MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris BisB18 chromosome

Total Repeats: 127017

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_007925	ACG	2	6	158306	158311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90421666
3502	NC_007925	TCG	2	6	158314	158319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90421666
3503	NC_007925	AAG	2	6	158383	158388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	90421666
3504	NC_007925	TGA	2	6	158390	158395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	90421666
3505	NC_007925	TTC	2	6	158403	158408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	90421666
3506	NC_007925	CCT	2	6	158568	158573	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	90421666
3507	NC_007925	TGA	2	6	158678	158683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	90421666
3508	NC_007925	GAA	2	6	158713	158718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	90421666
3509	NC_007925	GC	3	6	158727	158732	0 %	0 %	50 %	50 %	90421666
3510	NC_007925	TCA	2	6	158741	158746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	90421666
3511	NC_007925	AAC	2	6	158800	158805	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	90421666
3512	NC_007925	GGC	2	6	158806	158811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90421666
3513	NC_007925	CGG	2	6	158877	158882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90421666
3514	NC_007925	CGC	2	6	158909	158914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90421666
3515	NC_007925	CG	4	8	158938	158945	0 %	0 %	50 %	50 %	90421666
3516	NC_007925	CTT	2	6	158982	158987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	90421666
3517	NC_007925	TTCG	2	8	159060	159067	0 %	50 %	25 %	25 %	90421666
3518	NC_007925	CGA	2	6	159093	159098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90421666
3519	NC_007925	GTTC	2	8	159166	159173	0 %	50 %	25 %	25 %	90421666
3520	NC_007925	GC	3	6	159202	159207	0 %	0 %	50 %	50 %	90421667
3521	NC_007925	CGA	2	6	159259	159264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90421667
3522	NC_007925	GCC	2	6	159281	159286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90421667
3523	NC_007925	CG	3	6	159334	159339	0 %	0 %	50 %	50 %	90421667
3524	NC_007925	AGGTGT	2	12	159376	159387	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	90421667
3525	NC_007925	CGA	2	6	159406	159411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90421667
3526	NC_007925	GCC	2	6	159500	159505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90421667
3527	NC_007925	GGT	2	6	159638	159643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	90421667
3528	NC_007925	CAAA	2	8	159667	159674	75 %	0 %	0 %	25 %	90421667
3529	NC_007925	CTTC	2	8	159733	159740	0 %	50 %	0 %	50 %	90421667
3530	NC_007925	GCC	2	6	159799	159804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90421668
3531	NC_007925	ATG	2	6	159814	159819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	90421668
3532	NC_007925	ATT	2	6	159828	159833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	90421668
3533	NC_007925	CGA	2	6	159857	159862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90421668
3534	NC_007925	GCT	2	6	159875	159880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90421668
3535	NC_007925	AAT	2	6	159918	159923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	90421668
3536	NC_007925	GC	3	6	159928	159933	0 %	0 %	50 %	50 %	90421668
3537	NC_007925	TGAT	2	8	159970	159977	25 %	50 %	25 %	0 %	90421668
3538	NC_007925	CGC	2	6	160052	160057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90421668
3539	NC_007925	AAC	2	6	160116	160121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	90421668
3540	NC_007925	TTG	2	6	160135	160140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	90421668
3541	NC_007925	GT	3	6	160192	160197	0 %	50 %	50 %	0 %	90421668
3542	NC_007925	GC	3	6	160238	160243	0 %	0 %	50 %	50 %	90421668
3543	NC_007925	TAG	2	6	160265	160270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	90421668
3544	NC_007925	GTA	2	6	160272	160277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	90421668
3545	NC_007925	TGC	2	6	160280	160285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90421668
3546	NC_007925	TCA	2	6	160333	160338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	90421668
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3548	NC_007925	TCG	2	6	160459	160464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90421668
3549	NC_007925	CGC	2	6	160479	160484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90421668
3550	NC_007925	CCA	2	6	160490	160495	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	90421668
3551	NC_007925	CTT	2	6	160518	160523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	90421668
3552	NC_007925	CCG	2	6	160525	160530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90421668
3553	NC_007925	CGT	2	6	160579	160584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90421668
3554	NC_007925	GCAA	2	8	160635	160642	50 %	0 %	25 %	25 %	90421669
3555	NC_007925	CTGCT	2	10	160704	160713	0 %	40 %	20 %	40 %	90421669
3556	NC_007925	GA	3	6	160791	160796	50 %	0 %	50 %	0 %	90421669
3557	NC_007925	TCTTG	2	10	160839	160848	0 %	60 %	20 %	20 %	90421669
3558	NC_007925	TCT	2	6	160849	160854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	90421669
3559	NC_007925	ATG	2	6	160920	160925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	90421669
3560	NC_007925	CGC	2	6	161095	161100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90421669
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3562	NC_007925	GAAC	2	8	161375	161382	50 %	0 %	25 %	25 %	90421670
3563	NC_007925	GTT	2	6	161406	161411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	90421670
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3565	NC_007925	TCG	2	6	161501	161506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90421670
3566	NC_007925	GGA	2	6	161545	161550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	90421670
3567	NC_007925	TTCGAG	2	12	161619	161630	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	90421670
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3569	NC_007925	TGA	2	6	161702	161707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	90421670
3570	NC_007925	CGTC	2	8	161733	161740	0 %	25 %	25 %	50 %	90421670
3571	NC_007925	TCCT	2	8	161919	161926	0 %	50 %	0 %	50 %	90421670
3572	NC_007925	CGC	2	6	161951	161956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90421670
3573	NC_007925	CAG	3	9	161981	161989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90421670
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3579	NC_007925	GAT	2	6	162874	162879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	90421671
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3581	NC_007925	GAC	2	6	162919	162924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90421671
3582	NC_007925	CCG	2	6	162929	162934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90421671
3583	NC_007925	GCG	2	6	162961	162966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90421671
3584	NC_007925	CG	3	6	162979	162984	0 %	0 %	50 %	50 %	90421671
3585	NC_007925	TGC	2	6	163003	163008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90421672
3586	NC_007925	TTG	2	6	163009	163014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	90421672
3587	NC_007925	CCGT	2	8	163047	163054	0 %	25 %	25 %	50 %	90421672
3588	NC_007925	CCTC	2	8	163126	163133	0 %	25 %	0 %	75 %	90421672
3589	NC_007925	TCAG	2	8	163152	163159	25 %	25 %	25 %	25 %	90421672
3590	NC_007925	TCG	2	6	163182	163187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90421672
3591	NC_007925	TGC	2	6	163233	163238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90421672
3592	NC_007925	CAT	2	6	163313	163318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	90421672
3593	NC_007925	T	6	6	163417	163422	0 %	100 %	0 %	0 %	90421673
3594	NC_007925	GAGG	2	8	163424	163431	25 %	0 %	75 %	0 %	90421673
3595	NC_007925	GC	3	6	163432	163437	0 %	0 %	50 %	50 %	90421673
3596	NC_007925	CGT	2	6	163443	163448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90421673
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3598	NC_007925	ATC	2	6	163497	163502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	90421673
3599	NC_007925	GCC	2	6	163553	163558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90421673
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3601	NC_007925	GCG	2	6	163623	163628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90421673
3602	NC_007925	TGC	2	6	163647	163652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90421673
3603	NC_007925	CGG	2	6	163665	163670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90421673
3604	NC_007925	CG	3	6	163764	163769	0 %	0 %	50 %	50 %	90421673
3605	NC_007925	CGCAAG	2	12	163776	163787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90421673
3606	NC_007925	TCG	2	6	163824	163829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90421673
3607	NC_007925	TCAACG	2	12	163926	163937	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	90421673
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3609	NC_007925	CGAAGG	2	12	164140	164151	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	90421673
3610	NC_007925	GCC	2	6	164159	164164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90421673
3611	NC_007925	CG	3	6	164168	164173	0 %	0 %	50 %	50 %	90421673
3612	NC_007925	CG	4	8	164191	164198	0 %	0 %	50 %	50 %	90421673
3613	NC_007925	ATT	2	6	164213	164218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	90421673
3614	NC_007925	CGC	2	6	164271	164276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90421673
3615	NC_007925	GCGCG	2	10	164347	164356	0 %	0 %	60 %	40 %	90421673
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3619	NC_007925	CGTG	2	8	164512	164519	0 %	25 %	50 %	25 %	90421673
3620	NC_007925	GC	3	6	164525	164530	0 %	0 %	50 %	50 %	90421673
3621	NC_007925	TGTCC	2	10	164536	164545	0 %	40 %	20 %	40 %	90421673
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3623	NC_007925	GGC	2	6	164662	164667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90421673
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3993	NC_007925	CG	3	6	181341	181346	0 %	0 %	50 %	50 %	90421690
3994	NC_007925	CGA	2	6	181431	181436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90421690
3995	NC_007925	TGG	2	6	181445	181450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	90421690
3996	NC_007925	CGG	2	6	181551	181556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90421690
3997	NC_007925	GGT	2	6	181596	181601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	90421690
3998	NC_007925	CGA	2	6	181611	181616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90421690
3999	NC_007925	CAT	2	6	181653	181658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	90421690
4000	NC_007925	CGA	3	9	181668	181676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90421690

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