MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium etli CFN 42 plasmid p42f

Total Repeats: 13053

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_007766	TCG	2	6	160950	160955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360883
3002	NC_007766	ATC	2	6	160991	160996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360883
3003	NC_007766	ACCG	2	8	161006	161013	25 %	0 %	25 %	50 %	86360883
3004	NC_007766	CGG	2	6	161062	161067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360883
3005	NC_007766	CGG	2	6	161228	161233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360883
3006	NC_007766	GGC	2	6	161272	161277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360883
3007	NC_007766	GCA	2	6	161278	161283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360883
3008	NC_007766	GTC	2	6	161297	161302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360883
3009	NC_007766	CGGC	2	8	161329	161336	0 %	0 %	50 %	50 %	86360883
3010	NC_007766	GTC	2	6	161351	161356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360883
3011	NC_007766	CGA	2	6	161383	161388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360883
3012	NC_007766	CGAGCG	2	12	161398	161409	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	86360883
3013	NC_007766	ACGG	2	8	161482	161489	25 %	0 %	50 %	25 %	86360883
3014	NC_007766	TCG	2	6	161496	161501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360883
3015	NC_007766	GAG	2	6	161546	161551	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86360883
3016	NC_007766	GCA	2	6	161575	161580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360883
3017	NC_007766	T	6	6	161704	161709	0 %	100 %	0 %	0 %	86360883
3018	NC_007766	TCT	2	6	161715	161720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86360883
3019	NC_007766	CAGGG	2	10	161759	161768	20 %	0 %	60 %	20 %	86360883
3020	NC_007766	CGG	2	6	161772	161777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360883
3021	NC_007766	CCG	2	6	161784	161789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360883
3022	NC_007766	TCGA	2	8	161813	161820	25 %	25 %	25 %	25 %	86360883
3023	NC_007766	CCT	2	6	161836	161841	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86360883
3024	NC_007766	CGA	2	6	161869	161874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360883
3025	NC_007766	GCC	2	6	161875	161880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360883
3026	NC_007766	GCG	2	6	161908	161913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360883
3027	NC_007766	GGA	2	6	161914	161919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86360883
3028	NC_007766	GGC	2	6	161959	161964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360883
3029	NC_007766	TCC	2	6	162059	162064	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86360883
3030	NC_007766	CTGGTC	2	12	162070	162081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360883
3031	NC_007766	GTGC	2	8	162104	162111	0 %	25 %	50 %	25 %	86360883
3032	NC_007766	GGA	2	6	162127	162132	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86360883
3033	NC_007766	CAG	2	6	162164	162169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360883
3034	NC_007766	ATC	2	6	162237	162242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360883
3035	NC_007766	GCCG	2	8	162256	162263	0 %	0 %	50 %	50 %	86360883
3036	NC_007766	GAT	2	6	162319	162324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360883
3037	NC_007766	CCA	2	6	162417	162422	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86360883
3038	NC_007766	AGG	2	6	162429	162434	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86360883
3039	NC_007766	CGTC	2	8	162568	162575	0 %	25 %	25 %	50 %	86360883
3040	NC_007766	TCCA	2	8	162600	162607	25 %	25 %	0 %	50 %	86360883
3041	NC_007766	GCC	2	6	162615	162620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360883
3042	NC_007766	CGG	2	6	162745	162750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360883
3043	NC_007766	CGG	2	6	162796	162801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360883
3044	NC_007766	GAT	2	6	162835	162840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360883
3045	NC_007766	CTG	2	6	163001	163006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360883
3046	NC_007766	GCCC	2	8	163033	163040	0 %	0 %	25 %	75 %	86360883
3047	NC_007766	GAG	2	6	163121	163126	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86360883
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3050	NC_007766	CGC	2	6	163210	163215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360883
3051	NC_007766	CGA	2	6	163222	163227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360883
3052	NC_007766	ACG	2	6	163333	163338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360883
3053	NC_007766	CGA	2	6	163369	163374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360883
3054	NC_007766	AGC	2	6	163428	163433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360883
3055	NC_007766	GACG	2	8	163462	163469	25 %	0 %	50 %	25 %	86360883
3056	NC_007766	CGT	2	6	163477	163482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360883
3057	NC_007766	GGC	2	6	163585	163590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360883
3058	NC_007766	TGG	2	6	163611	163616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86360883
3059	NC_007766	GCTGGT	2	12	163621	163632	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	86360883
3060	NC_007766	TCA	2	6	163668	163673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360883
3061	NC_007766	GTC	3	9	163703	163711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360883
3062	NC_007766	GTG	2	6	163742	163747	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86360883
3063	NC_007766	ATG	2	6	163760	163765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360883
3064	NC_007766	AGGTG	2	10	163792	163801	20 %	20 %	60 %	0 %	86360883
3065	NC_007766	AGG	2	6	164114	164119	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86360884
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3068	NC_007766	ATGG	2	8	164445	164452	25 %	25 %	50 %	0 %	86360885
3069	NC_007766	TGC	2	6	164593	164598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360885
3070	NC_007766	ACG	2	6	164615	164620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360885
3071	NC_007766	GAG	2	6	164626	164631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86360885
3072	NC_007766	GAA	2	6	164643	164648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86360885
3073	NC_007766	GAG	2	6	164668	164673	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86360885
3074	NC_007766	A	6	6	164685	164690	100 %	0 %	0 %	0 %	86360885
3075	NC_007766	GC	3	6	165133	165138	0 %	0 %	50 %	50 %	86360886
3076	NC_007766	GGC	2	6	165192	165197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360886
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3078	NC_007766	CA	3	6	165341	165346	50 %	0 %	0 %	50 %	86360886
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3080	NC_007766	GC	3	6	165397	165402	0 %	0 %	50 %	50 %	86360886
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3082	NC_007766	GAT	2	6	165570	165575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360887
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3084	NC_007766	GACAT	2	10	165619	165628	40 %	20 %	20 %	20 %	86360887
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3087	NC_007766	ATG	2	6	165724	165729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360887
3088	NC_007766	CCG	2	6	165730	165735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360887
3089	NC_007766	TCT	2	6	165790	165795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86360887
3090	NC_007766	TCG	2	6	165856	165861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360887
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3092	NC_007766	CTT	2	6	165935	165940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86360887
3093	NC_007766	GGCGC	2	10	165972	165981	0 %	0 %	60 %	40 %	86360887
3094	NC_007766	TCG	2	6	165994	165999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360887
3095	NC_007766	CGG	2	6	166007	166012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360887
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3099	NC_007766	CTGGGA	2	12	166167	166178	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	86360887
3100	NC_007766	GCCT	2	8	166181	166188	0 %	25 %	25 %	50 %	86360887
3101	NC_007766	CGA	2	6	166198	166203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360887
3102	NC_007766	GAT	2	6	166272	166277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360887
3103	NC_007766	CAT	2	6	166326	166331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360887
3104	NC_007766	CCCG	2	8	166345	166352	0 %	0 %	25 %	75 %	86360887
3105	NC_007766	GCC	2	6	166384	166389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360887
3106	NC_007766	ACG	2	6	166396	166401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360887
3107	NC_007766	CGA	2	6	166415	166420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360887
3108	NC_007766	ACG	2	6	166434	166439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360887
3109	NC_007766	CGC	2	6	166466	166471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360887
3110	NC_007766	GGCCGC	2	12	166679	166690	0 %	0 %	50 %	50 %	86360888
3111	NC_007766	GCT	2	6	166701	166706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360888
3112	NC_007766	GGC	2	6	166736	166741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360888
3113	NC_007766	GC	3	6	166772	166777	0 %	0 %	50 %	50 %	86360888
3114	NC_007766	ACGG	2	8	166788	166795	25 %	0 %	50 %	25 %	86360888
3115	NC_007766	TGG	2	6	166930	166935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86360888
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3121	NC_007766	ACAACC	2	12	167929	167940	50 %	0 %	0 %	50 %	86360889
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3123	NC_007766	GC	3	6	168006	168011	0 %	0 %	50 %	50 %	86360889
3124	NC_007766	CTA	2	6	168134	168139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360889
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3239	NC_007766	CCAT	2	8	174296	174303	25 %	25 %	0 %	50 %	86360897
3240	NC_007766	GCGG	2	8	174339	174346	0 %	0 %	75 %	25 %	86360897
3241	NC_007766	GGC	3	9	174372	174380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360897
3242	NC_007766	GAT	2	6	174405	174410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360897
3243	NC_007766	GAG	2	6	174415	174420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86360897
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3366	NC_007766	CCT	2	6	181126	181131	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86360902
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3473	NC_007766	GCAA	2	8	186263	186270	50 %	0 %	25 %	25 %	86360907
3474	NC_007766	CGT	2	6	186273	186278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360907
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3477	NC_007766	GGAC	2	8	186393	186400	25 %	0 %	50 %	25 %	86360907
3478	NC_007766	CGC	2	6	186422	186427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360907
3479	NC_007766	TCC	2	6	186522	186527	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86360907
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3482	NC_007766	CCG	2	6	186571	186576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360907
3483	NC_007766	CACC	2	8	186583	186590	25 %	0 %	0 %	75 %	86360907
3484	NC_007766	GGACCG	3	18	186637	186654	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	86360907
3485	NC_007766	CCG	3	9	186673	186681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360907
3486	NC_007766	ATGG	2	8	186910	186917	25 %	25 %	50 %	0 %	86360908
3487	NC_007766	CTCC	2	8	186918	186925	0 %	25 %	0 %	75 %	86360908
3488	NC_007766	TCG	2	6	186953	186958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360908
3489	NC_007766	GATGGA	2	12	187008	187019	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	86360908
3490	NC_007766	CGAAC	2	10	187020	187029	40 %	0 %	20 %	40 %	86360908
3491	NC_007766	CGCA	2	8	187051	187058	25 %	0 %	25 %	50 %	86360908
3492	NC_007766	ATC	2	6	187060	187065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360908
3493	NC_007766	GC	4	8	187079	187086	0 %	0 %	50 %	50 %	86360908
3494	NC_007766	GCG	2	6	187124	187129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360908
3495	NC_007766	TGAA	2	8	187196	187203	50 %	25 %	25 %	0 %	86360908
3496	NC_007766	TGA	2	6	188243	188248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360909
3497	NC_007766	ATC	2	6	188257	188262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360909
3498	NC_007766	AG	3	6	188391	188396	50 %	0 %	50 %	0 %	86360909
3499	NC_007766	CTG	3	9	188464	188472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360909
3500	NC_007766	T	6	6	188484	188489	0 %	100 %	0 %	0 %	86360909

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