MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium etli CFN 42 plasmid p42f

Total Repeats: 13053

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_007766	CGG	2	6	640380	640385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86361300
13002	NC_007766	GC	3	6	640388	640393	0 %	0 %	50 %	50 %	86361300
13003	NC_007766	CGT	2	6	640424	640429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361300
13004	NC_007766	CGA	2	6	640439	640444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86361300
13005	NC_007766	GC	4	8	640482	640489	0 %	0 %	50 %	50 %	86361300
13006	NC_007766	GGA	2	6	640532	640537	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86361300
13007	NC_007766	CGC	2	6	640574	640579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86361300
13008	NC_007766	GAT	2	6	640601	640606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86361300
13009	NC_007766	GTC	2	6	640635	640640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361300
13010	NC_007766	GCT	2	6	640694	640699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361300
13011	NC_007766	GCC	2	6	640710	640715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86361300
13012	NC_007766	GCG	2	6	640719	640724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86361300
13013	NC_007766	TCA	2	6	640757	640762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86361300
13014	NC_007766	GCG	2	6	640797	640802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86361300
13015	NC_007766	GC	3	6	640813	640818	0 %	0 %	50 %	50 %	86361300
13016	NC_007766	GAA	2	6	640892	640897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86361300
13017	NC_007766	GCCG	2	8	640938	640945	0 %	0 %	50 %	50 %	86361300
13018	NC_007766	TC	3	6	640958	640963	0 %	50 %	0 %	50 %	86361300
13019	NC_007766	GAG	2	6	641001	641006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86361300
13020	NC_007766	GAC	2	6	641254	641259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86361301
13021	NC_007766	GCG	2	6	641269	641274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86361301
13022	NC_007766	CTG	3	9	641291	641299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361301
13023	NC_007766	GCG	2	6	641305	641310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86361301
13024	NC_007766	GAC	2	6	641332	641337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86361301
13025	NC_007766	CAA	2	6	641341	641346	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86361301
13026	NC_007766	GACC	2	8	641395	641402	25 %	0 %	25 %	50 %	86361301
13027	NC_007766	GCT	2	6	641425	641430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361301
13028	NC_007766	TGG	2	6	641472	641477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86361301
13029	NC_007766	GCC	2	6	641522	641527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86361301
13030	NC_007766	CCG	2	6	641536	641541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86361301
13031	NC_007766	TCG	2	6	641556	641561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361301
13032	NC_007766	CCG	2	6	641611	641616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86361301
13033	NC_007766	GGCAG	2	10	641618	641627	20 %	0 %	60 %	20 %	86361301
13034	NC_007766	GCC	2	6	641699	641704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86361301
13035	NC_007766	CGC	2	6	641710	641715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86361301
13036	NC_007766	TGC	2	6	641727	641732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361301
13037	NC_007766	CGC	3	9	641785	641793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86361301
13038	NC_007766	TTC	2	6	641830	641835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86361301
13039	NC_007766	GCT	2	6	641848	641853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361301
13040	NC_007766	GGC	2	6	641869	641874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86361301
13041	NC_007766	CAT	2	6	641929	641934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86361301
13042	NC_007766	GA	3	6	641952	641957	50 %	0 %	50 %	0 %	86361301
13043	NC_007766	ATCTGA	2	12	642028	642039	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	86361301
13044	NC_007766	AGG	2	6	642060	642065	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86361301
13045	NC_007766	GAT	2	6	642104	642109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86361301
13046	NC_007766	AGGC	2	8	642112	642119	25 %	0 %	50 %	25 %	86361301
13047	NC_007766	CGGA	2	8	642152	642159	25 %	0 %	50 %	25 %	86361301
13048	NC_007766	CGG	3	9	642267	642275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86361301
13049	NC_007766	TGC	2	6	642291	642296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361301
13050	NC_007766	CCG	2	6	642305	642310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86361301
13051	NC_007766	GCC	2	6	642350	642355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86361301
13052	NC_007766	CCG	2	6	642399	642404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86361301
13053	NC_007766	GCCCG	2	10	642454	642463	0 %	0 %	40 %	60 %	86361301

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.