MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodoferax ferrireducens T118 plasmid1

Total Repeats: 3819

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_007901	TCT	2	6	28500	28505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89885759
502	NC_007901	GCT	2	6	28535	28540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89885759
503	NC_007901	ACC	2	6	28585	28590	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89885759
504	NC_007901	TTGC	2	8	28644	28651	0 %	50 %	25 %	25 %	89885759
505	NC_007901	TC	3	6	29084	29089	0 %	50 %	0 %	50 %	89885760
506	NC_007901	GAT	2	6	29095	29100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89885760
507	NC_007901	AC	3	6	29167	29172	50 %	0 %	0 %	50 %	89885760
508	NC_007901	CAATGC	2	12	29173	29184	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	89885760
509	NC_007901	CAC	2	6	29267	29272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89885760
510	NC_007901	C	7	7	29345	29351	0 %	0 %	0 %	100 %	89885760
511	NC_007901	AGGCA	2	10	29379	29388	40 %	0 %	40 %	20 %	89885760
512	NC_007901	CAT	2	6	29473	29478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89885760
513	NC_007901	AAG	2	6	29493	29498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89885760
514	NC_007901	GA	3	6	29538	29543	50 %	0 %	50 %	0 %	89885760
515	NC_007901	CAG	2	6	29552	29557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89885760
516	NC_007901	CAT	2	6	29726	29731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89885760
517	NC_007901	C	6	6	29765	29770	0 %	0 %	0 %	100 %	89885760
518	NC_007901	CTG	2	6	29805	29810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89885760
519	NC_007901	GCC	2	6	29921	29926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89885760
520	NC_007901	TTC	2	6	29948	29953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89885760
521	NC_007901	TCA	2	6	30039	30044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89885760
522	NC_007901	CCGT	2	8	30069	30076	0 %	25 %	25 %	50 %	89885760
523	NC_007901	GCCCT	2	10	30125	30134	0 %	20 %	20 %	60 %	89885760
524	NC_007901	CAG	2	6	30157	30162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89885760
525	NC_007901	C	6	6	30174	30179	0 %	0 %	0 %	100 %	89885760
526	NC_007901	GCT	2	6	30184	30189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89885760
527	NC_007901	GGTCC	2	10	30190	30199	0 %	20 %	40 %	40 %	89885760
528	NC_007901	TTG	2	6	30201	30206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	89885760
529	NC_007901	CCA	2	6	30259	30264	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89885760
530	NC_007901	GCA	2	6	30268	30273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89885760
531	NC_007901	CGG	2	6	30298	30303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89885760
532	NC_007901	CAG	2	6	30341	30346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89885760
533	NC_007901	TGATC	2	10	30349	30358	20 %	40 %	20 %	20 %	89885760
534	NC_007901	TG	3	6	30360	30365	0 %	50 %	50 %	0 %	89885760
535	NC_007901	GGC	2	6	30386	30391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89885760
536	NC_007901	GAA	2	6	30446	30451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89885760
537	NC_007901	CCT	2	6	30490	30495	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	89885760
538	NC_007901	ATGA	2	8	30499	30506	50 %	25 %	25 %	0 %	89885760
539	NC_007901	CGT	2	6	30508	30513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89885760
540	NC_007901	ACA	2	6	30514	30519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	89885760
541	NC_007901	CG	3	6	30546	30551	0 %	0 %	50 %	50 %	89885760
542	NC_007901	TGCG	2	8	30570	30577	0 %	25 %	50 %	25 %	89885760
543	NC_007901	TCC	2	6	30591	30596	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	89885760
544	NC_007901	ACG	2	6	30609	30614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89885760
545	NC_007901	GAT	2	6	30719	30724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89885760
546	NC_007901	TCA	2	6	30738	30743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89885760
547	NC_007901	GCC	2	6	30790	30795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89885760
548	NC_007901	CGT	2	6	30812	30817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89885760
549	NC_007901	TTG	2	6	30852	30857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	89885760
550	NC_007901	CCG	2	6	30936	30941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89885761
551	NC_007901	CCT	2	6	30984	30989	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	89885761
552	NC_007901	GCC	2	6	31135	31140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89885761
553	NC_007901	CCTT	2	8	31174	31181	0 %	50 %	0 %	50 %	89885761
554	NC_007901	CAA	2	6	31225	31230	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	89885761
555	NC_007901	GAA	2	6	31252	31257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89885761
556	NC_007901	GAC	2	6	31309	31314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89885761
557	NC_007901	TTG	2	6	31364	31369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	89885761
558	NC_007901	TCG	2	6	31466	31471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89885761
559	NC_007901	TGC	2	6	31479	31484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89885761
560	NC_007901	CAT	2	6	31486	31491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89885761
561	NC_007901	ATG	2	6	31547	31552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89885761
562	NC_007901	ATG	2	6	31613	31618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89885761
563	NC_007901	TGT	2	6	31659	31664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	89885761
564	NC_007901	ACC	2	6	31765	31770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89885761
565	NC_007901	ATCA	2	8	31849	31856	50 %	25 %	0 %	25 %	89885761
566	NC_007901	G	6	6	31888	31893	0 %	0 %	100 %	0 %	89885761
567	NC_007901	CG	3	6	31936	31941	0 %	0 %	50 %	50 %	89885761
568	NC_007901	ACC	2	6	31976	31981	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89885761
569	NC_007901	GTTT	2	8	32001	32008	0 %	75 %	25 %	0 %	89885761
570	NC_007901	AC	5	10	32788	32797	50 %	0 %	0 %	50 %	89885762
571	NC_007901	GTC	2	6	32868	32873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89885762
572	NC_007901	GTC	2	6	32897	32902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89885762
573	NC_007901	TC	3	6	32935	32940	0 %	50 %	0 %	50 %	89885762
574	NC_007901	TAC	2	6	33002	33007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89885762
575	NC_007901	TCA	2	6	33013	33018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89885762
576	NC_007901	CAC	2	6	33076	33081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89885763
577	NC_007901	AG	3	6	33108	33113	50 %	0 %	50 %	0 %	89885763
578	NC_007901	ATT	2	6	33143	33148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	89885763
579	NC_007901	AAC	2	6	33156	33161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	89885763
580	NC_007901	C	6	6	33175	33180	0 %	0 %	0 %	100 %	89885763
581	NC_007901	ATTGG	2	10	33251	33260	20 %	40 %	40 %	0 %	89885763
582	NC_007901	CAT	2	6	33263	33268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89885763
583	NC_007901	CCA	2	6	33286	33291	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89885763
584	NC_007901	GCCG	2	8	33315	33322	0 %	0 %	50 %	50 %	89885763
585	NC_007901	GCA	2	6	33366	33371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89885763
586	NC_007901	CCG	2	6	33382	33387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89885763
587	NC_007901	ACC	2	6	33507	33512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89885763
588	NC_007901	CTG	2	6	33514	33519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89885763
589	NC_007901	GAC	2	6	33552	33557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89885763
590	NC_007901	CCA	2	6	33930	33935	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89885763
591	NC_007901	GGT	2	6	33941	33946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89885763
592	NC_007901	GGC	2	6	33978	33983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89885763
593	NC_007901	GAT	2	6	33984	33989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89885763
594	NC_007901	AGG	2	6	34077	34082	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	89885763
595	NC_007901	TCAA	2	8	34095	34102	50 %	25 %	0 %	25 %	89885763
596	NC_007901	TCA	2	6	34105	34110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89885763
597	NC_007901	TGTT	2	8	34166	34173	0 %	75 %	25 %	0 %	89885764
598	NC_007901	TGA	2	6	34178	34183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89885764
599	NC_007901	CAC	2	6	34397	34402	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89885764
600	NC_007901	CCT	2	6	34410	34415	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	89885764
601	NC_007901	TTG	2	6	34479	34484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	89885764
602	NC_007901	GCC	2	6	34591	34596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89885764
603	NC_007901	GCC	2	6	34606	34611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89885764
604	NC_007901	GTC	2	6	34695	34700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89885764
605	NC_007901	GCC	2	6	34742	34747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89885764
606	NC_007901	ATG	2	6	34749	34754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89885764
607	NC_007901	CT	3	6	34781	34786	0 %	50 %	0 %	50 %	89885764
608	NC_007901	AGC	2	6	34991	34996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89885765
609	NC_007901	CG	3	6	35047	35052	0 %	0 %	50 %	50 %	89885765
610	NC_007901	TTGCCG	2	12	35562	35573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89885765
611	NC_007901	ACCC	2	8	35594	35601	25 %	0 %	0 %	75 %	89885765
612	NC_007901	GGT	2	6	35602	35607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89885765
613	NC_007901	A	6	6	35683	35688	100 %	0 %	0 %	0 %	89885765
614	NC_007901	TGA	2	6	35783	35788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89885766
615	NC_007901	AAG	2	6	35919	35924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89885766
616	NC_007901	TTC	2	6	35937	35942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89885766
617	NC_007901	AGC	2	6	35948	35953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89885766
618	NC_007901	TGG	2	6	35999	36004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89885766
619	NC_007901	CTT	2	6	36023	36028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89885766
620	NC_007901	GT	3	6	36050	36055	0 %	50 %	50 %	0 %	89885766
621	NC_007901	CGT	2	6	36074	36079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89885766
622	NC_007901	AGC	2	6	36082	36087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89885766
623	NC_007901	AAT	2	6	36105	36110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	89885766
624	NC_007901	TCC	2	6	36205	36210	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	89885766
625	NC_007901	GTC	2	6	36213	36218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89885766
626	NC_007901	CAA	2	6	36258	36263	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	89885766
627	NC_007901	GGTTT	2	10	36290	36299	0 %	60 %	40 %	0 %	89885766
628	NC_007901	C	6	6	36376	36381	0 %	0 %	0 %	100 %	89885766
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630	NC_007901	TGA	2	6	36485	36490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89885766
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