MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium etli CFN 42 plasmid p42f

Total Repeats: 13053

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_007766	CGGC	2	8	209250	209257	0 %	0 %	50 %	50 %	86360929
4002	NC_007766	CAAGAC	2	12	209283	209294	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	86360929
4003	NC_007766	GGC	2	6	209490	209495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360929
4004	NC_007766	GATC	2	8	209508	209515	25 %	25 %	25 %	25 %	86360929
4005	NC_007766	GGC	3	9	209541	209549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360929
4006	NC_007766	TGC	2	6	209557	209562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360929
4007	NC_007766	CGC	3	9	209579	209587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360929
4008	NC_007766	CAC	2	6	210026	210031	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86360930
4009	NC_007766	TCG	2	6	210049	210054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360930
4010	NC_007766	GGC	2	6	210057	210062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360930
4011	NC_007766	TCG	2	6	210088	210093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360930
4012	NC_007766	GCCG	2	8	210123	210130	0 %	0 %	50 %	50 %	86360930
4013	NC_007766	ATC	2	6	210159	210164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360930
4014	NC_007766	GCG	3	9	210249	210257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360930
4015	NC_007766	TCCTT	2	10	210391	210400	0 %	60 %	0 %	40 %	86360930
4016	NC_007766	GAT	2	6	210404	210409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360930
4017	NC_007766	ATC	2	6	210489	210494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360930
4018	NC_007766	GC	3	6	210531	210536	0 %	0 %	50 %	50 %	86360930
4019	NC_007766	ACTGGC	2	12	210702	210713	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	86360931
4020	NC_007766	TGA	2	6	210836	210841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360931
4021	NC_007766	ATC	2	6	210860	210865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360931
4022	NC_007766	GC	3	6	210891	210896	0 %	0 %	50 %	50 %	86360931
4023	NC_007766	TCG	2	6	210917	210922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360931
4024	NC_007766	CTG	2	6	210924	210929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360931
4025	NC_007766	GTCG	2	8	210930	210937	0 %	25 %	50 %	25 %	86360931
4026	NC_007766	GCG	3	9	210938	210946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360931
4027	NC_007766	GGC	2	6	210969	210974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360931
4028	NC_007766	AGG	2	6	211070	211075	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86360931
4029	NC_007766	CTTC	2	8	211094	211101	0 %	50 %	0 %	50 %	86360931
4030	NC_007766	CGT	2	6	211127	211132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360931
4031	NC_007766	CCG	2	6	211258	211263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360932
4032	NC_007766	GCCC	2	8	211269	211276	0 %	0 %	25 %	75 %	86360932
4033	NC_007766	ATG	2	6	211285	211290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360932
4034	NC_007766	CGG	2	6	211340	211345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360932
4035	NC_007766	CCT	2	6	211396	211401	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86360932
4036	NC_007766	GGC	2	6	211448	211453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360932
4037	NC_007766	GCC	2	6	211479	211484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360932
4038	NC_007766	GC	3	6	211487	211492	0 %	0 %	50 %	50 %	86360932
4039	NC_007766	TGC	2	6	211495	211500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360932
4040	NC_007766	AGG	2	6	211555	211560	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86360932
4041	NC_007766	GCC	2	6	211629	211634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360932
4042	NC_007766	TCCT	2	8	211635	211642	0 %	50 %	0 %	50 %	86360932
4043	NC_007766	GAT	2	6	211712	211717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360932
4044	NC_007766	GCG	2	6	211721	211726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360932
4045	NC_007766	GTC	2	6	211824	211829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360932
4046	NC_007766	CTC	2	6	211838	211843	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86360932
4047	NC_007766	CTTGCC	2	12	211863	211874	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	86360932
4048	NC_007766	GC	3	6	212029	212034	0 %	0 %	50 %	50 %	86360932
4049	NC_007766	CGG	2	6	212063	212068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360932
4050	NC_007766	CGC	2	6	212074	212079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360932
4051	NC_007766	CGA	2	6	212090	212095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360932
4052	NC_007766	TGC	2	6	212165	212170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360932
4053	NC_007766	GCC	2	6	212223	212228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360932
4054	NC_007766	GC	3	6	212236	212241	0 %	0 %	50 %	50 %	86360932
4055	NC_007766	GC	3	6	212297	212302	0 %	0 %	50 %	50 %	86360932
4056	NC_007766	CGT	2	6	212303	212308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360932
4057	NC_007766	CGG	2	6	212363	212368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360932
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4059	NC_007766	GGC	2	6	212468	212473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360932
4060	NC_007766	GTC	2	6	212502	212507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360932
4061	NC_007766	TCG	2	6	212536	212541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360932
4062	NC_007766	GC	3	6	212563	212568	0 %	0 %	50 %	50 %	86360932
4063	NC_007766	GC	4	8	212585	212592	0 %	0 %	50 %	50 %	86360932
4064	NC_007766	TGG	2	6	212605	212610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86360932
4065	NC_007766	CGG	2	6	212633	212638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360932
4066	NC_007766	CGG	2	6	212651	212656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360932
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4069	NC_007766	CCAC	2	8	212903	212910	25 %	0 %	0 %	75 %	86360933
4070	NC_007766	GCAT	2	8	212915	212922	25 %	25 %	25 %	25 %	86360933
4071	NC_007766	GC	3	6	212923	212928	0 %	0 %	50 %	50 %	86360933
4072	NC_007766	CG	3	6	212942	212947	0 %	0 %	50 %	50 %	86360933
4073	NC_007766	TCG	2	6	212948	212953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360933
4074	NC_007766	GCC	2	6	213044	213049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360933
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4076	NC_007766	CACGG	2	10	213115	213124	20 %	0 %	40 %	40 %	86360933
4077	NC_007766	TAC	2	6	213241	213246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360933
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4079	NC_007766	CGGC	2	8	213258	213265	0 %	0 %	50 %	50 %	86360933
4080	NC_007766	AGA	3	9	213272	213280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86360933
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4082	NC_007766	TCC	2	6	213383	213388	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86360933
4083	NC_007766	TAT	2	6	213403	213408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	86360933
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4090	NC_007766	C	7	7	213556	213562	0 %	0 %	0 %	100 %	86360933
4091	NC_007766	CTG	2	6	213610	213615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360933
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4094	NC_007766	CGA	2	6	213876	213881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360933
4095	NC_007766	TCG	2	6	213890	213895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360933
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4104	NC_007766	GAG	2	6	214223	214228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86360933
4105	NC_007766	GGC	2	6	214258	214263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360934
4106	NC_007766	GGC	2	6	214283	214288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360934
4107	NC_007766	CGG	2	6	214332	214337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360934
4108	NC_007766	GAT	2	6	214421	214426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360934
4109	NC_007766	CCG	2	6	214431	214436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360934
4110	NC_007766	GCAG	2	8	214449	214456	25 %	0 %	50 %	25 %	86360934
4111	NC_007766	CGGT	2	8	214497	214504	0 %	25 %	50 %	25 %	86360934
4112	NC_007766	TCG	2	6	214509	214514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360934
4113	NC_007766	CGA	3	9	214585	214593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360934
4114	NC_007766	CGGG	2	8	214624	214631	0 %	0 %	75 %	25 %	86360934
4115	NC_007766	GGC	2	6	214634	214639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360934
4116	NC_007766	AT	3	6	214648	214653	50 %	50 %	0 %	0 %	86360934
4117	NC_007766	TGC	2	6	214656	214661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360934
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4121	NC_007766	CGG	2	6	214804	214809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360934
4122	NC_007766	ATC	2	6	214823	214828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360934
4123	NC_007766	GGC	2	6	214885	214890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360934
4124	NC_007766	GTC	2	6	214916	214921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360934
4125	NC_007766	CGAT	2	8	214977	214984	25 %	25 %	25 %	25 %	86360934
4126	NC_007766	GTC	2	6	214985	214990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360934
4127	NC_007766	TCG	2	6	214998	215003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360934
4128	NC_007766	ACG	2	6	215057	215062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360934
4129	NC_007766	CGT	2	6	215083	215088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360934
4130	NC_007766	TCG	2	6	215208	215213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360934
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4132	NC_007766	TCG	2	6	215274	215279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360934
4133	NC_007766	CG	3	6	215411	215416	0 %	0 %	50 %	50 %	86360935
4134	NC_007766	CGC	2	6	215421	215426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360935
4135	NC_007766	GCT	2	6	215427	215432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360935
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4142	NC_007766	CCG	2	6	215693	215698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360935
4143	NC_007766	CAT	2	6	215708	215713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360935
4144	NC_007766	CGG	2	6	215751	215756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360935
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4150	NC_007766	CGG	2	6	216119	216124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360936
4151	NC_007766	CAT	2	6	216144	216149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360936
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4153	NC_007766	CGC	2	6	216231	216236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360936
4154	NC_007766	TCG	2	6	216320	216325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360936
4155	NC_007766	CCAG	2	8	216380	216387	25 %	0 %	25 %	50 %	86360936
4156	NC_007766	GC	3	6	216450	216455	0 %	0 %	50 %	50 %	86360936
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4159	NC_007766	TCG	2	6	216608	216613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360936
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4161	NC_007766	GCA	2	6	216757	216762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360936
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4176	NC_007766	GCCCG	2	10	217822	217831	0 %	0 %	40 %	60 %	86360938
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4178	NC_007766	CG	3	6	218037	218042	0 %	0 %	50 %	50 %	86360938
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4180	NC_007766	CGA	2	6	218177	218182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360938
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4197	NC_007766	ATG	2	6	218928	218933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360939
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4200	NC_007766	GTC	2	6	219072	219077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360939
4201	NC_007766	CGA	2	6	219142	219147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360939
4202	NC_007766	CGC	2	6	219149	219154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360939
4203	NC_007766	CTC	2	6	219155	219160	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86360939
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4206	NC_007766	ATC	2	6	219438	219443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360939
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4215	NC_007766	GAT	2	6	219721	219726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360940
4216	NC_007766	GTCGAA	2	12	219769	219780	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	86360940
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4225	NC_007766	CGA	2	6	220245	220250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360940
4226	NC_007766	CGA	2	6	220272	220277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360940
4227	NC_007766	CCA	2	6	220345	220350	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86360940
4228	NC_007766	CGA	2	6	220428	220433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360940
4229	NC_007766	GCCA	2	8	220500	220507	25 %	0 %	25 %	50 %	86360940
4230	NC_007766	CGA	2	6	220509	220514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360940
4231	NC_007766	GTC	2	6	220731	220736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360941
4232	NC_007766	CGG	2	6	220765	220770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360941
4233	NC_007766	GCG	2	6	220911	220916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360941
4234	NC_007766	GTC	2	6	220928	220933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360941
4235	NC_007766	GGTC	2	8	220939	220946	0 %	25 %	50 %	25 %	86360941
4236	NC_007766	GC	4	8	220974	220981	0 %	0 %	50 %	50 %	86360941
4237	NC_007766	GCT	2	6	221025	221030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360941
4238	NC_007766	CCG	2	6	221070	221075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360941
4239	NC_007766	CGG	2	6	221098	221103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360941
4240	NC_007766	TCA	2	6	221119	221124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360941
4241	NC_007766	GCATAG	2	12	221169	221180	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	86360941
4242	NC_007766	CG	3	6	221224	221229	0 %	0 %	50 %	50 %	86360941
4243	NC_007766	TTC	3	9	221231	221239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86360941
4244	NC_007766	CGG	2	6	221258	221263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360941
4245	NC_007766	GCC	3	9	221304	221312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360941
4246	NC_007766	GTT	2	6	221318	221323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86360941
4247	NC_007766	GCC	3	9	221357	221365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360941
4248	NC_007766	CGA	2	6	221366	221371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360941
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4274	NC_007766	GA	3	6	222945	222950	50 %	0 %	50 %	0 %	86360942
4275	NC_007766	ACCG	2	8	222959	222966	25 %	0 %	25 %	50 %	86360942
4276	NC_007766	TCG	2	6	222970	222975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360942
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4340	NC_007766	GC	3	6	225818	225823	0 %	0 %	50 %	50 %	86360944
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4344	NC_007766	TCGTCA	2	12	226152	226163	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	86360945
4345	NC_007766	CGACAT	2	12	226171	226182	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	86360945
4346	NC_007766	CGC	2	6	226225	226230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360945
4347	NC_007766	GCG	2	6	226263	226268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360945
4348	NC_007766	CGA	4	12	226275	226286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360945
4349	NC_007766	CCG	2	6	226347	226352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360945
4350	NC_007766	GC	3	6	226442	226447	0 %	0 %	50 %	50 %	86360945
4351	NC_007766	AGG	2	6	226551	226556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86360945
4352	NC_007766	GGTCGA	2	12	226563	226574	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	86360945
4353	NC_007766	ACCC	2	8	226644	226651	25 %	0 %	0 %	75 %	86360945
4354	NC_007766	TCA	2	6	226659	226664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360945
4355	NC_007766	CGTTC	2	10	226717	226726	0 %	40 %	20 %	40 %	86360945
4356	NC_007766	TCG	2	6	226730	226735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360945
4357	NC_007766	CGG	2	6	226742	226747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360945
4358	NC_007766	CGT	2	6	226778	226783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360945
4359	NC_007766	GCC	2	6	226817	226822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360945
4360	NC_007766	GCCGAT	2	12	226843	226854	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	86360945
4361	NC_007766	GGA	2	6	226907	226912	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86360945
4362	NC_007766	TGC	2	6	226928	226933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360945
4363	NC_007766	ATC	2	6	226993	226998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360945
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4488	NC_007766	AGG	2	6	234079	234084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86360951
4489	NC_007766	CGT	2	6	234187	234192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360951
4490	NC_007766	CCG	2	6	234211	234216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360951
4491	NC_007766	C	6	6	234625	234630	0 %	0 %	0 %	100 %	86360952
4492	NC_007766	TTC	2	6	234650	234655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86360952
4493	NC_007766	TCGC	2	8	234689	234696	0 %	25 %	25 %	50 %	86360952
4494	NC_007766	GGT	2	6	234697	234702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86360952
4495	NC_007766	CCGG	2	8	234731	234738	0 %	0 %	50 %	50 %	86360952
4496	NC_007766	TGG	2	6	234785	234790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86360952
4497	NC_007766	GA	3	6	234810	234815	50 %	0 %	50 %	0 %	86360952
4498	NC_007766	TCA	3	9	234972	234980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360952
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4500	NC_007766	CGCTGG	2	12	235119	235130	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	86360952

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