MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris HaA2 chromosome

Total Repeats: 129790

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_007778	GGCG	2	8	162214	162221	0 %	0 %	75 %	25 %	86747275
4002	NC_007778	CTG	4	12	162224	162235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86747275
4003	NC_007778	GGCT	2	8	162266	162273	0 %	25 %	50 %	25 %	86747275
4004	NC_007778	GGC	3	9	162313	162321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86747275
4005	NC_007778	GC	4	8	162330	162337	0 %	0 %	50 %	50 %	86747275
4006	NC_007778	CCG	2	6	162346	162351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86747275
4007	NC_007778	CTT	2	6	162424	162429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86747275
4008	NC_007778	CGG	2	6	162430	162435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86747275
4009	NC_007778	ACG	2	6	162441	162446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86747275
4010	NC_007778	CG	3	6	162455	162460	0 %	0 %	50 %	50 %	86747275
4011	NC_007778	CGG	4	12	162480	162491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86747275
4012	NC_007778	TCG	2	6	162504	162509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86747275
4013	NC_007778	TGA	2	6	162525	162530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86747275
4014	NC_007778	CTG	2	6	162548	162553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86747275
4015	NC_007778	AGC	2	6	162566	162571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86747275
4016	NC_007778	CTG	4	12	162665	162676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86747275
4017	NC_007778	CTG	2	6	162686	162691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86747275
4018	NC_007778	CGC	2	6	162702	162707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86747275
4019	NC_007778	GCG	2	6	162756	162761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86747275
4020	NC_007778	CGC	2	6	162766	162771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86747275
4021	NC_007778	GC	3	6	162774	162779	0 %	0 %	50 %	50 %	86747275
4022	NC_007778	TGA	2	6	162792	162797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86747275
4023	NC_007778	ACC	2	6	162825	162830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86747275
4024	NC_007778	CGG	4	12	162847	162858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86747275
4025	NC_007778	ATC	2	6	162917	162922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86747275
4026	NC_007778	CGC	2	6	162934	162939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86747275
4027	NC_007778	GCT	2	6	162955	162960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86747275
4028	NC_007778	CGCGG	2	10	162982	162991	0 %	0 %	60 %	40 %	86747275
4029	NC_007778	CCG	2	6	163023	163028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86747275
4030	NC_007778	GCT	3	9	163039	163047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86747275
4031	NC_007778	GGT	2	6	163048	163053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86747275
4032	NC_007778	GC	5	10	163058	163067	0 %	0 %	50 %	50 %	86747275
4033	NC_007778	TCT	2	6	163101	163106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86747275
4034	NC_007778	GCG	2	6	163128	163133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86747275
4035	NC_007778	GTC	2	6	163151	163156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86747275
4036	NC_007778	TCA	2	6	163167	163172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86747275
4037	NC_007778	AGC	2	6	163209	163214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86747275
4038	NC_007778	CTG	2	6	163235	163240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86747275
4039	NC_007778	CGC	2	6	163255	163260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86747275
4040	NC_007778	GCC	2	6	163262	163267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86747275
4041	NC_007778	GGC	2	6	163293	163298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86747275
4042	NC_007778	GGT	2	6	163408	163413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86747275
4043	NC_007778	GCTGTC	2	12	163414	163425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86747275
4044	NC_007778	CG	4	8	163432	163439	0 %	0 %	50 %	50 %	86747275
4045	NC_007778	GCGCC	2	10	163444	163453	0 %	0 %	40 %	60 %	86747275
4046	NC_007778	GCC	2	6	163468	163473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86747275
4047	NC_007778	GAG	2	6	163541	163546	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86747275
4048	NC_007778	ATC	2	6	163637	163642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86747276
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4050	NC_007778	CCTGTT	2	12	163672	163683	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	86747276
4051	NC_007778	GGC	2	6	163692	163697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86747276
4052	NC_007778	TGG	3	9	163809	163817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86747276
4053	NC_007778	CG	3	6	163885	163890	0 %	0 %	50 %	50 %	86747276
4054	NC_007778	GGC	2	6	163900	163905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86747276
4055	NC_007778	TCG	2	6	163925	163930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86747277
4056	NC_007778	ATC	2	6	163936	163941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86747277
4057	NC_007778	CGT	2	6	163950	163955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86747277
4058	NC_007778	CGC	2	6	163956	163961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86747277
4059	NC_007778	CTGGTG	2	12	163966	163977	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	86747277
4060	NC_007778	CCAG	2	8	163994	164001	25 %	0 %	25 %	50 %	86747277
4061	NC_007778	TGC	2	6	164030	164035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86747277
4062	NC_007778	CGG	3	9	164063	164071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86747277
4063	NC_007778	GC	3	6	164075	164080	0 %	0 %	50 %	50 %	86747277
4064	NC_007778	GC	4	8	164106	164113	0 %	0 %	50 %	50 %	86747277
4065	NC_007778	CGA	2	6	164150	164155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86747277
4066	NC_007778	TGC	3	9	164156	164164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86747277
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4069	NC_007778	CCT	2	6	164333	164338	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86747277
4070	NC_007778	TGC	2	6	164348	164353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86747277
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4073	NC_007778	GGC	2	6	164369	164374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86747277
4074	NC_007778	CTGTTC	2	12	164422	164433	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	86747277
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4077	NC_007778	GCT	5	15	164541	164555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86747277
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4080	NC_007778	GGC	2	6	164634	164639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86747277
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4084	NC_007778	GCT	3	9	164853	164861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86747277
4085	NC_007778	CCG	2	6	164894	164899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86747277
4086	NC_007778	TAT	2	6	164905	164910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	86747277
4087	NC_007778	CTG	2	6	164911	164916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86747277
4088	NC_007778	GCG	2	6	164930	164935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86747277
4089	NC_007778	CTG	2	6	164947	164952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86747277
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4091	NC_007778	TCGCC	2	10	164979	164988	0 %	20 %	20 %	60 %	86747277
4092	NC_007778	TTC	2	6	165043	165048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86747277
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4094	NC_007778	AGC	2	6	165169	165174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86747277
4095	NC_007778	TCG	2	6	165185	165190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86747277
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4097	NC_007778	CCGG	2	8	165234	165241	0 %	0 %	50 %	50 %	86747277
4098	NC_007778	GCCG	2	8	165246	165253	0 %	0 %	50 %	50 %	86747277
4099	NC_007778	GCT	2	6	165315	165320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86747277
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4101	NC_007778	CG	3	6	165397	165402	0 %	0 %	50 %	50 %	86747277
4102	NC_007778	CCG	2	6	165410	165415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86747277
4103	NC_007778	G	6	6	165431	165436	0 %	0 %	100 %	0 %	86747277
4104	NC_007778	CGC	2	6	165437	165442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86747277
4105	NC_007778	TCG	2	6	165496	165501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86747278
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4107	NC_007778	CTG	2	6	165543	165548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86747278
4108	NC_007778	CGC	2	6	165623	165628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86747278
4109	NC_007778	TCG	2	6	165640	165645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86747278
4110	NC_007778	TCG	2	6	165655	165660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86747278
4111	NC_007778	TCG	2	6	165724	165729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86747278
4112	NC_007778	GCT	2	6	165767	165772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86747278
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4115	NC_007778	ACGA	2	8	165901	165908	50 %	0 %	25 %	25 %	86747278
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4119	NC_007778	GTCG	2	8	166132	166139	0 %	25 %	50 %	25 %	86747279
4120	NC_007778	CTG	2	6	166172	166177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86747279
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4122	NC_007778	TTC	2	6	166257	166262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86747280
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4488	NC_007778	ACG	2	6	179377	179382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86747293
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