MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Rhodoferax ferrireducens T118 plasmid1

Total Repeats: 494

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007901	CGCA	2	8	475	482	25 %	0 %	25 %	50 %	89885733
2	NC_007901	CCAT	2	8	683	690	25 %	25 %	0 %	50 %	89885733
3	NC_007901	GATA	2	8	728	735	50 %	25 %	25 %	0 %	89885733
4	NC_007901	GAAC	2	8	1910	1917	50 %	0 %	25 %	25 %	89885734
5	NC_007901	GCAA	2	8	2179	2186	50 %	0 %	25 %	25 %	89885734
6	NC_007901	AACG	2	8	2576	2583	50 %	0 %	25 %	25 %	89885734
7	NC_007901	GGCA	2	8	3432	3439	25 %	0 %	50 %	25 %	89885735
8	NC_007901	TTCT	2	8	3943	3950	0 %	75 %	0 %	25 %	89885736
9	NC_007901	ACGA	2	8	4136	4143	50 %	0 %	25 %	25 %	89885736
10	NC_007901	CTGT	2	8	4379	4386	0 %	50 %	25 %	25 %	89885736
11	NC_007901	ACGA	2	8	4607	4614	50 %	0 %	25 %	25 %	89885736
12	NC_007901	AGCG	2	8	5639	5646	25 %	0 %	50 %	25 %	89885738
13	NC_007901	TGGC	2	8	5742	5749	0 %	25 %	50 %	25 %	89885738
14	NC_007901	TTGT	2	8	6447	6454	0 %	75 %	25 %	0 %	89885738
15	NC_007901	TGAT	2	8	7190	7197	25 %	50 %	25 %	0 %	89885739
16	NC_007901	ACTG	2	8	8413	8420	25 %	25 %	25 %	25 %	89885740
17	NC_007901	ATGA	2	8	9183	9190	50 %	25 %	25 %	0 %	89885741
18	NC_007901	GGTC	2	8	9324	9331	0 %	25 %	50 %	25 %	89885741
19	NC_007901	CCGG	2	8	9924	9931	0 %	0 %	50 %	50 %	89885742
20	NC_007901	AATT	2	8	11191	11198	50 %	50 %	0 %	0 %	89885742
21	NC_007901	AACC	2	8	11555	11562	50 %	0 %	0 %	50 %	89885742
22	NC_007901	ATAC	2	8	11685	11692	50 %	25 %	0 %	25 %	89885742
23	NC_007901	AACG	2	8	11809	11816	50 %	0 %	25 %	25 %	89885742
24	NC_007901	ACAG	2	8	11853	11860	50 %	0 %	25 %	25 %	89885742
25	NC_007901	ATTG	2	8	12012	12019	25 %	50 %	25 %	0 %	89885743
26	NC_007901	TGAC	2	8	12128	12135	25 %	25 %	25 %	25 %	89885743
27	NC_007901	ACCA	2	8	12218	12225	50 %	0 %	0 %	50 %	89885743
28	NC_007901	GGCT	2	8	12501	12508	0 %	25 %	50 %	25 %	89885744
29	NC_007901	GACG	2	8	12574	12581	25 %	0 %	50 %	25 %	89885744
30	NC_007901	TGAG	2	8	12612	12619	25 %	25 %	50 %	0 %	89885744
31	NC_007901	TTTG	2	8	12681	12688	0 %	75 %	25 %	0 %	89885744
32	NC_007901	CTTT	2	8	12788	12795	0 %	75 %	0 %	25 %	89885744
33	NC_007901	TCCA	2	8	14579	14586	25 %	25 %	0 %	50 %	89885745
34	NC_007901	CATT	2	8	15609	15616	25 %	50 %	0 %	25 %	89885746
35	NC_007901	CAGG	2	8	15966	15973	25 %	0 %	50 %	25 %	89885747
36	NC_007901	TTTC	2	8	16029	16036	0 %	75 %	0 %	25 %	89885747
37	NC_007901	TCAA	2	8	16184	16191	50 %	25 %	0 %	25 %	89885747
38	NC_007901	TCGT	2	8	16525	16532	0 %	50 %	25 %	25 %	89885747
39	NC_007901	AAAG	2	8	16689	16696	75 %	0 %	25 %	0 %	89885747
40	NC_007901	GTCT	2	8	17923	17930	0 %	50 %	25 %	25 %	89885747
41	NC_007901	ACAA	2	8	18788	18795	75 %	0 %	0 %	25 %	89885749
42	NC_007901	TCAA	2	8	18938	18945	50 %	25 %	0 %	25 %	89885750
43	NC_007901	GCCG	2	8	18960	18967	0 %	0 %	50 %	50 %	89885750
44	NC_007901	CGTT	2	8	19254	19261	0 %	50 %	25 %	25 %	89885750
45	NC_007901	AGAA	2	8	19429	19436	75 %	0 %	25 %	0 %	89885750
46	NC_007901	ATCT	2	8	19843	19850	25 %	50 %	0 %	25 %	89885750
47	NC_007901	TCTT	2	8	20122	20129	0 %	75 %	0 %	25 %	89885751
48	NC_007901	TCCA	2	8	20148	20155	25 %	25 %	0 %	50 %	89885751
49	NC_007901	CAAA	2	8	20165	20172	75 %	0 %	0 %	25 %	89885751
50	NC_007901	ACCA	2	8	20188	20195	50 %	0 %	0 %	50 %	89885751
51	NC_007901	CGAT	2	8	21034	21041	25 %	25 %	25 %	25 %	89885752
52	NC_007901	GACC	2	8	21174	21181	25 %	0 %	25 %	50 %	89885752
53	NC_007901	GTAA	2	8	21567	21574	50 %	25 %	25 %	0 %	89885753
54	NC_007901	CGGC	2	8	22417	22424	0 %	0 %	50 %	50 %	89885753
55	NC_007901	CGAC	2	8	23617	23624	25 %	0 %	25 %	50 %	89885754
56	NC_007901	CAGA	2	8	24310	24317	50 %	0 %	25 %	25 %	89885754
57	NC_007901	CGAA	2	8	24629	24636	50 %	0 %	25 %	25 %	89885754
58	NC_007901	CCCG	2	8	25367	25374	0 %	0 %	25 %	75 %	89885755
59	NC_007901	TGGG	2	8	25713	25720	0 %	25 %	75 %	0 %	89885756
60	NC_007901	CTCG	2	8	25721	25728	0 %	25 %	25 %	50 %	89885756
61	NC_007901	TCAG	2	8	25744	25751	25 %	25 %	25 %	25 %	89885756
62	NC_007901	CGAC	2	8	26502	26509	25 %	0 %	25 %	50 %	89885757
63	NC_007901	GCTT	2	8	27242	27249	0 %	50 %	25 %	25 %	89885758
64	NC_007901	CGCT	2	8	28076	28083	0 %	25 %	25 %	50 %	89885758
65	NC_007901	TTGC	2	8	28644	28651	0 %	50 %	25 %	25 %	89885759
66	NC_007901	CCGT	2	8	30069	30076	0 %	25 %	25 %	50 %	89885760
67	NC_007901	ATGA	2	8	30499	30506	50 %	25 %	25 %	0 %	89885760
68	NC_007901	TGCG	2	8	30570	30577	0 %	25 %	50 %	25 %	89885760
69	NC_007901	CCTT	2	8	31174	31181	0 %	50 %	0 %	50 %	89885761
70	NC_007901	ATCA	2	8	31849	31856	50 %	25 %	0 %	25 %	89885761
71	NC_007901	GTTT	2	8	32001	32008	0 %	75 %	25 %	0 %	89885761
72	NC_007901	GCCG	2	8	33315	33322	0 %	0 %	50 %	50 %	89885763
73	NC_007901	TCAA	2	8	34095	34102	50 %	25 %	0 %	25 %	89885763
74	NC_007901	TGTT	2	8	34166	34173	0 %	75 %	25 %	0 %	89885764
75	NC_007901	ACCC	2	8	35594	35601	25 %	0 %	0 %	75 %	89885765
76	NC_007901	TTCG	2	8	37902	37909	0 %	50 %	25 %	25 %	89885767
77	NC_007901	CAGG	2	8	38074	38081	25 %	0 %	50 %	25 %	89885767
78	NC_007901	CACG	2	8	38887	38894	25 %	0 %	25 %	50 %	89885768
79	NC_007901	TTTC	2	8	40118	40125	0 %	75 %	0 %	25 %	89885768
80	NC_007901	GACT	2	8	40242	40249	25 %	25 %	25 %	25 %	89885769
81	NC_007901	GCCT	2	8	40321	40328	0 %	25 %	25 %	50 %	89885769
82	NC_007901	CGTC	2	8	40526	40533	0 %	25 %	25 %	50 %	89885769
83	NC_007901	GATG	2	8	40600	40607	25 %	25 %	50 %	0 %	89885769
84	NC_007901	CTGG	2	8	40792	40799	0 %	25 %	50 %	25 %	89885769
85	NC_007901	GCCA	2	8	40886	40893	25 %	0 %	25 %	50 %	89885769
86	NC_007901	CCCA	2	8	41233	41240	25 %	0 %	0 %	75 %	89885770
87	NC_007901	AGTA	2	8	41928	41935	50 %	25 %	25 %	0 %	89885771
88	NC_007901	CATC	2	8	41953	41960	25 %	25 %	0 %	50 %	89885771
89	NC_007901	GTCC	2	8	42115	42122	0 %	25 %	25 %	50 %	89885771
90	NC_007901	TTCA	2	8	42874	42881	25 %	50 %	0 %	25 %	89885772
91	NC_007901	TTTG	2	8	44993	45000	0 %	75 %	25 %	0 %	89885773
92	NC_007901	TAGT	2	8	45193	45200	25 %	50 %	25 %	0 %	89885773
93	NC_007901	AAAG	2	8	45564	45571	75 %	0 %	25 %	0 %	89885773
94	NC_007901	GATG	2	8	45874	45881	25 %	25 %	50 %	0 %	89885774
95	NC_007901	TGCG	2	8	47316	47323	0 %	25 %	50 %	25 %	89885775
96	NC_007901	GGTG	2	8	47653	47660	0 %	25 %	75 %	0 %	89885775
97	NC_007901	TGCC	2	8	48507	48514	0 %	25 %	25 %	50 %	89885776
98	NC_007901	TCAA	2	8	49527	49534	50 %	25 %	0 %	25 %	89885777
99	NC_007901	CCGT	2	8	50651	50658	0 %	25 %	25 %	50 %	89885778
100	NC_007901	TCGA	2	8	51175	51182	25 %	25 %	25 %	25 %	89885778
101	NC_007901	AGAA	2	8	51254	51261	75 %	0 %	25 %	0 %	89885778
102	NC_007901	CGGT	2	8	51346	51353	0 %	25 %	50 %	25 %	89885778
103	NC_007901	GTCG	2	8	51775	51782	0 %	25 %	50 %	25 %	89885778
104	NC_007901	CGGC	2	8	52287	52294	0 %	0 %	50 %	50 %	89885778
105	NC_007901	TACA	2	8	53653	53660	50 %	25 %	0 %	25 %	89885780
106	NC_007901	ACAA	2	8	53912	53919	75 %	0 %	0 %	25 %	89885780
107	NC_007901	GAAC	2	8	57234	57241	50 %	0 %	25 %	25 %	89885781
108	NC_007901	TGAA	2	8	57564	57571	50 %	25 %	25 %	0 %	89885781
109	NC_007901	CCTG	2	8	57850	57857	0 %	25 %	25 %	50 %	89885781
110	NC_007901	CTCG	2	8	58246	58253	0 %	25 %	25 %	50 %	89885781
111	NC_007901	CTTG	2	8	59103	59110	0 %	50 %	25 %	25 %	89885781
112	NC_007901	GGAC	2	8	60609	60616	25 %	0 %	50 %	25 %	89885781
113	NC_007901	ATTG	2	8	61548	61555	25 %	50 %	25 %	0 %	89885781
114	NC_007901	AAGG	2	8	62923	62930	50 %	0 %	50 %	0 %	89885782
115	NC_007901	AGCA	3	12	64427	64438	50 %	0 %	25 %	25 %	89885784
116	NC_007901	CTTG	2	8	64577	64584	0 %	50 %	25 %	25 %	89885784
117	NC_007901	CATG	2	8	64628	64635	25 %	25 %	25 %	25 %	89885784
118	NC_007901	AAGG	2	8	64953	64960	50 %	0 %	50 %	0 %	89885784
119	NC_007901	TCCA	2	8	65421	65428	25 %	25 %	0 %	50 %	89885784
120	NC_007901	AATA	2	8	65924	65931	75 %	25 %	0 %	0 %	89885785
121	NC_007901	CCAC	2	8	66097	66104	25 %	0 %	0 %	75 %	89885785
122	NC_007901	AACC	2	8	66885	66892	50 %	0 %	0 %	50 %	89885786
123	NC_007901	TCGA	2	8	67136	67143	25 %	25 %	25 %	25 %	89885787
124	NC_007901	TGAG	2	8	67299	67306	25 %	25 %	50 %	0 %	89885787
125	NC_007901	ATCG	2	8	67777	67784	25 %	25 %	25 %	25 %	89885788
126	NC_007901	AGCA	2	8	67859	67866	50 %	0 %	25 %	25 %	89885788
127	NC_007901	ATCT	2	8	68240	68247	25 %	50 %	0 %	25 %	89885789
128	NC_007901	GCTG	2	8	68359	68366	0 %	25 %	50 %	25 %	89885789
129	NC_007901	CAAT	2	8	68544	68551	50 %	25 %	0 %	25 %	89885789
130	NC_007901	TTGA	2	8	69464	69471	25 %	50 %	25 %	0 %	89885791
131	NC_007901	TGCC	2	8	69748	69755	0 %	25 %	25 %	50 %	89885791
132	NC_007901	GCCT	2	8	70552	70559	0 %	25 %	25 %	50 %	89885792
133	NC_007901	GGCC	2	8	70566	70573	0 %	0 %	50 %	50 %	89885792
134	NC_007901	CCTT	2	8	70703	70710	0 %	50 %	0 %	50 %	89885792
135	NC_007901	TGAC	2	8	71390	71397	25 %	25 %	25 %	25 %	89885793
136	NC_007901	TCGT	2	8	71405	71412	0 %	50 %	25 %	25 %	89885793
137	NC_007901	CAAC	2	8	72186	72193	50 %	0 %	0 %	50 %	89885793
138	NC_007901	CCGA	2	8	72904	72911	25 %	0 %	25 %	50 %	89885793
139	NC_007901	TGCG	2	8	73148	73155	0 %	25 %	50 %	25 %	89885793
140	NC_007901	TCTA	2	8	73457	73464	25 %	50 %	0 %	25 %	89885794
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142	NC_007901	CACG	2	8	76853	76860	25 %	0 %	25 %	50 %	89885798
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