MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris HaA2 chromosome

Total Repeats: 95185

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007778	CTG	2	6	870	875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86747128
2	NC_007778	GCG	3	9	952	960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86747128
3	NC_007778	TCG	2	6	972	977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86747128
4	NC_007778	CGG	2	6	1050	1055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86747128
5	NC_007778	CGC	2	6	1058	1063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86747128
6	NC_007778	TCG	3	9	1091	1099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86747128
7	NC_007778	GCC	3	9	1123	1131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86747128
8	NC_007778	GCC	2	6	1148	1153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86747128
9	NC_007778	GCG	2	6	1154	1159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86747128
10	NC_007778	CTG	2	6	1219	1224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86747128
11	NC_007778	CCG	2	6	1280	1285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86747128
12	NC_007778	TCG	2	6	1304	1309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86747128
13	NC_007778	CGA	2	6	1377	1382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86747128
14	NC_007778	ACC	2	6	1405	1410	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86747128
15	NC_007778	CCG	2	6	1483	1488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86747128
16	NC_007778	CGA	2	6	1506	1511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86747128
17	NC_007778	CGG	2	6	1533	1538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86747128
18	NC_007778	TCG	3	9	1541	1549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86747128
19	NC_007778	CTG	2	6	1714	1719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86747128
20	NC_007778	TCG	2	6	1835	1840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86747128
21	NC_007778	GTC	2	6	1875	1880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86747128
22	NC_007778	GCC	2	6	1967	1972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86747128
23	NC_007778	CGG	2	6	1977	1982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86747128
24	NC_007778	TGC	2	6	2000	2005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86747128
25	NC_007778	CGA	2	6	2055	2060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86747128
26	NC_007778	ACC	2	6	2554	2559	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86747129
27	NC_007778	GCC	2	6	2716	2721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86747129
28	NC_007778	CTA	2	6	2814	2819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86747129
29	NC_007778	CCG	2	6	2843	2848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86747129
30	NC_007778	GCC	2	6	2932	2937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86747129
31	NC_007778	ACG	2	6	3002	3007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86747129
32	NC_007778	AAC	2	6	3124	3129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86747129
33	NC_007778	TGG	2	6	3140	3145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86747129
34	NC_007778	AAG	2	6	3151	3156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86747129
35	NC_007778	CGA	2	6	3185	3190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86747129
36	NC_007778	GAG	2	6	3283	3288	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86747129
37	NC_007778	CGC	2	6	3354	3359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86747129
38	NC_007778	TGC	2	6	3383	3388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86747129
39	NC_007778	TGC	2	6	3743	3748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86747130
40	NC_007778	CCG	2	6	3777	3782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86747130
41	NC_007778	AGC	2	6	3827	3832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86747130
42	NC_007778	CTC	2	6	3901	3906	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86747130
43	NC_007778	AAC	2	6	3937	3942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86747130
44	NC_007778	TGC	2	6	3947	3952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86747130
45	NC_007778	GCG	2	6	4152	4157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86747131
46	NC_007778	GAC	2	6	4163	4168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86747131
47	NC_007778	GTG	2	6	4182	4187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86747131
48	NC_007778	GCG	2	6	4262	4267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86747131
49	NC_007778	GAC	2	6	4278	4283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86747131
50	NC_007778	GGC	2	6	4319	4324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86747131
51	NC_007778	CGC	2	6	4375	4380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86747131
52	NC_007778	CGC	2	6	4388	4393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86747131
53	NC_007778	CGG	3	9	4518	4526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86747131
54	NC_007778	TTC	2	6	4527	4532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86747131
55	NC_007778	CTG	2	6	4614	4619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86747131
56	NC_007778	CCG	2	6	4669	4674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86747131
57	NC_007778	CGC	2	6	4724	4729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86747131
58	NC_007778	CGG	2	6	4825	4830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86747131
59	NC_007778	GCC	2	6	4864	4869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86747131
60	NC_007778	CGC	3	9	4877	4885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86747131
61	NC_007778	GTC	2	6	4926	4931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86747131
62	NC_007778	GCT	2	6	4985	4990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86747131
63	NC_007778	CGC	2	6	5044	5049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86747131
64	NC_007778	TGC	3	9	5050	5058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86747131
65	NC_007778	CGA	2	6	5060	5065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86747131
66	NC_007778	GGT	2	6	5066	5071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86747131
67	NC_007778	CAA	2	6	5226	5231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86747131
68	NC_007778	CGA	2	6	5596	5601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86747132
69	NC_007778	CAC	2	6	5615	5620	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86747132
70	NC_007778	GTC	2	6	5633	5638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86747132
71	NC_007778	CGA	2	6	5650	5655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86747132
72	NC_007778	CGA	2	6	5722	5727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86747132
73	NC_007778	CGG	2	6	5772	5777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86747132
74	NC_007778	TCA	2	6	5784	5789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86747132
75	NC_007778	CGG	2	6	5806	5811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86747132
76	NC_007778	CGG	2	6	5842	5847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86747132
77	NC_007778	GGT	2	6	5869	5874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86747132
78	NC_007778	CAT	2	6	5929	5934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86747132
79	NC_007778	GAG	2	6	6152	6157	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86747132
80	NC_007778	GCG	2	6	6171	6176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86747132
81	NC_007778	CAA	2	6	6205	6210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86747132
82	NC_007778	GGC	2	6	6241	6246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86747132
83	NC_007778	TGG	2	6	6281	6286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86747132
84	NC_007778	CAA	2	6	6322	6327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86747132
85	NC_007778	GGT	2	6	6344	6349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86747132
86	NC_007778	AAG	2	6	6416	6421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86747132
87	NC_007778	CGA	2	6	6442	6447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86747132
88	NC_007778	TCG	2	6	6503	6508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86747132
89	NC_007778	CCG	2	6	6600	6605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86747132
90	NC_007778	TCG	2	6	6618	6623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86747132
91	NC_007778	GCC	4	12	6638	6649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86747132
92	NC_007778	TCG	2	6	6771	6776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86747132
93	NC_007778	CCG	2	6	6786	6791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86747132
94	NC_007778	TGC	2	6	6834	6839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86747132
95	NC_007778	CGA	2	6	6946	6951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86747132
96	NC_007778	ATC	2	6	6983	6988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86747132
97	NC_007778	TGA	2	6	6990	6995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86747132
98	NC_007778	GCT	2	6	7030	7035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86747132
99	NC_007778	TTC	3	9	7043	7051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86747132
100	NC_007778	GGC	2	6	7076	7081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86747132
101	NC_007778	GCC	2	6	7099	7104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86747132
102	NC_007778	CGA	2	6	7189	7194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86747132
103	NC_007778	CGG	2	6	7228	7233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86747132
104	NC_007778	CTG	2	6	7241	7246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86747132
105	NC_007778	GGT	2	6	7315	7320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86747132
106	NC_007778	GGC	2	6	7327	7332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86747132
107	NC_007778	GCC	3	9	7388	7396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86747132
108	NC_007778	CGA	2	6	7426	7431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86747132
109	NC_007778	TCG	2	6	7458	7463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86747132
110	NC_007778	GCG	2	6	7497	7502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86747132
111	NC_007778	GAT	2	6	7516	7521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86747132
112	NC_007778	CGA	2	6	7522	7527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86747132
113	NC_007778	GCT	2	6	7531	7536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86747132
114	NC_007778	CCG	2	6	7542	7547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86747132
115	NC_007778	CGC	2	6	7570	7575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86747132
116	NC_007778	TGC	2	6	7578	7583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86747132
117	NC_007778	AGG	2	6	7584	7589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86747132
118	NC_007778	TGC	2	6	7608	7613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86747132
119	NC_007778	CGA	2	6	7801	7806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86747132
120	NC_007778	CGA	2	6	7810	7815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86747132
121	NC_007778	CGT	2	6	7840	7845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86747132
122	NC_007778	CGC	2	6	7853	7858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86747132
123	NC_007778	GGC	2	6	8096	8101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86747133
124	NC_007778	AGC	3	9	8124	8132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86747133
125	NC_007778	GCG	2	6	8224	8229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86747133
126	NC_007778	TGC	2	6	8236	8241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86747133
127	NC_007778	GTC	2	6	8327	8332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86747133
128	NC_007778	CCT	2	6	8353	8358	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86747133
129	NC_007778	GCT	2	6	8381	8386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86747133
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131	NC_007778	CCA	2	6	8567	8572	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86747133
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