MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris HaA2 chromosome

Total Repeats: 4237

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007778	GCCAC	2	10	1010	1019	20 %	0 %	20 %	60 %	86747128
2	NC_007778	ACCAC	2	10	1988	1997	40 %	0 %	0 %	60 %	86747128
3	NC_007778	CGGGG	2	10	4249	4258	0 %	0 %	80 %	20 %	86747131
4	NC_007778	CGCGG	2	10	4743	4752	0 %	0 %	60 %	40 %	86747131
5	NC_007778	GCCAC	2	10	5667	5676	20 %	0 %	20 %	60 %	86747132
6	NC_007778	GTGCT	2	10	6308	6317	0 %	40 %	40 %	20 %	86747132
7	NC_007778	CCGCG	2	10	6367	6376	0 %	0 %	40 %	60 %	86747132
8	NC_007778	CGCTG	2	10	8035	8044	0 %	20 %	40 %	40 %	86747133
9	NC_007778	GCCGA	2	10	9881	9890	20 %	0 %	40 %	40 %	86747135
10	NC_007778	GCAGC	2	10	12534	12543	20 %	0 %	40 %	40 %	86747138
11	NC_007778	CCGCG	2	10	14899	14908	0 %	0 %	40 %	60 %	86747140
12	NC_007778	GCCGG	2	10	15241	15250	0 %	0 %	60 %	40 %	86747141
13	NC_007778	CGCGG	2	10	16909	16918	0 %	0 %	60 %	40 %	86747144
14	NC_007778	CGAGC	2	10	17665	17674	20 %	0 %	40 %	40 %	86747144
15	NC_007778	GCGAG	2	10	19131	19140	20 %	0 %	60 %	20 %	86747145
16	NC_007778	GTTGC	2	10	20503	20512	0 %	40 %	40 %	20 %	86747146
17	NC_007778	GCGAC	2	10	22440	22449	20 %	0 %	40 %	40 %	86747149
18	NC_007778	GCCGC	2	10	25402	25411	0 %	0 %	40 %	60 %	86747153
19	NC_007778	CGCGG	2	10	25564	25573	0 %	0 %	60 %	40 %	86747153
20	NC_007778	CGCGC	2	10	25966	25975	0 %	0 %	40 %	60 %	86747154
21	NC_007778	GCCAC	2	10	30603	30612	20 %	0 %	20 %	60 %	86747159
22	NC_007778	CGGCT	2	10	31082	31091	0 %	20 %	40 %	40 %	86747159
23	NC_007778	GCGAC	2	10	31259	31268	20 %	0 %	40 %	40 %	86747159
24	NC_007778	GGCGC	2	10	32590	32599	0 %	0 %	60 %	40 %	86747159
25	NC_007778	CGGCG	2	10	34124	34133	0 %	0 %	60 %	40 %	86747162
26	NC_007778	GCGCA	2	10	34242	34251	20 %	0 %	40 %	40 %	86747162
27	NC_007778	TCGCG	2	10	34814	34823	0 %	20 %	40 %	40 %	86747162
28	NC_007778	GGCGC	2	10	35388	35397	0 %	0 %	60 %	40 %	86747162
29	NC_007778	TCCGA	2	10	35470	35479	20 %	20 %	20 %	40 %	86747162
30	NC_007778	GCGCG	2	10	36128	36137	0 %	0 %	60 %	40 %	86747162
31	NC_007778	GTCCG	2	10	36387	36396	0 %	20 %	40 %	40 %	86747162
32	NC_007778	GAAGT	2	10	36523	36532	40 %	20 %	40 %	0 %	86747162
33	NC_007778	TCGAA	2	10	36635	36644	40 %	20 %	20 %	20 %	86747162
34	NC_007778	CCGAC	2	10	38606	38615	20 %	0 %	20 %	60 %	86747165
35	NC_007778	CGCCC	2	10	39670	39679	0 %	0 %	20 %	80 %	86747166
36	NC_007778	CTGGC	2	10	39820	39829	0 %	20 %	40 %	40 %	86747167
37	NC_007778	CGATC	2	10	40693	40702	20 %	20 %	20 %	40 %	86747168
38	NC_007778	GCCGC	2	10	40710	40719	0 %	0 %	40 %	60 %	86747168
39	NC_007778	GCGCC	2	10	46993	47002	0 %	0 %	40 %	60 %	86747174
40	NC_007778	CGATC	2	10	49314	49323	20 %	20 %	20 %	40 %	86747175
41	NC_007778	CGGCC	2	10	49728	49737	0 %	0 %	40 %	60 %	86747175
42	NC_007778	TGTCA	2	10	50176	50185	20 %	40 %	20 %	20 %	86747175
43	NC_007778	GCCGC	2	10	51102	51111	0 %	0 %	40 %	60 %	86747176
44	NC_007778	ACGCG	2	10	51436	51445	20 %	0 %	40 %	40 %	86747177
45	NC_007778	CAGTT	2	10	51573	51582	20 %	40 %	20 %	20 %	86747177
46	NC_007778	CGGCG	2	10	51876	51885	0 %	0 %	60 %	40 %	86747177
47	NC_007778	CCGCG	2	10	52895	52904	0 %	0 %	40 %	60 %	86747177
48	NC_007778	GGCTT	2	10	53590	53599	0 %	40 %	40 %	20 %	86747177
49	NC_007778	CCGCG	2	10	58286	58295	0 %	0 %	40 %	60 %	86747183
50	NC_007778	GCCCG	2	10	63100	63109	0 %	0 %	40 %	60 %	86747187
51	NC_007778	AGATC	2	10	64155	64164	40 %	20 %	20 %	20 %	86747187
52	NC_007778	CTCGC	2	10	64897	64906	0 %	20 %	20 %	60 %	86747188
53	NC_007778	GCATC	2	10	65135	65144	20 %	20 %	20 %	40 %	86747189
54	NC_007778	TCCGA	2	10	67284	67293	20 %	20 %	20 %	40 %	86747190
55	NC_007778	CATCG	2	10	68011	68020	20 %	20 %	20 %	40 %	86747191
56	NC_007778	GATCA	2	10	69346	69355	40 %	20 %	20 %	20 %	86747193
57	NC_007778	GTCCG	2	10	70743	70752	0 %	20 %	40 %	40 %	86747195
58	NC_007778	CGATG	2	10	70838	70847	20 %	20 %	40 %	20 %	86747195
59	NC_007778	TCGCC	2	10	74825	74834	0 %	20 %	20 %	60 %	86747199
60	NC_007778	CGTTG	2	10	75704	75713	0 %	40 %	40 %	20 %	86747200
61	NC_007778	GTGCC	2	10	79163	79172	0 %	20 %	40 %	40 %	86747203
62	NC_007778	CGTGC	2	10	80522	80531	0 %	20 %	40 %	40 %	86747204
63	NC_007778	CCGAG	2	10	80921	80930	20 %	0 %	40 %	40 %	86747204
64	NC_007778	TCGGG	2	10	83346	83355	0 %	20 %	60 %	20 %	86747207
65	NC_007778	GCAGC	2	10	83656	83665	20 %	0 %	40 %	40 %	86747207
66	NC_007778	GCGTC	2	10	85060	85069	0 %	20 %	40 %	40 %	86747209
67	NC_007778	CGGGC	2	10	86017	86026	0 %	0 %	60 %	40 %	86747209
68	NC_007778	CGGGG	2	10	86661	86670	0 %	0 %	80 %	20 %	86747209
69	NC_007778	CGCGG	2	10	90046	90055	0 %	0 %	60 %	40 %	86747211
70	NC_007778	CGGCC	2	10	91809	91818	0 %	0 %	40 %	60 %	86747212
71	NC_007778	ATCCG	2	10	93764	93773	20 %	20 %	20 %	40 %	86747214
72	NC_007778	CCGCA	2	10	95306	95315	20 %	0 %	20 %	60 %	86747216
73	NC_007778	GGCGT	2	10	95796	95805	0 %	20 %	60 %	20 %	86747216
74	NC_007778	CGGCG	2	10	98844	98853	0 %	0 %	60 %	40 %	86747218
75	NC_007778	TGACC	2	10	100413	100422	20 %	20 %	20 %	40 %	86747220
76	NC_007778	TGCGC	2	10	100776	100785	0 %	20 %	40 %	40 %	86747220
77	NC_007778	TCGGC	2	10	101592	101601	0 %	20 %	40 %	40 %	86747221
78	NC_007778	CCGCG	2	10	102371	102380	0 %	0 %	40 %	60 %	86747222
79	NC_007778	ACGGC	2	10	102397	102406	20 %	0 %	40 %	40 %	86747222
80	NC_007778	CGCGC	2	10	105462	105471	0 %	0 %	40 %	60 %	86747224
81	NC_007778	CGGCC	2	10	107294	107303	0 %	0 %	40 %	60 %	86747227
82	NC_007778	ACAAT	2	10	108527	108536	60 %	20 %	0 %	20 %	86747228
83	NC_007778	GCCGG	2	10	108951	108960	0 %	0 %	60 %	40 %	86747228
84	NC_007778	GGTGA	2	10	109122	109131	20 %	20 %	60 %	0 %	86747228
85	NC_007778	GCCAA	2	10	110325	110334	40 %	0 %	20 %	40 %	86747229
86	NC_007778	CAGGT	2	10	111300	111309	20 %	20 %	40 %	20 %	86747229
87	NC_007778	CGCCA	2	10	115272	115281	20 %	0 %	20 %	60 %	86747231
88	NC_007778	CAGGA	2	10	120776	120785	40 %	0 %	40 %	20 %	86747237
89	NC_007778	CGCGC	2	10	121786	121795	0 %	0 %	40 %	60 %	86747238
90	NC_007778	TCCGG	2	10	122152	122161	0 %	20 %	40 %	40 %	86747238
91	NC_007778	CGCGG	2	10	122506	122515	0 %	0 %	60 %	40 %	86747239
92	NC_007778	CGACG	2	10	123677	123686	20 %	0 %	40 %	40 %	86747240
93	NC_007778	CGCGG	2	10	123800	123809	0 %	0 %	60 %	40 %	86747240
94	NC_007778	CGGCG	2	10	126484	126493	0 %	0 %	60 %	40 %	86747243
95	NC_007778	GCCGC	2	10	128145	128154	0 %	0 %	40 %	60 %	86747244
96	NC_007778	GCGCC	2	10	128310	128319	0 %	0 %	40 %	60 %	86747244
97	NC_007778	ACGCC	2	10	128676	128685	20 %	0 %	20 %	60 %	86747244
98	NC_007778	AGCGA	2	10	131332	131341	40 %	0 %	40 %	20 %	86747246
99	NC_007778	CGCGC	2	10	131765	131774	0 %	0 %	40 %	60 %	86747247
100	NC_007778	CCAGA	2	10	132439	132448	40 %	0 %	20 %	40 %	86747248
101	NC_007778	CGGCG	2	10	136567	136576	0 %	0 %	60 %	40 %	86747253
102	NC_007778	GCGAT	2	10	137523	137532	20 %	20 %	40 %	20 %	86747254
103	NC_007778	CGGCG	2	10	139093	139102	0 %	0 %	60 %	40 %	86747255
104	NC_007778	GGCGC	2	10	139713	139722	0 %	0 %	60 %	40 %	86747256
105	NC_007778	GCCGC	2	10	140828	140837	0 %	0 %	40 %	60 %	86747257
106	NC_007778	ATCGA	2	10	141507	141516	40 %	20 %	20 %	20 %	86747258
107	NC_007778	ACGGC	2	10	142488	142497	20 %	0 %	40 %	40 %	86747259
108	NC_007778	GCGCG	2	10	142782	142791	0 %	0 %	60 %	40 %	86747259
109	NC_007778	ACGGC	2	10	143238	143247	20 %	0 %	40 %	40 %	86747259
110	NC_007778	GCTCG	2	10	144679	144688	0 %	20 %	40 %	40 %	86747260
111	NC_007778	TGCGC	2	10	145358	145367	0 %	20 %	40 %	40 %	86747261
112	NC_007778	GCAGC	2	10	147210	147219	20 %	0 %	40 %	40 %	86747262
113	NC_007778	CGGCT	2	10	148006	148015	0 %	20 %	40 %	40 %	86747262
114	NC_007778	CGGCT	2	10	148378	148387	0 %	20 %	40 %	40 %	86747262
115	NC_007778	CGAGG	2	10	150380	150389	20 %	0 %	60 %	20 %	86747264
116	NC_007778	TTGCC	2	10	150451	150460	0 %	40 %	20 %	40 %	86747264
117	NC_007778	GCACC	2	10	150640	150649	20 %	0 %	20 %	60 %	86747264
118	NC_007778	TCGGC	2	10	152794	152803	0 %	20 %	40 %	40 %	86747266
119	NC_007778	CCGGC	2	10	154860	154869	0 %	0 %	40 %	60 %	86747268
120	NC_007778	CTCGG	2	10	155895	155904	0 %	20 %	40 %	40 %	86747269
121	NC_007778	CGGCG	2	10	156101	156110	0 %	0 %	60 %	40 %	86747269
122	NC_007778	TCGGC	2	10	156274	156283	0 %	20 %	40 %	40 %	86747269
123	NC_007778	GCGCG	2	10	160034	160043	0 %	0 %	60 %	40 %	86747274
124	NC_007778	TCCGG	2	10	160737	160746	0 %	20 %	40 %	40 %	86747275
125	NC_007778	CGCGG	2	10	162982	162991	0 %	0 %	60 %	40 %	86747275
126	NC_007778	GCGCC	2	10	163444	163453	0 %	0 %	40 %	60 %	86747275
127	NC_007778	TCGCC	2	10	164979	164988	0 %	20 %	20 %	60 %	86747277
128	NC_007778	ACATC	2	10	167893	167902	40 %	20 %	0 %	40 %	86747282
129	NC_007778	CGCGC	2	10	168754	168763	0 %	0 %	40 %	60 %	86747282
130	NC_007778	CCGTG	2	10	169354	169363	0 %	20 %	40 %	40 %	86747282
131	NC_007778	CGAGC	2	10	171512	171521	20 %	0 %	40 %	40 %	86747286
132	NC_007778	CGAGG	2	10	173805	173814	20 %	0 %	60 %	20 %	86747289
133	NC_007778	CCGCG	2	10	174372	174381	0 %	0 %	40 %	60 %	86747289
134	NC_007778	GCCGC	2	10	174667	174676	0 %	0 %	40 %	60 %	86747289
135	NC_007778	CGAGC	2	10	175095	175104	20 %	0 %	40 %	40 %	86747289
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137	NC_007778	CCCGC	2	10	177213	177222	0 %	0 %	20 %	80 %	86747291
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