MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium etli CFN 42 plasmid p42e

Total Repeats: 10909

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_007765	GT	3	6	240540	240545	0 %	50 %	50 %	0 %	86360480
5002	NC_007765	CGG	2	6	240663	240668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360480
5003	NC_007765	G	6	6	240677	240682	0 %	0 %	100 %	0 %	86360480
5004	NC_007765	TCG	2	6	240710	240715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360480
5005	NC_007765	GCTTG	2	10	240735	240744	0 %	40 %	40 %	20 %	86360480
5006	NC_007765	GCCGG	2	10	240761	240770	0 %	0 %	60 %	40 %	86360480
5007	NC_007765	CCT	2	6	240801	240806	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86360480
5008	NC_007765	GCC	2	6	240817	240822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360480
5009	NC_007765	TTC	2	6	240829	240834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86360480
5010	NC_007765	GAT	2	6	240840	240845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360480
5011	NC_007765	CGA	2	6	240851	240856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360480
5012	NC_007765	CCG	2	6	240902	240907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360480
5013	NC_007765	GCTG	2	8	240947	240954	0 %	25 %	50 %	25 %	86360480
5014	NC_007765	ATC	2	6	240988	240993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360480
5015	NC_007765	TGC	2	6	241010	241015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360480
5016	NC_007765	TGCC	2	8	241019	241026	0 %	25 %	25 %	50 %	86360480
5017	NC_007765	CTG	2	6	241030	241035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360480
5018	NC_007765	CGC	2	6	241124	241129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360480
5019	NC_007765	CTT	2	6	241152	241157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86360480
5020	NC_007765	CTG	2	6	241161	241166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360480
5021	NC_007765	GCG	2	6	241168	241173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360480
5022	NC_007765	CGA	2	6	241208	241213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360480
5023	NC_007765	GCG	2	6	241217	241222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360480
5024	NC_007765	GGC	2	6	241233	241238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360480
5025	NC_007765	GCT	2	6	241284	241289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360480
5026	NC_007765	CTG	2	6	241342	241347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360480
5027	NC_007765	GGC	3	9	241353	241361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360480
5028	NC_007765	CGT	2	6	241413	241418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360480
5029	NC_007765	GGC	2	6	241435	241440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360480
5030	NC_007765	CAT	2	6	241488	241493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360480
5031	NC_007765	GCG	2	6	241510	241515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360480
5032	NC_007765	CGG	2	6	241557	241562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360480
5033	NC_007765	ATT	2	6	241586	241591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	86360480
5034	NC_007765	TCGGC	2	10	241604	241613	0 %	20 %	40 %	40 %	86360480
5035	NC_007765	CGGCG	2	10	241626	241635	0 %	0 %	60 %	40 %	86360480
5036	NC_007765	GCTT	2	8	241644	241651	0 %	50 %	25 %	25 %	86360480
5037	NC_007765	GT	3	6	241691	241696	0 %	50 %	50 %	0 %	86360480
5038	NC_007765	CATC	2	8	241922	241929	25 %	25 %	0 %	50 %	86360481
5039	NC_007765	GCG	2	6	241990	241995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360481
5040	NC_007765	GCG	2	6	242011	242016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360481
5041	NC_007765	CGG	2	6	242060	242065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360481
5042	NC_007765	GCT	2	6	242089	242094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360481
5043	NC_007765	GGC	2	6	242095	242100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360481
5044	NC_007765	GTC	2	6	242152	242157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360481
5045	NC_007765	GAG	2	6	242158	242163	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86360481
5046	NC_007765	CAA	2	6	242199	242204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86360481
5047	NC_007765	CGG	2	6	242208	242213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360481
5048	NC_007765	GCC	2	6	242260	242265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360481
5049	NC_007765	GGC	2	6	242295	242300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360481
5050	NC_007765	GCC	2	6	242308	242313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360481
5051	NC_007765	GAA	2	6	242325	242330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86360481
5052	NC_007765	TCA	3	9	242342	242350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360481
5053	NC_007765	ACC	2	6	242353	242358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86360481
5054	NC_007765	CGC	2	6	242364	242369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360481
5055	NC_007765	CGG	3	9	242376	242384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360481
5056	NC_007765	CGC	2	6	242403	242408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360481
5057	NC_007765	CGA	2	6	242426	242431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360481
5058	NC_007765	CG	3	6	242435	242440	0 %	0 %	50 %	50 %	86360481
5059	NC_007765	TCG	2	6	242576	242581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360481
5060	NC_007765	GGA	2	6	242589	242594	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86360481
5061	NC_007765	CGG	2	6	242670	242675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360481
5062	NC_007765	TCT	2	6	242872	242877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86360482
5063	NC_007765	TA	3	6	242982	242987	50 %	50 %	0 %	0 %	86360482
5064	NC_007765	GCT	3	9	243074	243082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360482
5065	NC_007765	ATG	2	6	243124	243129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360482
5066	NC_007765	ATCGG	2	10	243142	243151	20 %	20 %	40 %	20 %	86360482
5067	NC_007765	CGA	2	6	243170	243175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360482
5068	NC_007765	GC	3	6	243184	243189	0 %	0 %	50 %	50 %	86360482
5069	NC_007765	CGT	2	6	243206	243211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360482
5070	NC_007765	CGG	2	6	243252	243257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360482
5071	NC_007765	CGATC	2	10	243362	243371	20 %	20 %	20 %	40 %	86360482
5072	NC_007765	ACC	2	6	243376	243381	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86360482
5073	NC_007765	TCA	2	6	243382	243387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360482
5074	NC_007765	GCT	2	6	243410	243415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360482
5075	NC_007765	TCG	2	6	243430	243435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360482
5076	NC_007765	A	6	6	243454	243459	100 %	0 %	0 %	0 %	86360482
5077	NC_007765	CTT	2	6	243494	243499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86360482
5078	NC_007765	CGC	2	6	243502	243507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360482
5079	NC_007765	TC	3	6	243518	243523	0 %	50 %	0 %	50 %	86360482
5080	NC_007765	CGGC	2	8	243571	243578	0 %	0 %	50 %	50 %	86360482
5081	NC_007765	TCA	2	6	243586	243591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360482
5082	NC_007765	TTA	2	6	243671	243676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	86360482
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5084	NC_007765	GAT	2	6	243690	243695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360482
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5086	NC_007765	GATCC	2	10	243900	243909	20 %	20 %	20 %	40 %	86360482
5087	NC_007765	GCGG	2	8	243951	243958	0 %	0 %	75 %	25 %	86360482
5088	NC_007765	CGG	2	6	243968	243973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360482
5089	NC_007765	CGA	2	6	244013	244018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360482
5090	NC_007765	CGG	2	6	244043	244048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360482
5091	NC_007765	GGC	2	6	244064	244069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360482
5092	NC_007765	GC	3	6	244068	244073	0 %	0 %	50 %	50 %	86360482
5093	NC_007765	CCT	2	6	244120	244125	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86360482
5094	NC_007765	TCT	2	6	244133	244138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86360482
5095	NC_007765	CGC	4	12	244302	244313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360482
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5098	NC_007765	CGA	2	6	244367	244372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360482
5099	NC_007765	CAA	3	9	244394	244402	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86360482
5100	NC_007765	GCAG	2	8	244474	244481	25 %	0 %	50 %	25 %	86360482
5101	NC_007765	ACG	2	6	244615	244620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360482
5102	NC_007765	GCAC	2	8	244661	244668	25 %	0 %	25 %	50 %	86360482
5103	NC_007765	GATG	2	8	244682	244689	25 %	25 %	50 %	0 %	86360482
5104	NC_007765	CGG	2	6	244712	244717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360482
5105	NC_007765	ACG	2	6	244810	244815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360482
5106	NC_007765	CCG	2	6	244881	244886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360482
5107	NC_007765	GCG	2	6	244907	244912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360482
5108	NC_007765	GGT	2	6	244915	244920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86360482
5109	NC_007765	GC	3	6	245100	245105	0 %	0 %	50 %	50 %	86360483
5110	NC_007765	GC	3	6	245110	245115	0 %	0 %	50 %	50 %	86360483
5111	NC_007765	CG	4	8	245192	245199	0 %	0 %	50 %	50 %	86360483
5112	NC_007765	CCG	2	6	245297	245302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360483
5113	NC_007765	GGC	2	6	245354	245359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360483
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5115	NC_007765	CGA	2	6	245375	245380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360483
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5117	NC_007765	TCG	2	6	245467	245472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360483
5118	NC_007765	GGC	2	6	245505	245510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360483
5119	NC_007765	GCAGC	2	10	245519	245528	20 %	0 %	40 %	40 %	86360483
5120	NC_007765	GAA	2	6	245559	245564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86360483
5121	NC_007765	GCC	2	6	245581	245586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360483
5122	NC_007765	GCG	2	6	245611	245616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360483
5123	NC_007765	GGC	2	6	245717	245722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360483
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5489	NC_007765	GAGC	2	8	262414	262421	25 %	0 %	50 %	25 %	86360504
5490	NC_007765	GGC	2	6	262512	262517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360505
5491	NC_007765	GCA	2	6	262534	262539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360505
5492	NC_007765	ACA	2	6	262540	262545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86360505
5493	NC_007765	GGC	2	6	262604	262609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360505
5494	NC_007765	GCC	2	6	262638	262643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360505
5495	NC_007765	AGCGGC	2	12	262676	262687	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	86360505
5496	NC_007765	GAA	2	6	262722	262727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86360505
5497	NC_007765	GCC	2	6	262755	262760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360505
5498	NC_007765	CAG	2	6	262766	262771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360505
5499	NC_007765	GGTG	2	8	262793	262800	0 %	25 %	75 %	0 %	86360505
5500	NC_007765	GCG	2	6	262887	262892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360505

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