195	221200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91974679
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5083	NC_007958	AGG	2	6	221230	221235	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	91974679
5084	NC_007958	CGG	3	9	221294	221302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91974679
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5086	NC_007958	CGT	2	6	221348	221353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974679
5087	NC_007958	GCG	2	6	221400	221405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91974679
5088	NC_007958	CGG	2	6	221414	221419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91974679
5089	NC_007958	TGC	2	6	221431	221436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974679
5090	NC_007958	CTG	2	6	221454	221459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974679
5091	NC_007958	CCG	2	6	221500	221505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974679
5092	NC_007958	TGC	2	6	221613	221618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974679
5093	NC_007958	CAT	2	6	221630	221635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91974679
5094	NC_007958	TGA	2	6	221781	221786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91974679
5095	NC_007958	GAA	2	6	221818	221823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	91974680
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5097	NC_007958	GAC	3	9	222056	222064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91974680
5098	NC_007958	TAC	2	6	222089	222094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91974680
5099	NC_007958	GGC	2	6	222142	222147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91974680
5100	NC_007958	ATC	2	6	222164	222169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91974680
5101	NC_007958	GCC	2	6	222178	222183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974680
5102	NC_007958	GGA	3	9	222184	222192	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	91974680
5103	NC_007958	TGCC	2	8	222203	222210	0 %	25 %	25 %	50 %	91974680
5104	NC_007958	ACC	2	6	222254	222259	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	91974680
5105	NC_007958	CGGCT	2	10	222334	222343	0 %	20 %	40 %	40 %	91974680
5106	NC_007958	CGG	2	6	222345	222350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91974680
5107	NC_007958	GCG	2	6	222440	222445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91974680
5108	NC_007958	CGC	2	6	222454	222459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974680
5109	NC_007958	GTC	2	6	222476	222481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974680
5110	NC_007958	CCA	2	6	222534	222539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	91974680
5111	NC_007958	GGC	2	6	222580	222585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91974680
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5118	NC_007958	GCTC	2	8	223124	223131	0 %	25 %	25 %	50 %	91974681
5119	NC_007958	GGC	2	6	223137	223142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91974681
5120	NC_007958	ATC	2	6	223153	223158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91974681
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5122	NC_007958	CGG	2	6	223215	223220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91974681
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5491	NC_007958	GC	3	6	236762	236767	0 %	0 %	50 %	50 %	91974689
5492	NC_007958	TCG	2	6	236789	236794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974689
5493	NC_007958	GAC	2	6	236894	236899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91974689
5494	NC_007958	GCG	2	6	236914	236919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91974689
5495	NC_007958	TCGC	2	8	236966	236973	0 %	25 %	25 %	50 %	91974689
5496	NC_007958	GCC	2	6	236995	237000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974689
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5498	NC_007958	GCG	2	6	237031	237036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91974689
5499	NC_007958	CGC	2	6	237039	237044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974689
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